FUNZIONE DELLE PROTEINE
Interazioni transitorie con altre molecole.
LIGANDI: altre molecole anche proteiche.
Il sito di legame è complementare ai ligandi per forma,
dimensione, carica, idrofilia e idrofobicità.
L’interazione è specifica e discriminante.
Il sito di legame si può adattare al legante: adattamento
indotto.
Negli enzimi le interazioni sono forti e provocano/
facilitano reazioni chimiche. I ligandi diventano
substrati che si legano nel sito catalitico o sito
attivo.
MIOGLOBINA:
L’ossigeno si lega al gruppo EME
Porfirina
Gruppo EME
Legame reversibile esempio mioglobina e emoglobina
Gruppo prostetico: EME
Per trasportare l’ossigeno che è poco solubile in acqua e quindi
diffonde lentamente specialmente in grandi organismi.
P+L
PL
[PL]
Ka =
[P][L]
[PL]
Ka [L] =
[P]
siti di legame occupati
q=
totale dei siti di legame
Ka[L]
=
Ka[L][P]
=
[L]
=
Ka[L]+1
[L]+_1_
Ka
Ka[L][P]+[P]
INTERAZIONI TRA EME E MIOGLOBINA
Confronto tra le strutture della mioglobina e
della subunità b dell’emoglobina
Identicità di amminoacidi in solo 27 posizioni
Interazioni dominanti tra le subunità dell’emoglobina
Il legame dell’ossigeno all’emoglobina è di tipo cooperativo
e provoca un notevole cambiamento di conformazione,
si passa dallo stato T a quella R
Legame cooperativo dell’ossigeno
L’emoglobina è una proteina allosterica
Varianti dell’emoglobina e malattie molecolari
L’anemia a cellule falciformi
Un unico amminoacdo è cambiato, valina al posto acido glutammico
Immuniglobuline
Proteine che provocano il movimento,
Actina e miosina
Filamenti spessi
L’ATP si lega alla testa
di miosina e causa
la dissociazione dell’actina
Filamento
di actina
b)
L’ATP saldamente legato è idrolizzato
e avviene una modificazione
conformazionale. ADP e Pi restano
legati alla testa della miosina
ATP
a)
c)
Filamento
spesso
di miosina
La testa della
miosina si
attacca al
filamento di
actina e il Pi
viene
rilasciato
Pi
e)
d)
ADP
Il rilascio del Pi innesca la generazione della “forza contrattile, una modificazione
conformazionale nella testa della miosina che fa scorrere i filamenti di miosina su
quelli di actina. In questo processo viene rilasciato l’ADP