“CORSO DI LAUREA” BIOCHIMICA AA. 2014/15 Docente: Prof. Ingeborg Grgurina Dipartimento Scienze Biochimiche “A. Rossi Fanelli” (Sede in Via degli Apuli, 9, piano II;stanza 209 tel 0649917571 e-mail: [email protected] Studenti target: Laurea triennale in Chimica Livello dell’Unità: di base/specialistico:di base Pre-requisiti: buona conoscenza della Chimica organica di base Crediti: 6 Modalità d’esame: esame orale Obiettivi formativi Fornire le conoscenze necessarie alla comprensione delle strutture e delle funzioni della materia vivente in termini molecolari. Strutture e funzioni delle proteine, lipidi, fosfolipidi e polisaccaridi. Relazione tra struttura e funzione delle proteine. Membrane biologiche e sistemi di trasporto. Le principali vie metaboliche dei carboidrati, lipidi, acidi grassi ed amminoacidi: meccanismi delle reazioni enzimatiche, meccanismi di regolazione, produzione e conservazione dell’energia. Programma Architettura delle cellule procariote ed eucariote. Macromolecole biologiche: proteine, acidi nucleici, polisaccaridi, lipidi. Proteine. Struttura, stereochimica e proprietà acido-base degli amminoacidi. Legame peptidico. Struttura primaria, secondaria (α-elica, foglietti β, ripiegamento β), terziaria e quaternaria delle proteine. Grafico di Ramachandran. Indice idropatico. Ripiegamento delle proteine. Denaturazione e rinaturazione delle proteine (esperimento di Anfinsen). Struttura del collageno. Mioglobina ed emoglobina. Struttura e funzione. Struttura e ruolo del gruppo prostetico. Cooperatività del legame dell’ossigeno all’emoglobina. Effetto Bohr. Effettori allosterici dell’emoglobina. Alcune patologie molecolari dell’emoglobina. Proteine allosteriche. Modello simmetrico, modello sequenziale dell’allosteria. Anticorpi. Funzioni del sistema immunitario. Struttura degli anticorpi e loro ruolo nella difesa immunitaria. Legame antigene-anticorpo. Produzione degli anticorpi e loro impiego nella ricerca biochimica e nel settore analitico. Lipidi e membrane. Classificazione dei lipidi. Struttura e organizzazione delle membrane biologiche. Proteine di membrana. Ionofori. Proteine trasportatrici. Sistemi di traslocazione: uniporto, simporto, antiporto. Trasporto del glucosio. Trasporto attivo guidato da ATP: sodio-potassio ATPasi. Enzimi. Nomenclatura e classificazione degli enzimi. Specificità di substrato, regiospecificità, stereospecificità, specificità prochirale. Cinetica enzimatica. Equazione di Michaelis-Menten. Inibizione enzimatica reversibile e irreversibile. Esempi di meccanismi catalitici (proteasi a serina, anidrasi carbonica). Regolazione dell’attività enzimatica nelle vie metaboliche: controllo della biosintesi dell’enzima, controllo dell’attività enzimatica, effettori allosterici, inibizione retroattiva, regolazione ormonale. Metabolismo. Vie cataboliche ed anaboliche. Principi della termodinamica applicati al metabolismo. Le reazioni accoppiate. ATP e trasferimento del gruppo fosforico. Approcci sperimentali allo studio del metabolismo. Metabolismo dei carboidrati. Glicolisi: meccanismi delle reazioni e della via glicolitica. Fermentazione omolattica e fermentazione alcoolica. Complesso multienzimatico piruvato deidrogenasi. Via del pentosio fosfato. Gluconeogenesi. Degradazione e biosintesi del glicogeno. Controllo allosterico e ormonale del metabolismo del glicogeno. Metabolismo dei lipidi. Degradazione dei triacilgliceroli e degli acidi grassi. Meccanismo d’azione delle lipasi. Biosintesi degli acidi grassi e dei lipidi. Steroidi: biosintesi e funzioni nell’organismo (cenni). Ciclo dell’acido citrico. Trasporto degli elettroni e fosforilazione ossidativa. Sistemi-navetta di trasporto mitocondriali. Sintesi dell’ATP. Meccanismi di regolazione delle vie metaboliche. Fissazione dell’azoto. Metabolismo degli amminoacidi. Enzimi piridossale-5’-fosfato (PLP)-dipendenti: meccanismo d’azione delle transaminasi. Serinaidrossimetiltransferasi. Deamminazione ossidativa degli amminoacidi. Ciclo dell’urea. Libri di testo consigliati D. Voet, J.G. Voet, C.W. Pratt: “Fondamenti di Biochimica” Zanichelli, Ed. C.K. Matthews, K.E. van Holde: “Biochimica” Casa Editrice Ambrosiana; J. Berg, J.L. Tymozsko, L. Stryer: “Biochimica” Zanichelli, Ed. D.L. Nelson, M.M: Cox: “Introduzione alla Biochimica di Lehninger” Zanichelli, Ed. Garrett & Grisham “Principi di Biochimica”- Piccin Nuova Libraria