Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli
editore S.p.A. Copyright ©
Sequenza di Shine-Dalgarno
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Traduzione degli mRNA policistronici nei procarioti
5'
5'
Inizio della traduzione negli eucarioti
Initiation Factors
prokaryotes
Activity
eukaryotes
IF3
eIF-1
Fidelity of AUG codon recognition
IF1
eIF-1A
Facilitate Met-tRNAiMet binding to small
subunit
eIF-2
Ternary complex formation
eIF-2B (GEF)
GTP/GDP exchange during eIF-2 recycling
eIF-3 (12 subunits)
Ribosome antiassociation, binding to 40S
eIF-4F (4E, 4A, 4G)
mRNA binding to 40S, RNA helicase activity
IF2
eIF-4A
ATPase-dependent RNA helicase
eIF-4E
5' cap recognition
eIF-4G
Scaffold for of eIF-4E and -4A
eIF-4B
Stimulates helicase, binds with eIF-4F
eIF-4H
Similar to eIF4B
eIF-5
Release of eIF-2 and eIF-3, GTPase
eIF5B
Subunit joining
eIF-6
Ribosome subunit antiassociation
La sequenza
consenso di
Kozak
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
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Negli Eucarioti
• eIF-2 forma un
complesso
ternario con MettRNAf
• Il complesso
ternario lega la
subunità 40S
libera che si lega
all’estremità 5’
dell’mRNA
• GTP viene
idrolizzato
quando eIF2
viene rilasciato
come eIF2-GDP
• eIF-2B rigenera
la forma attiva.
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4G
AUG
Cap
4E
4G
Cap
4E
3
4A
AUG
40 S
4B 4A
Cap
40 S
AUG
5
Cap
40 S
60 S
Inizio di traduzione nell’mRNA di poliovirus
pUp
AUG
AUG
AUG
AUG
UUUCCUUUU
AUG
IRES= Internal ribosome entry site
Traduzione: l’allungamento
Fattori di allungamento
procarioti
eucarioti
EF-Tu
eEF1A
trasporto aa-tRNA
EF-Ts
eEF1B
riciclo
EF-G
eEF2
traslocazione
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Traduzione: terminazione
Fattori di terminazione
procarioti
eucarioti
RF1
eRF1
riconoscimento
UAA, UAG
RF2
“
riconoscimento
UGA, UAA
RF3
eRF3
GTPase
RRF
rilascio
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Inhibitor
Effect
Chloramphenicol
inhibits prokaryotic peptidyl transferase
Streptomycin
(Neomycin)
inhibits prokaryotic initiation, also induces mRNA misreading
Tetracycline
inhibits prok. aminoacyl-tRNA binding to the ribosome small subunit
Erythromycin
inhibits prokaryotic translocation through the ribosome large subunit
Fusidic acid
similar to erythromycin only by preventing EF-G from dissociating
from the large subunit
Puromycin
resembles aa-tRNA, interferes with peptide transfer resulting in
premature termination in prok and euk
Diptheria toxin
catalyzes ADP-ribosylation of and inactivation of eEF-2
Ricin
found in castor beans, catalyzes cleavage of the euk. 28S rRNA
Cycloheximide
inhibits eukaryotic peptidyltransferase
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