Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 RNA polimerasi eucariotiche Enzima RNA polimerasi I Localizzazione nucleolo Prodotto Attività Sensibilità alla (relativa) -amanitina RNA ribosomale 50-70 % non sensibile RNA polimerasi II nucleoplasma RNA nucleare RNA polimerasi III nucleoplasma tRNA, 5S RNA 20-40 % sensibile 10% specie-specifica Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI ( trans-acting factors = fattori che agiscono in trans ) Possono essere distinti in: - Fattori generali - Attivatori I confini di un promotore possono essere determinati mediante analisi di delezioni progressive attività reporter 100 reporter 100 reporter 100 reporter 100 reporter 30 reporter 0 I geni per gli rRNA sono ripetuti in tandem nei genomi eucariotici NTS ETS 18S 28S ITS RNA RNA DNA DNA DNA other repetitive elements 60/81 bp repeats spacer promoter 60/81 bp repeats spacer promoter gene promoter Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 L'analisi per delezione mostra che il promotore Pol III del gene per l'RNA 5S è interno l'inizio avviene ad una distanza fissa ( 55 bp) a monte del promotore promotore promotore Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Assemblaggio del complesso di inizio su un promotore Pol II -5 0 -4 0 -3 0 -2 0 TATA 1 TBP + vari TAF TFII D TATA TFII A TFII B TFIIF Pol II TFII E Pol -1 0 1 10 20 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006 FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI ( trans-acting factors = fattori che agiscono in trans ) Possono essere distinti in: - Fattori generali - Attivatori Esempio di promotore eucariotico “fattori generali” e “attivatori” -100 -80 box (modulo) sequenza CAAT -60 GC GGCCAATCT GGGCGG Fattori proteici CTF che legano Sp1 -40 -20 TATA TATAAA Fattori generali (Pol II) 1 20 Modulo Consensus TATA box TATAAAA CAAT box GGCCAATCT GC box GGGCGG Ottamero ATTTGCAT " B " ATF " GGGACTTTCC " GTGACGT DNA legato (bp) Fattore >25 22 20 20 23 TFIID CTF/NF1 SP1 Oct-1 Oct-2 60,000 105,000 76,000 52,000 10 10 NFB H2-TF1 44,000 ? ? ? c.linfoidi generale 20 ATF ? ? generale Grandezza Abbond. (dalton) ( /cellula) ? ? 300,000 60,000 ? ? Distrib. generale generale generale generale c.linfoidi
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