Tipi di splicing
meccanismo
simile
• Splicing nucleare
spliceosoma
transesterificazioni
• Splicing di introni di tipo II
autosplicing
• Splicing di introni di tipo I
• Splicing di tRNA di lievito
nucleasi e ligasi
RNA catalitico
•RNAsi P
•Viroidi e virusoidi
•Introni di gruppo I e II
La “testa di martello” (hammerhead)
5'
Gppp
G
A
3'
G
HOUA
GC
CG
A A UC
A
A
U G G GC C G
U G A G C G U GA
G GC C C G GU
AC U C GC
A
A
C
C
C
GA
U
AG
loop 2
RNA substrato
C
C G
AU
CG
A A UN
GA
U C G A GC N N N
N N N GC G CC
A G CU CG
C GC G GA
C
5'ppp
3'OH
GUA GU
ribozima
loop 1
CG
AA UN
A
G
NN N N N
GN C
NN NN N
CN G
C
AG
NAGU
loop 3
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
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Struttura dell’introne
dell’rRNA di
Tetrahymena
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Elementi conservati negli introni di gruppo I
Introni
P
Q
R (9L)
S (2 )
Mitocondriali gruppo I
UGCUGG
UCAGCAG
GACUA
UAGUC
rDNA T etrahymena
UGCGGG
CCACGCA
GACUA
UAGUC
ACGG G
CCCG U
GACU A
UAGU C
T imidilato sint. T 4
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Editing
Editing dell’mRNA per la Apolipoproteina B umana
Il codone 2153 codifica per glutamina
---CAA-- -
mRNA del fegato
codifica per una proteina
di 4563 residui aa
editing
---UAA-- -
mRNA dell'intestino ha
un codone UAA che termina
la sintesi al aa 2153
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RNA regolatore
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siRNA
miRNA
(small interfering RNA)
(micro RNA)
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