Introduzione alla ricerca
bibliografia: risorse,
fonti e Pubmed
MATERIALE DIDATTICO A CURA DI:
G. GRILLO
Biblioteca “A. Rosmini” dei Corsi di Laurea Professioni Sanitarie
<[email protected]>
Didattica Integrativa Corso di Laurea triennale in DIETISTICA
Torino, 26 novembre 2012
http://www.lsmolinette.unito.it/biblioteca/biblioteca.htm
Banche dati
I database: definizione
La gestione dell’informazione è lo scopo
principale di un database:
è un insieme di descrizioni standard,
strutturate e organizzate, accessibile
all'utenza attraverso interfacce che ne
permettano l'interrogazione e il recupero
di dati
Una tabella di database
• Sono visibili i campi (colonne) in verticale e i record
(righe) in orizzontale
Relazione tra tabelle
• Esempio di database relazionale, in cui le
tabelle sono collegate tra loro
2 tipi principali di DB
• Bibliografici (METADATI)
• Fattuali o full text (DATI)
• …ma: occhio all’integrazione!!
Ricercare in un database
bibliografico
• Vanno distinti:
– la struttura del database
– il software di IR (= information
retrieval, recupero dell’informazione)
Cosa sono i database
bibliografici?
• In un database bibliografico i dati sono divisi in
campi e record
• I record rappresentano le citazioni bibliografiche
che derivano dallo spoglio di articoli di riviste
prese in considerazione dal database
• Per ogni articolo viene prodotta una citazione
bibliografica che comprende una serie di elementi
(metadati). Questi riferimenti bibliografici sono
relativi alla letteratura biomedica (prevalentemente
periodici)
Le singole citazioni bibliografiche sono organizzate
in campi (Autore, titolo, rivista …)
CINAHL : Cumulative Index to Nursing & Allied Health
Caratteristiche della banca dati:
Prodotto dall’American Nurses Association e dalla National League for Nursing
E’ la principale banca dati per le scienze infermieristiche ed affini
Parte dal 1981
Indicizza non solo riviste (quasi 3.000), ma anche libri, materiale audiovisivo,
tesi, atti di convegni...
Ha un proprio tesauro
(Il 70% del CINAHL subject headings (12,414 ) corrisponde ai MeSH del
MEDLINE; gli altri termini sono specifici per l’infermieristica e le scienze alleate)
Dal 1 gennaio 2009 è accessibile tramite la piattaforma EBSCOhost
CINAHL : Cumulative Index to Nursing & Allied Health
Le varie specialità
dell’infermieristica:
Discipline collaterali:
Chirurgia
Chirurgia plastica
Fisioterapia e
riabilitazione
Gastroenterologia
Ginecologia
Nutrizione e dietetica
Oncologia
Assistenza medica
Optometria
Pediatria
Pronto soccorso
Servizio sociale
nella cura della salute
Tecnica radiologica
Terapia occupazionale
Tecnica chirurgica
LA RICERCA BIBLIOGRAFICA
IN DUE PASSAGGI
PROGETTAZIONE
quesito  scomposizione
STRATEGIA
database quale utilizzare?
parole chiave  PICO
i tesauri  il MESH e non solo
operatori booleani 
concatenazione delle parole
la ricerca  per voce di
tesauro /termine libero
i sottodescrittori  da quale punto di
vista affrontare l’argomento cercato
Focus/explode  le voci di soggetto
principali, l’inclusione delle diramazioni
secondarie di un soggetto
i limiti e tipi di pubblicazione
LA PROGETTAZIONE
quesito  scomposizione
fase preliminare
Focalizzare il problema
Scomporlo in termini essenziali
Tradurre i termini in inglese
esecuzione
Cercare i termini MESH che rappresentano i concetti e i subheading
relativi ad ogni termine
Combinare i termini scegliendo gli operatori booleani adeguati
LA PROGETTAZIONE
Parole chiavePICO
In EBM viene richiesta la capacità di trasformare lo
scenario o caso clinico in domande (quesiti clinici)
correttamente formulate. Saranno caratterizzate dalla
peculiarità di:
•Essere centrate sul paziente
•Generare risposte appropriate e precise
I quesiti clinici dovrebbero contenere 4 elementi:
Il modello PICO : Patient group(s)
Intervention treatment
Comparison
Outcome
“TRADURRE” il PICO
Patient and Problem
Come descriveresti un gruppo di pazienti simili a colui che stai trattando? Quali
sono le principali caratteristiche del paziente? Considera il problema primario,
ma anche condizioni correlate: età, sesso, talvolta il gruppo sociale o etnico a
cui appartiene, la sua storia personale. (es: è un fumatore? è stato esposto a
sostanze tossiche? etc.)
Intervention
Quale intervento fondamentale stai per prendere in considerazione?
Prescrizione di un farmaco? di un test diagnostico? di un intervento
chirurgico? Quali altri fattori possono influenzare la prognosi del paziente
(vedi sopra)?
Comparison
Quali sono le alternative prinicipali all’intervento preso in esame? Stai
per scegliere tra due farmaci, un farmaco ed un placebo, due test
diagnostici?
Non sempre è presente un paragone specifico
Outcome
Che cosa vuoi ottenere, misurare, migliorare o modificare? Cosa stai
cercando di fare per il tuo paziente? Ridurre il numero di eventi avversi?
Migliorare i risultati funzionali?
LA STRATEGIA
databasequale utilizzare
MEDLINE
Caratteristiche della banca dati:
Parte dal 1950, prodotto dalla National Library of Medicine
Indicizza solo articoli di riviste
(5.197 riviste biomediche internazionali, 80% del contenuto in lingua
inglese)
Settori:
Medicine, Biology,Environmental science, Marine biology, Plant and
animal, science, Biophysics, Chemistry, Nursing, Dentistry, Veterinary
medicine, Allied health, Pre-clinical sciences
Thesaurus:
MESH (Medical Subject Headings della NLM)
LA STRATEGIA
I tesauri  il MeSH e non solo
Le pubblicazioni specifiche di una disciplina vengono recensite o indicizzate e
successivamente raccolte in un repertorio bibliografico (cartaceo: soggettiautore; elettronico: database) che ne agevola il ritrovamento.
Il metodo più efficace per interrogare un repertorio bibliografico è l’utilizzo di
parole chiave (o termini di soggetto) che formano un tesauro (o soggettario):
vocabolario controllato con l’abolizione dei sinonimi in cui le varie voci sono
strutturate tra loro in una rete di relazioni gerarchiche: “struttura ad albero”
Nell’ambito delle scienze mediche ed infermieristiche il repertorio principale è:
MEDLINE (due versioni: Pubmed gratuito http://www.pubmed.gov Ovid a
pagamento)
N.B. Per l’accesso al testo pieno, al catalogo e ad altri servizi
ricordarsi l’integrazione con
LA STRATEGIA
La ricerca  per voce di tesauro e/o
termine libero
Ricerca libera sconsigliabile in genere poiché riduce il controllo.
Implica una ricerca in tutti i campi[Tag] (TIAB, Text Word,
MeSH Terms, etc.)
Thesaurus
livello ottimale di controllo, consente univocità
nei termini di ricerca
IMPORTANTE!
La ricerca può anche essere effettuata tramite parole troncate,
in questo caso il sistema ricerca tutti i termini che iniziano con la stringa data,
es.: inserendo: bacter*
il sistema ritrova bacteria, bacterium, bacterophage etc…
LA STRATEGIA
I sottodescrittorida quale punto di vista
affrontare l’argomento cercato
Gli indicizzatori possono anche assegnare un ulteriore elemento descrittivo
ad un termine MeSH: i subheadings o sottodescrittori.
La loro funzione è di dettagliare ulteriormente un aspetto
specifico di un termine MeSH.
Es.:
Diagnosis
Surgery
Metabolism
Pathology
LA STRATEGIA
i filtri o limiti
•Età
•Specifici sottoinsiemi (subsets: systematic reviews…)
•Tipo di pubblicazione
•Lingua
•Data
•Altro…
LA STRATEGIA
tipi di pubblicazione
Tra i vari generi di pubblicazioni utilizzati dalla National Library of Medicine per la recensione del
materiale bibliografico (e utilizzabili come limiti nella ricerca) , ricordo i principali:
Clinical Trial rapporto di uno studio clinico pre-organizzato sulla sicurezza, efficacia o dosaggio ottimale di
uno o più farmaci, dispositivi o tecniche diagnostiche terapeutiche o profilattiche in esseri umani selezionati in
base a criteri predeterminati di idoneità e osservati per verificare l’evidenza di effetti favorevoli o sfavorevoli.
Controlled Clinical Trial lavoro che consiste in un esperimento clinico che implica uno o più
trattamenti di prova, almeno un trattamento di controllo, misure specifiche dei risultati per valutare l’intervento e
una metodologia priva di pregiudizi finalizzata ad assegnare i pazienti al trattamento.
Meta-Analysis lavoro che consiste in studi che utilizzano un’analisi quantitativa per combinare i risultati
di studi indipendenti e riassunti e conclusioni che possono essere usati per valutare l’efficacia terapeutica.
Practice Guideline lavoro che consiste in un insieme di direttive o principi per indirizzare il personale
medico in decisioni sanitarie circa le procedure diagnostiche, terapeutiche o cliniche da adottare in specifiche
circostanze cliniche. Possono essere sviluppate da agenzie governative a qualunque livello, istituzioni quali
società professionali o comitati governativi.
Randomized Controlled Trial lavoro che consiste in un esperimento clinico che include fasi
specifiche e preordinate di gestione dello stesso.
Revisione sistematica differiscono dalle revisioni tradizionali della letteratura in quanto riuniscono
risultati di tutti gli studi clinici condotti su un determinato argomento, ottenendo una stima basata su un
numero maggiore di soggetti, quindi statisticamente più stabile e clinicamente più affidabile.
Banche dati
RISORSE A PAGAMENTO
ACCESSO DA CASA
http://proxy-medicina.unito.it
TROVA@UNITO E PUBMED
Come posso accedere ai servizi di trova@unito
Collegarsi a Pubmed da link presenti su pc universitari
oppure da casa tramite proxy
http://proxy-medicina.unito.it
inserendo le proprie credenziali SCU:
?
Banche dati
MEDLINE IN PUBMED
tutorial e FAQ
Strumenti
risorse utili
La ricerca per parole “libere”
inserendo le parole della ricerca, Pubmed procede con la
funzione di completamento automatico, suggerendo i termini
gli esiti della ricerca:
Aprendo la finestra potrò selezionare i diversi formati di presentazione delle citazioni, il loro numero, e ordinarli
per anno, autore, titolo e rivista
Selezionando gli articoli, posso
gestirli in vario modo (cliccando
su Send to posso):
• mandare le citazioni in un file;
• mandarle in una “collection”
virtuale all’interno di MY NCBI;
• inviarle ad un “management
software” esterno;
• mandarle nel “clipboard” =
parcheggio temporaneo (max 8
ore) di citazioni;
• inviarle via mail;
• inviarle nella mia personale
bibliografia all’interno di MY
NCBI
La possibilità di
gestire i risultati
e di filtrarli
Sulla destra della schermata trovo:
La possibilità di
capire come il
sistema ha
interpretato la mia
ricerca
La possibilità di
visualizzare
le ultime ricerche
effettuate
Come Pubmed ha interpretato la ricerca – tramite
parole libere - di
hospital infections:
"cross infection"[MeSH Terms] OR ("cross"[All Fields] AND
"infection"[All Fields]) OR "cross infection"[All Fields] OR ("hospital"[All
Fields] AND "infections"[All Fields]) OR "hospital infections"[All Fields]
La chiave per accedere: a. all’eventuale full-text
b. al catalogo d’Ateneo
Questa citazione era stata selezionata per l’invio in clipboard, resta
segnalato anche nel corso di ulteriori ricerche
Fornisce informazioni importanti per l’articolo:
a. Tipo di disegno di studio
b. Termini MeSH correlati
c. Sostanze correlate
In Advanced Search trovo:
la “search history”
cliccando sul numero progressivo di ogni ricerca, posso:
cliccando sui numero di esiti
di ogni ricerca, ritorno
all’elenco complessivo
combinare le ricerche con gli operatori, cancellarle,
rilanciarle, vedere come il sistema ha interpretato la
ricerca, salvarla in MY NCBI
Un recente aggiornamento ha eliminato la pagina dei
“limiti” e inserito i “filtri” di ricerca (a sinistra dell’elenco)
che posso essere aggiunti o tolti dall’utente rispetto ai
risultati ottenuti.
La ricerca per termini MeSH
Opzione di ricerca tramite termini MeSH
Inserimento termine “libero”
Il sistema “interpreta” le parole inserite, suggerendo il
MeShH semanticamente più vicino al termine di partenza
Sottodescrittori
(Subheadings): essenziali
per capire da quale punto di
vista ci interessa
l’argomento cercato
Nella parte sottostante della schermata, trovo:
a. Tutti i termini che,
inseriti, avrebbero
portato a quel termine
MeSH, utili
(correlandoli con OR)
per ricerche per
parole libere in
database o altri
sistemi non provvisti
di tesauro
b. La ramificazione
del MeSH all’interno
della quale si trova il
termine cercato, utile
per sapere se ci
interessa anche il
termine “figlio” nella
funzione Explode
“figlio” di “cross infection”
Si aggiunge alla finestra di
composizione della stringa di ricerca
2 funzioni importanti:
a. Restringere la ricerca ai soli articoli aventi questo
soggetto come argomento PRINCIPALE
b. Non esplodere: non includere nella ricerca gli
articoli soggettati con le diramazioni “figlie” di
questo termine
N.B. Qualora non si selezioni alcun sottoscrittore
verranno tenuti in considerazione tutti i subheadings
Invio della ricerca (dopo aver selezionato le
opzioni dei subheadings desiderate) nel box di
composizione della stringa di ricerca con gli
operatori più opportuni
La ricerca è ora impostata all’interno del box, possibilità di verificarla
ed eventualmente modificarla, poi invio cliccando su
Stringa di ricerca lanciata e relativi risultati
La “carta d’identità” di un articolo
Dati
bibliografici
Mesh
attribuiti
Non utilizzare i MeSH per:
Argomenti recenti
Argomenti poco studiati o poco consueti
Articoli inseriti nel database nel corso
delle
ultime settimane
Registrazione per apertura account in Pubmed, che consente di:
Salvare le ricerche (anche in modalità alert = con avviso automatico di ulteriori pubblicazioni
inerenti la ricerca salvata)
Salvare collezioni di citazioni bibliografiche
Salvare la propria bibliografia, anche di altra letteratura non indicizzata in Pubmed
Visionare le ricerche svolte negli ultimi 6 mesi (solo se collegati nel corso di sessioni in My NCBI)
Personalizzare i filtri di ricerca
La registrazione è semplice e
ti permette di avere un tuo
spazio personale per gestire i
risultati della ricerca.
Ricerche salvate
Bibliografia salvata
Collezioni salvate
Attività recente (ultimi 6 mesi)
Da qui posso salvare la ricerca in My NCBI
Da qui, dopo averli selezionati, invio gli articoli nelle “Collections” o
In “My Bibliography”
Banche dati
LA COCHRANE COLLABORATION
http://www.cochrane.org/
La Cochrane Collaboration è una iniziativa internazionale no-profit
nata con lo scopo di raccogliere, valutare criticamente e diffondere le
informazioni relative alla efficacia degli interventi sanitari.
Produce - utilizzando una metodologia scientifica comune - sintesi
(revisioni sistematiche) sulla efficacia e sicurezza degli interventi
sanitari di tipo preventivo, terapeutico e riabilitativo. Questi rapporti
vengono diffusi attraverso un database elettronico denominato
"Cochrane Library“. (Da Centro Cochrane Italiano http://www.cochrane.it/it/)
L’Università di Torino offre il database elettronico della Cochrane
all’interno della piattaforma Wiley
Banche dati di studi secondari:
Cochrane Library
Da novembre 2009 accessibile da:
http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/mrwhome/106568753/HOME
La Cochrane Library è un insieme di database
all’interno dei quali è reperibile letteratura
indipendente e di qualità elevata creata per
migliorare l’assistenza e fornire prove sulle quali
basare le scelte in ambito clinico e sanitario.
I DATABASE
Cochrane Database of Systematic
Reviews (CDSR; Cochrane Reviews)
Database of Abstracts of Reviews of
Effects (DARE; Other Reviews)
Cochrane Central Register of Controlled
Trials (CENTRAL; Clinical Trials)
Cochrane Methodology Register (CMR;
Methods Studies)
Il principale database Cochrane:
contiene le revisioni sistematiche
Contiene abstract di revisioni
sistematiche validate qualitativamente.
Ogni abstact contiene un riassunto
e un commento critico sulla qualità
complessiva.
Include dettagli di articoli (trial
controllati) pubblicati ricavati dalle
principali BD bibliografiche e
da altre fonti altre pubblicate e non
E’ una bibliografia di pubblicazioni che
dettagliano i metodi utilizzati nella
conduzione di trial controllati
Health Technology Assessment Database Raccoglie studi (completati e in corso)
(HTA; Technology Assessments)
di valutazioni (mediche,sociali, etiche,
economiche) in ambito sanitario
NHS Economic Evaluation Database
(NHSEED; Economic Evaluations)
Contiene abstract di valutazioni
economiche basate su criteri di
qualità, evidenziandone i punti di forza
e di debolezza
Gli Archivi della Cochrane Library
LE LINEE GUIDA
Sono raccomandazioni di comportamento clinico, elaborate
mediante un processo di revisione sistematica della letteratura,
con lo scopo di aiutare i medici e i pazienti a decidere le
modalità assistenziali più appropriate in specifiche situazioni
cliniche1
1Field
MJ, Lohr KN eds (1992). Guidelines for Clinical Practice: From Development to Use, Washington, DC: National Academy Press.
CHI REALIZZA LE LINEE GUIDA?
Agenzie internazionali e nazionali
Agenzie governative
Agenzie regionali
Aziende sanitarie
Dove reperire le LG?
• In Medline o altro DB bibliografico, se pubblicate su
riviste censite
limitazione applicata alla stringa di ricerca:
Publication Types [Practice Guideline]
• Su risorse specifiche liberamente accessibili in rete.
DATABASE DI LG
Es. NGC o NHS EVIDENCE
SITI DI AGENZIE PRODUTTRICI DI LG
Es. NICE o SIGN
Altri siti su cui reperire LG
•
•
ANAES - www.has-sante.fr/ - Agence Nationale d’Accréditation et d’Evaluation en Santé –
Francia
CDC - Centers for Disease Control and Prevention – Atlanta (USA)
http://www.cdc.gov/hiv/resources/guidelines/
•
CMA Infobase - Clinical Practice Guidelines - http://mdm.ca/cpgsnew/cpgs/index.asp Canada
•
CPO - http://www.cpo.it/lineeguida - Centro di riferimento regionale per l’Epidemiologia e la
Prevenzione Oncologica - ASO S. Giovanni Battista Torino
•
MJA - http://www.mja.com.au/public/guides/guides.html - Clinical Guidelines - Australia
•
New Zeland Guidelines Group - http://www.nzgg.org.nz/ - Nuova Zelanda
•
PRODIGY - http://www.prodigy.nhs.uk/guidance/list.htm - NHS Dept of Health –
Inghilterra
•
ICSI - http://www.icsi.org/guidelines_and_more/ - Institute for Clinical Systems
Improvement – USA
•
SNLG - http://www.pnlg.it/ - Sistema Nazionale Linee Guida– Isituto Superiore di
Sanità - Italia
Un paziente adulto viene ricoverato d’urgenza in
ospedale per essere operato di appendicite. La sera
prima dell’operazione, il paziente vi esprime le sue
ansie e le sue preoccupazioni e vi chiede cosa ne
pensate dell’utilizzo della musica per superare queste
paure. Cosa rispondereste al paziente?
P
Paziente adulto ansioso ricoverato in ospedale
per essere sottoposto ad intervento chirurgico di
appendicectomia
I
C
O
musicoterapia
nessun intervento o altri tipi di intervento
verificare l’efficacia della musica per controllare
l’ansia
Un infermiere che assiste i pazienti oncologici ha sentito parlare
dell’esercizio fisico che potrebbe aiutare i suoi pazienti ad affrontare la
fatigue (l'insieme di sintomi fisici e psichici tra i più debilitanti e meno
trattati nei malati di cancro).
Si pone quindi la domanda se l’esercizio fisico è consigliabile o no per le
persone malate di tumore che presentano fatigue ovvero se un programma
di esercizi fisici è efficace nel diminuire la fatigue correlata al cancro?
P
I
Paziente oncologici con fatigue = Tumore
C
O
nessun esercizio fisico / riposo, sonno
programma di esercizi fisici
esercizi fisici
= programma di
Effetto sulla fatigue: riduzione della fatigue =
Fatigue