DIAGNOSI DI LABORATORIO DELLE MALATTIE INFETTIVE A) DIAGNOSI DIRETTA Ricerca dell'agente eziologico (intero o di una sua componente) e sua identificazione: Esame batteriologico/micologico/parassitologico/virologico B) DIAGNOSI INDIRETTA Ricerca di anticorpi specifici (ricerche sierologiche) A) DIAGNOSI DIRETTA (Esame batteriologico-micologico-parassitologico) Scopo accertare nel materiale patologico adatto la presenza del microrganismo patogeno, o di una sua parte, e identificarlo. 1 Esame microscopico preparati “a fresco“ preparati fissati e colorati 2 Esame colturale si coltiva su substrati adatti l’agente infettante Selezione e raccolta dei campioni Linee guida: 1. Selezionare il sito anatomico appropriato 2. Evitare contaminazione con flora commensale 3. Per sospetto germe anaerobio procedere con agoaspirato o biopsia tessuti 4. Raccogliere volume sufficiente di materiale 5. Etichettare correttamente il campione con i dati del paziente 6. Formulare correttamente la richiesta d’indagine Varietà di campioni Materiali Sangue (per emocoltura) Lesioni cutanee o sottocutanee (ascessi, ferite, fistole, ulcere, cisti etc), LCR, orecchio int. ed est., congiuntiva , cornea. Feci Secrezioni cervicali, vaginali, uretrali, urina BAL, espettorato Lesioni orali e nasali Etc …… Ogni campione va prelevato “al momento giusto e nel modo giusto” Esistono linee - guida Trasporto dei campioni Linee guida: I campioni devono essere trasportati il più velocemente possibile al laboratorio (entro 2 ore dal prelievo). Se ciò non è possibile, si deve usare adeguato terreno di trasporto e t° ottimale. Comunque non superare le 12 ore Per piccoli volumi (< 1ml, < 1 cc), entro 15-30 min. Germi sensibili alla temperatura sono: Shigella spp, Neisseria gonorrhoeae, N. meningitidis, Haemphilus influenzae, Streptococcus pneumoniae e gli anaerobi. Nessun campione deve essere mai refrigerato (se non indicato diversamente dalle specifiche linee guida) Esame microscopico batteriologico Utile per l’osservazione di batteri in materiali normalmente sterili (liquor, sangue) PROCEDIMENTO TECNICO 1. si distende una piccola quantità del materiale in esame sul vetrino portaoggetti 2. si fissa (calore o metanolo) 3. si colora Esame microscopico batteriologico Utile per l’osservazione di batteri in materiali normalmente sterili (liquor, sangue) Tecnica: si distende una piccola quantità del materiale in esame sul vetrino portaoggetti, si fissa (calore o metanolo) e si colora Gram+ GramColorazione di Ziehl-Neelsen per Micobatteri Colorazione di Gram Esame microscopico Esame microscopicomicologico in micologia preparati "a fresco“ o fissati e colorati Candida: ife in striscio vaginale Cryptococcus: lieviti Candida: lieviti Aspergillus: testa conidiale Penicillum: conidi Microsporum: conidi Esame microscopico parassitologia Esame microscopico parassitologico È di alto valore diagnostico! preparati "a fresco“ (utile per parassiti mobili) o fissati e colorati Leishmania: promastigoti e amastigoti Giardia intestinalis Sarcoptes scabiei Taenia: proglottide matura Plasmodium: trofozoiti Entamoeba Esame colturale Esame colturale Terreni di coltura liquidi Sono soluzioni di peptoni con estratto di carne e sali minerali Terreni di coltura solidi Sono soluzioni nutritizie solidificate con agar: permettono l’isolamento delle specie microbiche (colonie) Esame colturale-segue Terreni selettivi Contengono sostanze che selezionano lo sviluppo di alcune specie Agar sale-mannite Terreni di arricchimento Contengono sostanze che favoriscono lo sviluppo di specie esigenti Agar sangue Terreni cromogenici Contengono sostanze che determinano lo sviluppo colorato di alcune specie Candida spp.: Chromagar Esame colturale-segue PROCEDIMENTO TECNICO Incubazione delle colture su terreno solido o liquido 37°C x 1-2 gg (in alcuni casi per qualche settimana) Identificazione sistemi di identificazione biochimica) tecniche di biologia molecolare (PCR per l’amplificazione di tratti specifici di DNA o di RNA del microbo ricercato) Esame colturale - ANTIBIOGRAMMA E’ un test utile per verificare la sensibilità/resistenza di un microbo agli antimicrobici Dopo aver seminato su terreno solido il germe in esame si appoggiano sulla superficie dei dischetti imbevuti degli antibioticitest. Incubazione. Il mancato sviluppo del germe (alone di inibizione) significa sensibilità a quell’antibiotico Esame colturale in micologia Terreni di coltura: Terreno di Sabouraud (peptoni, glucosio, acqua con o senza agar) Incubazione : t.a., 37°C x 24-48 h fino a 20 gg Identificazione: prove biochimiche per i lieviti, osservazione morfologica per funghi filamentosi lievito Fungo filamentoso Esame colturale in parassitologia I terreni di coltura sono poco usati perché la maggior parte dei protozoi sono difficili da coltivare. (Es. terreno NNN o di Tobie per Leishmania) Identificazione: di routine è su base morfologica In alternativa: tecniche immunologiche o di biologia molecolare DIAGNOSI INDIRETTA Esame sierologico Ricerca di anticorpi nel siero Ricerca di antigeni nel siero Esame sierologico Scopo • ricercare anticorpi nel siero, specifici per un determinato agente d’infezione. Tecniche varie: precipitazione, immunoelettroforesi, immunofluorescenza, reazioni immunoenzimatiche etc. Tenere presente: 1. Utilità del doppio campione di siero per accertare un’infezione in atto 2. Utilità della ricerca di IgM per accertare un’infezione in atto 3. Scarsa o nulla utilità in immunodepressi La ricerca di antigeni, quando attuabile, supera il problema della immunodepressione