UNIVERSITÀ DEGLI STUDI “MAGNA GRÆCIA” DI CATANZARO FACOLTÀ DI FARMACIA SCUOLA DI SPECIALIZZAZIONE FARMACIA OSPEDALIERA CATTEDRA DI CHIMICA FARMACEUTICA INIBIZIONE DELL’ATTIVITA’ DELLA TRASCRITTASI INVERSA AD OPERA DELL’OSSIDO NITRICO STRUTTURA DEL VIRUS DELL’HIV-1 RUOLO DELL’RNA VIRALE SUBUNITA’ CHE FORMANO L’ETERODIMERO TRASCRITTASI INVERSA Carson, M. (1987) J. Mol. Graphics 5, 103-106. SUPERFICIE DELL’ENZIMA ACCESSIBILE AL SOLVENTE RESIDUI AMINOACIDICI DI CONTATTO TRA P66 E P51 In blu: V21, k22, P25, P52, E53, N57, T131, N136, N137, E138, T139. In azzurro: P392, I393, Q394, E396, T397, T400, W401, N418, P420, L422. In rosa: N255, Q258, V261, N265, V276, L283, T296, L289. Pradeep K. Et al., BMC Biochemistry 2002, 3:18 ATTIVITA’ CATALITICHE ED OMOLOGIE NELLA STRUTTURA PRIMARIA MOTIVO RESPONSABILE DELL’ATTIVITA’ POLIMERASICA: YMDD D. W. Rodgers et al., (1995) Biochemistry 92: 1222-1226. INETRAZIONI TRA IL POLLICE DI P51 E IL SITO RNasi H DI P66 Julias, J. G. et al., (2001). J. Virol. 75, 6537-6546. POSSIBILI TARGETS DELLA TERAPIA ANTI-HIV RESIDUI AMINOACIDICI MUTANTI CHE INDUCONO RESISTENZA AGLI INIBITORI NUCLEOSIDICI E NON-NUCLEOSIDICI. SITO POLIMERASICO LEGATO A CP-94,707 INIBITORE NON-NUCLEOSIDICO DI RT. RUOLO DEI MACROFAGI DURANTE L’EVOLUZIONE DELL’INFEZIONE Presentazione dell’antigene Fagocitosi Thomas R. et al., Virology 212:174-178 (1995) Secrezione di citochine Produzione di radicali reattivi ed ossido nitrico Donatori dell’ossido nitrico usati da Persichini e collaboratori: •SIN-1 •NOC-18 •NOR-3 •SNO-102 •SNP MODELLI CRISTALLOGRAFICI USATI IN QUESTO STUDIO: PDP ID: 1RTJ, 2.35 Ǻ PDP ID: 1RTD, 3.20 Ǻ OSSIDO NITRICO Ossidazione S-nitrosilazione • Y183 • Y188 • W229 • C38 • C280 • C62 CO2H H2NCH H2C SH FATTORI FAVORENTI: Accessibilità del solvente ai gruppi tiolici. Presenza di residui basici che facilitano la deprotonazione del gruppo tiolico aumentandone la reattività (istidina, arginina, lisina). Presenza di residui basici che stabiliscono la forma protonata del gruppo tiolico (acido aspartico, acido glutammico). CONCLUSIONI OSSIDO NITRICO Patologie cardiovascolari AIDS ?