Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol. 58
SPECIES SELECTION TOOL FOR THE StN
DATABASE, 2008
Claude Monteil, Martin C.D. Speight, Daniele Sommaggio and
Jean-Pierre Sarthou
SYRPH THE NET: THE DATABASE OF EUROPEAN SYRPHIDAE
(DIPTERA)
Volume 58
Series Editors:
Martin C.D. Speight, Emmanuel Castella, Jean-Pierre Sarthou
& Claude Monteil
Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol. 58
SPECIES SELECTION TOOL FOR THE StN DATABASE, 2008
Partie 1 (Version française) : GUIDE D'UTILISATION DE L'ASSISTANT DE
SELECTION D'ESPECES DE LA BASE DE DONNEES « SYRPH THE NET »
Part 2 (English version): A GUIDE TO USE OF THE « SYRPH THE NET »
SPECIES SELECTION TOOL
Parte 3 (Versione italiana): UNA GUIDA ALL'UTILIZZO DEL SPECIES
SELECTION TOOL DI « SYRPH THE NETE »
Claude Monteil
UMR 1201 DYNAFOR INPT/ENSAT - INRA
École Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse
Avenue de l'agrobiopole, BP 32607, 31326 Auzeville-Tolosane, FRANCE
Martin C.D. Speight
Research Branch, Nat.Pks. & Wildlife Service
7 Ely Place, Dublin 2, IRELAND
Daniele Sommaggio
Biostudio
Via Riello 4, 36010 Velo d'Astico (VI), ITALY
Jean-Pierre Sarthou
UMR 1201 DYNAFOR INPT/ENSAT - INRA
École Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse
Avenue de l'agrobiopole, BP 32607, 31326 Auzeville-Tolosane, FRANCE
Syrph the Net: the database of European Syrphidae (Diptera)
Volume 58
Speight, M.C.D., Castella, E., Sarthou, J.-P. and Monteil, C (eds.)
Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol. 58
compilation of the Syrph the Net (StN) database initially received funding from:
contract STEP/CT90/0084 (Science and Technology for Environmental Protection),
European Commission
this publication may be referred to as:
Monteil, C, Speight, M.C.D., Sommaggio, D., and Sarthou, J.P. (2007). Species
Selection Tool for the StN Database, 2008. In: Speight, M.C.D., Castella, E.,
Sarthou, J.-P. and Monteil, C. (eds.) Syrph the Net, the database of European
Syrphidae, Vol. 58: 32 pp, Syrph the Net publications, Dublin.
ISSN 1393-4546 (Series)
Syrph the Net Publications
Dublin
2008
© M.C.D.Speight 2008
Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol. 58
Preface
This Guide details use of the StN Species Selection Tool software. It is in three parts,
each of which presents the same text in a different language. Part 1 is the French
version of the text, Part 2 the English version and Part 3 the Italian version.
The first version of the StN “Species Selection Tool" software was produced in 2006,
together with the first version of the Guide to its use. The present version of the Guide
has been produced to accompany the 2008 version of the Species Selection Tool and
to explain changes that have been introduced to the Selection Tool since 2006.
Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol.58
Partie 1: Guide d’utilisation de l’assistant de selection d’espèces
GUIDE D'UTILISATION DE L'ASSISTANT DE SELECTION D'ESPECES
DE LA BASE DE DONNEES « SYRPH THE NET »
Ce document constitue la première partie de la publication :
Monteil, C, Speight, M.C.D., Sommaggio, D., and Sarthou, J.P. (2008). Species
Selection Tool for the StN database, 2008. In: Speight, M.C.D., Castella, E., Sarthou,
J.-P. and Monteil, C. (eds.) Syrph the Net, the database of European Syrphidae, Vol.
58: 32 pp, Syrph the Net publications, Dublin.
TABLE DES MATIERES
1. OBJECTIF................................................................................................................6
2. TERMINOLOGIE...................................................................................................6
3. CODAGE DES INFORMATIONS CONTENUES DANS SYRPH THE NET .6
4. PRINCIPES DE BASE POUR LE PROCESSUS DE SÉLECTION..................7
4.1. SÉLECTION AU SEIN DE CHAQUE HABITAT CONSTITUTIF .......................................7
4.2. COMBINAISON GLOBALE AU NIVEAU DU SITE .......................................................7
5. UTILISATION DE L'ASSISTANT DE SÉLECTION D'ESPÈCES..................8
5.1. FEUILLE GLOBALE "SITE".....................................................................................8
5.1.1. Noms des espèces.........................................................................................8
5.1.2. Liste globale de sélection du site et filtrage des résultats ...........................9
5.1.3. Ensemble des sélections de chaque habitat constitutif ................................9
5.1.4. Outils additionnels .......................................................................................9
5.2. FEUILLES DE SÉLECTION DE CHAQUE HABITAT CONSTITUTIF ..............................10
5.2.1. Noms des espèces.......................................................................................10
5.2.2. Liste de sélection de l'habitat courant et filtrage des résultats .................10
5.2.3. Description de l'habitat principal et des habitats supplémentaires...........11
5.2.4. Outils additionnels .....................................................................................11
6. ETAPES DU PROCESSUS DE SÉLECTION D'ESPÈCES .............................12
7. MISE À JOUR DE SYRPH THE NET................................................................14
8. PRÉCAUTIONS D'EMPLOI ...............................................................................14
9. RÉFÉRENCES.......................................................................................................15
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol.58
Partie 1: Guide d’utilisation de l’assistant de selection d’espèces
1. Objectif
Le but du classeur Excel SelectionTool_2008.xls est de faciliter la constitution de
listes d'espèces de syrphes potentiellement attendues en un site donné à partir des
macrohabitats présents sur ce site. Auparavant, ce processus devait être effectué
manuellement, ce qui était à la fois fastidieux et long. Les listes d'espèces prédites
générées par l'assistant de sélection peuvent ensuite être exportées pour être utilisées
avec d'autres fichiers de Syrph the Net.
Le classeur SelectionTool_2008.xls doit être utilisé avec le classeur StN_2008.xls
contenant les macrohabitats définis dans la base de données Syrph the Net. Les
définitions des catégories d'habitats sont fournies dans le document
StN_Content&Glossary_2008 (versions doc et pdf).
Avant de décrire les fonctionnalités de l'assistant de sélection d'espèces, il est
important de bien comprendre les principes du processus de sélection mis en œuvre.
Le présent guide décrit d'abord la structure du fichier StN_2008.xls puis les principes
de son utilisation par l'assistant de sélection. Il développe ensuite les différentes
fonctions de l'assistant de sélection d'espèces et précise le schéma-type de son
utilisation.
La manière dont les listes d'espèces produites par l'assistant de sélection peuvent être
utilisées par les autres fichiers de Syrph the Net n'est pas détaillée ici. Plusieurs
applications ont été décrites dans Speight (2005), Speight and Castella (2001, 2005) et
Speight et al (2002). Par ailleurs, une vue d'ensemble de l'utilisation de la base de
données Syrph The Net est développée dans Speight et al (2000).
2. Terminologie
La terminologie suivante est utilisée :
• Un habitat (nom abrégé pour macrohabitat) correspond à une unité de petite
taille constituée d'un habitat principal (par exemple une prairie, une forêt, une
culture) éventuellement associé à un ou plusieurs habitats supplémentaires (par
exemple, un ruisseau, une mare temporaire, une source…) ;
• Un site (par exemple un Parc National) correspond à un ou plusieurs habitats. De
même, une station – correspondant à un lieu de piégeage de syrphes (par
exemple avec une tente Malaise) – est également constituée d'un ou plusieurs
habitats.
3. Codage des informations contenues dans Syrph the Net
Syrph the Net est constitué d'un classeur principal StN_2008.xls contenant 3 feuilles
de calcul décrivant les habitats : "Forest macrohabitats", "Open ground & wetland
macrohabs" et "Freshwater macrohabitats". Ces feuilles de calcul correspondent à une
table de données avec pour chaque ligne une espèce (plus de 600 espèces recensées au
niveau européen) et pour chaque colonne un élément d'habitat, avec des niveaux de
précision différents et hiérarchisés entre eux : par exemple, "Forest Macrohabitat
(gen.)" comprend pour partie "Deciduous Forests (gen.)" qui comprend pour partie
"Dry (in Deciduous Forests) (gen.)" qui comprend pour partie "Thermophilous
Quercus (in Dry Deciduous Forests) (gen.)" qui comprend pour partie "Overmature
(in Thermophilous Quercus Dry Deciduous Forests)").
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Partie 1: Guide d’utilisation de l’assistant de selection d’espèces
Deux types d'éléments d'habitat sont décrits :
• Des habitats principaux : chaque cellule à l'intersection d'une espèce et d'un
élément d'habitat principal peut contenir l'une des 3 valeurs suivantes, ou être
vide :
o 3 : espèce fortement attendue dans cet élément d'habitat
o 2 : espèce normalement attendue dans cet élément d'habitat
o 1 : espèce potentiellement attendue dans cet élément d'habitat si un autre
élément d'habitat supplémentaire est également favorable
Dans l'utilisation qui sera faite ici, les codes 2 et 3 joueront un rôle analogue (pas
de différenciation).
• Des habitats supplémentaires : chaque cellule à l'intersection d'une espèce et d'un
élément d'habitat supplémentaire peut contenir la valeur 1 ou être vide ;
lorsqu'elle contient 1, cela signale un indice de présence potentielle pour autant
que l'habitat principal au voisinage immédiat duquel se situe cet habitat
supplémentaire contient une présence potentielle de l'espèce (codage 1 parmi les
quatre états précédemment indiqués : valeurs de 1 à 3, ou pas de valeur).
4. Principes de base pour le processus de sélection
Le processus de sélection se décompose généralement en 2 niveaux :
(i)
un niveau global correspondant au site étudié et combinant les sélections
effectuées au niveau de chaque habitat constitutif du site ; dans les cas
simples, le site peut ne comporter qu'un seul habitat ;
(ii)
un niveau détaillé pour chaque habitat constitutif du site, dans lequel
chaque sélection pour un habitat constitutif résulte d'une combinaison
entre son habitat principal et ses éventuels habitats supplémentaires
associés ; dans les cas simples, un habitat peut se réduire à un habitat
principal sans aucun habitat supplémentaire associé.
4.1. Sélection au sein de chaque habitat constitutif
Une espèce est retenue pour un habitat si sa présence est attendue dans l'élément
d'habitat principal (code 2 ou 3). En outre, si sa présence n'est que potentielle dans
l'habitat principal (code 1), on retiendra l'espèce si au moins l'un des éventuels
habitats supplémentaires contient un indice de présence (code 1).
A ce stade, chaque espèce retenue se verra donc associée à un code 1, 2 ou 3 indiquant
la raison pour laquelle elle a été retenue (2 ou 3 si l'habitat principal seul a suffi, 1 s'il
a fallu la présence d'au moins un habitat supplémentaire pour lequel cette espèce est
codée 1). Si l'on ne s'intéresse qu'à constituer une simple liste d'espèces sans
différenciation des causes de présence, les 3 codes précédents pourront être signifié
sous forme d'un unique code 1 indiquant que l'espèce est retenue.
4.2. Combinaison globale au niveau du site
Une espèce est retenue pour un site si elle l'est pour au moins un des habitats
constitutifs du site selon la règle précédemment décrite. Si plusieurs habitats
retiennent l'espèce, le code affecté globalement au site sera le plus grand des codes
des habitats constitutifs. Ici encore, si l'on ne s'intéresse qu'à la constitution d'une liste
brute, on n'utilisera qu'un unique code 1.
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Partie 1: Guide d’utilisation de l’assistant de selection d’espèces
5. Utilisation de l'assistant de sélection d'espèces
L'assistant de sélection d'espèces est constitué du classeur Excel
SelectionTool_2008.xls associé à des fichiers PDF contenant chacun le guide
d'utilisation dans une langue donnée (actuellement le français et l'anglais). Le classeur
Excel est constitué d'une feuille principale décrivant le site, et d'autant de feuilles
auxiliaires correspondant chacune à un habitat constitutif.
Toutes les feuilles sont verticalement structurées en 2 zones :
• Une zone d'en-tête de 4 lignes (et 4 seulement)
• Une zone de données à raison d'une ligne par espèce, à l'instar du classeur
StN_2008.xls
Comme l'assistant de sélection utilise la base de données contenue dans ce dernier
classeur, il est nécessaire de l'ouvrir préalablement à l'ouverture de
SelectionTool_2008.xls ; en cas d'oubli, un message informatif le signale et
SelectionTool_2008.xls est automatiquement refermé.
Il est normal de voir apparaître à l'ouverture de SelectionTool_2008.xls la fenêtre
d'alerte "macro" d'Excel (s'il est configuré comme tel, ce qui est hautement
recommandé par mesure de sécurité contre les virus). Les versions récentes d'Excel
comportent 3 niveaux de sécurité :
• Sécurité élevée: les macros du classeur sont automatiquement désactivées (à
moins que le classeur ait fait l'objet d'une « signature numérique » en vue de sa
diffusion)
• Sécurité moyenne : une fenêtre d'alerte-macro s'affiche, invitant l'utilisateur à
activer ou désactiver les macros ; en présence d'un classeur Excel dont on ne
connaît pas l'origine, le réflexe doit être de désactiver les macros, qui sont
généralement des « macro-virus » susceptibles de perturber ou endommager le
fonctionnement de l'ordinateur ! Pour le présent classeur SelectionTool_2008.xls,
il faudra bien évidemment activer les macros afin de pouvoir exécuter toutes les
fonctionnalités
• Sécurité faible : les macros du classeur sont automatiquement activées ; en
particulier, si une macro est attachée à l'évènement « ouverture du classeur », son
exécution est lancée (c'est ainsi que procèdent tous les virus de macro) : il est
évident qu'il ne faut jamais configurer Excel (ou toute autre application) sur un
niveau faible de sécurité !
Les versions récentes d'Excel ont une configuration par défaut avec un niveau de
sécurité élevé, qui ne nous permet pas d'exécuter SelectionTool_2008.xls. Il faut
donc passer en niveau moyen de sécurité : valider le menu « Outils / Macro /
Sécurité... », onglet « Niveau de sécurité », et cocher « Moyenne ». Attention : il faut
quitter Excel et le rouvrir pour que ce nouveau réglage prenne effet.
5.1. Feuille globale "Site"
Elle est horizontalement subdivisée en 3 zones : nom des espèces à gauche de la
feuille, puis liste de sélection globale, et enfin listes de sélection de chaque habitat
constitutif.
5.1.1. Noms des espèces
La première colonne de la feuille contient la liste des noms de toutes les espèces
recensées dans Syrph the Net.
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Partie 1: Guide d’utilisation de l’assistant de selection d’espèces
5.1.2. Liste globale de sélection du site et filtrage des résultats
La colonne "LISTE GLOBALE" (ou "COMBINED LIST") (colonne D de la feuille)
correspond au résultat final du processus de sélection, avec pour chaque espèce une
valeur de 1 à 3 si elle est retenue, ou aucune valeur sinon ; pour chaque code de
sélection présent, une couleur de fond permet de le mettre en valeur (jaune pour le
code 1, vert pour les codes 2 et 3 qui ont une signification proche)
Une flèche de filtrage située dans la cellule de titre de cette colonne permet
respectivement d'afficher :
• Les lignes correspondant à une valeur numérique de code particulière (les autres
lignes étant masquées)
• les lignes correspondant uniquement aux espèces sélectionnées (choix "Non
vides") ou au contraire celles qui n'ont pas été retenues (choix "Vides")
• les lignes vérifiant une condition particulière (choix "Personnalisé) : par exemple,
celles dont le code est supérieur ou égal à 2
• toutes les lignes : choix "Tous" pour supprimer le filtrage et rétablir un affichage
standard
5.1.3. Ensemble des sélections de chaque habitat constitutif
Chaque colonne située à droite de la liste globale de sélection correspond à la
sélection de l'un des habitats constitutifs du site :
• chaque colonne affiche le résultat de la sélection du site si la case présente dans la
cellule d'en-tête est cochée ; si elle ne l'est pas, les affichages des codes
disparaissent, désactivant ainsi la prise en compte de cet habitat pour la prédiction
globale du site
• la cellule de titre contient le code alphanumérique caractérisant l'habitat
élémentaire de Syrph the Net (par exemple, 11 pour "Deciduous Forest")
correspondant à la composante principale de l'habitat constitutif du site ; en outre,
si l'on survole cette cellule avec la souris, un nom plus explicite apparaît sous
forme d'info-bulle
• la cellule de titre est cliquable (lien hypertextuel) et permet d'aller directement
sur la feuille de sélection de l'habitat correspondant (cf. descriptif ci-dessous)
• les cellules situées au dessus de la cellule de titre récapitulent les nombres
d'espèces correspondant à chacun des codes de sélection possibles ; on peut
afficher le total global en décochant la case "Detailed Codes" (cf. ci-après)
5.1.4. Outils additionnels
Divers outils d'interface sont présents dans le coin supérieur gauche de la feuille :
• case à cocher "Black & White" : elle permet de supprimer les couleurs de fond
qui apparaissent normalement dans les cellules contenant un code de sélection ;
ceci peut être utile dans le cas d'une impression-papier de la feuille
• case à cocher "Detailed Codes" : elle permet de basculer entre un affichage des
codes détaillés (1, 2 et 3) et celui d'un simple affichage booléen (tous les codes de
sélection étant fusionnés en un unique code 1) ; dans le cas d'un affichage
détaillé, les nombres d'espèces sélectionnés pour le site global et chaque habitat
constitutif apparaît dans la zone supérieure de la feuille ; si l'affichage n'est pas
détaillé, seul apparaît le total des espèces sélectionnées
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Partie 1: Guide d’utilisation de l’assistant de selection d’espèces
•
•
•
•
case à cocher "Copy with sp. names" en association avec l'icône de
recopie de la sélection : un clic sur cette icône permet de placer dans le
presse-papier l'ensemble des codes de la plage de sélection globale ; si la case est
cochée, la liste des noms des espèces est également copiée dans le presse-papier ;
ceci permet de coller ensuite rapidement dans un autre classeur Excel ou dans une
autre application le résultat de la sélection en cours ; si l'on utilise l'icône de
recopie de la sélection après avoir activé un filtrage sur des valeurs particulières
de la colonne de sélection (cf. bouton "flèche de filtrage" précédemment décrit),
seules seront placées dans le presse-papiers les informations correspondant aux
lignes visibles
boutons "Add new habitat" et "Remove curr. habitat" : ils permettent
respectivement d'ajouter ou de supprimer un habitat constitutif du site :
o ajout d'habitat : un nouvel habitat est ajouté en plus des habitats existants, ce
qui se traduit par l'ajout d'une nouvelle feuille d'habitat dans le classeur, et
l'ajout d'une nouvelle colonne dans la feuille de sélection globale du site ; le
nouvel habitat créé est initialisé avec l'habitat "1-FOREST
MACROHABITATS (gen.)" (premier habitat du groupe "Forest
Macrohabitats"), associé à 2 habitats supplémentaires (apparaissant dans des
colonnes juxtaposées à droite) désactivés (cases non cochées) ; on peut
potentiellement rajouter jusqu'à 99 habitats
o suppression d'habitat : après confirmation explicite, la colonne d'habitat
courante (sur laquelle le curseur est actuellement positionné) est supprimée
ainsi que sa feuille de calcul associée
bouton "Help" : il permet l'accès au guide d'utilisation en diverses langues
bouton "Reinit" : il réinitialise l'ensemble de l'application en supprimant tous les
habitats du site à l'exception des 2 premiers, dans lesquels sont également
supprimés tous les habitats supplémentaires sauf 2.
5.2. Feuilles de sélection de chaque habitat constitutif
Tout comme la feuille globale de site, chaque feuille décrivant un habitat constitutif
est horizontalement subdivisée en 3 zones : noms des espèces, colonne "SELECTED
SPECIES" des espèces prédites, colonnes de description de chaque habitat (principal
et supplémentaires) constituant l'habitat de la feuille.
5.2.1. Noms des espèces
La première colonne de la feuille contient la liste des noms de toutes les espèces
recensées dans Syrph the Net.
5.2.2. Liste de sélection de l'habitat courant et filtrage des résultats
La colonne "LISTE DE SELECTION" (ou "SELECTED SPECIES") (colonne D de la
feuille) correspond à la sélection des espèces compatibles avec l'habitat courant, avec
pour chaque espèce une valeur de 1 à 3 si elle est retenue, ou aucune valeur sinon ;
pour chaque code de sélection présent, une couleur de fond permet de le mettre en
valeur (jaune pour le code 1, vert pour les codes 2 et 3 qui ont une signification
proche).
Une flèche de filtrage situé dans la cellule de titre de cette colonne permet
respectivement d'afficher :
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•
•
•
•
les lignes correspondant à une valeur numérique de code particulier (les autres
lignes étant masquées)
les lignes correspondant uniquement aux espèces sélectionnées (choix "Non
vides") ou au contraire celles qui n'ont pas été retenues (choix "Vides")
les lignes vérifiant une condition particulière (choix "Personnalisé) : par exemple,
celles dont le code est supérieur ou égal à 2
toutes les lignes : choix "Tous" pour supprimer le filtrage et rétablir un affichage
standard
5.2.3. Description de l'habitat principal et des habitats supplémentaires
La description complète de l'habitat courant contient d'une part une colonne
définissant l'habitat principal, et d'autre part une succession de colonnes
correspondant chacune à la définition d'un habitat supplémentaire :
• chaque colonne affiche le code brut de la base de données Syrph the Net pour
l'habitat sélectionné en haut de la colonne ; pour les habitats supplémentaires, la
case à cocher présente dans la zone d'en-tête permet d'activer ou de désactiver la
prise en compte de cet habitat : dans ce dernier cas, la colonne apparaîtra vide et
grisée
• la zone d'en-tête des colonnes permet de définir les habitats par sélection dans des
listes déroulantes ; pour la colonne d'habitat principal, on définit en premier le
groupe global auquel appartient l'habitat, puis dans une 2ème liste de choix
l'habitat souhaité ; pour les autres colonnes (habitats supplémentaires), seule est
disponible cette dernière liste de choix ; le contenu des listes de choix d'habitats
principal et supplémentaires est modifié selon le choix de groupe de
macrohabitats préalablement fixé ; chaque choix dans une liste déroulante
entraîne une réactualisation automatique des diverses listes de sélection
d'espèces dans la feuille de l'habitat courant et dans la feuille globale de
sélection au niveau du site
• les cellules situées au dessus de la colonne de sélection des espèces (LISTE DE
SELECTION) récapitulent les nombres d'espèces correspondant à chacun des
codes de sélection possibles ; on peut afficher le total global en décochant la case
"Detailled codes" (cf. ci-après)
5.2.4. Outils additionnels
Divers outils d'interface sont présents dans le coin supérieur gauche de la feuille :
• la cellule "Back to global site selection" située sur le bord gauche de la feuille
au niveau de la zone d'en-tête (ligne 4) est cliquable (lien hypertextuel) et
permet d'accéder directement à la feuille globale du site ; lorsque cette dernière
feuille s'ouvrira, la colonne correspondant à l'habitat que l'on vient de quitter
apparaîtra sélectionnée
• case à cocher "Black & White" : elle a le même rôle que pour la feuille globale
du site : suppression des couleurs de fond qui apparaissent normalement dans les
cellules contenant un code de sélection ; tout comme précédemment, cette action
est globale sur l'ensemble de l'application
• case à cocher "Detailed Codes" : elle a le même rôle que pour la feuille globale
du site : bascule entre un affichage des codes détaillés (1, 2 et 3) et celui d'un
simple affichage booléen (tous les codes de sélection étant fusionnés en un
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Partie 1: Guide d’utilisation de l’assistant de selection d’espèces
•
•
unique code 1) ; toute action faite au niveau d'un quelconque habitat est
répercutée dans tous les autres et au niveau de la feuille globale du site
case à cocher "Copy with sp. names" en association avec l'icône de
recopie de la sélection : un clic sur cette icône permet de placer dans le
presse-papier l'ensemble des codes de la plage de sélection de la feuille ; si la
case est cochée, la liste des noms des espèces est également copiée dans le pressepapier ; ceci permet de coller ensuite rapidement dans un autre classeur Excel ou
dans une autre application le résultat de la sélection en cours
boutons "Add new suppl. hab." et "Remove curr. suppl. hab." : ils
permettent respectivement d'ajouter ou de supprimer un habitat supplémentaire
associé à l'habitat principal de la feuille :
o ajout d'habitat supplémentaire : un nouvel habitat supplémentaire est ajouté
en plus des habitats supplémentaires existants, sous forme d'une nouvelle
colonne en partie droite de la feuille ; le nouvel habitat supplémentaire créé
est initialisé avec les valeurs de l'habitat supplémentaire précédent (à sa
gauche) ; on peut potentiellement rajouter jusqu'à 99 habitats
supplémentaires par feuille
o suppression d'habitat supplémentaire : après confirmation explicite, la
colonne d'habitat supplémentaire courante (sur laquelle le curseur est
actuellement positionné) est supprimée
6. Etapes du processus de sélection d'espèces
1) Faire une copie du fichier SelectionTool_2008.xls de manière à conserver la
version originale du fichier. Chaque copie de ce fichier peut avoir un nom
quelconque, signifiant pour l'usager (par exemple avec le nom du site sur lequel est
opérée la sélection).
NB: on peut également faire une copie de sauvegarde du fichier StN_2008.xls ; il
est cependant indispensable d'utiliser le fichier original portent ce nom pour
travailler avec l'assistant de sélection d'espèces.
2) Ouvrir le fichier StN_2008.xls.
3) Ouvrir la copie de travail de l'assistant de sélection d'espèce (et cliquer sur le
bouton "Activer les macros" lorsque la fenêtre de vérification de présence de macros
apparaît)
4) Cliquer sur l'onglet "Habitat01" (la feuille "Habitat01" fera apparaître l'habitat
principal par défaut 1 ("Forest macrohabitats") avec 2 habitats supplémentaires (par
défaut, habitats 211f et 234f)
5) Cliquer sur la liste de choix supérieure qui apparaît sous le titre "MAIN
HABITAT" et choisir la catégorie voulue parmi les 4 grandes classes d'habitats.
6) Cliquer sur la liste de choix inférieure qui apparaît sous le titre "MAIN
HABITAT" et choisir l'habitat principal voulu : la colonne correspondante de la
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Partie 1: Guide d’utilisation de l’assistant de selection d’espèces
feuille "Site" est mise à jour en conséquence, avec en son en-tête l'utilisation du code
StN correspondant et sous forme de commentaire le nom de cet habitat.
7) S'il n'y a pas besoin d'habitat supplémentaire, les désactiver en enlevant la coche
des cases à cocher situées dans l'en-tête des 2 colonnes "SUPPLEMENTARY
HABITATS" (les colonnes correspondantes sont alors grisées).
8) S'il y a besoin d'1 seul habitat supplémentaire associé à l'habitat principal choisi,
enlever la coche de la case à cocher de la colonne intitulée "Suppl.hab.02" de manière
à la désactiver, puis sélectionner avec la liste déroulante de la colonne "Suppl.hab.01"
l'habitat supplémentaire voulu.
9) S'il y a besoin de 2 habitats supplémentaire associés à l'habitat principal choisi,
sélectionner avec les listes déroulantes des colonnes "Suppl.hab.01" "Suppl.hab02" les
habitats supplémentaires voulus.
10) Si le site ne contient qu'un seul habitat, sélectionner la feuille "Site" et désactiver
le second habitat en enlevant la coche située sur la colonne correspondante
11) Si le site contient 2 habitats, réitérer les étapes 5 à 9 précédentes pour définir les
composants de ce second habitat en utilisant la feuille nommée "Habitat02".
12) Si le site contient plus de 2 habitats, cliquer sur le bouton "Add new Habitat"
de la feuille "Site" : une nouvelle colonne apparaît dans la feuille "Site", associée à
une nouvelle feuille d'habitat dont l'onglet apparaît dans la liste des onglets au bas de
la feuille, avec le nom HabitatNN (par exemple Habitat03).
13) Cliquer sur l'onglet de la nouvelle feuille d'habitat (ou sur le numéro de code
affiché dans l'en-tête de la colonne correspondante).
14) Cliquer sur la liste déroulante supérieure de la colonne "MAIN HABITAT" et
choisir la catégorie générale d'habitat voulue.
15) Cliquer sur la liste déroulante inférieure de la colonne "MAIN HABITAT" et
choisir l'habitat voulu.
16) S'il y a besoin de 2 habitats supplémentaires ou moins, utiliser l'étape 7, 8 ou 9
correspondante. S'il y en a besoin de plus de 2, cliquer sur le bouton "Add new
suppl. hab." et choisir l'habitat voulu avec la liste déroulante placée dans l'en-tête de
la colonne nouvellement créée:
o chaque choix d'habitat supplémentaire met à jour la colonne "SELECTED
SPECIES" dans la feuille courante, ainsi que la colonne correspondante dans
la feuille "Site"
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol.58
Partie 1: Guide d’utilisation de l’assistant de selection d’espèces
o la case à cocher de la colonne d'habitat supplémentaire permet
d'inclure ou exclure cette colonne dans le processus de sélection ; quand
une colonne est exclue, elle apparaît en grisé
17) Le résultat du processus complet de sélection apparaît dans la colonne
"COMBINED LIST" de la feuille "Site", qui combine les "SELECTION LIST" de
chaque habitat pris en compte, chacun d'entre eux pouvant être exclu ou inclus via la
case à cocher présente dans son en-tête
18) On peut exporter la colonne "COMBINED LIST" du site pour l'utiliser dans
d'autres classeurs Excel ou documents Word :
a. copier dans le presse-papier la liste "COMBINED LIST" en cliquant sur la
petite icône de copie ( )
b. coller le presse-papier dans le fichier voulu
c. on peut associer ou non la liste des noms d'espèces en cochant ou non la
case à cocher "Copy with sp. names"
7. Mise à jour de Syrph the Net
Le présent classeur SelectionTool_2008.xls est conçu pour fonctionner avec la
version StN_2008.xls correspondante et peut gérer automatiquement certaines mises à
jour de ce dernier fichier :
• toute modification d'une valeur de cellule dans le fichier StN_2008.xls est prise
en compte dans l'assistant de sélection d'espèces, que ce soit dans les codes de
préférences ou dans les libellés d'habitats ou d'espèces
• l'ajout de nouvelles espèces est également automatiquement géré dès qu'il est
saisi dans la feuille "Open ground & wetland macrohabs" ; il est conseillé de
saisir directement la nouvelle espèce à la fin de la table déjà existante, puis de
faire un tri des lignes sur l'ordre des noms d'espèces
En revanche, l'ajout de nouveaux traits d'habitats n'est pas pris en compte, cette
opération nécessitant des modifications de structure dans l'assistant de sélection
d'espèces.
8. Précautions d'emploi
Il est totalement déconseillé d'insérer ou supprimer manuellement des lignes ou
colonnes dans l'une quelconque des feuilles constituant le classeur
SelectionTool_2008.xls, ou encore de modifier manuellement le contenu de l'une
quelconque des cellules. L'utilisateur qui souhaite malgré tout se hasarder dans ce
genre de pratique le fait à ses propres risques et périls ! Pour des raison de non
compatibilité avec la version 2000 (ou antérieure) d'Excel, il n'a pas été possible de
mettre en place un mécanisme de protection automatique des feuilles et de la structure
du classeur empêchant d'effectuer ce genre de modifications.
Par contre, il est tout à fait possible d'enregistrer le classeur SelectionTool_2008.xls
sous un nom différent de manière à sauvegarder une étude particulière faite sur un site
donné.
Il est par ailleurs recommandé de conserver une copie de sécurité du classeur
SelectionTool_2008.xls initial.
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol.58
Partie 1: Guide d’utilisation de l’assistant de selection d’espèces
9. Références
SPEIGHT, M.C.D. (2005) An "expert system" approach to development of decision
tools for use in maintenance of invertebrate biodiversity in forests. PanEuropean Ecological Network in forests: Conservation of biodiversity and
sustainable management. Proc.5th Internat. Symposium, Pan-European
Ecological Network. Environmental Encounters No.57, 133-141. Council of
Europe, Strasbourg.
SPEIGHT, M. C. D. & CASTELLA, E. (2001) An approach to interpretation of lists of
insects using digitised biological information about the species. Journal of
Insect Conservation. 5: 131-139.
SPEIGHT, M. C. D. & CASTELLA, E. (2005a) Assessment of subalpine grassland and
heath sites in Haute-Savoie using Syrphidae (Diptera). In: Speight, M.C.D.,
Castella, E., Sarthou, J.-P. and Monteil, C. (eds.) Syrph the Net, the database of
European Syrphidae, vol. 46, 37 pp., Syrph the Net publications, Dublin.
SPEIGHT, M.C.D., CASTELLA, E. & OBRDLIK, P. (2000) Use of the Syrph the Net
database 2000. In: Speight, M.C.D., Castella, E., Obrdlik, P. and Ball, S.
(eds.) Syrph the Net, the database of European Syrphidae , vol.25, 99 pp.,
Syrph the Net publications, Dublin
SPEIGHT M.C.D., GOOD, J.A. & CASTELLA, E. (2002) Predicting the changes in farm
syrphid faunas that could be caused by changes in farm management regimes
(Diptera: Syrphidae). Volucella, 6: 125-137.
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol.58
Part 2: Guide to use of the StN Species Selection Tool
A GUIDE TO USE OF THE StN SPECIES SELECTION TOOL
This document is the second part of the publication:
Monteil, C, Speight, M.C.D., Sommaggio, D., and Sarthou, J.P. (2008). Species
Selection Tool for the StN database, 2008. In: Speight, M.C.D., Castella, E., Sarthou,
J.-P. and Monteil, C. (eds.) Syrph the Net, the database of European Syrphidae,
Vol.58, 32 pp, Syrph the Net publications, Dublin.
CONTENTS
1. PURPOSE OF THE SPECIES SELECTION TOOL ........................................13
2. TERMINOLOGY ..................................................................................................13
3. ANATOMY OF THE STN MACROHABITATS FILE ....................................13
4. BASIC PRINCIPLES OF USE OF THE STN MACROHABITATS FILE
DATA BY THE SELECTION TOOL .....................................................................14
4.1. SPECIES SELECTION AT THE SINGLE HABITAT LEVEL ..........................................14
4.2. SPECIES SELECTION AT THE SITE LEVEL ..............................................................14
5. ANATOMY OF THE SPECIES SELECTION TOOL......................................15
5.1. THE"SITE" WORKSHEET .....................................................................................15
5.1.1. Species names ............................................................................................16
5.1.2. Combined List ............................................................................................16
5.1.3. The lists of species selected for individual habitats...................................16
5.1.4. Additional options......................................................................................17
5.2. WORKSHEETS FOR INDIVIDUAL HABITATS ..........................................................17
5.2.1. Species names ............................................................................................17
5.2.2. List of selected species ...............................................................................17
5.2.3. Additional options......................................................................................18
6. CARRYING OUT THE SELECTION PROCEDURE......................................19
7. UPDATING OF STN FILES ...............................................................................21
8. WARNING .............................................................................................................21
9. REFERENCES.......................................................................................................22
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol.58
Part 2: Guide to use of the StN Species Selection Tool
1. Purpose of the Species Selection Tool
The purpose of the Excel file SelectionTool_Dec2007.xls is to automate the
production of lists of the syrphid species predicted to occur on a site in association
with the habitats present on that site, using the species/habitat association data coded
into the Syrph the Net (StN) Macrohabitats file. Previously, this process had to be
carried out manually, which was both tedious and time-consuming. The lists of
predicted species engendered using the Selection Tool can be exported from that file
for use with the other StN files.
The file SelectionTool_Dec2007.xls has to be used in conjunction with the file
StN_2007.xls that contains a specially modified version of the StN Macrohabitats
worksheets from the last issue of the database. Definitions of the habitat categories
used are provided separately, in the text file StN_Content&Glossary_2007 (doc and
pdf).
This text firstly outlines the anatomy of the file StN_2007.xls and the basic principles
of its use by the Selection Tool. It then describes the anatomy of the Selection Tool
file, explaining the functions of its various components, and goes on to sketch the
operational procedure to follow in using it. The ways in which the lists of species it
produces can be used with the other StN files are not detailed here. Various
applications are described in Speight (2005), Speight and Castella (2001, 2005) and
Speight et al (2002). A more general overview of use of the StN database is provided
by Speight et al (2000).
2. Terminology
The following terminology is used in the Selection Tool:
A habitat (short for macrohabitat) is a unit of variable size comprising a main
habitat (for example a grassland, a forest, a crop) plus any supplementary
habitats that occur within it (for instance a stream, a temporary pool, a spring) ;
A site (for example a National Park) may comprise one or more habitats. Similarly, a
station – a location at which sampling of syrphids is carried out (for instance
using Malaise traps) – may comprise one or more habitats.
3. Anatomy of the StN Macrohabitats file
Central to use of the Syrph the Net database (StN) are the Macrohabitats worksheets.
There are three Macrohabitats worksheets, "Forest macrohabitats", "Open ground &
wetland macrohabs" and "freshwater macrohabitats". In these worksheets each line
provides the information for one species (more than 600 European species are
covered) and each column treats one habitat category. The habitat categories are
arranged in nested series. For instance, the column for "Forest Macrohabitat (gen.)" is
followed by a column for the more specific category "Deciduous Forests (gen.)", that
is itself followed by "Dry (deciduous) Forest (gen.)" and "Humid (deciduous) Forest",
each of which is then further subdivided into particular forest types in subsequent
columns, for instance "Fagus (humid deciduous) Forest" and "acidophilous (humid
deciduous) Quercus Forest". Each forest habitat type is further subdivided into
"overmature", "mature" and sapling" categories, defining the highest degree of
precision reached for forest habitats. Following the sequence of deciduous forest
habitat categories other series of columns similarly cover "Wet woodland", "Broadleaved, evergreen forests", "Scrub" and "Coniferous Forest" categories.
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol.58
Part 2: Guide to use of the StN Species Selection Tool
Two classes of habitat are recognised in the Macrohabitats worksheets, main habitats
and supplementary habitats. These two classes of habitat are coded differently in the
worksheets:
Main habitats: the cell lying at the intersection of the line for a species with the
column for a principal habitat is coded to express the degree of association
between that species and that habitat, on a scale of 1 to 3, or remains blank :
o 3 : the species is strongly predicted to occur in association with this habitat
o 2 : the species is normally expected to occur in association with this habitat
o 1 : the species is predicted to occur in this habitat only when one or another
of the supplementary habitats is also present
o blank cell: there is no known association between the species and this
habitat
In the use made of the coding by the selection tool, codes 2 and 3 play the same
role i.e. no distinction is made between them
Supplementary habitats: the cell lying at the intersection of the line for a species
with the column for a supplementary habitat is either coded 1 or remains blank. If
it is coded 1 this signals a possibly presence of the species if the corresponding
main habitat is also coded 1 for this species.
4. Basic principles of use of the StN Macrohabitats file data
by the Selection Tool
The selection procedure can operate at two levels:
(i)
single habitat level: each species selection provides a species list for one
main habitat plus the supplementary habitats observed with it; in the
simplest case no supplementary habitats would be present, so that the
selection process produces the potential list for a main habitat alone.
(ii)
site level: combines the species selections made for all habitats present on
a site to give a potential list for the entire site; only in the simplest case
would a single habitat be present.
4.1. Species selection at the single habitat level
In the selection procedure a species is retained for a main habitat represented on a site
if the presence of that species in that habitat is predicted at code level 2 or 3 in the
Macrohabitats file. A species coded 1 for the same main habitat is only retained if the
column for a supplementary habitat present with that main habitat is also coded 1 for
that species in the Macrohabitats file. At this stage, each selected species thus shows a
coding of 1, 2 or 3, indicating why it has been retained. If one is interested only in
obtaining a simple list of the species predicted to occur in association with a habitat,
without concern for which species are dependent upon presence of supplementary
habitats, the coding of all the selected species can be converted to 1, indicating simply
that they are retained.
4.2. Species selection at the site level
A species is retained in the list predicted for a site if that species is selected for at least
one of the habitats present on the site, as described in the preceding paragraph. If a
species is selected for more than one of the habitats present the coding retained for the
species is the highest given to it for any of the habitats involved. But if one is
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol.58
Part 2: Guide to use of the StN Species Selection Tool
interested only in obtaining a simple list of the species predicted to occur in
association with a site, the coding of all the selected species can be converted to 1,
indicating simply that they are retained.
5. Anatomy of the Species Selection Tool
The Species Selection Tool comprises an Excel file SelectionTool_Dec2007.xls
associated with several PDF files corresponding to the user's guide in several
languages (currently in French and English). The Excel file comprises a main
worksheet (Site) and a series of auxiliary worksheets (Habitats). In the main
worksheet the species selected for the entire site (i.e. all habitats on the site) are
treated together, while each auxiliary sheet lists the species selected for one habitat.
All of the worksheets are vertically structured, in two zones:
A header zone of 4 lines (and 4 only)
A zone of records with one line per species, the species coverage, nomenclature and
order being identical with that found in other files of the current version of
StN_2007.xls
Because the selection tool uses the StN Macrohabitats file it is necessary to open that
file before opening the SelectionTool_Dec2007.xls file. If the Selection Tool file is
opened first, a message appears on the screen indicating that the Macrohabitats file is
not open, and the SelectionTool_Dec2007.xls file is automatically closed.
It is normal that, following opening of the Selection Tool file, the Excel "macro"
warning appears (this is an inbuilt, anti-virus security measure of Excel), when using
older versions of Excel. When this happens click on the "Activate macros" option, to
proceed. In more recent versions of Excel three levels of security are provided and
activation of macros can involve a more complex procedure.
High security: macros are automatically deactivated (unless the file has been
provided with a "numeric signature" in anticipation of being generally
distributed)
Moderate security: a macro warning window appears, that enables the user to
activate or deactivate macros; in the presence of an XL file of unrecognised
origin the Excel default option is to deactivate macros, in order to guard against
macro-viruses that may damage or disrupt computer function. To use the
Selection Tool file it is necessary to activate the macros
Low level security: the file macros are automatically activated; in particular, if a
macro is attached to the "open file" command, its operation is initiated (as with
all the macro-viruses): clearly, it is necessary to ensure that Excel is never
configured to operate at the Low level of security!
The default option in recent versions of Excel is to configure the software to operate
at High security level. This prevents use of the file SelectionTool_Dec2007.xls. In
this situation it is thus necessary to change Excel configuration to operate at
Moderate security level: click on Tools/Macro/Security, then on the tab "security
level", and choose "Moderate". NB: it is necessary to exit and re-open Excel before
this change takes effect.
5.1. The"Site" worksheet
This worksheet is subdivided into 3 sections: the first section, one column at the left
of the sheet, gives the species names; the second section gives the combined list of all
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
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Part 2: Guide to use of the StN Species Selection Tool
species selected (i.e. the species predicted for the entire site); the third section shows
the species selected for each of the habitats treated (i.e. each of the habitats observed
on the site), using one column per habitat.
When the "Site" worksheet is opened it will be found to display already 2 columns for
main habitats. These columns form an integral part of the structure of the file and
cannot be deleted. The habitats covered by these two columns can be altered to suit
the requirements of the user. The default option (i.e. the habitat categories showing in
these columns when the "Site" worksheet is first opened) consigns the first of these
two columns to StN Macrohabitat category 1, "Forest Macrohabitats (general)" and
the other column to StN Macrohabitat category 51, "Crops".
5.1.1. Species names
The species names given in the first column are shown as they appear in the StN
Macrohabitats file.
5.1.2. Combined List
The "Combined List" column (column D of the worksheet) presents the final product
of the selection procedure, with each selected species showing a value of 1-3, if the
coding has been retained, or otherwise showing a "1". In this column the cells are
colour coded, so that the cells showing 1 appear in yellow, and those showing 2 or 3
appear green.
A filter arrow located in the title cell of this column permits the identification of
lines that have particular attributes:
Lines that have a particular coding value (the other lines are then masked)
Lines that correspond uniquely to species selected (choose "not-empty"), or to nonselected species (choose "empty")
Lines that have a particular combination of coding values (choose "personalised"):
for example those for which the selection is based on a code of 2 or 3.
All lines: choose "all", to annul the filtering process and return to the standard
presentation.
5.1.3. The lists of species selected for individual habitats
Each column situated to the right of the Combined List column provides the list of
species selected for one of the habitats observed on the site. In each of these columns:
The species that have been selected are shown if the box in the cell at the column
head shows a tick. If the tick is removed for one of these columns the codes
showing for species in that column disappear and the species added to the
Combined List by that habitat are also removed from the Combined List
The title cell to the column contains the alphanumeric code given in the file
StN_2007.xls to the main habitat treated by the column (for example, 11 for
"deciduous forest"); in addition, if this cell is superimposed by the cursor a more
detailed description of the habitat is given, in a comment box
The title cell is clickable (hyperlink), to show directly the worksheet where the
species listed for that habitat were selected (see below)
The cells above the title cell show the maximum numbers of species that can be
selected for that habitat at each value level; the equivalent totals for the
Combined List can be seen by checking on "Detailed Codes" (see below).
16
Species Selection Tool for the StN Database, 2008
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Part 2: Guide to use of the StN Species Selection Tool
5.1.4. Additional options
Various additional options are provided at the upper left corner of the worksheet:
Check box "Black & White": deletes the background colours showing in the cells
of the selected species.
Check box "Detailed Codes": permits alternation between display of species
selection values 1-3 and display of solely the value 1, to indicate the selected
species. In the detailed codes display the number of species selected for the site
and for each component habitat is shown in the header zone of the worksheet; the
display otherwise shows only the total number of species selected.
Check box "Copy with sp. names": in conjunction with the icon for
recopying the selection, one click on this icon makes it possible to print out
a copy of the species list for the site, together with the selection values for each of
the selected species; similarly, it permits copying of the selected list to another
XL file; clicking on this icon after first having filtered the selection by restricting
it to species of one selection value makes it possible to copy to another file, or to
the printer, the list of selected species with this selection value (see above, under
filter arrow).
Buttons "Add new habitat" and "Remove curr. habitat": these permit addition of
a main habitat to, or deletion of a main habitat from, the set of habitats that
contribute to the Combined List for a site:
o habitat addition: up to 99 main habitats (maximum) can be included in the
selection process for a site
o habitat deletion: a main habitat can be deleted, along with its associated
worksheet, by first selecting the habitat concerned, then clicking on “remove
curr.habitat”, on the “general selection” page and finally clicking in the
confirmation box that deletion of this habitat is required
Button "Help": clicking on this button provides access to the linguistic versions of
the user's guide
Button "Reinit": clicking on this button returns the "Selection Tool" file to the
condition it was in when it was last saved.
5.2. Worksheets for individual habitats
Each worksheet for an individual habitat is structured in the same way as the Site
worksheet, with three sections, the first section being the column of species names,
the second the column of selected species and the third section the column for the
main habitat and associated supplementary habitats treated by the worksheet.
5.2.1. Species names
The species names given in the first column are shown as they appear in the file
StN_2007.xls.
5.2.2. List of selected species
The column "SELECTED SPECIES" (column D of the worksheet) presents the
product of the selection procedure for the habitat treated by the worksheet, with each
selected species showing a value of 1-3, if the coding has been retained, or otherwise
showing a "1". In this column the cells are colour coded, so that the cells showing 1
appear in yellow, while those showing 2 or 3 appear green.
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
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Part 2: Guide to use of the StN Species Selection Tool
A filter arrow located in the title cell of this column permits the identification of lines
that have particular attributes:
Lines that have a particular coding value (the other lines are then masked).
Lines that correspond uniquely to species selected (choose "not-empty"), or to nonselected species (choose "empty").
Lines that have a particular combination of coding values (choose "personalised"):
for example those for which the selection is based on a code of 2 or 3.
All lines: choose "all" to return to the standard presentation.
5.2.3. Additional options
Various additional options are provided at the upper left corner of the worksheet:
The cell "back to global selection", located on the left side of the worksheet, at the
level of line 4 in the header zone, provides direct access to display of the "site"
worksheet by clicking on it (hyperlink). While the "site" worksheet is showing,
the column that shows the species selected for the last habitat treated is shown
highlighted on that worksheet.
Check box "Black & White": deletes the background colours showing in the cells
of the selected species
Check box "Detailed Codes": permits alternation between display of species
selection values 1-3 and display of solely the value 1, to indicate the selected
species. In the detailed codes display the number of species selected for the site
and for each component habitat is shown in the header zone of the worksheet; the
display otherwise shows only the total number of species selected.
Check box "Copy with sp. names": in conjunction with the icon for
recopying the selection, one click on this icon makes it possible to print out
a copy of the species list for the site, together with the selection values for each of
the selected species; similarly, it permits copying of the selected list to another
XL file; clicking on this icon after first having filtered the selection by restricting
it to species of one selection value makes it possible to copy to another file, or to
the printer, the list of selected species with this selection value (see above, under
filter arrow).
Buttons "Add new suppl. hab." and "Remove curr. suppl. hab." permit addition
or deletion of species selected for a supplementary habitat associated with a
principal habitat, on the worksheet for that principal habitat:
o addition of supplementary habitat: a column for the supplementary habitat is
added at the right-hand edge of the individual habitat worksheet involved,
showing the species added by that supplementary habitat to those already
selected for the principal habitat treated by that worksheet; it is technically
possible to add up to 99 supplementary habitats per worksheet.
o removal of supplementary habitat: following confirmation of the command
to remove a supplementary habitat on the worksheet for a principal habitat,
the current supplementary habitat column (where the excel cursor is located)
is deleted.
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
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Part 2: Guide to use of the StN Species Selection Tool
6. Carrying out the selection procedure
1) Make a copy of the file SelectionTool_Dec2007.xls to use for carrying out the
selection procedure, so that the original file remains pristine. When you save it, you
can change the name of a copy of the Selection Tool file that you make, to enable you
to identify each copy made, individually.
NB: if you decide to make a copy of the file StN_2007.xls, to use with the
Selection Tool file, retain the title StN_2007.xls for the copy, because if you save
that file under some other name it cannot be used with the Selection Tool.
2) Open the StN_2007.xls file.
3) Open the copy made of the Selection tool file (and click on the "enable macros"
button, when it appears)
4) Click on the "Habitat01" worksheet title in the copy of the Selection Tool (the
"Habitat01" worksheet will display the default main habitat category 1, with two
supplementary habitats 211f and 234f)
5) Click on the upper of the two scrolled habitat lists that appear below the "MAIN
HABITAT" label in the header zone of the worksheet and choose the general habitat
category (by clicking on its name) you require
6) Click on the lower of the two scrolled habitat lists that appear below the "MAIN
HABITAT" label in the header zone of the worksheet and choose the individual
habitat category you require:
o a column will appear on the "site" worksheet for each main habitat chosen
o the StN code number and name used for the habitat treated by that column
will be given at the column head.
7) If you require no supplementary habitats to be associated with the main habitat you
have chosen, click on the check boxes at the head of each of the worksheet columns
that appear under the heading "SUPPLEMENTARY HABITATS", to remove the
ticks (the corresponding columns become grey).
8) If you require 1 supplementary habitat to be associated with the Main Habitat you
have chosen, click on the check box at the head of the column entitled
"Suppl.hab.02", to remove the tick, and then click on the scrollbar in the
"Suppl.hab.01" column to choose the supplementary habitat you require (the default
supplementary habitat option showing initially in the "Suppl.hab.01" column is "tall
herb clearings/tracksides"; similarly the "Suppl.hab.02 column initially shows "grassy
clearings/tracksides").
9) If you require 2 supplementary habitats to be associated with the Main Habitat you
have chosen, click on the scrollbars in the "Suppl.hab.01" and "Suppl.hab02"
columns, to choose the supplementary habitats you require.
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol.58
Part 2: Guide to use of the StN Species Selection Tool
10) If you require only 1 Main Habitat, return to the "Site" worksheet and deactivate
the second habitat column showing (the default option showing is habitat category 51)
by clicking on the tick box at the head of the column, so that the tick is removed
11) If you require a second Main Habitat, repeat the process described in steps 5-9
above, using the worksheet entitled "Habitat02".
12) If you require more than 2 Main Habitats, for each of the additional habitats
required Click on the "Add new Habitat" button (on the "Site" worksheet):
o a new individual habitat worksheet is automatically generated and given a
title (e.g. Habitat03), that appears at the bottom of the page, along with the
titles of the existing worksheet(s).
13) Click on the title of the new individual habitat worksheet:
o that worksheet will now be displayed on the screen.
14) Click on the upper of the two scrolled habitat lists that appear below the
"MAIN HABITAT" label in the header zone of the worksheet and choose the general
habitat category (by clicking on its name) you require.
15) Click on the lower of the two scrolled habitat lists that appear below the
"MAIN HABITAT" label in the header zone of the worksheet and choose the
individual habitat you require:
o a column will appear on the "site" worksheet for each habitat chosen
o the StN code number and name used for the habitat treated by that column
will be given at the column head.
16) If you require more than 2 supplementary habitats associated with a Main Habitat
you have chosen, click on the "Add new suppl. hab." button, on the relevant
individual habitat worksheet and choose the supplementary habitat(s) you require:
o in the case of supplementary habitats only one scrolled list appears, of
supplementary habitats that can occur in association with the individual
habitat chosen,
o each choice of a supplementary habitat from the scrolled list sets in train an
adjustment of the list of selected species shown on a) the worksheet for the
individual habitat involved b) the worksheet for the entire site,
o on the individual habitat worksheet a column will appear for each
supplementary habitat chosen
o the check box present in the header zone above its column makes it possible
to include or exclude the species contributed by a supplementary habitat.
When the contribution of a particular supplementary habitat is excluded its
column appears empty and is coloured grey.
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
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Part 2: Guide to use of the StN Species Selection Tool
o in the "Selection list" column of the individual habitat worksheet the species
selected for that habitat, plus its associated supplementary habitats, are
combined into one list
o on the "Site" worksheet the "Selection list" for a habitat chosen is shown as
a column headed by the StN Macrohabitat code number for that habitat
17) The completed selection procedure results in a column that appears on the
"Site" worksheet under the heading "Combined List". This column combines the
"Selection lists" for all habitats chosen into one species list.
18) To export the "Combined List" for a site from the Selection Tool, for use with
the other files of the StN database:
1) copy the "Combined List" column from the "Site" worksheet of the
Selection Tool, by clicking on the small icon box immediately to the
left of the "COMBINED LIST" box in the header zone of the "Site"
worksheet
2) paste it into a new Excel file,
3) to copy the "Combined List", together with the column of species names,
it is necessary to click the box "Copy with sp. names", so that a tick
appears in that box, before clicking to copy the list.
7. Updating of StN files
The existing file SelectionTool_Dec2007.xls has been constructed for use with the
file StN_2007.xls and can continue to function in the event that certain types of minor
change are made in the latter:
All alterations in the values coded into the cells of the file StN_2007.xls can be
accommodated in the operation of the Selection Tool, whether involving the
coded habitat preferences of the species, or the code numbers of habitats, or the
names of species.
Addition of species to the file is also automatically accommodated if the additional
species lines are added at the end of the "Open ground & wetland macrohabs"
worksheet; once the new species line has been added the worksheet should be
sorted, by species name order.
However, addition of new habitat categories cannot be automatically
accommodated, because this operation requires structural modifications to the
Selection Tool.
8. Warning
The user is strongly advised not to manually insert or delete columns or lines in any
worksheet of the Selection Tool file SelectionTool_Dec2007.xls, or to modify
manually the content of any cell of this file. The user who disregards this warning
does so at his own risk! This is because versions of Excel dating from 2000 or earlier
do not include a facility to put in place automatic protection of worksheets or their
structure against this form of interference.
It is advisable to always work with a copy of the Selection Tool file
SelectionTool_Dec2007.xls, keeping the original file in its "pristine" condition. The
21
Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol.58
Part 2: Guide to use of the StN Species Selection Tool
work carried out using a copy of the file can then be safeguarded by saving the copy
under a new name.
9. References
SPEIGHT, M.C.D. (2005) An "expert system" approach to development of decision
tools for use in maintenance of invertebrate biodiversity in forests. PanEuropean Ecological Network in forests: Conservation of biodiversity and
sustainable management. Proc.5th Internat. Symposium, Pan-European
Ecological Network. Environmental Encounters No.57, 133-141. Council of
Europe, Strasbourg.
SPEIGHT, M. C. D. & CASTELLA, E. (2001) An approach to interpretation of lists of
insects using digitised biological information about the species. Journal of
Insect Conservation. 5: 131-139.
SPEIGHT, M. C. D. & CASTELLA, E. (2005a) Assessment of subalpine grassland and
heath sites in Haute-Savoie using Syrphidae (Diptera). In: Speight, M.C.D.,
Castella, E., Sarthou, J.-P. and Monteil, C. (eds.) Syrph the Net, the database of
European Syrphidae, vol. 46, 37 pp., Syrph the Net publications, Dublin.
SPEIGHT, M.C.D., CASTELLA, E. & OBRDLIK, P. (2000) Use of the Syrph the Net
database 2000. In: Speight, M.C.D., Castella, E., Obrdlik, P. and Ball, S.
(eds.) Syrph the Net, the database of European Syrphidae , vol.25, 99 pp.,
Syrph the Net publications, Dublin
SPEIGHT M.C.D., GOOD, J.A. & CASTELLA, E. (2002) Predicting the changes in farm
syrphid faunas that could be caused by changes in farm management regimes
(Diptera: Syrphidae). Volucella, 6: 125-137
22
Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol. 58
Parte 3 - Una guida all'utilizzo del species selection tool di « Syrph the Net »
UNA GUIDA ALL'UTILIZZO DEL SPECIES SELECTION TOOL
DI « SYRPH THE NET »
Questo documento è la terza parte della pubblicazione:
Monteil, C, Speight, M.C.D., Sommaggio, D., and Sarthou, J.P. (2008). Guide to the
use of the "Syrph the Net" Species Selection Tool. In: Speight, M.C.D., Castella, E.,
Sarthou, J.-P. and Monteil, C. (eds.) Syrph the Net, the database of European
Syrphidae, Vol. 58, 32 pp, Syrph the Net publications, Dublin.
TABLE DES MATIERES
1. SCOPO DEL SELECTION TOOL......................................................................24
2. TERMINOLOGIA.................................................................................................24
3. STRUTTURA DEL FILE STN MACROHABITATS .......................................24
4. PRINCIPI DI BASE PER L'USO DEL FILE STN MACROHABITATS
MEDIANTE IL SELECTION TOOL .....................................................................25
4.1. SELEZIONE DI SPECIE A LIVELLO DEL SOLO HABITAT ..........................................25
4.2. SELEZIONE DI SPECIE A LIVELLO DI SITO ............................................................25
5. STRUTTURA DEL FILE SELECTIONTOOL .................................................26
5.1. IL FOGLIO DI LAVORO “SITE"..............................................................................26
5.1.1. Nomi delle Specie.......................................................................................27
5.1.2. Combined List ............................................................................................27
5.1.3. Le liste di specie selezionate per singoli habitat .......................................27
5.1.4. Opzioni aggiuntive .....................................................................................27
5.2. FOGLIO DI LAVORO PER SINGOLI HABITATS ........................................................28
5.2.1. Nomi delle Specie.......................................................................................28
5.2.2. Lista delle specie selezionate .....................................................................28
5.2.3. Opzioni addizionali....................................................................................29
7. AGGIORNAMENTO DEI FILE STN.................................................................32
8. AVVERTENZE......................................................................................................32
9. REFERENCES.......................................................................................................32
23
Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol. 58
Parte 3 - Una guida all'utilizzo del species selection tool di « Syrph the Net »
1. Scopo del Selection Tool
Lo scopo del file di Excel SelectionTool_2008.xls è di rendere automatica la produzione di
liste di specie di Sirfidi previste in un sito in associazione con gli habitats presenti in quel
sito, mediante l'associazione dei dati relativi a specie/habitat, come codificati nel file
Macrohabitats di Syrph the Net (StN). Precedentemente, questo processo doveva essere
effettuato manualmente, il che era sia tedioso che dispendioso in termini di tempo. Le liste
delle specie generate usando Selection Tool possono essere esportate da quel file per essere
usate con altri file di StN.
Il file SelectionTool_2008.xls deve essere utilizzato insieme al file StN_2008.xls che
contiene una versione speciale, modificata dei fogli di lavoro dei Macrohabitats di StN. Le
definizioni relative alle categorie di habitat utilizzate sono fornite separatamente, nel file di
testo StN_Content&Glossary_2008 (file .doc e .pdf).
Questo testo prima sottolinea la struttura dei file Macrohabitats di StN_2008 e i principi base
del loro uso mediante il Selection Tool. Quindi descrive la struttura del file Selection Tool,
spiegando le funzioni delle sue varie componenti e quindi passa ad abbozzare le procedure
da seguire per l'utilizzo del file. I modi in cui le liste di specie prodotte possono essere usate
con altri file di StN non sono dettagliate nella presente relazione. Varie applicazioni sono
descritte in Speight (2005), Speight e Castella (2001, 2005) e Speight et al. (2002). Una
revisione più generale dell'uso del database StN è fornita da Speight et al (2000).
2. Terminologia
La seguente terminologia è usata nel Selection Tool:
Un habitat (abbreviato per macrohabitat) è una unità di dimensione variabile comprendente
un habitat principale (per esempio un prato, una foresta, un campo agricolo) con
qualsiasi habitat supplementare che si ritrova in esso (per esempio un ruscello, una pozza
temporanea, una sorgente);
Un sito (per esempio un Parco Nazionale) può comprendere uno o più habitats. Nello stesso
modo, una stazione – un punto in cui è predisposto un campionamento di Sirfidi (per
esempio usando una trappole Malaise) – può comprendere uno o più habitats.
3. Struttura del file StN Macrohabitats
Centrali per l'uso di Syrph the Net (StN) sono i fogli di lavoro Macrohabitats. Ci sono tre
fogli Macrohabitats, "Forest macrohabitats", "Open ground & wetland macrohabs" e
"freshwater macrohabitats". In questi fogli ogni linea fornisce l'informazione per una specie
(più di 650 specie Europee sono prese in considerazione) ed ogni colonna considera una
categoria di habitat. Le categorie di habitat sono disposte in serie ramificate. Per esempio la
colonna per "Forest Macrohabitat (gen.)" è seguita da una colonna per la categoria più
specifica "Deciduous Forests (gen.)", che a sua volta è seguita da "Dry (deciduous) Forest
(gen.)" e "Humid (deciduous) Forest", ognuna delle quali è ulteriormente suddivisa in
particolari tipi di bosco nelle successive colonne, per esempio "Fagus (humid deciduous)
Forest" e "acidophilous (humid deciduous) Quercus Forest". Ogni tipo di habitat forestale è
ulterioemente suddiviso in "overmature", "mature" e “sapling", raggiungendo il massimo
grado di precisione per gli habitat forestali. Seguendo la sequenza di categorie di habitat
forestali, altre serie di colonne simili coprono “Wet woodland", "Broad-leaved, evergreen
forests", "Scrub" e "Coniferous Forest".
Due tipi di habitat sono riconosciuti nei fogli di lavoro Macrohabitats: habitats principali e
habitats supplementari. Queste due classi di habitats sono codificate in modo differente nei
fogli:
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol. 58
Parte 3 - Una guida all'utilizzo del species selection tool di « Syrph the Net »
Habitats principali: la cella che si trova all'intersezione di una linea relativa ad una specie e
di una colonna per un habitat principale è codificata per esprimere il grado di
associazione tra quella specie e quel habitat, su una scala da 1 a 3, in alternativa la cella
rimane vuota:
o 3 : la specie è fortemente prevista in associazione con questo habitat
o 2 : la specie è normalmente attesa in associazione con questo habitat
o 1 : la specie è prevista per questo habitat solo quando è presente anche un
habitat supplementare.
o celle vuote: non c'è associazione nota tra la specie e l'habitat.
Nell'uso fatto del codice da parte del Selection Tool, i codici 2 e 3 giocano lo stesso
ruolo, ossia non vi è distinzione tra i due.
Habitats Supplementari: la cella che si trova all'intersezione di una linea relativa ad una
specie e di una colonna per un habitat supplementare può essere 1 o vuota. Se è
codificata 1 ciò indica una corrispondenza con una cella codificata 1 per questa specie
per uno degli habitats principali.
4. Principi di base per l'uso del file StN Macrohabitats mediante il Selection Tool
La procedura di selezione può operare a due livelli:
(i)
Livello di singolo habitat: ogni selezione fornisce una lista di specie per uno
degli habitat principali e dei relativi habitat supplementari osservati in questo; nel caso
più semplice nessun habitat supplementare è presente, così che il processo di selezione
produce la lista potenziale del solo habitat principale.
(ii)
Livello di sito: combina le selezioni di specie realizzate per tutti gli habitats
presenti in un sito per ottenere una lista potenziale per l'intero sito; solo nel caso più
semplice si può avere un solo habitat presente.
4.1. Selezione di specie a livello del solo habitat
Nella procedura di selezione una specie viene ritenuta presente nel sito se la presenza della
specie in quel habitat è codificata a livello 2 o 3 nel file Macrohabitat. Una specie codificata 1
per lo stesso habitat principale è mantenuta solo se la colonna per un habitat supplementare
presente nello stesso habitat principale è codificato 1 per quella specie nel file Macrohabitat.
A questo livello, ogni specie selezionata mostra un codice di 1, 2 o 3, indicando perché è stata
mantenuta. Se uno è interessato solo nell'ottenere una lista semplice di specie previste in
associazione con un habitat, senza informazioni relative a quali specie sono previste sulla
base di habitat supplementari, i codici di tutte le specie selezionate possono essere convertiti
in 1 indicando semplicemente che esse sono state prese in considerazione.
4.2. Selezione di Specie a livello di sito
Una specie è mantenuta nella lista prevista per un sito se quella specie è selezionata per
almeno uno degli habitat presenti nel sito, come descritto nel precedente paragrafo. Se una
specie è selezionata per più di uno degli habitat presenti, il codice per quella specie rimane
quello più alto tra quelli relativi agli habitat interessati. Ma se uno è interessato solo
nell'ottenere una lista semplice di specie previste in associazione con un sito, i codici di tutte
le specie selezionate possono essere convertiti in 1 indicando semplicemente che esse sono
state prese in considerazione.
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol. 58
Parte 3 - Una guida all'utilizzo del species selection tool di « Syrph the Net »
5. Struttura del file SelectionTool
Il file Species Selection Tool comprende un file SelectionTool_2008.xls associato con diversi
file PDF relativi alla guida in diverse lingue (attualmente Francese, Inglese ed Italiano). Il file
Excel comprende un foglio principale (“Site”) ed una serie di fogli ausiliarii (“Habitats”). Nel
foglio di lavoro principale le specie selezionate per il sito intero (ossia tutti gli habitat nel
sito) sono trattate insieme, mentre i fogli ausiliari elencano le specie selezionate per ogni
habitat.
Tutti i fogli di lavoro sono strutturati verticalmente, in due zone:
Una zona in alto di 4 linee (e 4 solo)
Una zona di dati con una linea per specie; la copertura delle specie, la nomenclatura e
l'ordine sono identici con quelli trovati in altri file della versione corrente di
StN_2008.xls.
Dal momento che il Selection Tool utilizza il file Macrohabitat di StN è necessario aprire
questo prima di aprire il file Selection_Tool.xls. Se il file Selection Tool è aperto prima, sullo
schermo appare un messaggio che indica che il file Macrohabitat non è aperto e il Selection
Tool_2008.xls è automaticamente chiuso.
Utilizzando versioni antecedenti di Excel, è normale che, all'apertura del file Selection Tool,
appaia un'avvertenza relativa all'uso di “macro” in Excel (questa è una misura di sicurezza
automatica anti-virus di Excel). Se questo messaggio appare, si deve cliccare sull'opzione
“Attiva macro” per procedere. Nelle versioni più recenti di Excel tre livelli di sicurezza sono
forniti e l'attivazione delle macro può implicare una procedura più complessa.
Alta sicurezza: le macro sono disattivate automaticamente (a meno che il file non sia stato
fornito di un « segnale numerico » in anticipo da essere distribuito)
Sicurezza Media: una finestra di avvertenza appare, che permette all'utilizzatore di attivare
o disattivare le macro; in presenza di un file XL di origine non riconosciuta l'opzione di
default di Excel è di disattivare le macro, nel tentativo di proteggere contro virus delle
macro che possono distruggere o danneggiare le funzioni del computer. Per usare il
Selection Tool è necessario attivare le macro.
Basso livello di sicurezza: i file macro sono automaticamente attivati; in particolare, se una
macro è associata ad un comando di apertura, viene subito avviata (così come con tutti i
virus-macro): chiaramente, è necessario assicurare che Excel non sia mai configurato per
operare ad un livello di sicurezza basso!
L'opzione di default nelle versioni recenti di Excel è di configurare il software per operare a
livelli di sicurezza elevati. Questo impedisce l'uso del file Selection Tool_2008.xls. In questa
situazione è quindi necessario cambiare la configurazione per operare ad un livello di
sicurezza intermedio: si deve cliccare sul menù strumenti/macro/protezione, quindi su
« livelli di protezione » e scegliere « Medio ». N.B.: è necessario uscire e riavviare Excel
prima che i cambi abbiano effetto.
5.1. Il foglio di lavoro “Site"
Questo foglio è suddiviso in tre parti: la prima parte, una colonna alla sinistra del foglio,
fornisce i nomi delle specie; la seconda fornisce una lista di tutte le specie selezionate (ossia
le specie previste per l'intero sito); la terza mostra le specie selezionate per gli habitat trattati
(ossia di ogni habitat osservato nel sito), usando una colonna per habitat.
Quando il foglio di lavoro “Site” è aperto mostrerà già 2 colonne per gli habitat principali.
Queste colonne formano una parte integrante della struttura del file e non possono essere
eleminate. Gli habitat coperti da queste due colonne possono essere alterati per accogliere le
richieste dell'utilizzatore. L'opzione di default (ossia le categorie di habitat mostrate in queste
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol. 58
Parte 3 - Una guida all'utilizzo del species selection tool di « Syrph the Net »
colonne quando il foglio “Site” è aperto) assegna la prima di queste due colonne alla
categoria 1 dei Macrohabitat di StN, "Forest Macrohabitats (general)", e l'altra colonna alla
categoria 51, “Crops”.
5.1.1. Nomi delle Specie
I nomi delle specie dati nella prima colonna sono mostrati come appaiono nel file
Macrohabitat di StN.
5.1.2. Combined List
La colonna "Combined List" (colunna D del foglio di lavoro) presenta il prodotto finale della
procedura di selezione, con ogni specie selezionata che mostra un valore di 1-3, se il codice è
stato mantenuto, oppure di “1”. In questa colonna le celle hanno differenti colori: quelle con
1 sono colorate di giallo, quelle con 2 o 3 sono colorate di verde.
Una freccia per il filtro, localizzata nelle celle titolo di questa colonna, permette di
identificare le linee che hanno particolari attributi:
Linee che hanno un particolare valore di codice (le altre linee sono quindi mascherate)
Linee che corrispondono unicamente a specie selezionate (scegliere "not-empty"), o a specie
non selezionate (scegliere « empty »).
Linee che hanno una particolare combinazione di codici (scegliere "personalised"): per
esempio quelle per le quali la selezione è basata su un codice di 2 o 3.
Tutte le linee: scegliere "all", per annulare il filtro e ritornare alla presentazione standard.
5.1.3. Le liste di specie selezionate per singoli habitat
Ogni colonna situata alla destra della colonna “Combined List” fornisce la lista delle specie
selezionate per uno degli habitat osservati nel sito. In ognuna di queste colonne:
Le specie che sono state selezionate vengono mostrate se è presente un tick nel titolo della
colonna. Se il tick è stato rimosso per una di queste colonne, i codici per la specie in
quella colonna scompaiono e le specie aggiunte alla "Combined List" da quel habitat
sono anch'esse rimosse dalla Combined List.
Le celle con i titoli della colonna contengono un codice alfanumerico fornito dal file
StN_2008.xls all'habitat principale trattato nella colonna (per esempio, 11 per "deciduous
forest"); posizionando il cursore sulla cella si ottiene una descrizione più dettagliata
dell'habitat in un box di commento.
La cella titolo è cliccabile (link ad ipertesto), per vedere direttamente i fogli di lavoro da
dove le specie elencate per quel habitat sono state selezionate (vedi sotto).
Le celle sopra la cella titolo mostrano il numero massimo di specie che possono essere
selezionate per quel habitat ad ogni livello; i corrispettivi totali per la “Combined List”
possono essere visti cliccando su “Detailed Codes” (vedi sotto).
5.1.4. Opzioni aggiuntive
Varie opzioni aggiuntive sono fornite sull'angolo superiore sinistro del foglio di lavoro:
Comando "Black and White": elimina i colori di sfondo presenti nelle celle delle specie
selezionate.
Comando "Detailed codes": permette di alternare, per le specie selezionate, tra la
visualizzazione dei valori di codice delle specie da 1 a 3 ed il solo valore 1. Nel caso dei
codici dettagliati il numero di specie selezionate per ogni sito e per ogni componente
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol. 58
Parte 3 - Una guida all'utilizzo del species selection tool di « Syrph the Net »
dell'habitat sono riportate nella zona in alto del foglio; altrimenti viene riportato solo il
numero totale di specie selezionate.
Comando "Copy with species names": insieme con l'icona per ricopiare la
selezione, un click su questa icona rende possibile stampare una copia della
lista
di specie per il sito, insieme con i valori di selezione per ognuna delle specie selezionate;
nello stesso modo, permette di copiare la lista selezionata in un altro file XL; cliccando
su questa icona dopo aver prima ristretto la selezione alle sole specie con un dato valore
di selezione, rende possibile copiare ad un altro file o alla stampante la lista delle specie
selezionate con il valore di selezione (vedi sotto, freccia filtro).
I pulsanti "Add new habitat" e "Remove curr. habitat": questi permettono di aggiungere
un habitat principale o di eliminarlo dal set di habitat che contribuiscono alla "Combined
List" per un sito:
o Aggiungere un habitat: fino ad un massimo di 99 habitats possono essere
inclusi nel processo di selezione per un sito.
o Eliminare un habitat: è possibile eliminare, dopo conferma, l’ultimo habitat
principale aggiunto nel processo di selezione, con il suo foglio associato.
Pulsante "Help": cliccare su questo pulsante apre le versioni linguistiche della guida
all'utilizzo.
Il pulsante "Reinit": cliccando su questo pulsante il file Selection Tool ritorna alla
condizione di quando è stato salvato.
5.2. Foglio di lavoro per singoli habitats
Ogni foglio di lavoro per un singolo habitat è strutturato nello stesso modo del foglio per il
Sito, con tre sezioni, la prima è la colonna per i nomi delle specie, la seconda è per le specie
selezionate e la terza per gli habitat principali e gli habitat supplementari associati trattati nel
foglio.
5.2.1. Nomi delle Specie
I nomi delle specie dati nella prima colonna sono mostrati come appaiono nel file
StN_2008.xls.
5.2.2. Lista delle specie selezionate
La colonna “SELECTED SPECIES” (colonna D del foglio di lavoro) presenta il prodotto
della procedura di selezione per gli habitat trattati nel foglio, con ogni specie selezionata che
mostra un valore di 1-3, se il codice è stato mantenuto, o altrimenti di “1”. In questa colonna
le celle hanno diversi colori: le celle con 1 sono gialle, quelle con 2 o 3 appaiono verdi.
Una freccia per il filtro è localizzata nel titolo di questa colonna e permette l'identificazione
di linee che hanno particolari attributi:
Linee che hanno un particolare valore di codice (le altre linee sono mascherate).
Linee che corrispondono unicamente a specie selezionate (scegliere "not-empty"), o a specie
non selezionate (scegliere "empty").
Linee che hanno una particolare combinazione di valori di codice (scegliere "personalised"):
per esempio quelle per le quali la selezione è basata su un codice di 2 o 3.
Tutte le linee: scegliere "all" per ritornare alla presentazione standard.
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol. 58
Parte 3 - Una guida all'utilizzo del species selection tool di « Syrph the Net »
5.2.3. Opzioni addizionali
Varie opzioni aggiuntive sono fornite sull'angolo sinistro del foglio di lavoro:
Cella "back to global selection", posizionato alla sinistra del foglio, a livello della linea 4
nella zona in alto, permette un accesso diretto al foglio "Site". Mentre il foglio "Site" è
attivo, la colonna che riporta le specie selezionate per l'ultimo habitat considerato viene
messa in evidenza su quel foglio.
Comando "Detailled codes": permette di alternare tra la schermata con evidenziati i valori
di selezione 1-3 e quella con solo il valore 1, ad indicare le specie selezionate. Nella
schermata con i codici dettagliati il numero di specie selezionate per il sito e per ogni
habitat componente è evidenziato nell'apice del foglio; altrimenti la schermata evidenzia
solo il numero totale delle specie selezionate.
Comando "Black and White": elimina i colori di sfondo evidenti nelle celle delle specie
selezionate.
Comando "Copy with species names": insieme con l'icona per ricopiare la
selezione, un click su questa icona rende possibile stampare una copia della
lista
di specie per il sito, insieme con i valori di selezione per ognuna delle specie selezionate;
allo stesso tempo permette di copiare la lista delle specie selezionate in un altro file XL;
cliccando su questa icona dopo aver prima filtrato la selezione restringendola a specie di
un specifico valore di selezione, rende possibile copiare in un altro file, o stampare, la
lista delle specie selezionate con il valore di selezione (vedi sopra, freccia per il filtro).
Pulsanti "Add new suppl. hab." e "Remove curr. suppl. hab." permettono di aggiungere
o togliere le specie selezionate per un habitat supplementare associato con un habitat
principale nel foglio per quell'habitat principale:
o aggiungere un habitat supplementare: una colonna per l'habitat supplementare è
aggiunta al margine destro del singolo foglio di lavoro interessato, mostrando
le specie aggiunte per quel habitat supplementare a quelle già selezionate per
l'habitat principale trattato da quel foglio; è tecnicamente possibile aggiungere
fino a 99 habitat supplementari per foglio.
o Rimuovere un habitat supplementare : dopo aver confermato il comando per la
rimozione, l’ultima colonna di habitat supplementari relativa ad un habitat
principale viene eliminata.
1) Fare una copia del file Selection Tool_2008.xls da usare per lanciare la procedura di
selezione, così che i file originali restino intoccati. Quando si salva, si può cambiare il nome
di una copia del file Selection Tool, per permettere di identificare ogni copia fatta,
individualmente.
NB: se decidi di fare una copia del file "StN_2008.xls, da usare con il file Selection Tool,
mantieni il titolo StN_2008.xls per la copia, perché se salvi quel file con un altro nome
non può essere usato con il Selection Tool.
2) Apri il file StN_2008.xls.
3) Apri la copia del file Selection Tool (e clicca sul pulsante “permetti le macro”, quando
appare)
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol. 58
Parte 3 - Una guida all'utilizzo del species selection tool di « Syrph the Net »
4) Clicca su titolo "Habitat01" del foglio di lavoro nella copia del Selection Tool (il foglio
"Habitat01" illustra come habitat principale di default la categoria 1, con due habitats
supplementari 211f and 234f)
5) Clicca sulla prima delle due liste di habitat che appaiono sotto l'etichetta "MAIN
HABITAT" nella zona alta del foglio di lavoro
o scegli la categoria di habitat generale richiesta, cliccando sul suo nome
6) Clicca sulla seconda delle due liste di habitat che appaiono sotto l'etichetta "MAIN
HABITAT" nella zona alta del foglio di lavoro e scegli la singola categoria di habitat
necessaria:
o una colonna appare sul foglio di lavoro "Site" per ogni habitat scelto
o automaticamente la colonna riceve il numero di codice StN e il nome usato per
l'habitat riportato in quella colonna
7) Se non è necessario nessun habitat supplementare associato agli habitat principali che
sono stati scelti, rimuovi i ticks cliccando sugli stessi in alto in ognuna delle colonne del
foglio, in corrispondenza della scritta "SUPPLEMENTARY HABITATS".
8) Se è necessario un habitat supplementare associato con quello principale che è stato scelto,
clicca sul box in alto della colonna intitolata "Suppl.hab.02" per rimuovere il tick e quindi
clicca sulla scrollbar nella colonna "Suppl.hab.01" per scegliere l'habitat supplementare
necessario (per default viene scelto come habitat supplementare evidenziato all'inizio la
colonna "Suppl.hab.01" che è "tall herb clearings/tracksides"; così come la colonna
"Suppl.hab.02” inizialmente mostra "grassy clearings / tracksides").
9) Se sono necessari 2 habitat supplementari da associare con quello principale che è stato
scelto, clicca sulla scrollbar nelle colonne "Suppl.hab.01" e "Suppl.hab02" per scegliere gli
habitat supplementari richiesti.
10) Se hai bisogno di un solo habitat principale, ritorna al foglio di lavoro "Site" e disattiva la
colonna del secondo habitat (di default viene scelto come habitat il 51), cliccando sul tick del
box all'apice della colonna, in modo da rimuovere il tick.
11) Se è necessario un secondo habitat principale, ripeti il processo come descritto nei punti
5-9, usando il foglio di lavoro intitolato "Habitat02".
12) Se hai bisogno di più di 2 habitat principali, per ognuno degli habitat aggiuntivi oltre il
secondo, clicca sul pulsante "Add new Habitat" (nel foglio "Site"):
o un nuovo foglio singolo è generato automaticamente con un titolo (e.g. Habitat03)
che appare all'apice della pagina, insieme con i titoli dei fogli esistenti.
13) Clicca sul titolo del nuovo foglio habitat:
o quel foglio di lavoro sarà ora attivo sullo schermo.
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol. 58
Parte 3 - Una guida all'utilizzo del species selection tool di « Syrph the Net »
14) Clicca sulla prima delle due liste di habitats che appaiono sotto l'etichetta "MAIN
HABITAT" nella parte alta del foglio di lavoro:
o scegli la categoria di habitat generale (cliccando sul suo nome) di cui hai bisogno
15) Clicca sulla seconda delle due liste di habitats che appaiono sotto l'etichetta "MAIN
HABITAT" nella parte alta del foglio e scegli il singolo habitat di cui hai bisogno:
o sul foglio “site” appare una colonna per ogni habitat scelto
o in alto sulla colonna apparirà il codice di StN ed il corrispettivo nome per ogni
habitat trattato nella colonna.
16) Se sono necessari più di 2 habitat supplementari associati con il principale che è stato
scelto, clicca sul pulsante "Add new suppl.hab.", sul rispettivo foglio del singolo
habitat e scegli gli habitat supplementary necessari
o nel caso di habitats supplementari solo una lista appare, formata da habitat
supplementari che sono associati con l'habitat scelto,
o la scelta di ogni habitat supplementare dalla lista porta di conseguenza un
aggiustamento della lista delle specie selezionate su a) il foglio di lavoro per il
singolo habitat interessato e b) per il foglio dell'intero sito.
o sul foglio di lavoro del singolo habitat appare una colonna per ogni habitat
supplementare scelto
o il box cliccabile nella zona alta sopra la sua colonna, rende possibile includere o
escludere le specie aggiunte per la presenza dell'habitat supplementare. Quando il
contributo di uno specifico habitat supplementare è escluso la sua colonna appare
vuota ed è colorata di grigio.
o nella colonna "Selection list" del foglio di lavoro del singolo habitat le specie
selezionate per quel habitat, più gli habitat supplementari associati, sono combinate
in una lista.
o nel foglio "Site" la "Selection list" per un habitat scelto è evidenziata come una
colonna intitolata con il numero di codice di StN Macrohabitat per quello specifico
habitat
17) La procedura di selezione completata risulta in una colonna che appare nel foglio di
lavoro "Site" sotto il titolo "Combined List". Questa colonna combina la "Selection
lists" per tutti gli habitat scelti in una sola lista di specie.
18) Per esportare la "Combined List" di un sito dal file Selection Tool, in modo da usarla
in altri file del database StN:
o copia la colonna "Combined List" dal foglio di lavoro "Site" del file Selection Tool,
cliccando sulla piccola icona immediatamente alla destra del box della
"COMBINED LIST" nella zona alta del foglio "Site”
o incollala in un nuovo file XL,
o per copiare la "Combined List", insieme con la colonna dei nomi delle specie, è
necessario cliccare sul box "Copy with sp names", in modo che un tick appare in
quel box, prima di cliccare per copiare la lista.
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Species Selection Tool for the StN Database, 2008
Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol. 58
Parte 3 - Una guida all'utilizzo del species selection tool di « Syrph the Net »
7. Aggiornamento dei file StN
Il file SelectionTool_2008.xls è stato realizzato per essere usato con il file StN_2007.xls e
può continuare a funzionare anche nel caso che alcuni cambiamenti minori siano fatti in
quest'ultimo:
Tutte le variazioni nei valori codificati nelle celle del file StN_2008.xls possono essere
accolte nell'operatività del Selection Tool, sia che interessino i codici delle preferenze
degli habitat delle specie, o i numeri di codice degli habitat o i nomi delle specie.
Anche l'aggiunta di specie al file è automaticamente accolta se le linee aggiuntive sono poste
alla fine del foglio di lavoro "Open ground & wetland macrohabs"; una volta che la
nuova specie è stata aggiunta il foglio dovrebbe essere ordinato, scegliendo come criterio
il nome della specie.
Tuttavia, l'aggiunta di nuove categorie di habitat non può essere automaticamente
accolta, poichè questa operazione richiede modifiche strutturali al Selection Tool.
8. Avvertenze
Si consiglia vivamente all'utilizzatore di non inserire o cancellare manualmente colonne o
linee in nessuno dei fogli di lavoro del file SelectionTool_2008.xls, o di modificare il
contenuto di qualsiasi cella di questo file. Chi disattende questa avvertenza lo fa a suo
rischio! Questo perchè le versioni di Excel datate 2000 o antecedenti non includono la
possibilità di porre delle protezioni ai fogli o alla struttura contro questa forma di
interferenza.
E' sempre consigliabile lavorare con una copia del Selection Tool del file
SelectionTool_2008.xls, mantenendo l'originale in una condizione di “primario”. Il lavoro
effettuato usando una copia del file può quindi essere salvato come copia, usando un nuovo
nome.
9. References
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use in maintenance of invertebrate biodiversity in forests. Pan-European Ecological
Network in forests: Conservation of biodiversity and sustainable management. Proc.5th
Internat. Symposium, Pan-European Ecological Network. Environmental Encounters
No.57, 133-141. Council of Europe, Strasbourg.
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using digitised biological information about the species.
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Conservation. 5: 131-139.
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in Haute-Savoie using Syrphidae (Diptera). In: Speight, M.C.D., Castella, E., Sarthou,
J.-P. and Monteil, C. (eds.) Syrph the Net, the database of European Syrphidae, vol.
46, 37 pp., Syrph the Net publications, Dublin.
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SPEIGHT M.C.D., GOOD, J.A. & CASTELLA, E. (2002) Predicting the changes in farm syrphid
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