Come l’Evoluzione di una Macromolecola garantisce la Regolazione della Funzione: l’Esempio dell’Emoglobina Prof. Mauro Fasano [email protected] Perché l’emoglobina? • Proteina nota a tutti • Tra le prime strutture determinate • Conservazione strutturale in tutti gli organismi • Principale esempio di correlazione struttura-funzione • Principale esempio di regolazione allosterica Struttura e funzione • Struttura terziaria: il corretto “folding” garantisce la corretta funzione • Mioglobina: legare ossigeno nel muscolo aumentandone la disponibilità • Emoglobina: trasportare ossigeno, legandolo e rilasciandolo a seconda delle necessità Mioglobina Da un disegno di Irving Geis, 1983 Mioglobina Mioglobina Mioglobina Distale Prossimale Equilibrio di legame dell’ossigeno alla Mioglobina Mb O2 Kd MbO2 YO2 MbO2 O2 Mb MbO2 K d O2 Equilibrio di legame dell’ossigeno alla Mioglobina YO2 MbO2 O2 Mb MbO2 K d O2 Legame dell’ossigeno all’eme • Il legame dell’ossigeno al FeII dell’eme determina variazioni conformazionali della struttura terziaria che avvengono senza restrizioni • La situazione sarebbe diversa in una struttura quaternaria!! • La struttura quaternaria impedisce le variazioni conformazionali associate al legame dell’ossigeno • In eccesso di ossigeno, la struttura quaternaria viene forzata a raggiungere un nuovo “stato conformazionale” ad elevata affinità per l’ossigeno Due stati conformazionali • Forma T: deossigenata, bassa affinità per l’ossigeno • Forma R: ossigenata, alta affinità per l’ossigeno Variazione dei contatti intercatena conseguenti all’ossigenazione Equilibrio di legame dell’ossigeno all’Emoglobina Grafico di Hill P L h PLn K Y P PLn P P Lh h L h K L K Y L 1 Y K h Log Y log h log L log K 1 Y Y 1-Y Log K Grafico di Hill Modelli termodinamici di cooperatività Monod, Wyman, Changeux Koshland L’effetto Bohr L’effetto Bohr L’effetto allosterico Il bisfosfoglicerato modifica la “soglia” necessaria a far avvenire la variazione conformazionale Quante Emoglobine umane?!? Embrionale e Fetale g1 g2 Pseudogene yh Adulta d b 3’ 5’ 0 100 duplicazione genica 200 Mya Perché? Cooperatività ed allosteria: non solo emoglobina Cosa succede se: • Una delle istidine prossimali è mutata in tirosina? La coordinazione dell’ossigeno al posto dell’azoto cambia il valore del potenziale redox del ferro, stabilizzando lo stato +3 e rendendo la proteina incapace di legare l’ossigeno Cosa succede se: • Il glutammato in posizione 6 delle catene β è mutato in valina? Anemia falciforme Anemia falciforme Per saperne di più • Basics: qualunque testo di biochimica • I classici: – M. Brunori, E. Antonini, “Hemoglobin and Myoglobin in Their Reactions with Ligands” (1971) – R.E. Dickerson, I.E. Geis, “Hemoglobin: Structure, Function, Evolution, and Pathology” (1983) • Allosteria: J.F. Swain, L.M. Gierasch, “The changing landscape of protein allostery”. Curr. Op. Struct. Biol. 16, 102-108 (2006). • The Web