GENETIC TEST: analisi molecolare su striscia (cod. AC019 - 25 test) Risultato in sole 4 ore Reagenti in formato pronto uso - Primo test su striscia - domanda di brevetto n°. MI2003A001627 GENETIC TEST Analisi genetica per evidenziare la suscettibilità/resistenza alla scrapie negli ovini Analisi singola per differenti mutazioni Possibile automazione del test - Bossers A,de Vries R,Smits M.A."Susceptibility of Sheep for Scrapie as Assessed by In vitro Conversion of Nine Naturally Occuring Variants of PrP" Journal of Virology,Feb 2000 pp 1407-1414 - Vaccari G., Petraroli R., Agrimi U., Eleni C., Perfetti M.G., Di Bari A., Morelli L., Busani L., Ligios C., Nonno R., Di Guardo G., “ PrP genotype in Sarda breed sheep and its relevance to scrapie infection” Archives of Virology; 2001,146; 2029-2037. - Hunter N,Goldmann W,Marshall E,O'Neill G"Sheep and goats:natural and experimental TSEs and factors influencing incidence of disease" Arch. Virol. Suppl. 2000;(16):181-8 -Hunter N,Moore L,Hosie BD,Dingwall WS,Greig A."Association between natural scrapie and PrP genotype in a flock of Suffolk sheep in Scotland" Vet.Rec. 1997 Jan 18; 140 (3): 59-63 - Acutis P.L.,Riina M.V.,Caramelli M " Sorveglianza attiva per la Scrapie: Analisi genetica per gli ovini" Progresso Veterinario n°5 - maggio 2002 - Normative europee : - Regolamento (CE) n° 260/2003 della commissione del 12 Febbraio 2003 ; - Decisione della commissione 100/2003/CE del 13 Febbraio 2003 Bibliografia NUCLEAR LASER MEDICINE S.r.l. Viale delle Industrie, 3 - 20090 Settala (MI) Tel. 02.95.24.51 - Fax 02.95.24.52.37 - 02.95.24.52.38 - E-mail: [email protected] - www.nlm.it Indagine molecolare dei codoni 136, 154 e 171 del gene della proteina prionica associati alla scrapie GENETIC TEST: analisi molecolare su striscia (cod. AC019 - 25 test) INTRODUZIONE RIVELAZIONE Lo scrapie è una malattia appartenente alla famiglia delle Encefalopatie Spongiformi Trasmissibili (TSE) o malattie da prioni e risulta molto diffusa fra le greggi europee. L’insorgenza della malattia è influenzata anche dalla predisposizione genetica degli ovini. Il test, tramite tecniche di biologia molecolare, consente di identificare i polimorfismi associati al gene che codifica la proteina prionica. La manifestazione della malattia è associata agli alleli VRQ e ARQ mentre l’allele ARR è associato ad una naturale resistenza alla scrapie. - Analisi dell’amplificato mediante ibridazione inversa su striscia. 3’ Amplificato 5’ DNA-probe Principio e procedura Il test si basa sulla indagine delle seguenti mutazioni A136V, R154H, Q171R, Q171H, attraverso le suddette fasi ESTRAZIONE DEL DNA Strip di nitrocellulosa - DNA estratto da campioni di sangue (in EDTA) fresco o congelato o da spot su carta assorbente. RISULTATI AMPLIFICAZIONE IN VITRO Mix Pronto uso + DNA - polimerasi - Amplificazione in multiplex delle sequenze del gene che codifica per la proteina prionica (Prp). DNA target Marker Line rossa Controllo di rivelazione A136V A136V wild type mutato R154H R154H wild type mutato Q171R Q171R Q171H wild type mutato mutato Marker line verde Schema interpretativo Esempio: Codoni 136 154 171 (1) 171(2) Normali A R Q Q Eterozigoti A-V R-H Q-R Q-H Esempio di interpretazione: Risultati 136Wt - 154 Wt - 171 Wt 136Etero - 154 Wt - 171 Wt 136Wt - 154 Wt - 171 Etero(1) → → → Omozigoti (mut) V H R H Genotipo ARQ/ARQ ARQ/VRQ ARQ/ARR