MALATTIE DA ESPANSIONE (instabile) DI BREVI TRATTI RIPETUTI La base molecolare di queste malattie consiste nella ripetizione abnorme di un tratto tri-, tetra- o penta-nucleotidico Alleli normali l’unità base è presente un numero di volte variabile, ma comunque limitato Alleli patologici l’unità base è presente un numero di volte molto maggiore Esempio: nella Corea di Huntington gli alleli normali contengono il trinucleotide CAG ripetuto 11-36 volte, gli alleli patologici lo presentano 40120 volte CAG 40-120 CAG CAG CAG CAG 11-36 CAG CAG gene HD CAG ORF Quando si studiano pedigree in cui segregano malattie dovute ad espansioni nucleotidiche si osservano, in generazione successive della stessa famiglia, anticipazione dell’età di insorgenza e aumento della gravità dei sintomi clinici I 54a II 1 III 56a 2 1 2 41a 3 42a 18a 1 4 2 3 53a 52a 5 6 Entrambi i fenomeni sono spiegati dal fatto che il tratto espanso è soggetto ad instabilità meiotica e mitotica a seguito del processo di replicazione del DNA vengono prodotte con frequenza elevata molecole figlie con un numero di ripetizioni diverso da quello della molecola originaria Esempio cellula madre con tratto (CAG)48 una delle cellule figlie con (CAG)51 I II 48/28 28/30 1 III 28/32 31/30 1 2 54/31 48/30 56a 54a 2 30/27 41a 3 4 62/30 53a 54/30 42a 18a 1 48/30 2 3 48/31 52a 5 6 Età di insorgenza SCA1 vs numero di ripetizioni dell'allele espanso Età di insorgenza 50 40 30 20 10 0 40 45 50 55 60 No. di ripetizioni 65 70 Le malattie da espansione possono essere suddivise in 3 categorie sulla base della regione genica in cui si trova il tratto ripetuto (regioni codificanti o non codificanti) e del meccanismo molecolare alla base della patogenicità (perdita di funzione, produzione di una proteina mutata con nuove caratteristiche, produzione di mRNA con nuove funzioni) Nat Rev Genet (2005) 6: 743-755 1. Malattie in cui il gene contiene l’espansione in una regione NON codificante (nel 5’ UTR per FRAXA e FRAXE e nel 1° introne per FRDA) e in cui il meccanismo patogenetico è la perdita di funzione l’unità ripetuta è diversa da gene a gene il range di espansione patologico è molto elevato (centinaia o addirittura migliaia di copie) 2. Malattie in cui il gene contiene l’espansione in una regione NON codificante (nel 5’ UTR o nel 1° introne) e il meccanismo patogenetico è la produzione di un mRNA con nuove caratteristiche l’unità ripetuta è diversa da gene a gene il range di espansione patologico è molto elevato (centinaia o addirittura migliaia di copie) Malattie in cui il gene contiene l’espansione in una regione codificante sono malattie neurodegenerative l’unità base ripetuta è sempre CAG (codone che codifica per Glutamina per cui vengono anche chiamate malattie da poliglutamine) sono a trasmissione Autosomica Dominante (tranne SBMA) il meccanismo patogenetico è l’acquisizione di funzione da parte della proteina mutata HD CAG 41-121 6-36 SCA1 DRPLA SCA3 CAG CAG CAG 40-83 49-88 CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG 6-39 CAG CAG CAG CAG 3-36 CAG CAG 61-84 12-40 CAG ORF 14-32 34-77 CAG CAG 9-36 CAG CAG 11-33 CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG CAG SCA2 38-62 CAG CAG SBMA 38-130 CAG CAG SCA7 SCA6 4-18 21-30 6 39 45 83 SCA1 14 SCA2 32 34 77 40 12 62 86 SCA3 4 18 21 30 SCA6 11 33 38 130 SCA7 6 36 41 121 HD 9 36 38 62 SBMA 3 36 49 88 DRPLA CAG repeats alleli nel range normale 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 alleli nel range di ridotta penetranza alleli nel range patologico (modificato da Andrew et al. (1997) Hum. Mol. Genet. 6: 2005-2010) alleli nel range intermedio