CONVEGNO NAZIONALE GISCi
Finalborgo (SV) 20-22 maggio 2015
Complesso Monumentale di Santa Caterina
Workshop pre-congressuale
Umbria: esperienza con Cobas®
Basilio Ubaldo Passamonti
Az. USL Umbria 1
Direttore
Diagnostica di Laboratorio
Laboratorio Unico di Screening
Il Laboratorio Unico di
Screening in Umbria
80 punti per il prelievo
capillarità dell’offerta
1 Laboratorio di
screening regionale
qualità delle prestazioni
Flusso dei dati nella rete informatica
Unico database
Anagrafica Assistiti
Atena e Demetra colloquiano fra di loro ed entrambe fanno riferimento ad un
unico database e ad un’unica anagrafica dinamica (anagrafica regionale degli assistiti) ciò
vuol dire che tutti condividono in tempo reale le stesse informazioni
Prelievo in LBC come sistema per “test reflex”,
identificazione contenitore ed abbinamento
nominativo al codice fiscale

Il contenitore per prelievo
viene etichettato (non importa
se trattasi di prelievo Pap
LBC o test HPV)
 Leggendo il barcode
dell’etichetta si abbina nel
software il n. progressivo del
consultorio al nominativo
paziente con il CODICE
FISCALE.
 Sviluppo in corso è la
predisposizione di etichette
con RFid.
USL1
UU 0001
IIIIIIIIIIIIIII
SISTEMA DI PRELIEVO BROOM-TYPE
ROVER “CERVEXBRUSH”
• Inserire il cervexbrush nel canale
• Ruotare 2-3 volte in senso orario
La testa del dispositivo di prelievo può essere
sganciata e lasciata cadere nel vial
ALGORITMO donne con età: 25-34 anni da screening attivo
Pap-test
ogni 3 anni
NEGATIVO
invito a ripetere il pap
test dopo 3 anni
ANOMALO
BASSO GRADO:
ASC-US e L-SIL
ALTO GRADO:
H-LSIL+, ASC-H,
AGC, AIS ed ADK
triage HPV-DNAhr
NEGATIVO
rientro nello screening
POSITIVO
Colposcopia
Colposcopia/Approfondimento
diagnostico
ALGORITMO donne con d’età: 35-64 da screening attivo
HPV-DNA HR
NEGATIVO
invito a ripetere dopo 5 anni
NEGATIVO
HPV-DNA-HR DOPO 1 ANNO
NEGATIVO
RIENTRO NELLO SCREENING
POSITIVO
TRIAGE CITOLOGICO
ANOMALO (ASC +)
COLPOSCOPIA
POSITIVO
COLPOSCOPIA
Reingegnerizzazione dello Screening: dalla LBC
all’automatizzare per la processazione del Pap-LBC
sistemi di
prelievo in
fase liquida
vial
barcodato
Analizzatori robotizzati ad elevato
numero di test
mmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm
mmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm
mmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm
mmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm
mmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm
mmmm
Sistemi software di acquisizione ed elaborazione protocolli
gestionali delle campagne di sreening
restituzione dei
risutati dallo
strumento al
software
gestionale
™ System
BD
Totalys
™
BD Totalys System
SISTEMA DI CARICO E DI IDENTIFICAZIONE
CON BAR-CODE 2D
1
™™System
BD
Totalys
BD Totalys System
SISTEMA DI PREPARAZIONE E COLORAZIONE
DEI PAP-TEST DIRETTAMENTE DAL TOTALYS
11
Reingegnerizzazione dello Screening: dalla LBC
all’automatizzare per la processazione del test HPV
Analizzatori robotizzati ad elevato
numero di test
sistemi di
prelievo in
fase liquida
vial
barcodato
mmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm
mmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm
mmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm
mmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm
mmmmmmmmmmmmmmmmmmmmm
mmmm
Sistemi software di acquisizione ed elaborazione protocolli
gestionali delle campagne di sreening
restituzione dei
risutati dallo
strumento al
software gestionale
Flusso di lavoro
8,00
1 hr
2 hr
3 hr
4 hr
walk-away time
140 min
5 hr
6 hr
7 hr
walk-away time
walk-away time
120 min
3e run, 282 campioni completi
Manutenzione
9 hr
18,00
walk-away
time
1e run, 94 campioni completi
120 min
140 min
Intervento Manuale
8 hr
Setup
140 min
Estrazione
2e run, 188 campioni completi
120 min
Amplificazione/Detection
cobas® p480: preanalitica per cobas® 4800
PreservCyt®
PCR Media
SurePath
™
Attività eseguita:


Allineamento barcode
Agitazione Vial

Stappatura Vial

Ritappatura Vial
cobas® 4800
CARATTERISTICHE DEL SISTEMA:
• Esegue l’estrazione degli acidi nucleici
• Prepara
la
automazione
cobas® x 480
piastra
PCR
in
• Amplifica e rileva i campioni in PCR
Real-time
• Interpreta le curve di amplificazione
mediante un algoritmo appositamente
sviluppato e calcola automaticamente i
risultati
cobas® z 480
Accuratezza e monitoraggio della preparazione e
pipettamento che mi consente il controllo della “densità
della soluzione” e mi segnala gli errori di “trascinamento”
con possibili inquinamenti ed invalida il campione.
cobas z 480
algoritmi multivariati per l’analisi delle curve
• Non esiste la zona grigia;
• Risultato univoco: positivo/negativo.
cobas® 4800 HPVhr-DNA Test
Channel
1
31
33
35
39
45
51
52
56
58
59
66
68
Rilevazione 12 hrHPV
genotipi come un
pool di risultati
Channel
2
Channel
3
16
18
Rilevazione
HPV16
Rilevazione
HPV18
Channel
4
Rilevazione β-globin
(controllo interno della
adeguatezza del
campione)
Flessibilità delle sedute - cobas® HPV Test
usando il Kit da 24 determinazioni
≤ 22 Samples
23 – 46 Samples
47-70 Samples
71 – 94 Samples
Sample Prep Kit
24
96
96
96
Wash Buffer Kit
24
96
96
96
Liq. Cyt. Prep Kit
24
96
96
96
Amp/Det Kit
24
HPV Controls Kit
1
Kit /Samples
24
24
1
24
24
1
24
96
1
Valore Predittivo Positivo a confronto
(anni 2000/2006 - anni 2008/2013)
60%
50%
50%
49%
51%
45%
40%
30%
20%
34%
32%
28%
17%
16%
34%
39%
37%
36%
33%
30%
17%
29%
27%
16%
19%
45%
24%
23%
22%
20%
16%
10%
0%
2000
2001
2002
2003
2004
2005
2006
VPP ascus/lsil
2007
2008
2009
VPP tutte le altre categorie
2010
2011
2012
2013
PAP TEST IN DONNE 25-34 ANNI maggio 2014- aprile 2015
età
esito citologico
NEG
INAD
ASC US
ASC H
LSIL
HSILCIN2
HSILCIN3
AGC
CA. SQUAM.
TOTALE
25-29
5663
133
126
30
180
64
20
3
30-34
6895
168
113
54
156
55
17
3
1
7462
TOTALE
12558
301
239
84
336
119
37
6
1
13681
6219
Risultati del triage hpv nelle categorie Ascus ed Lsil
ASC US
L SIL
53%
48%
33%
26%
13%
0%
NEG
13%
5%
1%
INAD
POS-16
4%
POS-18
1%
2%
POS-16-18
POS-ALTRI
HTA UMBRIA RISULTATI TEST HPV DNAhr
NELLO SCREENING
Test HPVhr eseguiti
6.272
Test HPVhr negativi
5.869
Test HPVhr inadeguati
93,6%
7
Test HPVhr positivi
396
Positività al test
6,4%
6,4%
test HPV-DNAhr in donne 35-64 anni maggio 2014 aprile 2015
esito
Totale
INAD
87
NEG
33963
POS-16
327
POS-16-18
6
POS-16-18-ALTRI
12
POS-16-ALTRI
139
POS-18
95
POS-18-ALTRI
51
POS-ALTRI
1812
Totale complessivo
36492
test HPV-DNAhr con esito positivo
esito
POS-16
percentuale di positività
7%
genotipo 16
19%
genotipo 18
6%
Totale
327
POS-16-18
6
POS-16-18-ALTRI
12
POS-16-ALTRI
139
POS-18
95
POS-18-ALTRI
51
POS-ALTRI
1812
Totale complessivo
2442
genotipi 16-18
1%
genotipi Altri
74%
HTA UMBRIA RISULTATI DEL TRIAGE CITOLOGICO
Test HPV positivo
396
Pap-test NEGATIVI
251
Pap-test INADEGUATI 4
Pap-test POSITIVI
141
ASCUS
2
1%
LSIL
95
67%
ASCH / AGH
20
14%
HSIL
24
18%
PAP-TEST
NEGATIVI 63%
63%
1%
PAP-TEST
POSITIVI 36%
36%
PAP-TEST
INADEGUATI 1%
LSIL 67%
ASCUS 1%
HSIL 18%
ASCH/AGH 14%
ESITI DEL TRIAGE CITOLOGICO
classificazioni citologiche
genotipi virali
POS-16
POS-18
POS-16-18
NEG
279
61%
107
74%
INAD
11
2%
2
1%
1
1%
ASC-US
10
56%
POS-ALTRI
TOTALE
1367
76%
1763
73%
36
2%
49
2,0%
1
0,04%
ASC-H
41
9%
7
5%
1
6%
48
3%
97
4%
L SIL
67
15%
18
13%
4
22%
271
15%
360
15%
HSILCIN2
27
6%
6
4%
2
11%
48
3%
83
3%
HSILCIN3
27
6%
3
2%
1
6%
21
1,2%
52
2,2%
CA. squam
2
0,4%
2
0,1%
AGC
1
0,2%
455
100%
TOTALE
144
100%
18
100%
1
0,1%
2
0,1%
1792
100%
*2409
100%
*23 casi in attesa di essere refertati e 10 casi senza triage
Distribuzione dei genotipi virali nelle diverse categorie citologiche
POS-16
73%
61%
POS-18
POS-16-18
POS-ALTRI
76%
56%
2%1%
NEG
INAD
2%
1%
ASC US
9%
5% 6%3%
ASC H
22%
15%
15%
12%
L SIL
11%
6%4%
3%
H SILCIN2
6% 6%
2% 1,20%0,40%
HSILCIN3
Ca. squam
0,20%
0,10%
AGC
tempi di refertazione del test-hpv
giorni % refertati
00-06
73%
07-12
98%
13-18
99%