Università degli Studi di Firenze
Facoltà di Psicologia
Corso Integrativo
“Uso di data base elettronici
nella ricerca psicologica”
(II semestre, A.A. 2002/’03).
Laura Bianciardi
"Good information is the best medicine. Immediate access to current
medical research information is as critical as the biopsy and the x-ray
have been in the diagnosis and treatment of disease. Not only health
professionals, but also consumers, should have the most recent medical
information at their fingertips."
Michael De Bakey, Heart Surgeon.
(http://www.nlm.nih.gov/news/press_releases/medplus.html)
2
Cosa cerchiamo
a) Informazioni bibliografiche (di articoli orignali, articoli di rassegna, ecc.)
b) Il testo integrale di documenti (articoli, protocolli clinici, lineeguida, schede di farmaci, ecc..)
c) Immagini
d) ……
Documenti a stampa
Documenti elettronici
con accesso locale (CD-ROM, DVD, Floppy disk, …)
con accesso remoto (CD-ROM e DVD in rete, siti Internet)
Dove cerchiamo
Su:
Cataloghi di
Contengono i dati
Gli OPAC (Online Public Access Catalog) sono cataloghi
biblioteche
bibliografici dei libri
consultabili gratuitamente su Internet.
e dei periodici
Es.:
posseduti da una
biblioteca o da un
sistema bibliotecario
Catalogo Italiano Periodici (ACNP)
(http://acnp.cib.unibo.it/cgi-ser/start/it/cnr/fp.html), Servizio
Bibliotecario Senese (SBS)
(http://www.unisi.it/servizi/sab/accesso.html), Servizio
Bibliotecario Nazionale (SBN) (http://opac.sbn.it/), ecc..
Database bibliografici Raccolgono
Sono quasi tutti consultabili via Internet, alcuni
di
gratuitamente, altri a pagamento.
psicologico
interesse riferimenti
bibliografici alla
letteratura scientifica
(soprattutto periodici)
e non danno accesso
ai testi completi dei
lavori, se non
attraverso link ad
altre risorse (database
integrati)
Es.:
A pagamento: EmBase, Biosis Previews, Current Contents,
Science Citation Index, CINAHL, Ageline, PsycInfo, Mental
Health Abstracts, Social Scisearch, PASCAL, Applied Social
Science Index and Abstracts, British Education Index,
Philosopher’s Index, ecc….
Gratuiti: PubMed-Medline,
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed), Orphanet
(http://orphanet.infobiogen.fr/), Pilots Database
(http://www.ncptsd.org/publications/pilots/), OMIM
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/), Eric
(http://www.askeric.org/Eric/)
Cancerlit (http://www.nci.nih.gov/search/cancer_literature/),
3
Ingenta (http://www.ingenta.com/).
(Selezione di basi dati gratuite recuperata dal sito della
Biblioteca del Dipartimento di Psicologia di Bologna
(http://www.psibo.unibo.it/badabi.htm): PSYCHit,
(http://www.psico-comunicazione.net/search.htm), PsyKe
(http://alfama.sim.ucm.es/isishtm/psyke.htm), BiblioSleep
(http://www.websciences.org/bibliosleep/), PsydocFrance
(http://psydoc-fr.broca.inserm.fr/Psydoc@base/default.htm),
CHILDES Bibliography
(http://childes.psy.cmu.edu/html/bib.html), Etic/ae Test
Locator (http://ericae.net/testcol.htm), ecc..
Subject
gateways, Organizzano elenchi
repertori di risorse,
per argomento di
e Indici di interesse risorse Internet
selezionate
psicologico
(repertori)
Es.:
Gratuiti: OMNI (http://omni.ac.uk), NLM Gateway
(http://gateway.nlm.nih.gov/gw/Cmd), Karolinska Institutet
Library (http://www.mic.ki.se/Diseases/index.html),
Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones
(http://www.chu-rouen.fr/cismef/), PychCrawler
(http://www.psychcrawler.com/), Psychomedia
(http://www.psychomedia.it/), CogPrints
(http://cogprints.ecs.soton.ac.uk/), Psicologia:
Biblioteca del Dipartimento di Psicologia dell’Università di
Bologna, Guida alle risorse su Internet classificate per aree
tematiche (http://www.psibo.unibo.it/griglia.htm), ecc..
A pagamento: Medical Matrix
(http://www.medmatrix.org/reg/login.asp), ecc..,
Liste di discussione
Gli iscritti si
Psychology mailing lists (http://www.wjh.harvard.edu/soc-
scambiano
sci/psy/psy-maillist.html),
informazioni
sull’argomento di
interesse
Siti di enti ed
Selezione effettuata dalla Biblioteca del Dipartimento di
organizzazioni
Psicologia di Bologna
professionali di
(http://www.psibo.unibo.it/assoint.htm), Associzione
ambito psicologico
Nazionale Psicologi Terapeuti (http://www.anapp.it/
4
Riviste elettroniche
Elenchi di riviste a
Biblioteca Medica Statale
full-text gratuito
(http://biblioroma.sbn.it/medica/ejnls/fulltext.htm),
Free Medical Journals (http://freemedicaljournals.com/),
Free Medical Journals : PubMed Search (Hardin
MD)(http://www.lib.uiowa.edu/hardin/md/ej.html), Highwire
Free Online Full-text Articles
(http://highwire.stanford.edu/lists/freeart.dtl),
Alcune riviste
Family Economics and Nutrition Review (Fenr)
gratuite o
(http://www.usda.gov/cnpp/FENR.htm), The American
parzialmente gratuite Journal of Clinical Nutrition (http://www.ajcn.org/), The
Journal of the American College of Nutrition
(http://www.jacn.org/), The Journal of Nutrition
(http://www.nutrition.org/), American Family Physician
(http://www.aafp.org/afp.xml), PTSD Research Quarterly
(http://www.ncptsd.org/publications/rq/index.html), NCP
Clinical Quarterly
(http://www.ncptsd.org/publications/cq/index.html), ecc..
Siti specifici per
Centro Cochrane Italiano
lineeguida e review
(http://www.areas.it/index.asp?IDL=ITA),
sistematiche
National Guideline Clearinghouse
(http://www.guideline.gov), Scottish Intercollegiate Guideline
Network
(http://www.sign.ac.uk/guidelines/published/index.html),
New Zealand Guideline Group
(http://www.nzgg.org.nz/library.cfm), Programma Nazionale
Lineeguida (http://www.pnlg.it/)
Siti specifici per
National Institutes Clinical Trials
protocolli clinici
(http://www.clinicaltrials.gov/), Physician data Query (PDQ)
(http://www.nci.nih.gov/search/clinical_trials/), Centerwatch
Clinical Trials Listing Service
(http://www.centerwatch.com/), ecc..
I database bibliografici
Reperrtori bibliografici
A stampa
Elettronici = database bibliorafici
5
Alcuni repertori bibliografici a stampa
Corrispondenti Database
Index Medicus
Medline
(gratuito)
(Per la descrizione, vedi Cosa contiene PubMed)
Excerpta Medica
Embase
(a pagamento)
9 milioni di citazioni indicizzate, da 4.000
giornali biomedici di 70 paesi.
450.000 citazioni aggiunte annualmente
1974Aggiornamento settimanaleTopics:
Farmacologia, effetti avversi dei farmaci, terapia
farmacologica, tossicologia, dipendenza e abuso da
sostanze, farmacoeconomia.
Ricerca biologica di base.
Medicina clinica e sperimentale.
Politica sanitaria, salute pubblica, salute ambientale,
salute occupazionale.
Psichiatria.
Scienza forense.
Ingegneria biomedica.
Current Contents
Current Contents Search
(a pagamento)
Oltre 12.000 records di indici e citazioni
bibliografiche da 6.500 riviste scientifiche
internazionali
1990 Aggiornamento quotidiano
6
Topics distribuiti in sette sezioni:
Clinical Medicine
Life Sciences
Engineering, Technology and Applied Sciences
Agriculture, Biology and Environmental Sciences
Physical, Chemical and Earth Sciences
Social and Behavioral Sciences
Arts and Humanities.
Psychological Abstract
PsycInfo
(a pagamento)
Oltre 1 milione di citazioni, indicizzate dal 1967,
da 1845 riviste internazionali, capitoli di libri,
libri, technical report, dissertazioni in 25 lingue.
1887 –
Aggiornamento settimanale
Topics:
Psicologia applicata
Psicologia evolutiva
Psicologia educazionale
Sistemi di comunicazione
Psicologia sperimentale
Personalità
Disturbi fisici e psicologici
Neuroscienze
Psicometria
Psicologia sociale
Psicologia dello sport e del tempo libero
EmBase, Current Contents, PsycInfo sono consultabili su CD o via Internet, tramite Hosts come Dialog o
Ovid.
Per consultare un database, occorre conoscere:
1. la struttura del database
2. il software di information retrieval
7
3. l’uso degli operatori booleani
Gli operatori booleani
Cancro AND depressione
Depressione in pazienti
Cancro OR Depressione
Depressione BUTNOT Cancro
Depressione o Pazienti oncologici Depressione ma non nei Pazienti
oncologici
oncologici
Es.:
Eziologia, Diagnosi, Terapia dell’Anoressia e della Bulimia, ma non in Pazienti femmine
1) Etiology OR Diagnosis OR Therapy
2) Anorex* OR Bulim*
3) 1 AND 2
4) 3 BUTNOT (Female* OR Women OR Woman)
OPPURE
(Etiology OR Diagnosis OR Therapy) AND (Anorex* OR Bulim*) BUTNOT ((Female*
OR Woman OR Women)
OPPURE
(Etiology OR Therapy OR Diagnosis) AND (Anorex* OR Bulim*) AND (Female* OR
Wom#n)
Il Troncamneto si può indicare con l’asterisco o con il punto iinterrogativo, as econda delle basi dati. Alcune
basi di dati consento anche il Mascheramento, che può essere indicato con il #.
Esiste per alcuni archivi anche la possibilità di usare altri comandi come quello di adiacenza e prossimità.
Es.: Clinical adj Psychology
PubMed
8
Cosa è PubMed
PubMed è un servizio prodotto dal National Center for Biotechnology Information (BNCI) della National
Library of Medicine di Bethesda. Gestito in collaborazione con editori di letteratura biomedica, tramite il
software Entrez, fornisce l’accesso ad oltre 12 milioni di citazioni bibliografiche di articoli tratti da riviste
biomediche internazionali.
Viene lanciato ufficialmente il 26 giugno 1997 dal vicepresidente Al Gore, che proclama la decisione del
governo statunitense di mettere a disposizione di tutti i cittadini e non solo dei medici le collezioni di
letteratura biomedica, fra le più grosse nel mondo, della National Library of Medicine.
Indirizzo per collegarsi: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi
Cosa contiene PubMed?
PubMed contiene:
1) Medline, la base dati bibliografica a carattere biomedico più importante prodotta dalla National Library
of Medicine e più conosciuta a livello mondiale, che indicizza oltre 12 milioni di citazioni di articoli di
più di 4.600 riviste internazionali pubblicate negli Stati Uniti e in altri 70 paesi, dal 1966 ad oggi, oltre a
109.000 citazioni dal 1963 al 1965. Contiene, appunto dalla metà degli anni ’60, le citazioni presenti
nell’Index Medicus, il repertorio bibliografico a stampa, pubblicato per la prima volta dalla National
Library of Medicine nel 1879. (Citazioni “etichettate” con la dicitura [PubMed – indexed for Medline]).
2) Premedline: questa sezione contiene citazioni di articoli inserite quotidianamente, non ancora sottoposte
alle operazioni di indicizzazioni. (Citazioni “etichettate” con la dicitura [PubMed – in process]).
3) Publisher: questa sezione contiene citazioni di articoli fornite direttamente in via elettronica dagli editori
che collaborano al mantenimento di PubMed e non ancora sottoposte alle operazioni di indicizzazioni.
(Citazioni “etichettate” con la dicitura [PubMed – as supplied by publisher].
Le citazioni collocate temporaneamente in Premedline e Publisher, allo scopo di renderle subito fruibili,
saranno poi trasferite in Meline, dopo il completamento delle procedure di indicizzazione.
Si ricorda che esiste anche OldMedline, http://www.nlm.nih.gov/databases/databases_oldmedline.html,
un’altra base di dati che si interroga tramite il Gateway della National Library of Medicine
(http://gateway.nlm.nih.gov/gw/Cmd) e che contiene citazioni dal 1958 al 1965. Non c’è sovrapposizione fra
le due basi di dati per quanto riguarda le citazioni precedenti al 1966, in quanto sono inserite o in una dase o
nell’altra. Perciò per assicurarsi una ricerca completa ed esaustiva delle citazioni dal 1963 al 1965, occorre
effettuare la consultazione sia di meline che di Oldmedline
Come si interroga PubMed
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La consultazione di PubMed si effettua avvalendosi di tre strumenti fondamentali:
1) il MeSH;
2) i comandi del programma di interrogazione;
3) gli operatori booleani.
I MeSH
Ad ogni articolo vengono assegnati dei descrittori che ne indicano il contenuto, il tipo di pubblicazione, il
taglio di trattazione, ecc..
Descrittori di Medline = MeSH = Medical Subject Headings
•Costituiscono un TESAURO:
a) sono termini in forma normalizzata;
b) sono collegati tra loro tramite rinvii;
c) sono strutturati in una gerarchia “ad albero” (gerarchicamente subordinati o coordinati tra di loro);
d) sono distribuiti in categorie.
Il Tesauro si trova:
♦ all’interno di PubMed, alla voce “MeSH Brower” (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/meshbrowser.cgi),
oppure
♦ nel sito della National Library of Medicine (http://www.nlm.nih.gov/mesh/2002/MBrowser.html)
Quest’ultimo è più efficace.
I subheadings
Indicano i tagli di trattazione dell’articolo
Servono per selezionare le citazioni di interesse
L’utilizzo dei MeSH in Pubmed
Sono assenti nei record contrassegnati con :
–“medline record in process”,
–“record as supplied by publisher”.
Non esistono per argomenti che ricorrono raramente (es.: patologie rare).
Non esistono per termini “nuovi”: in questo caso infatti il futuro descrittore avrà bisogno di un periodo di
monitoraggio.
10
In alternativa, si effettua la ricerca libera con operatori logici
Limits
La ricerca può essere ristretta attraverso una serie di selezioni:
–gruppi d’età
–data di pubblicazione dell’articolo
–data d’inserimento del record nel database
–tipo di pubblicazione.
Preview/Index
Permette di:
vedere in anticipo il numero delle citazioni della ricerca;
raffinare le strategie di ricerca aggiungendo uno o più termini;
aggiungere alla strategia termini da specifici campi (author, title, MeSH, MeSH Subheadings, ecc..);
vedere e selezionare termini dall’Index per sviluppare strategie di ricerca.
History
E’ un elenco di tutte le ricerche effettuate dall’inizio della sessione
Si disattiva dopo un’ora di inattività
Permette di combinare ricerche (es.: “#3 AND #5”), usando i set in elenco.
Clipboard
Con il comando “SEND + Clipboard
o
E’ lo spazio dove accantonare le citazioni interessanti, selezionate da ricerche diverse effettuate durante
la stessa sessione
o
Accoglie al massimo 500 citazioni.
o
Si disattiva dopo un’ora di inattività.
Il materiale raccolto si visualizza tramite il comando “CLIPBOARD”
Display
Brief
Pmid (PubMed Identifier + nome del primo autore + alcune parole del titolo)
Summary
Dati bibliografici essenziali
11
Citation
Dati bibliografici + abstract + MeSH
Abstract
Dati bibliografici + abstract
MEDLINE
Tutti i campi
Sort
Serve per per ordinare i record per autore, rivista o data di pubblicazione.
Esempio di record in Citation:
1: J Am Diet Assoc 2002 Aug;102(8):1145-55
Position of the American Dietetic Association: weight management.
Cummings S, Parham ES, Strain GW; American Dietetic Association. Massachusetts General Hospital
Weight Center, Boston, USA.
It is the position of the American Dietetic Association that successful weight management to improve overall
health for adults requires a lifelong commitment to healthful lifestyle behaviors emphasizing sustainable and
enjoyable eating practices and daily physical activity. Americans are increasing in body fat as they become
more sedentary. Obesity has reached epidemic proportions and health care costs associated with weightrelated illnesses have escalated. Although our knowledge base has greatly expanded regarding the complex
causation of increased body fat, little progress has been made in long-term maintenance interventions with
the exception of surgery. Lifestyle modifications in food intake and exercise remain the hallmarks of effective
treatment, but are difficult to initiate and sustain over the long term. The dietitian can play a pivotal role in
modifying weight status by helping to formulate reasonable goals which can be met and sustained with a
healthy eating approach as outlined in the Dietary Guidelines for 2000. Any changes in dietary intake and
exercise patterns which decrease caloric intake below energy expenditure will result in weight loss, but it is
the responsibility of the dietitian to make sure the changes recommended are directed toward improved
physiological and psychological health. A thorough clinical assessment should help define possible genetic,
environmental, and behavioral factors contributing to weight status and is important to the formulation of an
individualized intervention. The activation of treatment strategies is often limited by available resources and
cost. Reimbursement by third party payers for services is limited. Health care dollars are consumed for
treatment of weight-related diseases. Public policy must change if the obesity epidemic is to be stopped and
appropriate weight management techniques activated.
Publication Types: Guideline Practice Guideline
MeSH Terms:
Body Weight/physiology*
Dietetics
Environment
12
Health Promotion
Human
Life Style
Obesity*/prevention & control
Obesity*/etiology
Obesity*/diet therapy
Obesity*/diagnosis
Recurrence
Societies
United States
PMID: 12171464 [PubMed - indexed for MEDLINE]
Salvataggio e stampa delle citazioni
Con il comando
+ File
Per salvare la ricerca
“SEND
+ Text
Per visualizzare l’elenco in forma grafica essenziale
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E’ un algoritmo che ritrova i record che hanno più parole similari con il record da noi scelto.
Da usare con cautela, dopo aver scelto un record significativo o nel caso in cui non si siano trovati record
pertinenti.
Una strategia di ricerca corretta e ben impostata rende di solito inutile l’uso di questa opzione.
Clinical Queries
Filtri automatici, che permettono di scegliere fra due opzioni:
a) Sensibilità (individua tutta l’informazione interessante) o specificità (trova solo informazione
particolarmente pertinente)
b) Punto di vista: terapia, diagnosi, eziologia o prognosi
Il servizio è stato creato per i clinici, che devono recuperare rapidamente evidenze
NB: Non è indicato per ricerche approfondite
CUBBY
•Registrazione gratuita
•Permette di organizzarsi un servizio di aggiornamento personalizzato.
–Salvataggio di un massimo di 100 strategie di ricerca (anche complesse)
13
–Controllo periodico su eventuali nuovi inserimenti di informazione pertinente (E’ uscito qualcosa di nuovo
sull’argomento?)
14
Dr. Laura Bianciardi
CIRDIB
Centro Interdipartimentale per il Recupero e la Diffusione dell’Informazione Biomedica
Facoltà di Medicina e Chirurgia
Centro Didattico Le Scotte
53100 SIENA
Tel.: 0577 233288
Fax: 0577 233287
E-mail: [email protected]
15