Cap. 6 L’espressione genica:
la traduzione pp.144-167
Sintesi 06
• Chiamiamo codice genetico l’insieme delle triplette di
nucleotidi (codoni), ciascuna delle quali designa un
amminoacido nella catena polipeptidica
• Il codice genetico è (1) universale, (2) continuo e (3)
degenerato, cioè per un amminoacido possono esistere più
triplette
• Il messaggero viene tradotto in un peptide nei ribosomi
• L’ RNAt presenta al ribosoma gli amminoacidi
• La sequenza polipeptidica viene determinata dal legame fra
il codone e l’anticodone complementare del tRNA
• Il codone di inizio trascrizione è AUG, che codifica per Met
• La traduzione termina quando sull’mRNA si incontra un
codone di stop (UAG, UAA o UGA)
Cellula pro- ed Eu-cariote
Struttura di un amminoacido
Gli
amminoacidi
Le quattro strutture proteiche
Khorana: miniRNA in sistema cell-free
Frequenze nell’RNA ottenuto a partire da ¾ U e ¼ G e nei
polipeptidi:
Attese
Osservate
P(UUU) = ¾ x ¾ x ¾ = 27/64
Phe = 1.00
P(UUG) = ¾ x ¾ x ¼ = 9/64
Leu = 0.32
P(UGU) = ¾ x ¼ x ¾ = 9/64
Cys = 0.31
P(GUU) = ¼ x ¾ x ¾ = 9/64
Val = 0.37
P(UGG) = ¾ x ¼ x ¼ = 3/64
Trp = 0.12
P(GUG) = ¼ x ¾ x ¼ = 3/64
Gly = 0.14
P(GGU) = ¼ x ¼ x ¾ = 3/64
P(GGG) = ¼ x ¼ x ¼ = 1/64
Khorana: miniRNA in sistema cell-free
Attese
P(UUU) = ¾ x ¾ x ¾ = 27/64
P(UUG) = ¾ x ¾ x ¼ = 9/64
P(UGU) = ¾ x ¼ x ¾ = 9/64
P(GUU) = ¼ x ¾ x ¾ = 9/64
P(UGG) = ¾ x ¼ x ¼ = 3/64
P(GUG) = ¼ x ¾ x ¼ = 3/64
P(GGU) = ¼ x ¼ x ¾ = 3/64
P(GGG) = ¼ x ¼ x ¼ = 1/64
Osservate
Phe = 1.00
Leu = 0.32
Cys = 0.31
Val = 0.37
Trp = 0.12
Gly = 0.14
Il codice
genetico
Il codice genetico:
1.
2.
3.
4.
5.
6.
È a triplette;
È continuo (nessun nucleotide viene saltato);
Non ha sovrapposizioni (eccezioni: alcuni procarioti);
È universale (eccezioni: mitocondri, Tetrahymena);
È degenerato (tranne che per met e trp);
Ha segnali di inizio (AUG) e fine (UAA, UAG, UGA).
Qual è il vantaggio di un codice degenerato?
Wobbling o vacillamento in terza base
L’amminoacido viene legato al tRNA
Schema della traduzione
1. Inizio:
Legame fra fattori d’inizio e subunità 30S del ribosoma
Legame fra la seq. Di Shine-Dalgarno e l’rRNA 30S (complesso
d’inizio 30S)
Legame fra AUG e fMet-tRNA
Legame con la subunità 50S del ribosoma (complesso d’inizio 70S)
2. Allungamento:
Legame fra amminoacil-tRNA e ribosoma
Formazione del legame peptidico
Scorrimento (traslocazione) del ribosoma lungo l’mRNA
3. Terminazione:
Incontro col codone di stop
Legame fra fattore di rilascio e codone di stop
Rilascio del polipeptide, separazione delle subunità ribosomali
Traduzione: inizio
Traduzione: allungamento
Traduzione:
terminazione
Riassunto 06
• Chiamiamo codice genetico l’insieme delle triplette di
nucleotidi (codoni), ciascuna delle quali designa un
amminoacido nella catena polipeptidica
• Il codice genetico è (1) universale, (2) continuo e (3)
degenerato, cioè per un amminoacido possono esistere più
triplette
• Il messaggero viene tradotto in un peptide nei ribosomi
• L’ RNAt presenta al ribosoma gli amminoacidi
• La sequenza polipeptidica viene determinata dal legame fra
il codone e l’anticodone complementare del tRNA
• Il codone di inizio trascrizione è AUG, che codifica per Met
• La traduzione termina quando sull’mRNA si incontra un
codone di stop (UAG, UAA o UGA)