Organizzazione strutturale delle proteine Organizzazione strutturale Il legame peptidico Il legame peptidico Il legame peptidico Struttura secondaria Struttura secondaria • • • • • Alfa elica Foglietto beta Beta turn Elica 3-10 Elica sinistrorsa Struttura secondaria Struttura secondaria Struttura secondaria Struttura secondaria Struttura secondaria Struttura secondaria 14 15 16 Struttura secondaria Struttura secondaria ALA TRP PRO Struttura terziaria Quale struttura secondaria è preferibile? Struttura terziaria Quale struttura secondaria è preferibile? • Alcuni aminoacidi preferiscono assumere una delle due strutture • Alcuni aminoacidi non possono assumere una delle due strutture • Abbiamo considerato solo lo scheletro!! Struttura terziaria Interazioni non covalenti • • • • • Interazioni elettrostatiche Interazioni dipolari Forze di dispersione Effetto idrofobico Unica eccezione covalente: il ponte disolfuro Struttura terziaria Effetto idrofobico Formazione di un clatrato -Debole contributo entalpico intramolecolare favorevole -Debole contributo entropico intramolecolare sfavorevole -Forte contributo entropico intermolecolare favorevole Struttura terziaria Proteine fibrose Proteine globulari Proteine Fibrose Proteine Fibrose Proteine Fibrose Proteine Fibrose Proteine Fibrose Proteine Globulari Proteine Globulari Proteine Globulari Domìni Proteine Globulari Proteine Globulari Strutture Quaternarie Denaturazione e Folding Denaturazione e Folding Denaturazione e Folding Sequenza NLKTEWPELVGKSVEE AKKVILQDKPEAQIIVL PVGTIVTMEYRIDRVR LFVDKLDNIAEVPRVG Denaturazione e Folding Denaturazione e Folding