Le reti Regionali:
L’esperienza pugliese di BioBOP
A.Paradiso
Istituto Tumori, IRCCS, Bari
L’INTERVENTO “RETI DI LABORATORI PUBBLICI DI RICERCARegione Puglia”
Accordo di Programma Quadro per la Ricerca (Delibera CIPE
35/2005 relativa alle risorse FAS per il periodo 2005 – 2008)
Le linee d'intervento per il rafforzamento del sistema regionale
dell'innovazione sono:
• Sostegno alle attività di sviluppo sperimentale e
all'innovazione di processo e organizzativa delle PMI e aiuti
alla nascita e sviluppo di piccole imprese innovative
• Rafforzamento del potenziale tecnologico e infrastrutturale
della Regione
Medicina stratificata >>>>> personalizzata>>>>>precision
Domanda di innovazione del
sistema produttivo Pugliese
• Diagnostici:
nuovi Biomarkers
• Biomedicale
tecnologie innovative
• Campioni biologici umani
• Informazione su aggressività
clinica
• Caratterizzazione biologica
• Farmacologico
validazione clinicoanalitica di targets
• Procedure ELSI
standardizzate
Lifecycle of a Biospecimen
Medical
Treatment
Donor
Consent
Medical/
Transport Receiving
Surgical
Procedures
Storage
Processing
Antibiotics
Other drugs
Type of anesthesia
Anesthesia duration
Arterial clamp time
Acquisition
Processing Time
Temperature
Fixation Agent
SOP’s
Release, Scientific
Quality Distribution Analysis
Transport
Annotation
Measure in Minutes
Pre-acquisition
Medical
Research
Clinical Biobanking
Restocking/
Destruction
Measure in Years
Post Acquisition
Storage Media
Storage Method
Storage Temperature
Quality Controls
Pathology Review
Disease Site
Clinical Data
Data Standards
SOP’s
Pre- Release
Study Design
SOP’s
Equipment
Cohort Definition
SOP’s
Material Transfer
Ethics
Courtesy Peter Riegman Erasmus University and Marble Arch International Working Group on Human Specimen Biobanking for Biomedical Research
BioBOP-BioBanca Oncologica Pugliese
Network per l’utilizzo di tessuti oncologici controllati e caratterizzati per
lo sviluppo di nuovi approcci diagnostici, farmacologici e biomedicali
Unità di ricerca
Responsabile
1: Istituto Tumori G Paolo II, IRCCS,Bari
2: Dip Scienze Mediche e Lavoro, Univ Foggia
Dr A Paradiso
Prof A Liso
3: Dip Fisiol Generale e Ambientale, Univ Bari
Prof S Reshkin
4: Ist. Tecnologie Biomediche, CNR, Bari
5: Dip Fisiol Generale e Ambientale, Univ. Bari
Prof G Pesole
Prof S Cotecchia
6: IRCCS CSS, S. Giovanni Rotondo
Prof V Fazio
Cod Progetto: 57 BioBOP-BioBancaOncologica Pugliese
Obiettivo della Rete
-Sviluppo di
una Infrastruttura di Risorse
Biomolecolari per la Ricerca organizzate
intorno ad una Cancer-Oriented-Biobank
regionale.
-Integrazione risorse biomolecolari e
tecnologiche per caratterizzazione tessuti
oncologici
Tessuti Umani
Caratterizzzazione Biologica
Uni FGEmatologie
IRCCS
Tumori
Bari
Realtà Produttiva
CSS SGR
Biobanca
Regionale
DataBase
UniBa
ITBCNR
UO2: Dip Scienze Mediche e Lavoro, Fac. Medicina e Chirurgia,
Univ Foggia
Prof Arcangelo Liso
AutoMACS Pro
Separator, Miltenyi
Dip. Bioscienze, Biotecnologie e Biofarmaceutica Università Bari
Prof S Reshkin
Prof S Cotecchia
Microscopio confocale
Laser multi-fotoni
Targa del Confocale: BioBoP/Università
Targa del multi-fotoni: BioBoP/Università
UO4: Ist. Tecnologie Biomediche, CNR, Bari
Prof Graziano Pesole
Dr. Apollonia Tullo
1.
2
1. Liquid Handler:
3
2. Digital PCR:
4
4. Contatore automatico di cellule:
3. Sistema di frammentazione a ultrasuoni:
UO6: IRCCS Casa Sollievo Sofferenza, S. Giovanni Rotondo
Prof V Fazio
Dr P Parrella
HT7900 Fast Real time PCR System (Life Technology).
Sistema
di PCR in Real Time dotato di blocco Low Density Array (LDA) che permette di analizzare
fino a 380 diversi target precedentemente depositati su una apposita card. Conferendo
allo strumento funzionalità di microarray a bassa densità.
Tessuti Umani
Caratterizzzazione Biologica
Realtà Produttiva
Uni FGEmatologie
IRCCS
Tumori
Bari
CSS SGR
Biobanca Istituto
Tumori Bari
UniBa
ITBCNR
Biobanca Oncologica:
il percorso dell’Istituto Tumori, IRCCS, Bari
• Struttura
• Biobanking dal 1988 Lab Recettori Ormonali e Cinetica Cellulare
• Biobanca Laboratorio Oncologia Sperimentale>> Certificazione ISO 9001
nel 2008
• Biobanca Istituzionale 2009
• Biobanca di interesse Regionale-BioBOP 2011
• Responsabilità
•
•
•
•
•
2004: Italian Network Cancer Biobanks (NICAB): coordinamento
2008: Rete Italiana Biobanche Oncologiche (RIBBO): coordinamento
2009: EORTC Biobank WG co-chairman
2010: BBMRI Prototype Project, chairman Italian Cancer Biobanks
2012: BBMRI-ESFRI: member DG Committee
• Pubblicazioni>100
• Special Issue Biopreservation&Biobanking, vol 9, n.2, 2011
(Guest Edt Paradiso A, Daidone MG, Riegman P)
Biobanca Istituto Tumori Bari:
Le esigenze
Dimensioni:
Storage Biocampioni per
Performances
Versatilità
•
Istituto Tumori
Riferimento Regionale
Different tissues
Biomolecular Resource Centre
Storage material of GMP Facility
Istituto Tumori G Paolo II IRCCS Bari
Livello 1:
Elaborazione dati
Laboratorio manipolazione, aliquotaggio
Laboratorio Produzione Derivati
Ingresso
n. 2 livelli, 280 mq
Livello 2:
Area Stocckaggio per Diagnostica/ricerca
Criocontenitori, -80°C, -143°C,-173°C
Area Stocckaggio Materiale terapeutico
Criocontenitori,-143°C,-173°C, discesa
BioBanca Istituzionale
Area Congelatori piano -1
1)Equipment Monitoring, Calibration,
Maintenance, and Repair
2)Control of Biospecimen Collection Supplies
3)Biospecimen Quality Control Testing
4) Biosafety (Grizzle and Fredenburgh 2001)
Specimen traceability: The Tissue Bank Project
BioBanca
Istituzionale
IRCCS Bari
Storage
Clinical
Pathology
Biobanche tra presente e futuro
Organizzazione-Gestione
Standard Operating Procedures
•
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•
•
I
Informed Consent.
Equipment Monitoring, Calibration, Maintenance, and Repair
Control of Biospecimen Collection Supplies (Disposables and Reagents)
Biospecimen Identification and Labeling
Biospecimen Collection and Processing Methods
Storage and Retrieval
Shipping and Receiving
In-House Including Biospecimen Quality Control Testing
Biospecimen Data Collection and Management (Informatics)
Biosafety
Training
Security
(OBBR-NCI, last Revision 2010)
BIOBANCA ISTITUZIONALE
Istituto Tumori Bari
Opportunità:
Governance:
Management Interno
Rapporti con Providers-Rete BioBOP
Rapporti con Stake-holders
Sostenibilità/costi Barbareschi M (Pathologica, 2008)
D’Agnolo G (CNSBBV, RIBBO, 2012)
Clement B (JTM, 2014)
Clement B,JTM 2014
Outputs for a Biobank
• Make research - Scientific publication (BRIF)
(Hofman V, ..Parodi B, et al Biopreserv Biobank. 2013;
• Utilization of biobank resources (underuse)
(Paradiso A, Hansson M, Nature Medicine, 2013)
BIOBANCA ISTITUZIONALE
Istituto Tumori Bari
Punti di forza:
Capacità di sostenere l’impresa (Call “Clusters
tecnologici”)
Sviluppare Ricerca (ONEV, Trials Clinici, BBMRI, Registro
Tumori )
Cultura/Regolamentazione Biobanking a Livello
Regionale
Accordo Conferenza permanente Stato-Regioni 25 Marzo 2009
“Regioni responsabili della individuazione/regolamentazione delle
biobanche da certificare nel territorio di competenza”
• Rete biobanche Regione Liguria (delibera n.34 Giunta Regionale , 22
gennaio 2010)
• Rete biobanche Regione Campania (delibera n.39 Giunta Regionale
14 febbraio 2011)
• Rete Oncologica Lombarda (ROL) (Decreto n.10507,Novembre 2012.
Linee Guida Regolamentazione Biobanche di Ricerca )
• Regione Toscana (delibera n.974 del 25 novembre 2013)
http://www.bbmri.it/regioni
Biobanca:
sito web
Email:
www.biobop.it
[email protected]
Coord Scient.
A Paradiso
[email protected]
RUP
GSalomone
[email protected]
BBMRI.IT
ML Lavitrano
www.bbmri.it