Onclarity™ HPV Assay English: pages 1 – 16 Deutsch: Seiten 32 – 47 Español: páginas 64–79 Français: pages 16 – 31 Italiano: pagina 48 – 63 U 8089899(02) 2014-01 442946 r Свържете се с местния представител на BD за инструкзии. / Pokyny vám poskytne místní zástupce společnosti BD. / Kontakt den lokale BD repræsentant for at få instruktioner. / Επικοινωνήστε με τον τοπικό αντιπρόσωπο της BD για οδηγίες. / Kasutusjuhiste suhtes kontakteeruge oma kohaliku BD esindajaga. / Ota yhteys lähimpään BD:n edustajaan ohjeiden saamiseksi. / Kontaktiraj lokalnog predstavnika BD za upute. / A használati utasítást kérje a BD helyi képviseletétől. / Нұсқаулар үшін жергілікті BD өкілімен хабарласыңыз. / Naudojimo instrukcijų teiraukitės vietos BD įgaliotojo atstovo. / Neem contact op met uw plaatselijke BD-vertegenwoordiger voor instructies. / Kontakt din lokale BD-representant for mer informasjon. / Aby uzyskać instrukcje użytkowania, skontaktuj się z lokalnym przedstawicielstwem BD. / Contacte o representante local da BD para instruções. / Pentru instrucţiuni, contactaţi reprezentantul local BD. / Для получения указаний обратитесь к местному представителю компании BD. / Inštrukcie získate u miestneho zástupcu spoločnosti BD. / Obratite se svom lokalnom predstavniku kompanije BD za uputstva. / Kontakta närmaste BD-representant för anvisningar. / Talimatlar için yerel BD temsilcinizle temasa geçin. / За інструкціями зверніться до місцевого представника компанії BD. INTENDED USE The BD Onclarity HPV Assay is an amplified DNA test for the qualitative detection of high risk types of human papillomavirus (HPV). The assay detects all high risk HPV types (16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, and 68) and provides the capability for genotyping of six high risk types (HPV 16, 18, 31, 45, 51 and 52). Cervical specimens that are tested with the BD Onclarity HPV Assay include the BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit, BD SurePath™ Preservative Fluid, and PreservCyt® Solution (using an aliquot that is removed prior to or after processing for either the BD SurePath or ThinPrep™ Pap test). The BD Onclarity HPV Assay is performed with the BD Viper™ LT System. SUMMARY AND EXPLANATION Human papillomavirus (HPV) is the most common sexually transmitted virus in the world, with 50% of sexually active people having genital HPV at some point in their lives. People often do not know that they are infected and do not take precautions to prevent the spread of the virus to others. There are more than 40 types of HPV that can infect the genital tract.1 In many cases, HPV infections are transient, and the body will clear the virus on its own. In some instances however, the virus is persistent and will cause normal cells to become abnormal, leading to cancer. These oncogenic types of HPV are classified as high risk, and include HPV 16 and 18. Other types are considered low risk, as they do not appear to cause cancer. According to the World Health Organization (WHO), HPV is the second biggest cause of female cancer mortality worldwide, claiming about 250,000 lives annually. In Europe alone, the disease claims about 15,000 lives each year.2 It is estimated that nearly 70% of cervical cancers are caused by HPV types 16 and 18.3 Today, Pap tests can inform a clinician if there are changes to the cervical cells. If those cells are abnormal, an HPV test may be done to determine if those cervical changes are due to a strain of HPV which can lead to cervical cancer. Not all molecular assays can distinguish among the different types of HPV. The BD Onclarity HPV Assay, when tested with the BD Viper LT System, is an amplified DNA assay for the qualitative detection of high risk types of human papillomavirus (HPV). The assay detects HPV types 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, and 68 and allows simultaneous identification of the high-risk types 16, 18, 31, 45, 51, 52 and other high-risk genotypes reported by genotype group (P1: 33/58; P2: 56/59/66; P3: 35/39/68). Cervical specimens that may be tested with the BD Onclarity HPV Assay include BD SurePath Preservative Fluid (using an aliquot that is removed prior to or after processing for the BD SurePath Pap test), PreservCyt Solution (using an aliquot that is removed prior to or after processing for the PreservCyt Pap test), and the BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit. PRINCIPLES OF THE PROCEDURE The BD Onclarity Human Papillomavirus (HPV) Assay is designed for use with the BD SurePath Preservative Fluid (using an aliquot that is removed prior to or after processing for the BD SurePath Pap test), PreservCyt Solution (using an aliquot that is removed prior to or after processing for the PreservCyt Pap test), and the BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit, applicable reagents, the BD Viper LT System and BD FOX™ Extraction. Specimens undergo a pre-warm step in the BD Pre-warm Heater to homogenize the matrix, lyse cells, and release DNA capable of being extracted and amplified. After cooling, the specimens are loaded onto the BD Viper LT System which then performs all the steps involved in extraction and amplification of target DNA, without further user intervention. The specimen is transferred to an extraction tube that contains ferric oxide particles in a dissolvable film. Acid is then added to lower the pH and induce a positive charge on the ferric oxide, which in turn binds the negatively charged DNA. The particles and bound DNA are then pulled to the sides of the extraction tube by magnets and the treated specimen is aspirated to waste. The particles are washed and a high pH elution buffer is added to elute the purified DNA. Finally, a neutralization buffer is used to adjust the pH of the eluate to the optimum for DNA amplification. The BD Onclarity HPV Assay is based on the simultaneous amplification and detection of target DNA using amplification primers and fluorescently-labeled detector probes using real-time polymerase chain reaction (PCR). The reagents are dried in three tubes (G1, G2, and G3) that are capable of detecting the 14 HPV genotypes and a specimen-derived internal control consisting of a fragment of DNA from the human beta globin gene. Each single tube contains the amplification primers, fluorescently-labeled detector probes, DNA polymerase, nucleotides and other reagents necessary for amplification for the respective assays. The BD Viper LT System pipettes a portion of the purified DNA solution from each extraction tube into the three BD Onclarity HPV PCR tubes (G1, G2, and G3) which are then sealed to prevent contamination. The presence or absence of HPV DNA is determined by the PCR cycle at which the signal crosses a pre-established threshold. In addition, the assay will extract, amplify and detect a fragment of the human beta globin gene as an internal control to assess specimen processing, extraction, and amplification. REAGENTS AND MATERIALS PROVIDED: Each BD Onclarity HPV Assay Reagent Pack contains: BD Onclarity HPV G1 PCR tubes, 2 x 96: each G1 PCR tube contains approximately 32.5 pmol oligonucleotides, 20 pmol fluorescently-labeled detector probes, 80 nmol dNTPs, and 0.52 units of DNA polymerase with stabilizers and buffer components. BD Onclarity HPV G2 PCR tubes, 2 x 96: each G2 PCR tube contains approximately 42.5 pmol oligonucleotides, 30 pmol fluorescently-labeled detector probes, 80 nmol dNTPs, and 0.52 units of DNA polymerase with stabilizers and buffer components. BD Onclarity HPV G3 PCR tubes, 2 x 96: each G3 PCR tube contains approximately 42.5 pmol oligonucleotides, 25 pmol fluorescently-labeled detector probes, 80 nmol dNTPs, and 0.52 units of DNA polymerase with stabilizers and buffer components. NOTE: Each pouch contains one desiccant bag. Control Set for the BD Onclarity HPV Assay: 24 BD Onclarity HPV Positive Control tubes containing approximately 14,430 copies of HPV 16 linearized plasmid, 8,325 copies HPV 18 linearized plasmid, 8,418 copies of HPV 56 linearized plasmid, and 3,885 copies of a plasmid containing a human beta globin gene sequence in carrier nucleic acid, and 24 BD Onclarity HPV Negative Controls tubes containing carrier nucleic acid alone. The concentrations of the carrier nucleic acid and plasmids are determined spectrophotometrically. BD Onclarity HPV Liquid Based Cytology Specimen (LBC) Diluent Tubes: 400 tubes each containing approximately 1.7 mL of buffer with salt, detergent, and preservative. BD FOX PCR Extraction Tubes: 48 strips of 8 tubes, each containing approximately 10 mg of iron oxide in a dissolvable film. BD Viper PCR Extraction Reagent Trough with Piercing Tool: each 5 cavity Extraction Reagent trough contains approximately 16.5 mL Binding Acid, 72.5 mL Wash Buffer, 25.4 mL Elution Buffer, 19.4 mL Neutralization Buffer with preservative and 15.5 mL Waste Neutralization Solution. INSTRUMENT, EQUIPMENT AND SUPPLIES Materials Provided: BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit, BD Viper LT Instrument, BD Viper LT Instrument Plates, BD Viper LT Pipette Tips, BD Viper LT Solid Waste Liners, BD Viper LT System PCR Tube/Tray Kit, BD Viper LT System PCR Accessory Kit, BD Viper Pre-warm Heater, BD Viper LT Specimen Rack, BD Viper Neutralization Pouches, Specimen Tubes and Caps for use on the BD Viper System (Extracted Mode), BD ProbeTec™ Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae (CT/GC) Amplified DNA Assay Endocervical Specimen Collection and DRY TRANSPORT Kit. Materials Required But Not Provided: Nitrile gloves, displacement pipettes, polypropylene aerosol-resistant tips capable of delivering 0.5 ± 0.05 mL, vortex mixer, 0.5% (v/v) sodium hypochlorite, 1% (v/v) sodium hypochlorite, 3% (w/v) hydrogen peroxide, isopropyl alcohol, molecular biology-grade nuclease-free water. Storage and Handling Requirements: The BD Onclarity HPV LBC Diluent and the BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent should be stored at 2 – 25 ºC. All other reagents may be stored at 2 – 33 ºC. Unopened Reagent Packs are stable until the expiration date. Once a pouch is opened, the PCR tubes are stable for 4 weeks if properly sealed or until the expiration date, whichever comes first. Do not freeze. WARNINGS AND PRECAUTIONS 1.For in vitro Diagnostic Use. 2. Pathogenic microorganisms, including hepatitis viruses and Human Immunodeficiency Virus, may be present in clinical specimens. “Standard Precautions”4-7 and institutional guidelines should be followed in handling all items contaminated with blood and other body fluids. For additional specific warnings, cautions and notes specific to the BD Viper LT, consult the BD Viper LT System User’s Manual. Specimen: 3. For liquid-based cytology specimens, use only the BD Onclarity HPV LBC Diluent tubes. 4. For cervical brush specimens, use only the BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit. 5. Optimal performance of the BD Onclarity HPV Assay requires proper specimen collection, handling and transport. 6. To reduce unnecessary bleeding, do not over-rotate the cervical brush during specimen collection. 7. Proper labeling should accompany each specimen to the laboratory. 8. When breaking the shaft of the cervical brush, take care to avoid splashing, spilling, or creating aerosols. Avoid contamination of the cervical brush head. 9. Take care to avoid cross-contamination during the specimen handling steps. Ensure that specimen containers do not contact one another, and discard used materials without passing over open containers. If gloves come in contact with specimen, change gloves to avoid cross-contamination. 10. Under- or over-dispensing of LBC specimen into the BD Onclarity HPV LBC Diluent tube may affect assay performance. Over filling the tubes may also result in liquid overflow on the BD Viper LT deck, and could cause contamination. 11. Cervical specimens must be collected and tested before the expiration date of the BD Onclarity HPV LBC Diluent tube or the BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent tube. 12. Use only polypropylene aerosol-resistant pipette tips to transfer specimens to the BD Onclarity HPV LBC Diluent tubes. Assay/Reagent: 13. BD Onclarity HPV Positive and Negative Controls must be pre-warmed within 24 hours of hydration. 14. Use only sample and control tubes with pierceable caps on the BD Viper LT System. Do not remove pierceable caps prior to running the instrument. Be sure to replace any punctured pierceable caps with new pierceable caps prior to running the instrument. 15. Do not interchange or mix kit reagents from kits with different lot numbers. 2 16. Do not test the BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent tube if received in the laboratory without the brush present. A false negative test result may occur. 17. Use only the BD Viper LT pipette tips as supplied by BD with the BD Viper LT System. 18. BD Viper PCR Extraction Reagent Trough with Piercing Tool DANGER H314 Causes severe burns and eye damage. H302 Harmful if swallowed. P260 Do not breathe dust/fume/gas/mist/vapours/spray. P280 Wear protective gloves/protective clothing/eye protection/face protection. P303/361/353 IF ON SKIN (or hair): Remove/Take off immediately all contaminated clothing. Rinse skin with water/shower. P304/340 IF INHALED: Remove victim to fresh air and keep at rest in a position comfortable for breathing. P405 Store locked up. P501 Dispose of contents/container in accordance with local/regional/national/international regulations. 19. Use only the BD Viper LT Clear Plate Sealers on the PCR tubes with the BD Viper LT System. 20. Reagent pouches containing unused PCR tubes MUST be carefully resealed after opening. Verify that desiccant is present prior to resealing the reagent pouches. 21. The PCR tubes MUST be properly sealed with the BD Viper LT Clear Plate Sealers prior to removing the plate from the BD Viper LT System. Sealing ensures a closed reaction for amplification and detection and is necessary to avoid contamination of the instrument and work area with amplification products. Do not remove sealing material from PCR tubes at any time. 22. To prevent contamination of the work environment with amplification products, use the disposal bags provided in the BD Viper LT System PCR Accessory Kit to dispose of tested PCR tubes. Make sure the bags are properly closed before disposal. 23. Although dedicated work areas are not required because the BD Viper LT design reduces the possibility of amplicon contamination in the testing environment, other precautions for controlling contamination, particularly to avoid contamination of specimens during manipulation, are necessary. 24. CHANGE GLOVES if they come in contact with specimen or appear to be wet, to avoid contaminating other specimens. Change gloves before leaving work area and upon entry into work area. 25. In the event of contamination, refer to the BD Viper LT System User’s Manual for cleaning instructions. 26. Contact BD Technical Service and Support in the event of an unusual situation, such as a spill into the BD Viper LT instrument or DNA contamination that cannot be removed by cleaning. SPECIMEN COLLECTION AND TRANSPORT Cervical specimens that may be tested with the BD Onclarity HPV Assay include the BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit, BD SurePath Preservative Fluid (using an aliquot that is removed prior to or after processing with the BD SurePath Pap test) and PreservCyt Solution (using an aliquot that is removed prior to or after processing for the ThinPrep Pap test). For U.S. and international shipments, specimens should be labeled in compliance with applicable state, federal, and international regulations covering the transport of clinical specimens and etiologic agents/infectious substances. Time and temperature conditions for storage must be maintained during transport. CERVICAL BRUSH SPECIMEN COLLECTION 1. Insert the BD Onclarity HPV Cervical Brush into the endocervix until only the bottom most bristles are exposed at the os. Slowly rotate ¼ to ½ turn in one direction. To reduce unnecessary bleeding, do not over-rotate the brush. 2. Remove cap from the BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent tube and immediately place the brush into the bottom of the tube. 3. Carefully break the shaft at the score line. Avoid splashing of the contents. 4. Tightly recap the tube. CERVICAL BRUSH SPECIMEN STORAGE AND TRANSPORT The cervical brush specimens in BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent tubes must be stored and transported to the laboratory and/or test site within 30 days after collection if kept at 2 – 30 ºC or within 30 days after collection if kept frozen at -20 ºC. Specimen storage and transport should not exceed the expiration date of the Cervical Brush Diluent tube. LBC SPECIMEN COLLECTION BD SurePath or PreservCyt specimens must be collected using either an endocervical broom or a brush/spatula combination as described in the BD SurePath or PreservCyt product insert. Once collected, BD SurePath or PreservCyt specimens can be stored and transported in their original vials for up to 30 days at 2 – 30 °C or 30 days if kept frozen at -20 ºC prior to transfer to BD Onclarity HPV LBC Specimen Diluent tubes. 3 LBC SPECIMEN STORAGE AND TRANSPORT LBC Specimen Transfer to BD Onclarity HPV LBC Diluent tubes - Prior to or After Removing an Aliquot for Processing for either the BD SurePath or ThinPrep Test. A 0.5 mL aliquot of either the BD SurePath or PreservCyt specimen is manually transferred from the original vial to the BD Onclarity HPV LBC Specimen Diluent tube prior to or after processing for either the BD SurePath or ThinPrep Pap test. Wear gloves when handling the BD Onclarity HPV LBC Specimen Diluent tube and the BD SurePath or PreservCyt specimen vial. If gloves come in contact with the specimen, immediately change them to prevent contamination of other specimens. BD SurePath Specimen Transfer Prior to or After Processing for the BD SurePath test NOTE: Refer to the BD PrepStain™ Slide Processor or BD Totalys™ SlidePrep Product Insert for instructions on removing an aliquot from the BD SurePath specimen vial prior to performing the BD SurePath liquid-based Pap test. NOTE: Handle one specimen at a time for processing. 1. Label a BD Onclarity HPV LBC Diluent tube with patient identification information. 2. Remove the cap from the BD Onclarity HPV LBC Diluent tube. 3. In order to ensure a homogenous mixture, vortex the BD SurePath specimen vial for 10-20 s. 4. Quickly transfer 0.5 mL from the specimen vial using an aerosol-resistant tip to the BD Onclarity HPV LBC Diluent tube within one minute of vortexing. 5. Discard pipette tip. NOTE: A separate pipette tip must be used for each specimen. 6. Tighten the cap on the BD Onclarity HPV LBC Diluent tube securely. 7. Invert the BD Onclarity HPV LBC Diluent tube 3 – 4 times to ensure that the specimen and diluent are well mixed. PreservCyt Specimen Transfer Prior to or After Processing for the ThinPrep Pap test NOTE: Refer to the ThinPrep 2000/3000 System Operator’s Manual Addendum for instructions on removing an aliquot from the PreservCyt specimen vial prior to performing the ThinPrep test. NOTE: Handle one specimen at a time for processing. 1. Label a BD Onclarity HPV LBC Diluent tube with patient identification information. 2. Remove the cap from the BD Onclarity HPV LBC Diluent tube. 3. In order to ensure a homogenous mixture, vortex the PreservCyt specimen vial at high speed for 8-12 s. 4. Immediately transfer 0.5 mL from the specimen vial using an aerosol-resistant tip to the BD Onclarity HPV LBC Diluent tube. 5. Discard pipette tip. NOTE: A separate pipette tip must be used for each specimen. 6. Tighten the cap on the BD Onclarity HPV LBC Diluent tube securely. 7. Invert the BD Onclarity HPV LBC Diluent tube 3 – 4 times to ensure that the specimen and diluent are well mixed. Storage and Transport of Specimens Transferred to the BD HPV LBC Diluent tubes After manual transfer to a BD Onclarity HPV LBC Diluent tube, the diluted specimen can be stored at 2 – 30 °C for up to 15 days, or up to 30 days when stored at -20 °C. PROCESSING PROCEDURE FOR ALL SPECIMENS NOTE: If specimens are frozen, make sure they are thawed completely at room temperature and mixed by inversion prior to proceeding. 1. Using the Tube Layout Report, place the specimens in order in the BD Viper LT Specimen Rack and lock into place. 2. Specimens are ready to be pre-warmed. 3. Change gloves prior to proceeding to avoid contamination. QUALITY CONTROL PREPARATION 1. Uncap a BD Onclarity HPV Negative Control and a BD Onclarity HPV LBC Diluent tube. 2. Pour the entire contents of the BD Onclarity HPV LBC Diluent tube into the BD Onclarity HPV Negative Control. 3. Re-cap the rehydrated BD Onclarity HPV Negative Control. Re-cap and discard the empty BD Onclarity HPV LBC Diluent tube. 4. Uncap a BD Onclarity HPV Positive Control and a BD Onclarity HPV LBC Diluent tube. 5. Pour the entire contents of the BD Onclarity HPV LBC Diluent tube into the BD Onclarity HPV Positive Control. 6. Re-cap the rehydrated BD Onclarity HPV Positive Control. Re-cap and discard the empty BD Onclarity HPV LBC Diluent tube. 7. Using the Tube Layout Report, place the rehydrated BD Onclarity HPV Negative Control into the appropriate position in the BD Onclarity LT Specimen Rack. 8. Using the Tube Layout Report, place the rehydrated BD Onclarity HPV Positive Control into the appropriate position in the BD Onclarity LT Specimen Rack. 9. Controls are ready to be pre-warmed with the specimens. NOTE: Controls must be pre-warmed within 24 hours of hydration. PRE-WARM PROCEDURE NOTE: The pre-warm procedure must be applied to all specimens to ensure that the specimen matrix is homogeneous prior to loading on the BD Viper LT System. Failure to pre-warm specimens may have an adverse impact on performance of the BD Onclarity HPV Assay and/or BD Viper LT System. 4 NOTE: Refrigerated or frozen specimens must be thawed completely at room temperature prior to pre-warming. 1. Insert the BD Viper LT Specimen Rack into the BD Pre-warm Heater and select the BD Onclarity HPV Assay prewarm protocol on the BD Viper LT Instrument. 2.The BD Pre-warm Heater will automatically pre-warm the specimens and controls according to the BD Onclarity HPV Assay pre-warm protocol. 3. After the BD Onclarity HPV Assay pre-warm protocol is complete, remove the rack from the heater and load into the BD Viper LT instrument. 4. Refer to the Test Procedure for testing specimens and controls. 5. After pre-warming, specimens may be stored for up to 7 days at 2 – 30 ºC or for up to 30 days at -20 °C without additional pre-warming prior to testing on the BD Viper LT System. 6. After pre-warming, controls may be stored for up to 24 h at 2 – 30 °C without additional pre-warming prior to testing on the BD Viper LT System. TEST PROCEDURE Refer to the BD Viper LT System User’s Manual for specific instructions for operating and maintaining the components of the system. The optimum environmental conditions for the HPV assay were found to be 18 - 27 ºC and 20 - 85 % Relative Humidity. QUALITY CONTROL Quality control must be performed in accordance with applicable local, state and/or federal regulations or accreditation requirements and your laboratory’s standard Quality Control procedures. It is recommended that the user refer to pertinent CLSI guidance and CLIA regulations for appropriate Quality Control practices. The Control Set for the BD Onclarity HPV Assay is provided separately. One Positive and one Negative Control must be included in each assay run and for each new reagent kit lot number. Controls must be positioned according to the BD Viper LT System User’s Manual. The HPV Positive Control will monitor for substantial reagent failure only. The HPV Negative Control monitors for reagent and/or environmental contamination. Additional controls may be tested according to guidelines or requirements of local, state, and/or federal regulations or accrediting organizations. General QC Information for the BD Viper LT System: The location of the PCR tubes is shown in a color-coded plate layout screen on the LCD Monitor. The plus symbol (+) within the tube indicates the positive QC sample. The minus symbol (-) within the tube indicates the negative QC sample. A QC pair must be logged in for each reagent kit lot number. If QC pairs have not been properly logged in, a message box appears that prevents saving the rack and proceeding with the run until complete. Additional (optional) QC tubes for testing may be logged in. These tubes are tested as regular samples and do not affect the Pass/Fail status of the run. Refer to the BD Viper LT System User’s Manual for instructions. NOTE: BD Onclarity HPV Controls must be manually hydrated prior to loading them into the BD Viper LT Specimen Rack. Interpretation of Quality Control Results: The BD Onclarity HPV Positive Control and the BD Onclarity HPV Negative Control must test as positive and negative, respectively, in order to obtain patient results. If controls do not perform as expected, the run is considered invalid and patient results will not be reported by the instrument. If either of the controls does not provide the expected results, repeat the entire run using a new set of controls, new extraction tubes, new extraction reagent trough, and new PCR tubes. If the issue does not resolve, contact BD Technical Service and Support for additional information. Table 1: Interpretation of Quality Control Results Control Type Tube Result Report Symbol BD Onclarity HPV Positive Control OK QC Disposition QC Pass BD Onclarity HPV Positive Control QC Failure BD Onclarity HPV Positive Control QC Failure BD Onclarity HPV Positive Control QC Failure BD Onclarity HPV Negative Control OK QC Pass BD Onclarity HPV Negative Control QC Failure BD Onclarity HPV Negative Control QC Failure BD Onclarity HPV Negative Control Refer to the Interpretation of Test Results for a description of Tube Result Report symbols. QC Failure INTERPRETATION OF TEST RESULTS The BD Onclarity HPV Assay uses the real-time polymerase chain reaction to detect the presence of Human Papillomavirus (HPV) in clinical specimens. All calculations are performed automatically by the BD Viper LT software. The presence or absence of clinically relevant HPV DNA is determined by the PCR cycle (Ct) at which the signal crosses a pre-established threshold. The assay will extract, amplify and detect a fragment of the human beta- globin gene as an internal control to assess specimen processing, extraction, amplification, and to indicate the presence of PCR inhibitors. If the HPV-specific signal is greater than a cycle threshold, the internal control is utilized by the algorithm in the interpretation of the result. If the HPV-specific signal is less than or equal to a cycle threshold, the internal control is ignored by the algorithm. 5 For HPV specimens, an “HR” result (the combination of all genotypes) appears on the Tube Results Report. A positive symbol in this column indicates that one or more genotypes that the HPV assay is capable of detecting has a positive result. The “GT” column is used to report results for genotypes that are not available in your region. These results cannot be purchased. Specific genotypes and combined genotypes appear in columns. If the results for a genotype have been purchased, those results are reported as explained below. If any genotype results have not been configured for automatic purchase, those results are masked by a “key” icon. The instrument can be configured to purchase / report specific genotypes when the run is complete. See the BD Viper LT System User’s Manual for instructions on authorizing automatic genotype reporting. If assay control results are not as expected, patient results are not reported. See the Quality Control section for expected control values. Reported results are determined as follows. Table 2: Interpretation of High Risk HPV Genotype HPV Test Results for the BD Onclarity HPV Assay High Risk HPV Result HR HR Interpretation Result Positive for High Risk HPV types HPV HR Positive Negative for High Risk HPV types HPV HR Negative HPV DNA, if present, is not detectable Internal Control Failure HPV DNA, if present, is not detectable. Extraction Transfer Failure HPV DNA, if present, is not detectable. Liquid Level Failure HPV DNA, if present, is not detectable. Error Table 3: Interpretation of Specific HPV Genotype Test Results for the BD Onclarity HPV Assay HPV Genotype Result 16 16 18 18 45 45 P1 P1 31 31 P2 P2 51 51 52 52 P3 P3 GT GT -- Interpretation Result Positive for HPV type 16 HPV type 16 Positive Negative for HPV type 16 HPV type 16 Negative Positive for HPV type 18 HPV type 18 Positive Negative for HPV type 18 HPV type 18 Negative Positive for HPV type 45 HPV type 45 Positive Negative for HPV type 45 HPV type 45 Negative Positive for HPV types 33 and/or 58 HPV type 33 and/or 58 Positive Negative for HPV types 33 and/or 58 HPV type 33 and/or 58 Negative Positive for HPV type 31 HPV type 31 Positive Negative for HPV type 31 HPV type 31 Negative Positive for HPV types 56, 59 and/or 66 HPV type 56, 59 and/or 66 Positive Negative for HPV types 56, 59 and/or 66 HPV type 56, 59 and/or 66 Negative Positive for HPV type 51 HPV type 51 Positive Negative for HPV type 51 HPV type 51 Negative Positive for HPV type 52 HPV type 52 Positive Negative for HPV type 52 HPV type 52 Negative Positive for HPV types 35, 39 and/or 68 HPV type 35, 39 and/or 68 Positive Negative for HPV types 35, 39 and/or 68 HPV type 35, 39 and/or 68 Negative Positive HPV Genotype result(s) not available in your region Negative HPV Genotype result(s) not available in your region Positive HPV Genotype result(s) restricted Negative HPV Genotype result(s) restricted HPV genotype result is available for purchase Genotype result is locked HPV genotype result is not available for purchase HPV Negative result, Internal Control failure, Liquid Level failure or Extraction Transfer failure 6 Monitoring for the Presence of DNA Contamination At least monthly, the following test procedure should be performed to monitor the work area and equipment surfaces for the presence of DNA contamination. Environmental monitoring is essential to detect contamination prior to the development of a problem. 1. For each area to be tested, use a clean collection swab from the BD ProbeTec Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae (CT/GC) Amplified DNA Assay Endocervical Specimen Collection and DRY TRANSPORT Kit. 2. Pour off some molecular biology grade nuclease-free water into a small clean container. 3. Dip the swab into the molecular biology grade nuclease-free water and wipe the first area using a broad sweeping motion. 4. Remove the cap of a BD Onclarity HPV LBC Diluent tube and insert the swab into the Diluent. Mix by swirling the swab in the BD Onclarity HPV Diluent for 5 – 10 s. 5. Express the swab along the inside of the tube so that liquid runs back into the bottom of the tube. 6. Remove the swab carefully from the BD Onclarity HPV LBC Diluent tube to avoid splashing. Discard the swab. 7. Tightly recap the BD Onclarity HPV LBC Diluent tube with the black pierceable cap. 8. Repeat for each desired area. 9. After all swabs have been collected and expressed, process them according to the Pre-warming Procedure and then follow the Test Procedure. Consult the BD Viper LT System User’s Manual for more information on Environmental Monitoring and Cleaning Procedures. If a contamination event does not resolve, contact BD Technical Service and Support for additional information. LIMITATIONS OF THE PROCEDURE 1. Optimal performance of the test requires adequate specimen collection and handling. Refer to the Specimen Collection and Transport sections of this insert. 2. A negative test result does not exclude the possibility of infection because test results may be affected by improper specimen collection, technical error, specimen mix-up, or the number of organisms in the specimen which may be below the sensitivity of the test. 3.The BD Onclarity HPV Assay provides qualitative results. 4. Use of the BD Onclarity HPV Assay is limited to personnel who have been trained in the assay procedure and the BD Viper LT System. PERFORMANCE CHARACTERISTICS BD Onclarity HPV Cervical Brush specimens, BD SurePath specimens and/or PreservCyt specimens, were collected from 836 protocol compliant women who were referred for follow-up due to abnormal Pap test or HPV infection, or women attending a clinic for a routine visit at two geographically diverse clinical sites in Europe. Two specimens were collected from each enrolled subject in the following order: a BD SurePath specimen (Site A) or a PreservCyt specimen (Site B), and a BD Onclarity HPV Cervical Brush specimen (transported in a BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent tube). For each cytology vial collected, 0.5 mL was aliquoted into a BD Onclarity HPV LBC Diluent tube. Cytology, HPV DNA results (digene® Hybrid Capture 2 (hc2) High-Risk HPV DNA Test), and Roche LINEAR ARRAY® HPV Genotyping Test (RLA) results were available for most of the specimens. Histology results were available for most of the subjects attending a high-risk clinic. Each site also enrolled residual specimens (BD SurePath or PreservCyt) with associated cytology results, HPV DNA results (digene Hybrid Capture 2 High-Risk HPV DNA Test), Roche LINEAR ARRAY HPV Genotyping Test results, and where applicable, histology results. For each specimen enrolled, 0.5 mL was aliquoted into a BD Onclarity HPV LBC Diluent tube. There were 510 compliant retrospective specimens enrolled, with histology results available for 234 women. All specimens were tested on the BD Viper LT System in accordance with the assay package insert and user’s manual. For each media type, the clinical sensitivity and specificity for detection of disease, which is defined as (1) Cervical Intraepithelial Neoplasia (CIN2) or greater histology result or (2) Cervical Intraepithelial Neoplasia (CIN3) or greater histology result, was calculated. Final data analysis includes BD Onclarity HPV assay results from 472 BD SurePath specimens, 361 PreservCyt specimens, and a total of 515 BD Onclarity HPV Cervical Brush specimens: 247 BD Onclarity HPV Cervical Brush specimens (in BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent) for Site A and 268 BD Onclarity HPV Cervical Brush specimens (in BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent) for Site B. The performance estimates for the detection of high grade cervical disease for the BD Onclarity HPV assay and the hc2 assay are presented in Tables 4 and 5 for BD SurePath media, Tables 8 and 9 for PreservCyt media, and Tables 12 and 13 for the BD Onclarity HPV Cervical Brush specimens. BD Onclarity HPV assay results were also compared to HPV DNA results from the digene Hybrid Capture 2 High-Risk HPV DNA Test and Roche LINEAR ARRAY HPV Genotyping Test (composite comparator). A positive result from both the hc2 and RLA (high risk) assays is defined as composite comparator positive, a negative result from both the hc2 and RLA (high risk) assays is defined as composite comparator negative, and when the two assays disagree (or results were not available for both tests), the composite comparator result is defined as unresolved. Positive, negative, and overall percent agreement was calculated for each media type versus the composite comparator. Final data analysis includes BD Onclarity HPV Assay and composite comparator results (regardless of histology status) from 670 BD SurePath specimens and 674 PreservCyt specimens. (Tables 6 and 10) The absolute risk of disease (CIN2+ and CIN3+) in the study population for each media type was calculated for each genotype or genotype group in the BD Onclarity HPV assay. The absolute risks are calculated when the genotype (or genotype group) is present alone and/or in the presence of other genotypes. An absolute risk table is shown for each media type. Each media was only collected at one site; thus differences in HPV and genotype positivity rates due to population variation may be expected. (Tables 7 and 11) 7 BD SurePath Specimen Clinical Performance Table 4: Performance of the BD Onclarity HPV Assay with BD SurePath Media Compared to Histology Results (CIN2+) BD Onclarity HPV Assay Estimate hc2 HPV DNA Test 95% Confidence Interval Estimate 95% Confidence Interval Sensitivity 97.9% (190/194) (94.8%, 99.2%) 98.4% (190/193) (95.5%, 99.5%) Specificity 22.7% (63/278) (18.1%, 27.9%) 17.0% (47/277) (13.0%, 21.8%) Table 5: Performance of the BD Onclarity HPV Assay with BD SurePath Media Compared to Histology Results (CIN3+) BD Onclarity HPV Assay hc2 HPV DNA Test Estimate 95% Confidence Interval Estimate 95% Confidence Interval Sensitivity 97.7% (126/129) (93.4%, 99.2%) 98.4% (126/128) (94.5%, 99.6%) Specificity 18.7% (64/343) (14.9%, 23.1%) 14.0% (48/342) (10.8%, 18.1%) Table 6: Performance of the BD Onclarity HPV Assay with BD SurePath Media Compared to the Composite Comparator Composite Comparator Result BD Onclarity HPV Assay Positive Negative Unresolved* Total Positive 532 6 27 565 Negative 8 50 47 105 Total 540 56 74 670 Positive Percent Agreement (95% Confidence Interval) Negative Percent Agreement (95% Confidence Interval) Overall Percent Agreement (95% Confidence Interval) 98.5% (97.1%, 99.2%) 89.3% (78.5%, 95.0%) 97.7% (96.1%, 98.6%) *hc2 and RLA results do not agree or results were not available for both tests. Table 7: Absolute Risk of CIN2+ and CIN3+ for BD Onclarity HPV Assay Genotypes BD SurePath Media BD Onclarity HPV Assay Genotype Infection due to one or more genotype Infection due to single genotype or genotype group Absolute Absolute 95% 95% Risk Risk Confidence Confidence Interval Interval CIN2+ CIN2+ Infection due to one or more genotype Infection due to single genotype or genotype group Absolute Risk CIN3+ 95% Confidence Interval Absolute Risk CIN3+ 95% Confidence Interval HPV16 63.9% (99/155) (56.1%, 71.0%) 64.9% (48/74) (53.5%, 74.8%) 43.9% (68/155) (36.3%, 51.7%) 47.3% (35/74) (36.3%, 58.5%) HPV18 50.0% (24/48) (36.4%, 63.6%) 50.0% (7/14) (26.8%, 73.2%) 43.8% (21/48) (30.7%, 57.7%) 42.9% (6/14) (21.4%, 67.4%) HPV45 46.7% (21/45) (32.9%, 60.9%) 23.5% (4/17) (9.6%, 47.3%) 31.1% (14/45) (19.5%, 45.7%) 17.6% (3/17) (6.2%, 41.0%) HPV33/58 49.4% (42/85) (39.0%, 59.8%) 47.1% (16/34) (31.5%, 63.3%) 31.8% (27/85) (22.8%, 42.3%) 23.5% (8/34) (12.4%, 40.0%) HPV31 64.2% (52/81) (53.3%, 73.8%) 72.7% (16/22) (51.8%, 86.8%) 40.7% (33/81) (30.7%, 51.6%) 50.0% (11/22) (30.7%, 69.3%) HPV56/59/66 25.5% (25/98) (17.9%, 35.0%) 0.0% (0/29) (0.0%, 11.7%) 13.3% (13/98) (7.9%, 21.4%) 0.0% (0/29) (0.0%, 11.7%) HPV51 41.7% (15/36) (27.1%, 57.8%) 25.0% (2/8) (7.1%, 59.1%) 25.0% (9/36) (13.8%, 41.1%) 12.5% (1/8) (2.2%, 47.1%) HPV52 35.1% (20/57) (24.0%, 48.1%) 33.3% (4/12) (13.8%, 60.9%) 19.3% (11/57) (11.1%, 31.3%) 16.7% (2/12) (4.7%, 44.8%) HPV35/39/68 36.0% (27/75) (26.1%, 47.3%) 33.3% (7/21) (17.2%, 54.6%) 17.3% (13/75) (10.4%, 27.4%) 19.0% (4/21) (7.7%, 40.0%) 8 PreservCyt Specimen Clinical Performance Table 8: Performance of the BD Onclarity HPV Assay with PreservCyt Media Compared to Histology Results (CIN2+) BD Onclarity HPV Assay hc2 HPV DNA Test Estimate 95% Confidence Interval Estimate 95% Confidence Interval Sensitivity 94.7% (160/169) (90.2%, 97.2%) 97.0% (160/165) (93.1%, 98.7%) Specificity 50.5% (97/192) (43.5%, 57.5%) 40.8% (75/184) (33.9%, 48.0%) Table 9: Performance of the BD Onclarity HPV Assay with PreservCyt Media Compared to Histology Results (CIN3+) BD Onclarity HPV Assay hc2 HPV DNA Test Estimate 95% Confidence Interval Estimate 95% Confidence Interval Sensitivity 94.4% (85/90) Specificity 37.3% (101/271) (87.6%, 97.6%) 97.7% (85/87) (92.0%, 99.4%) (31.7%, 43.2%) 29.8% (78/262) (24.6%, 35.6%) Table 10: Performance of the BD Onclarity HPV Assay with PreservCyt Media Compared to the Composite Comparator Composite Comparator Result BD Onclarity HPV Assay Positive Negative Unresolved* Total Positive 246 5 18 269 Negative 10 366 29 405 Total 256 371 47 674 Positive Percent Agreement (95% Confidence Interval) Negative Percent Agreement (95% Confidence Interval) Overall Percent Agreement (95% Confidence Interval) 96.1% (93.0%, 97.9%) 98.7% (96.9%, 99.4%) 97.6% (96.1%, 98.5%) * hc2 and RLA results do not agree or results were not available for both tests. Table 11: Absolute Risk of CIN2+ and CIN3+ for BD Onclarity HPV Assay Genotypes PreservCyt Media BD Onclarity HPV Assay Genotype HPV 16 HPV 18 HPV 45 HPV 33/58 HPV 31 HPV 56/59/66 HPV 51 HPV 52 HPV 35/39/68 Infection due to one or more genotype Absolute Risk CIN2+ 77.1% (84/109) 50.0% (12/24) 50.0% (6/12) 70.0% (28/40) 67.7% (42/62) 34.0% (18/53) 48.0% (12/25) 73.9% (17/23) 38.5% (10/26) 95% Confidence Interval (68.3%, 84.0%) (31.4%, 68.6%) (25.4%, 74.6%) (54.6%, 81.9%) (55.4%, 78.0%) (22.7%, 47.4%) (30.0%, 66.5%) (53.5%, 87.5%) (22.4%, 57.5%) Infection due to single genotype or genotype group Absolute Risk CIN2+ 81.4% (57/70) 45.5% (5/11) 25.0% (1/4) 75.0% (15/20) 71.0% (22/31) 11.1% (2/18) 27.3% (3/11) 85.7% (6/7) 40.0% (2/5) 95% Confidence Interval (70.8%, 88.8%) (21.3%, 72.0%) (4.6%, 69.9%) (53.1%, 88.8%) (53.4%, 83.9%) (3.1%, 32.8%) (9.7%, 56.6%) (48.7%, 97.4%) (11.8%, 76.9%) 9 Infection due to one or more genotype Absolute Risk CIN3+ 44.0% (48/109) 29.2% (7/24) 16.7% (2/12) 35.0% (14/40) 30.6% (19/62) 9.4% (5/53) 16.0% (4/25) 26.1% (6/23) 15.4% (4/26) 95% Confidence Interval (35.1%, 53.4%) (14.9%, 49.2%) (4.7%, 44.8%) (22.1%, 50.5%) (20.6%, 43.0%) (4.1%, 20.3%) (6.4%, 34.7%) (12.5%, 46.5%) (6.1%, 33.5%) Infection due to single genotype or genotype group Absolute Risk CIN3+ 50.0% (35/70) 18.2% (2/11) 0.0 (0/4) 50.0% (10/20) 41.9% (13/31) 0.0% (0/18) 18.2% (2/11) 42.9% (3/7) 20.0% (1/5) 95% Confidence Interval (38.6%, 61.4%) (5.1%, 47.7%) (0.0%, 49.0%) (29.9%, 70.1%) (26.4%, 59.2%) (0.0%, 17.6%) (5.1%, 47.7%) (15.8%, 75.0%) (3.6%, 62.4%) BD Onclarity HPV Cervical Brush Specimen Clinical Performance Table 12: Performance of the BD Onclarity HPV Assay with the BD Onclarity HPV Cervical Brush Compared to Histology Results (CIN2+) BD Onclarity HPV Assay Estimate Estimate 95% Confidence Interval Sensitivity 97.2% (104/107) (92.1%, 99.0%) 99.1% (106/107) (94.9%, 99.8%) Specificity 17.9% (25/140) (12.4%, 25.0%) 21.4% (30/140) (15.4%, 28.9%) Sensitivity 100.0% (121/121) (96.9%, 100.0%) 97.5% (116/119) (92.8%, 99.1%) Specificity 37.4% (55/147) (30.0%, 45.5%) 43.0% (61/142) (35.1%, 51.2%) Site A B hc2 HPV DNA Test 95% Confidence Interval Table 13: Performance of the BD Onclarity HPV Assay with the BD Onclarity HPV Cervical Brush Compared to Histology Results (CIN3+) BD Onclarity HPV Assay Estimate Sensitivity 97.3% (72/74) Specificity 15.0% (26/173) Sensitivity Specificity Site A B hc2 HPV DNA Test 95% Confidence Interval Estimate 95% Confidence Interval (90.7%, 99.3%) 98.6% (73/74) (92.7%, 99.8%) (10.5%, 21.1%) 17.3% (30/173) (12.4%, 23.7%) 100.0% (60/60) (94.0%, 100.0%) 98.3% (57/58) (90.9%, 99.7%) 26.4% (55/208) (20.9%, 32.8%) 31.0% (63/203) (25.1%, 37.7%) Analytical Studies Analytical Sensitivity at the Clinical Cutoff: The limit of detection (LOD) at the HPV clinical cutoff was determined for the BD Onclarity HPV Assay using HPV positive cell lines: SiHa (HPV 16), HeLa (HPV 18) and MS751 (HPV 45) and cloned plasmid DNA containing the sequences for the following HPV genotypes: HPV 31, 33, 35, 39, 51, 52, 56, 58, 59, 66, and 68 in BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt Solution and BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent containing a HPV-negative cell line (C33A). The HPV cell lines were tested individually whereas the HPV plasmids were tested collectively in three groups: 1) HPV 31, 33, 51, 52, and 59; 2) HPV 56, 58, 68; and 3) HPV 35 and 66. A minimum of forty-five replicates of each of six target levels for the HPV cell lines and twenty replicates of each of six target levels for the HPV plasmids were tested across a minimum of three lots of reagents and a minimum of three BD Viper LT Systems. The LOD is the level of HPV DNA in the undiluted specimen that has positive results above the clinical cutoff at least 95% of the time. The maximum LOD value for each of the HPV genotypes and media is described in Table 14. Table 14: Analytical Sensitivity Target BD SurePath Media (95% Confidence Interval) PreservCyt Media (95% Confidence Interval) BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent (95% Confidence Interval) SiHa (HPV 16) cells/mL 1584 (1276 – 1962) 1835 (1426 – 2358) 137 (131 – 144) HeLa (HPV 18) cells/mL 915 (739 – 1131) 1786 (1175 – 2715) 51 (46 – 56) MS751 (HPV 45) cells/mL 3793 (2944 – 4888) 5425 (4167 – 7066) 305 (284 – 343) HPV 31 copies/mL 3652 (3159 – 3868) 4118 (3898 – 4228) 692 (650 – 817) HPV 33 copies/mL 7326 (6578-8932) 8272 (7946 – 8743) 1376 (1272 – 1451) HPV 35 copies/mL 6820 (6477 – 7282) 7282 (6895 – 7674) 1552 (1317 – 1780) HPV 39 copies/mL 7894 (7115 – 8193) 8272 (7810 – 9398) 1531 (1419 – 1685) HPV 51 copies/mL 6697 (5796-7097) 5909 (5553 – 6824) 1229 (1155 – 1353) HPV 52 copies/mL 3582 (3414 – 4184) 4184 (3740 – 4761) 833 (744 – 934) HPV 56 copies/mL 4976 (4140 – 5698) 4774 (4479 – 5997) 836 (737 – 911) HPV 58 copies/mL 10094 (9403 – 11180) 11488 (8989 – 12360) 2990 (2656 – 7819) HPV 59 copies/mL 4400 (4145 – 5069) 4374 (4105 – 5482) 772 (722 – 899) HPV 66 copies/mL 3793 (3621 – 4030) 4462 (4008 – 4844) 701 (646 – 767) HPV 68 copies/mL 10415 (9799 – 11642) 10481 (9816 – 12082) 2079 (1995 – 2125) 10 Cross-Reactivity: A panel of bacteria, yeast and cultured viruses along with cloned plasmid DNA containing high-risk and low-risk HPV target sequences was used to evaluate the analytical specificity of the BD Onclarity HPV Assay on the BD Viper LT System. Each potential cross-reactant was tested individually in BD SurePath Preservative Fluid and PreservCyt Solution containing a HPV-negative cell line (C33A). The microorganisms are described in Tables 15 and 16. The BD Onclarity HPV Assay did not cross-react with any of the microorganisms tested. Table 15: Microorganisms Tested for Analytical Specificity Bacteria* Viruses** Actinomyces israelii Adenovirus, type 5 Atopobium vaginae EBV-1, B95-8 Strain Bacteroides fragilis HCMV. AD169 Strain Bacteroides ureolyticus HIV-1 Bifidobacterium adolescentis HSV1 Bifidobacterium brevi Bifidobacterium longum ssp. longum High risk HPV*** HSV2 Chlamydia trachomatis HPV 16 Clostridium perfringens HPV 18 Corynebacterium genitalium HPV 31 Enterobacter cloacae ssp. cloacae HPV 33 Enterococcus faecalis HPV 35 Enterococcus faecium HPV 39 Escherichia coli HPV 45 Fusobacterium nucleatum ssp. nucleatum HPV 51 Gardnerella vaginalis HPV 52 Klebsiella pneumonia ssp. ozaenae HPV 56 Lactobacillus acidophilus HPV 58 Mycobacterium smegmatis HPV 59 Mycoplasma genitalium HPV 66 Neisseria gonorrhoeae HPV 68 Peptostreptococcus anaerobius Prevotella bivia Prevotella disiens Proteus mirabilis Proteus vulgaris Providencia stuartii Pseudomonas aeruginosa Staphylococcus aureus Staphylococcus epidermidis Streptococcus agalactiae Streptococcus pyogenes Ureaplasma urealyticum Yeast/Protozoa**** Candida albicans Trichomonas vaginalis *Bacteria tested at approximately 1.0 x 107 CFU/mL except for the following: Chlamydia trachomatis (1.0 x 107 EB/mL), Mycobacterium smegmatis (2.5 x 106 CFU/mL), and Ureaplasma urealyticum (8.0 x 106 CFU/mL). **Viruses tested at 1.0 x 106 VP/mL. ***High risk HPV plasmid DNA tested at 1.0 x 106 copies/mL. **** Yeast (Candida albicans tested at approximately 1.0 x 107 CFU/mL Protozoa; Protozoa (Trichomonas vaginalis) tested at 1.4 x 106 CFU/mL. 11 Table 16: Low risk HPV Plasmids Tested for Analytical Specificity HPV 6 HPV 69 HPV 11 HPV 70 HPV 26 HPV 73 HPV 30 HPV 82 HPV 34 HPV 97 HPV 53 HPV c85 HPV 67 *Low-risk HPV plasmid DNA tested at 1.0 x 106 copies/mL. Interfering Substances: The potential for interference in the BD Onclarity HPV Assay on the BD Viper LT System was determined with exogenous and endogenous substances that may be present in clinical cervical specimens. Contrived HPV negative specimens and HPV positive specimens (co-spiked with SiHa, HeLa and MS751 cells at 3 x LOD) were tested in the presence or absence of each potential interfering substance. Substances used in these studies are described in Table 17. The concentrations represent the highest level of substance that did not result in any interference in the BD Onclarity HPV Assay. Table 17: Potential Interfering Substances Potential Interfering Substance BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent Concentration tested KY® Vaginal Lubricant VCF® Vaginal Contraceptive Film VCF® Vaginal Contraceptive Foam BD SurePath Media PreservCyt Media Concentration tested Concentration tested 10% (w/v) 6% (w/v) 10% (w/v) 3% (w/v) 10% (w/v) 10% (w/v) 10% (w/v) 10% (w/v) 10% (w/v) Conceptrol® Contraceptive Gel 1% (w/v) 10% (w/v) 10% (w/v) Monistat® 3* 2% (w/v) 2% (w/v) 1.8% (w/v) Clotrimazole 7 10% (w/v) 10% (w/v) 10% (w/v) Vagistat®-1 Tioconazole 2% (w/v) 2% (w/v) 2% (w/v) Clindamycin Vaginal Cream 9% (w/v) 10% (w/v) 10% (w/v) Summer’s Eve® Douche 10% (v/v) 10% (v/v) 10% (v/v) Zovirax® (Acyclovir) Cream 10% (w/v) 8% (w/v) 10% (w/v) Vandazole™ Gel (Metronidazole Vaginal Gel, 0.75%) 10% (w/v) 10% (w/v) 10% (w/v) Summer’s Eve® Deodorant 2% (w/v) 3% (w/v) 2% (w/v) Bovine Mucin 10% (v/v) 10% (v/v) 10% (v/v) Progesterone 20 ng/mL 20 ng/mL 20 ng/mL Estradiol 1.2 ng/mL 1.2 ng/mL 1.2 ng/mL Whole Blood 3% (v/v) 5% (v/v) 5% (v/v) Leukocytes 1x106 cells/mL 1x106 cells/mL 1x106 cells/mL Semen 10% (v/v) 10% (v/v) 10% (v/v) Acetic Acid Wash** 5% (v/v) Blood + Acetic Acid Wash 5% Blood (v/v), 2.5% Acetic Acid Wash (v/v) *Concentrations higher than those listed resulted in liquid level failures during extraction on the BD Viper LT System. **Acetic Acid Wash consists of 1 part Glacial Acetic Acid: 9 parts CytoLyt® solution. 12 Competitive Target Interference: The potential for the inhibition of HPV detection due to one target present at a high level and another target present at low levels during a mixed infection was evaluated in the BD Onclarity HPV Assay. SiHa, HeLa and MS751 cells were tested individually or collectively at 3 x LOD in the presence or absence of competitive HPV target(s) at 1.0 x 106 copies/ mL in BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt Solution and BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent containing a HPV negative cell line (C33A) (Table 18). Table 18: Competitive Target Interference Individual HPV Cellular Targets at 3 x LOD HPV Plasmids at 1 x 106 copies/mL HPV Cellular Target Detection in the Presence or Absence of Competing Genotypes (HPV Plasmids) SiHa (HPV 16) HPV 18 + HPV 45 Yes HeLa (HPV 18) HPV 16 + HPV 45 Yes HPV 45 (MS751) HPV 16 + HPV 18 Yes G1 Genotypes with G2 co-amplified targets SiHa + HeLa + MS751 HPV 31 + HPV 33 + HPV 56 + HPV 58 + HPV 59 + HPV 66 Yes G1 Genotypes with G3 co-amplified targets SiHa + HeLa + MS751 HPV 35 + HPV 39 + HPV 51+ HPV 52 + HPV 68 Yes HPV Assay Tube Type G1 Genotypes with G1 co-amplified targets Reproducibility: The reproducibility of the BD Onclarity HPV Assay was evaluated on the BD Viper LT instrument using a four-member panel consisting of negative, high negative, low positive, and moderate positive specimens. The positive panel members were composed of SiHa, HeLa and MS751 cells spiked collectively into pools of HPV negative clinical BD SurePath specimens and BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent containing a HPV negative cell line (C33A). The panel was tested across an equal distribution of three lots of reagents and three instruments over 12 days. The data are summarized in Table 19. 13 Table 19: Summary of Reproducibility Data for the BD Onclarity HPV Assay on the BD Viper LT System Inter-Run Media Cell Line (Genotype) SurePath SiHa (HPV 16) HeLa (HPV 18) MS-751 (HPV 45) Panel Level Concentration cells/mL Neg 0 High Neg Low Pos Mod Pos 1582 Neg 0 High Neg Low Pos Mod Pos Cervical Brush Diluent 914 2742 0 3793 395 11378 0 Total 100% (216/216) 97.69% (211/216) 100% (216/216) 100% (216/216) 100% (216/216) 98.61% (213/216) 99.54% (215/216) 100% (216/216) 100% (216/216) 100% (216/216) 100% (216/216) 99.54% (215/216) 100% (214/214) NA NA NA NA NA NA NA (98.27% – 100%) % Correct Mean Ct SD %CV SD %CV SD %CV NA NA NA NA NA NA NA 35.28 0.16 0.46 0.54 1.52 0.57 1.62 32.31 0.16 0.50 0.22 0.69 0.30 0.92 31.07 0.22 0.69 0.22 0.71 0.35 1.11 NA NA NA NA NA NA NA 35.89 0.24 0.68 0.75 2.09 0.85 2.37 32.70 0.16 0.50 0.30 0.92 0.37 1.14 30.68 0.13 0.43 0.22 0.72 0.30 0.98 NA NA NA NA NA NA NA 35.77 0.00 0.00 0.52 1.45 0.55 1.53 32.71 0.20 0.60 0.26 0.80 0.36 1.10 31.33 0.18 0.57 0.35 1.10 0.41 1.31 High Neg 32 100% (218/218) 36.29 0.09 0.25 0.59 1.63 0.62 1.71 Low Pos 205 94.91% (205/216) (91.11% – 97.13%) 33.63 0.26 0.78 0.33 0.97 0.43 1.27 615 100% (216/216) (98.25% – 100%) 31.80 0.16 0.51 0.18 0.56 0.25 0.79 (98.24% – 100%) 0 100% (214/214) NA NA NA NA NA NA NA High Neg 13 99.07% (214/216) (96.69% – 99.75%) 35.69 0.10 0.29 0.78 2.18 0.80 2.23 Low Pos 76 99.08% (216/218) (96.72% – 99.75%) 33.34 0.15 0.44 0.25 0.76 0.30 0.91 228 99.54% (215/216) (97.42% – 99.92%) 32.07 0.24 0.73 0.25 0.78 0.37 1.16 (98.24% – 100%) Neg Mod Pos 0 100% (214/214) NA NA NA NA NA NA NA High Neg 59 100% (216/216) (98.25% – 100%) 36.54 0.22 0.61 0.62 1.68 0.66 1.81 Low Pos 457 99.54% (215/216) (97.42% – 99.92%) 33.22 0.16 0.48 0.25 0.75 0.32 0.95 1371 100% (218/218) (98.27% – 100%) 31.74 0.14 0.43 0.21 0.67 0.27 0.84 Neg MS-751 (HPV 45) 102 Neg Mod Pos HeLa (HPV 18) 4746 High Neg Low Pos Mod Pos Neg SiHa (HPV 16) 342 Intra-Run 95% Confidence Interval (98.25% – 100%) (94.7% – 99.01%) (100% – 98.25%) (100% – 98.25%) (98.25% – 100%) (96% – 99.53%) (97.42% – 99.92%) (100% – 98.25%) (98.25% – 100%) (98.25% – 100%) (100% – 98.25%) (97.42% – 99.92%) (98.24% – 100%) Mod Pos Cross Contamination: A study was performed to evaluate the risk of producing a false positive result in either the same run (within run crosscontamination) or in a subsequent run (between run carry-over contamination) on the BD Viper LT System. One run was performed per day over five days on each of three instruments comprising a total of 675 test replicates. Each run consisted of BD SurePath Preservative Fluid or PreservCyt Solution specimens containing a HPV negative cell line (C33A) with and without SiHa cells spiked at 1.0 x 105 cells/mL arranged in an alternating checkerboard pattern. The overall contamination rate with both BD SurePath Preservative Fluid and PreservCyt Solution was 0.00%. Neat (In-vial) Specimen Stability: Analytical studies were performed to support the storage claims for the stability of neat cervical specimens. BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt Solution and BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent specimens containing a HPV negative cell line (C33A), were spiked with SiHa cells at 3 x LOD and stored at 2 – 8 °C, 30 °C and -20 °C for multiple time points. At each time point, the specimens were removed from storage and tested with the BD Onclarity HPV Assay on the BD Viper LT System. Twenty-four assay replicates were generated for each condition (specimen type/temperature/ duration). Stability was achieved for 30 days at 2 – 30 °C and -20 °C. Diluted Specimen Stability: Analytical studies were performed to support the storage claims for the stability of diluted cervical specimens. BD SurePath Preservative Fluid and PreservCyt Solution specimens containing a HPV negative cell line (C33A) were spiked with SiHa cells at 3 X LOD, diluted with BD HPV LBC Diluent and then stored at 2 – 8 °C, 30 °C and -20 °C for multiple time points. At each time point, the specimens were removed from storage and tested with the BD Onclarity HPV Assay on the BD Viper LT 14 System. Twenty-four assay replicates were generated for each condition (specimen type/temperature/duration). Stability was achieved for 15 days 2 – 30 °C and for 30 days at -20 °C. Post Pre-warm Specimen Stability: Analytical studies were performed to support the storage claims for the stability of post pre-warm cervical specimens. BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt Solution and BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent specimens containing a HPV negative cell line (C33A), were spiked with SiHa cells at 3 x LOD, diluted with BD Onclarity HPV LBC Diluent and then pre-warmed with the BD Viper LT Pre-warm Heater. The processed specimens were stored at 2 – 8 °C, 30 °C and -20 °C for multiple time points. At each time point, the specimens were removed from storage and tested with the BD Onclarity HPV Assay on the BD Viper LT System. Twenty-four assay replicates were generated for each condition (specimen type/temperature/duration). Stability was achieved for 7 days at 2 – 30 °C and for 30 days at -20 °C INTERPRETATION OF TABLES Symbols and Abbreviations Symbols (+) (-) # % positive negative number percentage Abbreviations ASCUS Atypical squamous cells of undetermined significance cfu colony forming units CI Confidence Interval CIN Cervical intraepithelial neoplasia CV Coefficient of Variation HPV Human Papillomavirus HR High Risk LBC Liquid-Based Cytology n number NA Not applicable NEGNegative NPA Negative Percent Agreement PBS Phosphate Buffered Saline PCR Polymerase Chain Reaction POSPositive PPA Positive Percent Agreement QC Quality Control SD Standard Deviation AVAILABILITY The following BD Onclarity and BD Viper products for use on the BD Viper LT are also available: Cat. No. Description 442946 BD Onclarity™ HPV Assay Reagent Pack, 192 tests 441993 Control Set for the BD Onclarity™ HPV Assay, 24 positive and 24 negative tubes 442841 BD Viper™ PCR Extraction Reagent Trough with Piercing Tool, 12 Extraction Reagent Troughs 441992 BD FOX™ PCR Extraction Tubes, 384 tubes 441354 BD Viper™ System Neutralization Pouch, 12 pouches 442840 BD Onclarity™ HPV Liquid Based Cytology Specimen (LBC) Diluent Tubes, 400 441991 BD Onclarity™ HPV Assay Cervical Brush Collection Kit, 100 442957 BD Viper™ LT System PCR Tube/Tray Kit 443430 Key Card for the BD Viper™ LT System 440476 BD ProbeTec™ Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae (CT/GC) Amplified DNA Assay Endocervical Specimen Collection and DRY TRANSPORT Kit 441996 BD Viper™ LT Pipette Tips, 3840 441995 BD Viper™ LT Solid Waste Liners, 80 442950 BD™ Pre-warm Heater 442967 BD Viper™ LT System PCR Accessory kit 442839 BD Viper™ LT System 15 REFERENCES 1.http://www.cdc.gov/std/HPV/STDFact-HPV.htm 2.http://www.emcdda.europa.eu/html.cfm/index33767EN.html 3. Cervical cancer, human papillomavirus (hpv), and hpv vaccines – key points for policy-makers and health professionals http://whqlibdoc.who.int/hq/2008/who_rhr_08.14_eng.pdf 4. Clinical and Laboratory Standards Institute. 2005. Approved Guideline M29-A3. Protection of laboratory workers from occupationally acquired infections, 3rd ed., CLSI, Wayne, PA. 5. Garner, J.S. 1996. Hospital Infection Control Practices Advisory Committee, U.S. Department of Health and Human Services, Centers for Disease Control and Prevention. Guideline for isolation precautions in hospitals. Infect. Control Hosp. Epidemiol. 17:53-80. 6. U.S. Department of Health and Human Services. 2007. Biosafety in microbiological and biomedical laboratories,HHS Publication (CDC), 5th ed. U.S. Government Printing Office, Washington, D.C. 7. Directive 2000/54/EC of the European Parliament and of the Council of 18 September 2000 on the protection of workers from risks related to exposure to biological agents at work (seventh individual directive within the meaning of Article 16(1) of Directive 89/391/EEC). Official Journal L262, 17/10/2000, p. 0021-0045. For Technical Information: In the United States, contact BD Technical Service and Support at 800-638-8663 or www.bd.com/ds. Onclarity HPV Assay Français APPLICATION Le BD Onclarity HPV Assay (Test HPV) est un test d’ADN amplifié permettant d’effectuer une détection qualitative de types de papillomavirus humain (HPV) à haut risque. Le test détecte tous les types de HPV à haut risque (16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 et 68) et permet de définir le génotype de six types à haut risque (HPV 16, 18, 31, 45, 51 et 52). Les échantillons cervicaux sont analysés avec le BD Onclarity HPV Assay, ce qui inclut la BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit (Trousse de prélèvement avec brosse cervicale), le BD SurePath Preservative Fluid (Liquide de conservation) et la solution PreservCyt Solution (en utilisant une aliquote prélevée avant ou après toute préparation pour le test de Papanicolaou BD SurePath ou ThinPrep). Le BD Onclarity HPV Assay est exécuté sur le système BD Viper LT. RÉSUMÉ ET EXPLICATION Les papillomavirus humains (HPV) sont la cause la plus fréquente de virus sexuellement transmissibles dans le monde. Ainsi, 50 % de la population sexuellement active contractera des HPV au cours de sa vie. Les individus ignorent souvent qu’ils sont infectés et ne prennent pas les précautions nécessaires pour éviter de transmettre le virus à d’autres personnes. Il existe plus de 40 types de HPV susceptibles d’infecter les voies génitales.1 Dans la plupart des cas, les infections à HPV sont transitoires et l’organisme élimine lui-même le virus. Cependant, dans d’autres cas, le virus est persistant et attaque les cellules normales qui deviennent malignes, entraînant un cancer. Ces types oncogènes de HPV sont classés à haut risque et incluent les HPV 16 et 18. Les autres types sont considérés à faible risque car ils ne semblent pas provoquer de cancer. D’après l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS), le HPV est la deuxième cause la plus importante de mortalité par cancer chez les femmes dans le monde, provoquant environ 250 000 décès par an. En Europe uniquement, cette maladie provoque le décès d’environ 15 000 personnes chaque année.2 On estime que presque 70 % des cancers du col de l’utérus sont provoqués par des HPV de type 16 et 18.3 Aujourd’hui, les tests de Papanicolaou permettent d’informer le médecin en cas de modifications anormales des cellules du col de l’utérus. Si ces cellules sont anormales, un test HPV peut être effectué pour déterminer si ces modifications des cellules du col de l’utérus sont dues à une souche de HPV susceptible de provoquer un cancer du col de l’utérus. Les tests moléculaires ne permettent pas tous d’opérer une distinction parmi les différents types de HPV. Le BD Onclarity HPV Assay, exécuté sur le système BD Viper LT, est un test d’ADN amplifié permettant d’effectuer une détection qualitative de types de papillomavirus humain (HPV) à haut risque. Le test détecte les types de HPV 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 et 68 et permet d’identifier simultanément les types à haut risque 16, 18, 31, 45, 51, 52 et d’autres génotypes à haut risque rapportés par groupe de génotype (P1 : 33/58 ; P2 : 56/59/66 ; P3 : 35/39/68). Les échantillons cervicaux peuvent être analysés avec le BD Onclarity HPV Assay, ce qui inclut le BD SurePath Preservative Fluid (à l’aide d’une aliquote prélevée avant ou après le traitement pour le test de Papanicolaou BD SurePath), la solution PreservCyt Solution (à l’aide d’une aliquote prélevée avant ou après le traitement pour le test de Papanicolaou PreservCyt) et la trousse BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit. PRINCIPES DE LA MÉTHODE Le BD Onclarity Human Papillomavirus (HPV) Assay est conçu pour être utilisé avec le BD SurePath Preservative Fluid (à l’aide d’une aliquote prélevée avant ou après le traitement pour le test de Papanicolaou BD SurePath), la solution PreservCyt Solution (à l’aide d’une aliquote prélevée avant ou après le traitement pour le test de Papanicolaou PreservCyt), la trousse BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit, les réactifs applicables, le système BD Viper LT et la technologie d’extraction BD FOX Extraction. Les échantillons sont soumis à une étape de préchauffage avec le BD Pre-warm Heater (Bloc chauffant de préchauffage BD) pour homogénéiser la matrice, lyser les cellules et libérer l’ADN susceptible d’être extrait et amplifié. Une fois refroidis, les échantillons sont placés dans le BD Viper LT, qui effectue alors toutes les étapes nécessaires pour extraire et amplifier l’ADN cible, sans aucune intervention supplémentaire de la part de l’utilisateur. L’échantillon est transféré dans un tube d’extraction qui contient des particules d’oxyde de fer sous forme de film soluble. De l’acide est ensuite ajouté pour réduire le pH et créer une charge positive sur l’oxyde de fer, qui se lie alors à l’ADN négativement chargé. Les particules et l’ADN fixé sont ensuite attirés vers les bords du tube d’extraction par des aimants, et l’échantillon traité est aspiré et mis au rebut. Les particules sont lavées et un tampon d’élution à pH élevé est ajouté pour éluer l’ADN purifié. Enfin, un tampon de neutralisation est utilisé pour optimiser le pH de l’éluat en vue de l’amplification de l’ADN. Le 16 test BD Onclarity HPV Assay repose sur l’amplification et la détection simultanées de l’ADN cible à l’aide d’amorces d’amplification et de sondes de détection couplées à un marqueur fluorescent utilisant la réaction en chaîne par polymérase (PCR) en temps réel. Ces réactifs sont séchés dans trois tubes (G1, G2 et G3) susceptibles de détecter les génotypes HPV 14 et un contrôle interne dérivé de l’échantillon contenant un fragment d’ADN de gène bêta-globine humain. Chaque tube contient les amorces d’amplification, les sondes de détection couplées à un marqueur fluorescent, l’ADN polymérase, des nucléotides et d’autres réactifs nécessaires à l’amplification des tests respectifs. Le système BD Viper LT transfère une partie de la solution d’ADN purifié de chaque tube d’extraction dans les trois tubes BD Onclarity HPV PCR (G1, G2 et G3), qui sont ensuite scellés pour empêcher toute contamination. La présence ou l’absence d’ADN de HPV est déterminée par le cycle PCR au niveau duquel le signal croise un seuil prédéfini. En outre, le test extrait, amplifie et détecte un fragment du gène bêta-globine humain comme contrôle interne afin d’évaluer le traitement, l’extraction et l’amplification de l’échantillon. REACTIFS ET MATERIAUX FOURNIS : Chaque BD Onclarity HPV Assay Reagent Pack (Jeu de réactifs) contient : Tubes BD Onclarity HPV G1 PCR, 2 x 96 : chaque tube PCR G1 contient environ 32,5 pmol d’oligonucléotides, 20 pmol de sondes de détection couplées à un marqueur fluorescent, 80 nmol de dNTP et 0,52 unités d’ADN polymérase ainsi que des stabilisants et tampons. Tubes BD Onclarity HPV G2 PCR, 2 x 96 : chaque tube PCR G2 contient environ 42,5 pmol d’oligonucléotides, 30 pmol de sondes de détection couplées à un marqueur fluorescent, 80 nmol de dNTP et 0,52 unités d’ADN polymérase ainsi que des stabilisants et tampons. Tubes BD Onclarity HPV G3 PCR, 2 x 96 : chaque tube PCR G3 contient environ 42,5 pmol d’oligonucléotides, 25 pmol de sondes de détection couplées à un marqueur fluorescent, 80 nmol de dNTP et 0,52 unités d’ADN polymérase ainsi que des stabilisants et tampons. REMARQUE : chaque sachet contient un sachet de dessiccatif. Jeu de contrôles pour le BD Onclarity HPV Assay : 24 BD Onclarity HPV Positive Control Tubes (tubes de témoin positif) contenant environ 2 500 copies/mL de plasmides linéarisés HPV 16, 1 900 copies/mL de plasmides linéarisés HPV 18, 5 150 copies/mL de plasmides linéarisés HPV 56 et 2 950 copies/mL d’un plasmide contenant une séquence d’ADN bêta-globine dans un acide nucléique porteur, ainsi que 24 BD Onclarity HPV Negative Control Tubes (tubes de témoin négatif) contenant un acide nucléique porteur seul. Les concentrations de l’acide nucléique porteur et de plasmides sont déterminées par spectrophotométrie. BD Onclarity HPV Liquid Based Cytology Specimen (LBC) Diluent Tubes (Tubes de diluant) : 400 tubes contenant chacun environ 1,7 mL de tampon avec sel, détergent et conservateur. BD FOX PCR Extraction Tubes (Tubes d’extraction) : 48 barrettes de 8 tubes contenant chacun environ 10 mg d’une solution d’oxyde de fer dans un film soluble. BD Viper PCR Extraction Reagent Trough with Piercing Tool (Cuve de réactifs d’extraction avec outil de perçage) : chaque cuve de réactifs d’extraction à 5 cavités contient environ 16,5 mL d’acide de liaison, 72,5 mL de tampon de lavage, 25,4 mL de tampon d’élution, 19,4 mL de tampon de neutralisation avec agent de conservation et 15,5 mL de solution de neutralisation des déchets. INSTRUMENT, MATÉRIEL ET CONSOMMABLES Matériaux fournis : BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit (Trousse de prélèvement avec brosse cervicale), système BD Viper LT, BD Viper LT Instrument Plates (Plaques pour instrument), BD Viper LT Pipette Tips (Embouts de pipette), BD Viper LT Solid Waste Liners (Liners pour déchets solides), BD Viper LT System PCR Tube/Tray Kit (Kit de plateaux/tubes PCR du système BD Viper), BD Viper LT System PCR Accessory Kit (Kit d’accessoires PCR du système BD Viper), BD Viper Pre-warm Heater (Bloc chauffant de préchauffage), BD Viper LT Specimen Rack (Portoir d’échantillons), BD Viper Neutralization Pouches (Sachets de neutralisation), Tubes d’échantillons et bouchons utilisables sur le système BD Viper (Mode d’extraction), BD ProbeTec Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae (CT/GC) Amplified DNA Assay Endocervical Specimen Collection and DRY TRANSPORT Kit (Trousse de prélèvement et de transport à sec d’échantillons endocervicaux BD ProbeTec pour le test d’ADN amplifié Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae (CT/GC)). Matériaux requis mais non fournis : gants de nitrile, pipettes à déplacement d’air, embouts en polypropylène résistant aux aérosols capables de distribuer 0,5 ± 0,05 mL, agitateur vortex, solution d’hypochlorite de sodium à 0,5 % (v/v), solution d’hypochlorite de sodium à 1 % (v/v), solution de peroxyde d’hydrogène à 3 % (p/v), alcool isopropylique, eau moléculaire de qualité biologique sans nucléase. Impératifs de manipulation et de conservation : Le diluant BD Onclarity HPV LBC Diluent et le diluant BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent (Diluant pour brosse cervicale) doivent être conservés à une température comprise entre 2 et 25 °C. Tous les autres réactifs peuvent être conservés à une température comprise entre 2 et 33 °C. Les jeux de réactifs non entamés restent stables jusqu’à la date de péremption. Une fois qu’un sachet est ouvert, les tubes PCR restent stables pendant 4 semaines si le sachet est correctement refermé ou jusqu’à la date d’expiration, la première condition remplie prévalant. Ne pas congeler. AVERTISSEMENTS ET PRÉCAUTIONS 1. Pour le diagnostic in vitro. 2. Des micro-organismes pathogènes, notamment les virus de l’hépatite et de l’immunodéficience humaine, sont susceptibles d’être présents dans les échantillons cliniques. Respecter les « Précautions standard »4-7 et les consignes en vigueur dans l’établissement pour manipuler tout objet contaminé avec du sang et d’autres liquides organiques. Pour d’autres avertissements, précautions et remarques spécifiques au système BD Viper LT, consulter le manuel d’utilisation correspondant. Échantillon : 3. Pour les échantillons de cytologie en milieu liquide, utiliser uniquement des tubes BD Onclarity HPV LBC Diluent. 4. Pour les échantillons sur brosse cervicale, utiliser uniquement la trousse BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit. 5. Une performance optimale du test BD Onclarity HPV Assay suppose un prélèvement, une manipulation et un transport adéquats des échantillons. 17 6. Pour limiter les saignements, ne pas faire tourner excessivement la brosse cervicale au cours du prélèvement de l’échantillon. 7. Étiqueter soigneusement chaque prélèvement destiné au laboratoire. 8. Lors du bris de la tige de la brosse cervicale, veiller à ne pas éclabousser, renverser le contenu ni créer d’aérosols. Éviter toute contamination de la tête de la brosse cervicale. 9. Prendre soin d’éviter la contamination croisée pendant la manipulation des échantillons. S’assurer que les récipients contenant les échantillons ne se touchent pas et jeter les matériaux utilisés sans passer au-dessus de récipients ouverts. Si les gants entrent en contact avec un échantillon, les changer pour éviter toute contamination croisée. 10. La distribution d’une quantité insuffisante ou excessive d’échantillons LBC dans le tube BD Onclarity HPV LBC Diluent peut affecter la performance du test. Le remplissage excessif des tubes peut également occasionner un débordement du liquide sur le plateau du BD Viper LT et causer une contamination. 11. Les échantillons cervicaux doivent être prélevés et testés avant la date de péremption des tubes de diluant BD Onclarity HPV LBC Diluent ou BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent. 12. Utiliser seulement des embouts de pipettes en polypropylène résistant aux aérosols pour transférer les échantillons dans les tubes de diluant BD Onclarity HPV LBC Diluent. Test/réactif : 13.Les BD Onclarity HPV Positive and Negative Controls (contrôles positifs et négatifs) doivent être préchauffés dans les 24 heures suivant l’hydratation. 14. Utiliser exclusivement des tubes d’échantillons et de contrôles avec bouchon perçable avec le système BD Viper LT. Ne pas enlever les bouchons perçables avant de démarrer l’instrument. Veiller à remplacer les bouchons percés par de nouveaux bouchons perçables avant de démarrer l’instrument. 15. Ne pas échanger ni mélanger les réactifs de la trousse avec ceux de trousses portant des numéros de lot différents. 16. Ne pas tester le tube de diluant BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent s’il a été acheminé jusqu’au laboratoire sans la brosse. Un faux négatif pourrait être obtenu. 17. N’utiliser que les embouts de pipettes BD Viper LT fournis par BD avec le système BD Viper LT. 18. BD Viper PCR Extraction Reagent Trough with Piercing Tool (Cuve de réactifs d’extraction avec outil de perçage). DANGER H314 Cause de graves brûlures et lésions oculaires. H302 Nocif en cas d’ingestion. P260 Ne pas respirer les poussières/fumées/gaz/émanations/vapeurs/aérosols. P280 Porter des gants de protection/ un vêtement de protection/des lunettes de protection/un masque de protection du visage. P303/361/353 EN CAS DE CONTACT AVEC LA PEAU (ou les cheveux) : enlever immédiatement les vêtements contaminés. Rincer la peau soigneusement à l’eau/se doucher. P304/340 EN CAS D’INHALATION : transporter la victime à l’extérieur et la maintenir au repos dans une position où elle peut confortablement respirer. P405 Garder sous clef. P501 Mettre au rebut le contenu/le récipient conformément aux règlements locaux/régionaux/nationaux/internationaux. 19. Utiliser uniquement les BD Viper LT Clear Plate Sealers (Bandes d’étanchéité transparentes) sur les tubes PCR avec le système BD Viper LT. 20. Les sachets de réactifs contenant des tubes PCR non utilisés DOIVENT impérativement être refermés après ouverture. Vérifier la présence du dessiccatif avant de refermer les sachets de réactifs. 21. Les tubes PCR DOIVENT être correctement scellés avec les bandes BD Viper LT Clear Plate Sealers avant de retirer la plaque du système BD Viper LT. La bande d’étanchéité garantit un milieu réactionnel clos pour l’amplification et la détection. Elle est indispensable pour éviter la contamination de l’instrument et de la paillasse par des produits d’amplification. Ne jamais retirer les bandes d’étanchéité placées sur les tubes PCR. 22. Pour empêcher la contamination de la paillasse par des produits d’amplification, utiliser les sachets à déchets fournis dans la BD Viper LT System PCR Accessory Kit (Trousse d’accessoires) pour jeter les tubes PCR analysés. Vérifier que les sachets sont correctement fermés avant de les jeter. 23. Même s’il n’est pas nécessaire de disposer de postes de travail dédiés, car la conception du BD Viper LT réduit la possibilité de contamination par les produits d’amplification dans l’environnement de travail, d’autres précautions s’imposent pour éviter la contamination, en particulier pour éviter la contamination des échantillons au cours de la manipulation. 24. CHANGER DE GANTS dès qu’ils entrent en contact avec un échantillon ou semblent humides pour éviter de contaminer d’autres échantillons. Changer de gants avant de pénétrer dans la zone de travail ou de la quitter. 25. En cas de contamination, se reporter au Manuel d’utilisation du système BD Viper LT pour obtenir des instructions de nettoyage. 26. Contacter le service et l’assistance techniques de BD en cas de situation inhabituelle, comme un déversement dans l’instrument BD Viper LT ou une contamination par de l’ADN impossible à éliminer par nettoyage. PRÉLÈVEMENT ET TRANSPORT DES ÉCHANTILLONS Les échantillons cervicaux qui peuvent être analysés avec le BD Onclarity HPV Assay incluent la BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit, le BD SurePath Preservative Fluid (à l’aide d’une aliquote prélevée avant ou après le traitement pour le test de Papanicolaou BD SurePath) et la solution PreservCyt Solution (à l’aide d’une aliquote prélevée avant ou après le traitement pour le test de Papanicolaou ThinPrep). 18 Pour les envois nationaux et internationaux, étiqueter les échantillons conformément à la réglementation nationale ou internationale concernant le transport d’échantillons cliniques et d’agents étiologiques ou de produits infectieux. La durée et la température de conservation doivent être maintenues pendant le transport. PRÉLÈVEMENT DES ÉCHANTILLONS AVEC BROSSE CERVICALE 1. Insérer la brosse cervicale BD Onclarity HPV Cervical Brush dans l’endocol jusqu’à ce que seuls les poils les plus bas sur la tige soient exposés au niveau de l’orifice du col de l’utérus. Faire tourner lentement de ¼ à ½ tour dans un sens. Pour éviter les saignements, ne pas trop faire tourner la brosse. 2. Déboucher le tube de BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent et placer immédiatement la brosse au fond du tube. 3. Briser doucement la tige au niveau de la ligne pré-limée. Éviter la dispersion du contenu. 4. Bien reboucher le tube. CONSERVATION ET TRANSPORT D’ÉCHANTILLONS SUR BROSSE CERVICALE Les échantillons sur brosse cervicale contenus dans les tubes BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent doivent être conservés et acheminés au laboratoire/centre investigateur dans les 30 jours suivant le prélèvement s’ils sont conservés à une température comprise entre 2 et 30 °C ou dans les 30 jours suivant le prélèvement s’ils sont conservés au congélateur à -20 °C. La conservation et le transport des échantillons ne doivent pas dépasser la date de péremption figurant sur le tube de diluant de la brosse cervicale. PRÉLÈVEMENT DES ÉCHANTILLONS LBC Les échantillons BD SurePath ou PreservCyt doivent être prélevés en utilisant un dispositif de type balai endocervical ou une combinaison brosse/spatule, tel que décrit dans la notice des produits BD SurePath ou PreservCyt. Une fois prélevés, les échantillons BD SurePath ou PreservCyt peuvent être conservés et transportés dans leur flacon d’origine jusqu’à 30 jours entre 2 et 30 °C ou jusqu’à 30 jours au congélateur à -20 °C avant leur transfert dans les tubes de diluant Onclarity HPV LBC Specimen Diluent. CONSERVATION ET TRANSPORT DES ÉCHANTILLONS LBC Transfert de l’échantillon LBC dans des tubes BD Onclarity HPV LBC Diluent – avant ou après le prélèvement d’une aliquote en vue du traitement d’un test BD SurePath ou ThinPrep. Un volume aliquote de 0,5 mL de l’échantillon BD SurePath ou PreservCyt est transféré manuellement du flacon d’origine dans le tube BD Onclarity HPV LBC Specimen Diluent avant ou après le traitement d’un test de Papanicolaou BD SurePath ou ThinPrep. Porter des gants lors de la manipulation du tube BD Onclarity HPV LBC Specimen Diluent et du flacon d’échantillon BD SurePath ou PreservCyt. Si les gants entrent en contact avec l’échantillon, en changer immédiatement pour éviter de contaminer d’autres échantillons. Transfert des échantillons BD SurePath avant ou après le traitement pour les tests BD SurePath REMARQUE : consulter la notice du système BD PrepStain Slide Processor (Préparateur de lames) ou BD Totalys SlidePrep pour les instructions concernant la manière de prélever une aliquote du flacon d’échantillon BD SurePath avant d’effectuer le test de Papanicolaou en milieu liquide BD SurePath. REMARQUE : manipuler un seul échantillon à la fois pour le traitement. 1. Étiqueter un tube BD Onclarity HPV LBC Diluent avec les données d’identification de la patiente. 2. Retirer le bouchon du tube BD Onclarity HPV LBC Diluent. 3. Pour obtenir un mélange homogène, mélanger au vortex le flacon d’échantillon BD SurePath pendant 10 à 20 s. 4. Transférer rapidement 0,5 mL du flacon d’échantillon, à l’aide d’un embout résistant aux aérosols, dans le tube BD Onclarity HPV LBC Diluent, dans la minute suivant l’agitation au vortex. 5. Jeter l’embout de pipette. REMARQUE : utiliser un embout de pipette distinct pour chaque échantillon. 6. Bien serrer le bouchon du tube BD Onclarity HPV LBC Diluent. 7. Inverser le tube BD Onclarity HPV LBC Diluent 3 à 4 fois pour assurer un mélange correct de l’échantillon et du diluant. Transfert des échantillons PreservCyt avant ou après le traitement pour les tests de Papanicolaou ThinPrep REMARQUE : se reporter à l’addenda au manuel d’utilisation du système ThinPrep 2000/3000 pour des instructions concernant le prélèvement d’une aliquote à partir du flacon d’échantillon PreservCyt avant d’effectuer le test ThinPrep. REMARQUE : manipuler un seul échantillon à la fois pour le traitement. 1. Étiqueter un tube BD Onclarity HPV LBC Diluent avec les données d’identification de la patiente. 2. Retirer le bouchon du tube BD Onclarity HPV LBC Diluent. 3. Pour obtenir un mélange homogène, agiter au vortex le flacon d’échantillon PreservCyt à grande vitesse pendant 8 à 12 s. 4. Transférer immédiatement 0,5 mL du flacon d’échantillon, à l’aide d’un embout résistant aux aérosols, dans le tube BD Onclarity HPV LBC Diluent. 5. Jeter l’embout de pipette. REMARQUE : utiliser un embout de pipette distinct pour chaque échantillon. 6. Bien serrer le bouchon du tube BD Onclarity HPV LBC Diluent. 7. Inverser le tube BD Onclarity HPV LBC Diluent 3 à 4 fois pour assurer un mélange correct de l’échantillon et du diluant. 19 Conservation et transport des échantillons transférés dans les tubes BD HPV LBC Diluent Après le transfert manuel dans un tube BD Onclarity HPV LBC Diluent, l’échantillon dilué peut être conservé entre 2 et 30 °C pendant 15 jours maximum ou à -20 °C pendant 30 jours maximum. PROCÉDURE DE TRAITEMENT DE TOUS LES ÉCHANTILLONS REMARQUE : si les échantillons étaient congelés, s’assurer qu’ils sont complètement dégelés à température ambiante et les mélanger par inversion avant de continuer. 1. À l’aide du Tube Layout Report (Rapport de configuration des tubes), placer les échantillons à l’endroit approprié dans le portoir d’échantillons du système BD Viper LT et les verrouiller en place. 2. Les échantillons sont prêts à être préchauffés. 3. Changer de gants avant de continuer pour éviter la contamination. PRÉPARATION DU CONTRÔLE DE QUALITÉ 1. Déboucher un tube de contrôle négatif BD Onclarity HPV Negative Control et un tube de diluant BD Onclarity HPV LBC Diluent. 2. Verser tout le contenu du tube de diluant BD Onclarity HPV LBC Diluent dans le contrôle négatif BD Onclarity HPV Negative Control. 3. Reboucher le tube de contrôle négatif réhydraté BD Onclarity HPV Negative Control. Reboucher et mettre au rebut le tube de diluant BD Onclarity HPV LBC Diluent vide. 4. Déboucher un tube de contrôle positif BD Onclarity HPV Positive Control et un tube de diluant BD Onclarity HPV LBC Diluent. 5. Verser tout le contenu du tube de diluant BD Onclarity HPV LBC Diluent dans le contrôle positif BD Onclarity HPV Positive Control. 6. Reboucher le tube de contrôle positif réhydraté BD Onclarity HPV Positive Control. Reboucher et mettre au rebut le tube de diluant BD Onclarity HPV LBC Diluent vide. 7. À l’aide du Tube Layout Report (Rapport de configuration des tubes), placer le contrôle négatif réhydraté BD Onclarity HPV Negative Control à l’emplacement approprié dans le portoir d’échantillons BD Viper LT. 8. À l’aide du Tube Layout Report (Rapport de configuration des tubes), placer le contrôle positif réhydraté BD Onclarity HPV Positive Control à l’emplacement approprié dans le portoir d’échantillons BD Viper LT. 9. Les contrôles sont prêts à être préchauffés avec les échantillons. REMARQUE : les contrôles doivent être préchauffés dans les 24 heures suivant l’hydratation. MÉTHODE DE PRÉCHAUFFAG REMARQUE : la méthode de préchauffage doit être appliquée à tous les échantillons pour assurer une matrice d’échantillon homogène avant le chargement dans le système BD Viper LT. L’omission de l’étape de préchauffage des échantillons peut altérer les performances du test BD Onclarity HPV Assay et/ou du système BD Viper LT. REMARQUE : les échantillons réfrigérés ou congelés doivent être décongelés à température ambiante avant le préchauffage. 1. Introduire le portoir d’échantillons BD Viper LT dans le BD Pre-warm Heater et sélectionner le protocole de préchauffage du test BD Onclarity HPV Assay sur le système BD Viper LT. 2.Le BD Pre-warm Heater préchauffe automatiquement les échantillons et les contrôles conformément au protocole de préchauffage du test BD Onclarity HPV Assay. 3. Une fois le protocole de préchauffage du test BD Onclarity HPV Assay effectué, sortir le portoir du bloc chauffant et le charger sur le système BD Viper LT. 4. Suivre les instructions de la section Mode opératoire du test pour analyser les échantillons et les contrôles. 5. Une fois préchauffés, les échantillons peuvent être conservés jusqu’à 7 jours entre 2 et 30 ºC ou jusqu’à 30 jours à -20 ºC sans préchauffage supplémentaire avant leur analyse sur le système BD Viper LT. 6. Une fois préchauffés, les contrôles peuvent être conservés jusqu’à 24 heures entre 2 et 30 ºC sans préchauffage supplémentaire avant leur analyse sur le système BD Viper LT. MODE OPÉRATOIRE DU TEST Consulter le manuel d’utilisation du système BD Viper LT pour connaître les instructions détaillées de fonctionnement et de maintenance des éléments du système. Les conditions environmentales optimales pour le dosage HPV se sont avérées étre 18 à 27 ºC et 20 à 85 % d’humidité relative. CONTRÔLE DE QUALITÉ Effectuer les contrôles de qualité conformément à la réglementation nationale et/ou internationale, aux exigences des organismes d’homologation concernés et aux procédures de contrôle de qualité en vigueur dans l’établissement. Il est recommandé à l’utilisateur de consulter les directives CLSI et la réglementation CLIA correspondantes pour plus d’informations sur les modalités de contrôle de qualité. Le jeu de contrôles pour le test BD Onclarity HPV Assay est fourni séparément. Inclure un contrôle positif et un contrôle négatif dans chaque série de tests et pour chaque nouveau numéro de lot de trousse de réactifs. Les contrôles doivent être placés aux emplacements spécifiés dans le manuel d’utilisation du BD Viper LT. Le contrôle positif HPV ne peut révéler qu’une non conformité significative du réactif. Le contrôle négatif HPV détecte une contamination du réactif et/ou de l’environnement. D’autres contrôles peuvent être testés conformément aux directives ou aux exigences des réglementations nationale ou internationale ou des organismes d’homologation. Informations générales sur le CQ du système BD Viper LT : L’emplacement des tubes PCR est indiqué sur un écran de configuration de plaque à code de couleur affiché sur le moniteur LCD. Le symbole plus (+) à l’intérieur du tube indique l’échantillon de CQ positif. Le symbole moins (-) à 20 l’intérieur du tube indique l’échantillon de CQ négatif. Une paire de CQ doit être enregistrée pour chaque numéro de lot de trousse de réactifs. Dans le cas contraire, un message s’affiche, qui empêche la sauvegarde du portoir et la poursuite de l’analyse jusqu’à la saisie correcte de la paire. L’utilisateur peut saisir d’autres tubes de CQ (facultatif) pour le test. Ces tubes sont testés comme des échantillons normaux et n’affectent pas l’état d’échec/réussite de l’analyse. Consulter le manuel d’utilisation du système BD Viper LT pour plus d’informations. REMARQUE : les contrôles BD Onclarity HPV doivent être hydratés manuellement avant leur chargement dans le portoir d’échantillons BD Viper LT. Interprétation des résultats du contrôle de qualité : Les contrôles positif et négatif BD Onclarity HPV Positive Control et BD Onclarity HPV Negative Control doivent donner un résultat positif et négatif, respectivement, pour que les résultats d’échantillons soient valables. Si les contrôles ne produisent pas les résultats escomptés, la série de tests est considérée comme non valide et l’instrument ne rapporte pas les résultats cliniques. Si l’un des contrôles ne produit pas le résultat escompté, répéter toute la série avec un nouveau jeu de contrôles, de nouveaux tubes d’extraction, de nouvelles cuves de réactifs d’extraction et de nouveaux tubes PCR. Si le problème persiste, contacter le service et l’assistance technique de BD pour de plus amples informations. Tableau 1 : interprétation des résultats du contrôle de qualité Type de contrôle Symbole de résultat du tube BD Onclarity HPV Positive Control OK Résultat du CQ CQ conforme BD Onclarity HPV Positive Control CQ non conforme BD Onclarity HPV Positive Control CQ non conforme BD Onclarity HPV Positive Control CQ non conforme BD Onclarity HPV Negative Control OK CQ conforme BD Onclarity HPV Negative Control CQ non conforme BD Onclarity HPV Negative Control CQ non conforme BD Onclarity HPV Negative Control CQ non conforme Consulter la section Interprétation des résultats pour obtenir la description des symboles de résultat de tube. INTERPRÉTATION DES RÉSULTATS Le test BD Onclarity HPV Assay utilise la réaction en chaîne par polymérase pour déceler la présence du papillomavirus humain (HPV) dans les échantillons cliniques. Tous les calculs sont effectués automatiquement par le logiciel BD Viper LT. La présence ou l’absence d’ADN de HPV cliniquement pertinente est déterminée par le cycle PCR (Ct) au niveau duquel le signal croise un seuil prédéfini. Le test extrait, amplifie et détecte un fragment du gène bêta-globine humain comme contrôle interne afin d’évaluer le traitement, l’extraction et l’amplification de l’échantillon et d’indiquer la présence d’inhibiteurs de la PCR. Si le signal spécifique au HPV est supérieur à un seuil de cycle, le contrôle interne est utilisé par l’algorithme dans l’interprétation du résultat. Si le signal spécifique au HPV est inférieur ou égal à un seuil de cycle, le contrôle interne est ignoré par l’algorithme. Pour les échantillons HPV, un résultat « HR » (la combinaison de tous les génotypes) apparaît sur le Tube Results Report (Rapport des résultats du tube). Un symbole positif dans cette colonne indique qu’un ou plusieurs génotypes décelables par le test HPV présente un résultat positif. La colonne « GT » est utilisée pour rapporter des résultats pour des génotypes non disponibles dans votre pays. Ces résultats ne peuvent pas être achetés. Des génotypes spécifiques et des génotypes combinés apparaissent dans des colonnes. Si les résultats d’un génotype ont été achetés, ces résultats sont rapportés comme expliqué ci-dessous. Si les résultats d’un génotype n’ont pas été configurés pour un achat automatique, ces résultats sont masqués par une icône représentant une « clé ». L’instrument peut être configuré pour acheter/rapporter des génotypes spécifiques une fois l’analyse terminée. Consulter le Manuel d’utilisation du système BD Viper LT pour des instructions sur l’autorisation de rapports automatiques de génotype. Si les contrôles du test ne donnent pas les résultats escomptés, les résultats des échantillons cliniques ne sont pas pris en considération. Voir la section Contrôle de qualité pour connaître les valeurs attendues pour les contrôles. Les résultats rapportés sont déterminés comme suit. Tableau 2 : interprétation des résultats des tests de HPV de génotype HPV à haut risque du test BD Onclarity HPV Assay Résultat HPV à haut risque HR HR Interprétation Résultat Positif pour les types de HPV à haut risque HPV HR positif Négatif pour les types de HPV à haut risque HPV HR négatif ADN HPV, si présent, non décelable Erreur de contrôle interne ADN HPV, si présent, non décelable Transfert d’extraction non conforme ADN HPV, si présent, non décelable Niveau de liquide non conforme ADN HPV, si présent, non décelable. Erreur 21 Tableau 3 : interprétation des résultats des tests de HPV de génotype spécifique du test BD Onclarity HPV Assay Résultat de génotype de HPV 16 16 18 18 45 45 P1 P1 31 31 P2 P2 51 51 52 52 P3 P3 GT GT -- Interprétation Résultat Positif pour HPV, type 16 HPV de type 16 positif Négatif pour HPV, type 16 HPV de type 16 négatif Positif pour HPV, type 18 HPV de type 18 positif Négatif pour HPV, type 18 HPV de type 18 négatif Positif pour HPV, type 45 HPV de type 45 positif Négatif pour HPV, type 45 HPV de type 45 négatif Positif pour HPV, types 33 et/ou 58 HPV de types 33 et/ou 58 positif Négatif pour HPV, types 33 et/ou 58 HPV de types 33 et/ou 58 négatif Positif pour HPV, type 31 HPV de type 31 positif Négatif pour HPV, type 31 HPV de type 31 négatif Positif pour HPV, types 56, 59 et/ou 66 HPV de types 56, 59 et/ou 66 positif Négatif pour HPV, types 56, 59 et/ou 66 HPV de types 56, 59 et/ou 66 négatif Positif pour HPV, type 51 HPV de type 51 positif Négatif pour HPV, type 51 HPV de type 51 négatif Positif pour HPV, type 52 HPV de type 52 positif Négatif pour HPV, type 52 HPV de type 52 négatif Positif pour HPV, types 35, 39 et/ou 68 HPV de types 35, 39 et/ou 68 positif Négatif pour HPV, types 35, 39 et/ou 68 HPV de types 35, 39 et/ou 68 négatif Résultat(s) de génotype HPV positif non disponible(s) dans votre pays Résultat(s) de génotype HPV positif limité(s) Résultat(s) de génotype HPV négatif non disponible(s) dans votre pays Résultat de génotype HPV disponible à l’achat Résultat(s) de génotype HPV négatif limité(s) Résultat de génotype HPV non disponible à l’achat Résultat de génotype verrouillé. Résultat HPV négatif, erreur de contrôle interne, erreur de niveau de liquide ou erreur de transfert d’extraction Dépistage de la présence d’ADN contaminant Au moins une fois par mois, réaliser le test suivant pour dépister la présence d’ADN contaminant sur la paillasse et le matériel. Le contrôle du poste de travail est essentiel pour détecter une contamination avant qu’un problème ne se développe. 1. Pour chaque zone à tester, utiliser un écouvillon de prélèvement propre de la trousse BD ProbeTec Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae (CT/GC) Amplified DNA Assay Endocervical Specimen Collection and DRY TRANSPORT Kit (Trousse de prélèvement et de transport à sec d’échantillons endocervicaux BD ProbeTec pour le test de détection d’ADN amplifié de Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae (CT/GC)). 2. Verser de l’eau moléculaire de qualité biologique sans nucléase dans un petit récipient propre. 3. Tremper l’écouvillon dans l’eau moléculaire de qualité biologique sans nucléase et essuyer la première surface en utilisant un grand mouvement de balayage. 4. Retirer le bouchon du tube BD Onclarity HPV LBC Diluent et introduire l’écouvillon dans le diluant. Mélanger en tournant l’écouvillon dans le tube BD Onclarity HPV Diluent pendant 5 à 10 s. 5. Presser l’écouvillon contre la paroi interne du tube pour faire redescendre le liquide au fond du tube. 6. Sortir délicatement l’écouvillon du tube BD Onclarity HPV LBC Diluent pour éviter les éclaboussures. Jeter l’écouvillon. 7. Bien refermer le tube BD Onclarity HPV LBC Diluent avec le bouchon perçable noir. 8. Renouveler l’opération pour chaque zone à tester. 9. Une fois tous les écouvillonnages prélevés et exprimés, les traiter selon la procédure de préchauffage, puis suivre le mode opératoire du test. Consulter le Manuel d’utilisation du système BD Viper LT pour plus d’informations sur les méthodes de contrôle environnemental et de nettoyage. Si la contamination persiste, contacter le service et l’assistance technique de BD pour plus d’informations. 22 LIMITES DE LA PROCÉDURE 1. Une performance optimale du test nécessite un prélèvement et une manipulation adéquate des échantillons. Se reporter à la section « Prélèvement et transport de l’échantillon » de cette notice. 2. Un résultat négatif n’exclut pas l’éventualité d’une infection car les résultats du test peuvent être affectés par un prélèvement inapproprié des échantillons, une erreur technique, une substitution d’échantillons ou une concentration de microorganismes dans l’échantillon inférieure à la sensibilité du test. 3. Le test BD Onclarity HPV Assay fournit des résultats qualitatifs. 4. L’utilisation du test BD Onclarity HPV Assay est réservée aux personnes ayant reçu la formation nécessaire à la réalisation de ce test et familiarisées avec le système BD Viper LT. CARACTÉRISTIQUES DE PERFORMANCES Les échantillons BD Onclarity HPV Cervical Brush, les échantillons BD SurePath et/ou les échantillons PreservCyt ont été prélevés sur 836 femmes répondant aux critères du protocole et suivies pour un test Pap anormal ou une infection à HPV ou sur des femmes se rendant en consultation de routine dans deux centres cliniques géographiquement dispersés en Europe. Deux échantillons ont été prélevés sur chacun des sujets recrutés dans l’ordre suivant : un échantillon BD SurePath (Centre A) ou un échantillon PreservCyt (Centre B), et un échantillon BD Onclarity HPV Cervical Brush (transporté dans un tube BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent). Pour chaque flacon d’échantillon cytologique recueilli, une aliquote de 0,5 mL a été prélevée dans un tube BD Onclarity HPV LBC Diluent. Les résultats d’ADN HPV de cytologie (digene Hybrid Capture 2 (hc2) High-Risk HPV DNA Test) et les résultats Roche LINEAR ARRAY HPV Genotyping Test (RLA) étaient disponibles pour la plupart des échantillons. Les résultats de l’histologie étaient disponibles pour la plupart des femmes à risque élevé. Chaque centre a également recruté des échantillons résiduels (BD SurePath ou PreservCyt) associés aux résultats de cytologie, des résultats d’ADN HPV (digene Hybrid Capture 2 High-Risk HPV DNA Test), des résultats Roche LINEAR ARRAY HPV Genotyping Test et, le cas échéant, des résultats d’histologie. Pour chaque échantillon recruté, une aliquote de 0,5 mL a été prélevée dans un tube BD Onclarity HPV LBC Diluent. 510 échantillons rétrospectivement conformes ont été recrutés avec des résultats d’histologie disponibles pour 234 femmes. Tous les échantillons ont été analysés sur le système BD Viper LT conformément à la notice du test et au manuel d’utilisation. Pour chaque type de milieu, la sensibilité et la spécificité cliniques ont été calculées pour la détection de la maladie, définie comme étant (1) une néoplasie cervicale intraépithéliale (CIN 2) ou de grade histologique supérieur ou (2) une néoplasie cervicale intraépithéliale (CIN 3) ou de grade histologique supérieur. L’analyse finale des données inclut les résultats du test BD Onclarity HPV Assay réalisé sur 472 échantillons BD SurePath, 361 échantillons PreservCyt et un total de 515 échantillons BD Onclarity HPV Cervical Brush : 247 échantillons BD Onclarity HPV Cervical Brush (recueillis dans des tubes BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent) pour le centre A et 268 échantillons BD Onclarity HPV Cervical Brush (recueillis dans des tubes BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent) pour le centre B. Les estimations de performance pour la détection d’une maladie du col utérin de haut grade avec le test BD Onclarity HPV Assay et le test hc2 sont présentées dans les tableaux 4 et 5 pour le milieu BD SurePath, dans les tableaux 8 et 9 pour le milieu PreservCyt et dans les tableaux 12 et 13 pour les échantillons de la BD Onclarity HPV Cervical Brush. Les résultats du test BD Onclarity HPV Assay ont également été comparés aux résultats d’ADN HPV du test digene Hybrid Capture 2 High-Risk HPV DNA Test et du test Roche LINEAR ARRAY HPV Genotyping Test (référence composite). Un résultat positif issu des tests hc2 et RLA (haut risque) est défini comme étant une référence composite positive, un résultat négatif issu des tests hc2 et RLA (haut risque) est défini comme étant une référence composite négative, et lorsque les deux tests génèrent des résultats différents (ou lorsque les résultats ne sont pas disponibles pour les deux tests), le résultat de la référence composite est défini comme non résolu. Le pourcentage de concordance positive, négative et globale a été calculé pour chaque type de milieu par rapport à la référence composite. L’analyse finale des données inclut les résultats du test BD Onclarity HPV Assay et de la référence composite (quelle que soit l’histologie) provenant de 670 échantillons BD SurePath et 674 échantillons PreservCyt. (Tableaux 6 et 10) Le risque absolu de maladie (CIN 2+ et CIN 3+) dans la population étudiée de chaque type de milieu a été calculé pour chaque génotype ou groupe de génotypes avec le test BD Onclarity HPV Assay. Les risques absolus sont calculés lorsque seul le génotype (ou groupe de génotypes) est présent et/ou en présence d’autres génotypes. Un tableau répertoriant les risques absolus est présenté pour chaque type de milieu. Chaque milieu a été prélevé uniquement sur un centre. Par conséquent, des différences entre les taux de positivité de HPV et de génotype dues à la diversité de la population sont susceptibles de survenir. (Tableaux 7 et 11) Performance clinique des échantillons BD SurePath Tableau 4 : Performances du test BD Onclarity HPV Assay avec le milieu BD SurePath par rapport aux résultats de l’histologie (CIN 2+) BD Onclarity HPV Assay hc2 HPV DNA Test Sensibilité 97,9 % (190/194) Intervalle de confiance à 95 % (94,8 %, 99,2 %) Spécificité 22,7 % (63/278) (18,1 %, 27,9 %) Estimation 98,4 % (190/193) Intervalle de confiance à 95 % (95,5 %, 99,5 %) 17,0 % (47/277) (13,0 %, 21,8 %) Estimation Tableau 5 : Performances du test BD Onclarity HPV Assay avec le milieu BD SurePath par rapport aux résultats de l’histologie (CIN 3+) Sensibilité BD Onclarity HPV Assay Intervalle de confiance à 95 % 97,7 % (126/129) (93,4 %, 99,2 %) hc2 HPV DNA Test Intervalle de confiance à 95 % 98,4 % (126/128) (94,5 %, 99,6 %) Spécificité 18,7 % (64/343) 14,0 % (48/342) Estimation (14,9 %, 23,1 %) 23 Estimation (10,8 %, 18,1 %) Tableau 6 : Performances du test BD Onclarity HPV Assay avec le milieu BD SurePath par rapport à la référence composite Résultat de la référence composite Pourcentage de Pourcentage de Pourcentage de concordance concordance concordance positive négative globale BD Onclarity Positif Négatif Non résolu* Total HPV Assay (Intervalle de (Intervalle de (Intervalle de confiance à confiance à confiance à 95 %) 95 %) 95 %) Positif 532 6 27 565 Négatif 8 50 47 105 Total 540 56 74 670 98,5 % (97,1 %, 99,2 %) 89,3 % (78,5 %, 95,0 %) 97,7 % (96,1 %, 98,6 %) *Les résultats hc2 et RLA ne concordent pas ou bien les résultats n’étaient pas disponibles pour les deux tests. Tableau 7 : Risque absolu de CIN 2+ et CIN 3+ pour les génotypes du test BD Onclarity HPV Assay avec le milieu BD SurePath Génotype de BD Onclarity HPV Assay HPV16 Infection due à un Infection due à un ou Infection due à un ou seul génotype ou à un plusieurs génotypes plusieurs génotypes groupe de génotypes Intervalle Intervalle Intervalle Risque Risque Risque de de de absolu absolu absolu confiance confiance confiance CIN2+ CIN2+ CIN3+ à 95 % à 95 % à 95 % 63,9 % (56,1 %, 64,9 % (53,5 %, 43,9 % (36,3 %, (99/155) 71,0 %) (48/74) 74,8 %) (68/155) 51,7 %) Infection due à un seul génotype ou à un groupe de génotypes Intervalle Risque de absolu confiance CIN3+ à 95 % 47,3 % (36,3 %, (35/74) 58,5 %) HPV18 50,0 % (24/48) (36,4 %, 63,6 %) 50,0 % (7/14) (26,8 %, 73,2 %) 43,8 % (21/48) (30,7 %, 57,7 %) 42,9 % (6/14) (21,4 %, 67,4 %) HPV45 46,7 % (21/45) (32,9 %, 60,9 %) 23,5 % (4/17) (9,6 %, 47,3 %) 31,1 % (14/45) (19,5 %, 45,7 %) 17,6 % (3/17) (6,2 %, 41,0 %) HPV33/58 49,4 % (42/85) (39,0 %, 59,8 %) 47,1 % (16/34) (31,5 %, 63,3 %) 31,8 % (27/85) (22,8 %, 42,3 %) 23,5 % (8/34) (12,4 %, 40,0 %) HPV31 64,2 % (52/81) (53,3 %, 73,8 %) 72,7 % (16/22) (51,8 %, 86,8 %) 40,7 % (33/81) (30,7 %, 51,6 %) 50,0 % (11/22) (30,7 %, 69,3 %) HPV56/59/66 25,5 % (25/98) (17,9 %, 35,0 %) 0,0 % (0/29) (0,0 %, 11,7 %) 13,3 % (13/98) (7,9 %, 21,4 %) 0,0 % (0/29) (0,0 %, 11,7 %) HPV51 41,7 % (15/36) (27,1 %, 57,8 %) 25,0 % (2/8) (7,1 %, 59,1 %) 25,0 % (9/36) (13,8 %, 41,1 %) 12,5 % (1/8) (2,2 %, 47,1 %) HPV52 35,1 % (20/57) (24,0 %, 48,1 %) 33,3 % (4/12) (13,8 %, 60,9 %) 19,3 % (11/57) (11,1 %, 31,3 %) 16,7 % (2/12) (4,7 %, 44,8 %) HPV35/39/68 36,0 % (27/75) (26,1 %, 47,3 %) 33,3 % (7/21) (17,2 %, 54,6 %) 17,3 % (13/75) (10,4 %, 27,4 %) 19,0 % (4/21) (7,7 %, 40,0 %) Performance clinique des échantillons PreservCyt Tableau 8 : Performances du test BD Onclarity HPV Assay avec le milieu PreservCyt par rapport aux résultats de l’histologie (CIN 2+) BD Onclarity HPV Assay hc2 HPV DNA Test Estimation Intervalle de confiance à 95 % Estimation Intervalle de confiance à 95 % Sensibilité 94,7 % (160/169) (90,2 %, 97,2 %) 97,0 % (160/165) (93,1 %, 98,7 %) Spécificité 50,5 % (97/192) (43,5 %, 57,5 %) 40,8 % (75/184) (33,9 %, 48,0 %) Tableau 9 : Performances du test BD Onclarity HPV Assay avec le milieu PreservCyt par rapport aux résultats de l’histologie (CIN 3+) BD Onclarity HPV Assay hc2 HPV DNA Test Estimation Intervalle de confiance à 95 % Estimation Intervalle de confiance à 95 % Sensibilité 94,4 % (85/90) Spécificité 37,3 % (101/271) (87,6 %, 97,6 %) 97,7 % (85/87) (92,0 %, 99,4 %) (31,7 %, 43,2 %) 29,8 % (78/262) (24,6 %, 35,6 %) 24 Tableau 10 : Performances du test BD Onclarity HPV Assay avec le milieu PreservCyt par rapport à la référence composite Résultat de la référence composite BD Onclarity HPV Assay Positif Négatif Non résolu* Total Positif 246 5 18 269 Négatif 10 366 29 405 Total 256 371 47 674 Pourcentage de concordance positive Pourcentage de concordance négative Pourcentage de concordance globale (Intervalle de confiance à 95 %) (Intervalle de confiance à 95 %) (Intervalle de confiance à 95 %) 96,1 % (93,0 %, 97,9 %) 98,7 % (96,9 %, 99,4 %) 97,6 % (96,1 %, 98,5 %) * Les résultats hc2 et RLA ne concordent pas ou bien les résultats n’étaient pas disponibles pour les deux tests. Tableau 11 : Risque absolu de CIN 2+ et CIN 3+ pour les génotypes du test BD Onclarity HPV Assay avec le milieu PreservCyt Génotype de BD Onclarity HPV Assay Infection due à un ou plusieurs génotypes Risque absolu CIN2+ HPV 16 HPV 18 HPV 45 HPV 33/58 HPV 31 HPV 56/59/66 HPV 51 HPV 52 HPV 35/39/68 77,1 % (84/109) 50,0 % (12/24) 50,0 % (6/12) 70,0 % (28/40) 67,7 % (42/62) 34,0 % (18/53) 48,0 % (12/25) 73,9 % (17/23) 38,5 % (10/26) Intervalle de confiance à 95 % (68,3 %, 84,0 %) (31,4 %, 68,6 %) (25,4 %, 74,6 %) (54,6 %, 81,9 %) (55,4 %, 78,0 %) (22,7 %, 47,4 %) (30,0 %, 66,5 %) (53,5 %, 87,5 %) (22,4 %, 57,5 %) Infection due à un seul génotype ou à un groupe de génotypes Intervalle Risque de absolu confiance CIN2+ à 95 % 81,4 % (70,8 %, (57/70) 88,8 %) 45,5 % (21,3 %, (5/11) 72,0 %) 25,0 % (4,6 %, (1/4) 69,9 %) 75,0 % (53,1 %, (15/20) 88,8 %) 71,0 % (53,4 %, (22/31) 83,9 %) 11,1 % (3,1 %, (2/18) 32,8 %) 27,3 % (9,7 %, (3/11) 56,6 %) 85,7 % (48,7 %, (6/7) 97,4 %) 40,0 % (11,8 %, (2/5) 76,9 %) Infection due à un ou plusieurs génotypes Intervalle de confiance à 95 % (35,1 %, 53,4 %) (14,9 %, 49,2 %) (4,7 %, 44,8 %) (22,1 %, 50,5 %) (20,6 %, 43,0 %) (4,1 %, 20,3 %) (6,4 %, 34,7 %) (12,5 %, 46,5 %) (6,1 %, 33,5 %) Risque absolu CIN3+ 44,0 % (48/109) 29,2 % (7/24) 16,7 % (2/12) 35,0 % (14/40) 30,6 % (19/62) 9,4 % (5/53) 16,0 % (4/25) 26,1 % (6/23) 15,4 % (4/26) Infection due à un seul génotype ou à un groupe de génotypes Intervalle Risque de absolu confiance CIN3+ à 95 % 50,0 % (38,6 %, (35/70) 61,4 %) 18,2 % (5,1 %, (2/11) 47,7 %) 0,0 (0,0 %, (0/4) 49,0 %) 50,0 % (29,9 %, (10/20) 70,1 %) 41,9 % (26,4 %, (13/31) 59,2 %) 0,0 % (0,0 %, (0/18) 17,6 %) 18,2 % (5,1 %, (2/11) 47,7 %) 42,9 % (15,8 %, (3/7) 75,0 %) 20,0 % (3,6 %, (1/5) 62,4 %) Performance clinique des échantillons BD Onclarity HPV Cervical Brush Tableau 12 : Performances du test BD Onclarity HPV Assay avec le milieu BD Onclarity HPV Cervical Brush par rapport aux résultats de l’histologie (CIN 2+) BD Onclarity HPV Assay Estimation Estimation Intervalle de confiance à 95 % Sensibilité 97,2 % (104/107) (92,1 %, 99,0 %) 99,1 % (106/107) (94,9 %, 99,8 %) Sensibilité 17,9 % (25/140) (12,4 %, 25,0 %) 21,4 % (30/140) (15,4 %, 28,9 %) Sensibilité 100,0 % (121/121) (96,9 %, 100,0 %) 97,5 % (116/119) (92,8 %, 99,1 %) Sensibilité 37,4 % (55/147) (30,0 %, 45,5 %) 43,0 % (61/142) (35,1 %, 51,2 %) Centre A B hc2 HPV DNA Test Intervalle de confiance à 95 % 25 Tableau 13 : Performances du test BD Onclarity HPV Assay avec le milieu BD Onclarity HPV Cervical Brush par rapport aux résultats de l’histologie (CIN 3+) BD Onclarity HPV Assay Estimation Sensibilité 97,3 % (72/74) Sensibilité 15,0 % (26/173) Sensibilité Sensibilité Centre A B hc2 HPV DNA Test Intervalle de confiance à 95 % Estimation Intervalle de confiance à 95 % (90,7 %, 99,3 %) 98,6 % (73/74) (92,7 %, 99,8 %) (10,5 %, 21,1 %) 17,3 % (30/173) (12,4 %, 23,7 %) 100,0 % (60/60) (94,0 %, 100,0 %) 98,3 % (57/58) (90,9 %, 99,7 %) 26,4 % (55/208) (20,9 %, 32,8 %) 31,0 % (63/203) (25,1 %, 37,7 %) Etudes analytiques Sensibilité analytique calculée au niveau du seuil clinique : La limite de détection (LD) au niveau du seuil clinique HPV a été déterminée pour le test BD Onclarity HPV Assay à l’aide de lignées cellulaires HPV positives : SiHa (HPV 16), HeLa (HPV 18) et MS751 (HPV 45) et ADN cloné dans un plasmide contenant les séquences des génotypes HPV suivants : HPV 31, 33, 35, 39, 51, 52, 56, 58, 59, 66 et 68 avec les milieux BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt Solution et BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent contenant une lignée cellulaire HPV négative (C33A). Les lignées cellulaires HPV ont été analysées individuellement alors que les plasmides HPV ont été analysés ensemble dans trois groupes : 1) HPV 31, 33, 51, 52 et 59 ; 2) HPV 56, 58, 68 ; et 3) HPV 35 et 66. Un minimum de quarante-cinq réplicats de chacun des six niveaux cibles des lignées cellulaires HPV et vingt réplicats de chacun des six niveaux cibles des plasmides HPV ont été analysés avec un minimum de trois lots de réactifs et un minimum de trois systèmes BD Viper LT. La LD est la concentration d’ADN HPV présente dans l’échantillon dilué présentant des résultats positifs au-dessus du seuil clinique au moins 95 % du temps. La valeur LD maximum de chacun des génotypes HPV et des milieux sont décrits dans le tableau 14. Tableau 14 : Sensibilité analytique Cible Milieu BD SurePath (Intervalle de confiance à 95 %) Milieu PreservCyt (Intervalle de confiance à 95 %) BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent (Intervalle de confiance à 95 %) SiHa (HPV 16) cellules/mL 1 584 (1 276 – 1 962) 1 835 (1 426 – 2 358) 137 (131 – 144) HeLa (HPV 18) cellules/mL 915 (739 – 1 131) 1 786 (1 175 – 2 715) 51 (46 – 56) MS751 (HPV 45) cellules/mL 3 793 (2 944 – 4 888) 5 425 (4 167 – 7 066) 305 (284 – 343) HPV 31 copies/mL 3 652 (3 159 – 3 868) 4 118 (3 898 – 4 228) 692 (650 – 817) HPV 33 copies/mL 7 326 (6 578 – 8 932) 8 272 (7 946 – 8 743) 1 376 (1 272 – 1 451) HPV 35 copies/mL 6 820 (6 477 – 7 282) 7 282 (6 895 – 7 674) 1 552 (1 317 – 1 780) HPV 39 copies/mL 7 894 (7 115 – 8 193) 8 272 (7 810 – 9 398) 1 531 (1 419 – 1 685) HPV 51 copies/mL 6 697 (5 786 – 7 097) 5 909 (5 553 – 6 824) 1 229 (1 155 – 1 353) HPV 52 copies/mL 3 582 (3 414 – 4 184) 4 184 (3 740 – 4 761) 833 (744 – 934) HPV 56 copies/mL 4 976 (4 140 – 5 698) 4 774 (4 479 – 5 997) 836 (737 – 911) HPV 58 copies/mL 10 094 (9 403 – 11 180) 11 488 (8 989 – 12 360) 2 990 (2 656 – 7 819) HPV 59 copies/mL 4 400 (4 145 – 5 069) 4 374 (4 105 – 5 482) 772 (722 – 899) HPV 66 copies/mL 3 793 (3 621 – 4 030) 4462 (4008 – 4 844) 701 (646 – 767) HPV 68 copies/mL 10 415 (9 799 – 11 642) 10 481 (9 816 – 12 082) 2 079 (1 995 – 2 125) Réactivité croisée : Une galerie de bactéries, levures et virus cultivés avec de l’ADN cloné dans un plasmide contenant des séquences cibles de HPV à haut risque et à faible risque a été utilisée pour évaluer la spécificité analytique du test BD Onclarity HPV Assay sur le système BD Viper LT. Chaque déclencheur de réaction croisée potentiel a été analysé individuellement avec le BD SurePath Preservative Fluid et la PreservCyt Solution contenant une lignée cellulaire HPV négative (C33A). Les microorganismes sont décrits dans les tableaux 15 et 16. Le test BD Onclarity HPV Assay n’a déclenché aucune réaction croisée avec les microorganismes testés. 26 Tableau 15 : Microorganismes testés pour la spécificité analytique Bactéries* Virus** Actinomyces israelii Adénovirus de type 5 Atopobium vaginae EBV-1, souche B95-8 Bacteroides fragilis HCMV. Souche AD169 Bacteroides ureolyticus HIV-1 Bifidobacterium adolescentis HSV1 Bifidobacterium brevi HSV2 Bifidobacterium longum ssp. longum HPV à haut risque*** Chlamydia trachomatis HPV 16 Clostridium perfringens HPV 18 Corynebacterium genitalium HPV 31 Enterobacter cloacae ssp. cloacae HPV 33 Enterococcus faecalis HPV 35 Enterococcus faecium HPV 39 Escherichia coli Fusobacterium nucleatum ssp. nucleatum HPV 45 Gardnerella vaginalis HPV 52 Klebsiella pneumonia ssp. ozaenae HPV 56 Lactobacillus acidophilus HPV 58 Mycobacterium smegmatis HPV 59 Mycoplasma genitalium HPV 66 Neisseria gonorrhoeae HPV 68 HPV 51 Peptostreptococcus anaerobius Prevotella bivia Prevotella disiens Proteus mirabilis Proteus vulgaris Providencia stuartii Pseudomonas aeruginosa Staphylococcus aureus Staphylococcus epidermidis Streptococcus agalactiae Streptococcus pyogenes Ureaplasma urealyticum Levures/Protozoaires**** Candida albicans Trichomonas vaginalis * Bactéries analysées à environ 1,0 x 107 UFC/mL à l’exception des bactéries suivantes : Chlamydia trachomatis (1,0 x 107 CI/mL), Mycobacterium smegmatis (2,5 x 106 UFC/mL) et Ureaplasma urealyticum (8,0 x 106 UFC/mL). **Virus analysés à 1,0 x 106 PV/mL. ***ADN plasmidique de HPV à haut risque analysé à 1,0 x 106 copies/mL. **** Levures (Candida albicans) analysées à environ 1,0 x 107 UFC/mL ; Protozoaires (Trichomonas vaginalis) analysés à 1,4 x 106 UFC/mL. TTableau 16 : Plasmides HPV à faible risque testés pour la spécificité analytique HPV 6 HPV 69 HPV 11 HPV 70 HPV 26 HPV 73 HPV 30 HPV 82 HPV 34 HPV 97 HPV 53 HPV c85 HPV 67 *ADN plasmidique de HPV à faible risque analysé à 1,0 x 106 copies/mL. 27 Substances interférentes : Les interférences potentielles avec le BD Onclarity HPV Assay sur le système BD Viper LT ont été déterminées avec des substances endogènes et exogènes susceptibles d’être présentes dans des échantillons cervicaux cliniques. Une combinaison d’échantillons HPV négatifs et HPV positifs (co-ensemencés avec les cellules SiHa, HeLa et MS751 à 3 x LD) ont été analysés en présence ou en l’absence de chaque substance potentiellement interférente. Les substances utilisées dans cette étude sont décrites au tableau 17. Les valeurs indiquées représentent les concentrations de substance les plus élevées ne générant pas d’interférence avec le BD Onclarity HPV Assay. Tableau 17 : Substances potentiellement interférentes Substance potentiellement interférente BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent Concentration testée Milieu BD SurePath Milieu PreservCyt Concentration testée Concentration testée Gel lubrifiant KY 10 % (p/v) 6 % (p/v) 10 % (w/v) VCF Vaginal Contraceptive Film (Film contraceptif vaginal) 3 % (w/v) 10 % (w/v) 10 % (w/v) VCF Vaginal Contraceptive Foam (Mousse contraceptive vaginal) 10 % (w/v) 10 % (w/v) 10 % (w/v) Gel contraceptif Conceptrol 1 % (w/v) 10 % (w/v) 10 % (w/v) Monistat 3* 2 % (w/v) 2 % (w/v) 1,8 % (w/v) 10 % (w/v) Clotrimazole 7 10 % (w/v) 10 % (w/v) Vagistat-1 Tioconazole 2 % (w/v) 2 % (w/v) 2 % (w/v) Crème vaginale clindamycine 9 % (w/v) 10 % (w/v) 10 % (w/v) Summer’s Eve Douche (soin d’hygiène intime) 10 % (v/v) 10 % (v/v) 10 % (v/v) Crème Zovirax (Acyclovir) 10 % (w/v) 8 % (w/v) 10 % (w/v) Gel Vandazole (gel vaginal de métronidazole, 0,75 %) 10 % (w/v) 10 % (w/v) 10 % (w/v) Summer’s Eve Deodorant (Déodorant) 2 % (w/v) 3 % (w/v) 2 % (w/v) Mucine bovine 10 % (v/v) 10 % (v/v) 10 % (v/v) Progestérone 20 ng/mL 20 ng/mL 20 ng/mL Estradiol 1,2 ng/mL 1,2 ng/mL 1,2 ng/mL Sang total 3 % (v/v) 5 % (v/v) 5 % (v/v) Leucocytes 1x106 1x106 cellules/mL cellules/mL 1x106 cellules/mL Liquide séminal 10 % (v/v) 10 % (v/v) 10 % (v/v) Nettoyant à l’acide acétique** 5 % (v/v) Sang + Nettoyant à l’acide acétique 5 % de sang (v/v), 2,5 % de nettoyant à l’acide acétique (v/v) *Les concentrations supérieures à celles indiquées ont généré des erreurs de niveau de liquide au cours de l’extraction sur le système BD Viper LT. **Le nettoyant à l’acide acétique contient 1 volume d’acide acétique glacial : 9 volumes de solution CytoLyt. 28 Interférences avec des cibles concurrentes : L’inhibition potentielle de la détection du HPV due à la présence d’une cible à une concentration élevée et d’une autre cible à une concentration faible lors d’une infection mixte a été évaluée avec le test BD Onclarity HPV Assay. Les cellules SiHa, HeLa et MS751 ont été analysées individuellement ou en groupe à 3 x LD en présence ou en l’absence de cible(s) HPV concurrente(s) à 1,0 x 106 copies/mL avec les milieux BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt Solution et BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent contenant une lignée cellulaire HPV négative (C33A) (Tableau 18). Tableau 18 : Interférences avec des cibles concurrentes : Type de tube de test HPV Cibles cellulaires individuelles HPV à 3 x LD Plasmides HPV à 1 x 106 copies/mL Détection de cible cellulaire HPV en présence ou en l’absence de génotypes concurrents (plasmides HPV) SiHa (HPV 16) HPV 18 + HPV 45 Oui Génotypes G1 avec cibles co-amplifiées G1 HeLa (HPV 18) HPV 16 + HPV 45 Oui HPV 45 (MS751) HPV 16 + HPV 18 Oui Génotypes G1 avec cibles co-amplifiées G2 SiHa + HeLa + MS751 HPV 31 + HPV 33 + HPV 56 + HPV 58 + HPV 59 + HPV 66 Oui Génotypes G1 avec cibles co-amplifiées G3 SiHa + HeLa + MS751 HPV 35 + HPV 39 + HPV 51+ HPV 52 + HPV 68 Oui Reproductibilité : La reproductibilité du test BD Onclarity HPV Assay a été évaluée sur le système BD Viper LT à l’aide d’un panel de quatre membres se composant d’échantillons négatifs, fortement négatifs, faiblement positifs et moyennement positifs. Les membres positifs du panel étaient composés des cellules SiHa, HeLa et MS751 ensemencées collectivement en groupes d’échantillons cliniques BD SurePath HPV négatifs et avec le milieu BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent contenant une lignée cellulaire HPV négative (C33A). Le panel a été testé de façon équitable avec trois lots de réactifs et sur trois instruments pendant 12 jours. Les données sont résumées dans le tableau 19. 29 Tableau 19 : Résumé des données de reproductibilité du test BD Onclarity HPV Assay sur le système BD Viper LT Inter-série Lignée Milieu cellulaire (Génotype) SurePath SiHa (HPV 16) HeLa (HPV 18) MS-751 (HPV 45) Cervical Brush Diluent SiHa (HPV 16) Niveau du panel Concentration cellules/mL Nég 0 Fortement nég. 342 Faiblement pos. 1 582 Moyennement pos. 4 746 Nég 0 Fortement nég. 102 Faiblement pos. 914 Moyennement pos. 2 742 Nég 0 Fortement nég, 395 Faiblement pos. 3 793 Moyennement pos. 11 378 Nég 0 SD %CV SD %CV NA NA NA NA 0,54 1,52 0,57 1,62 0,22 0,69 0,30 0,92 0,22 0,71 0,35 1,11 NA NA NA NA 0,75 2,09 0,85 2,37 0,30 0,92 0,37 1,14 0,22 0,72 0,30 0,98 NA NA NA NA 0,52 1,45 0,55 1,53 0,26 0,80 0,36 1,10 0,35 1,10 0,41 1,31 NA NA NA NA Fortement nég. 32 36,29 0,09 0,25 0,59 1,63 0,62 1,71 205 94,91 % (205/216) (91,11 % – 97,13 %) 33,63 0,26 0,78 0,33 0,97 0,43 1,27 615 100 % (216/216) (98,25 % – 100 %) 31,80 0,16 0,51 0,18 0,56 0,25 0,79 0 100 % (214/214) (98,24 % – 100 %) NA NA NA NA NA NA NA Fortement nég. 13 99,07 % (214/216) (96,69 % – 99,75 %) 35,69 0,10 0,29 0,78 2,18 0,80 2,23 Faiblement pos. 76 99,08 % (216/218) (96,72 % – 99,75 %) 33,34 0,15 0,44 0,25 0,76 0,30 0,91 228 99,54 % (215/216) (97,42 % – 99,92 %) 32,07 0,24 0,73 0,25 0,78 0,37 1,16 0 100 % (214/214) (98,24 % – 100 %) NA NA NA NA NA NA NA Fortement nég. 59 100 % (216/216) (98,25 % – 100 %) 36,54 0,22 0,61 0,62 1,68 0,66 1,81 Faiblement pos. 457 99,54 % (215/216) (97,42 % – 99,92 %) 33,22 0,16 0,48 0,25 0,75 0,32 0,95 1 371 100 % (218/218) (98,27 % – 100 %) 31,74 0,14 0,43 0,21 0,67 0,27 0,84 Moyennement pos. Nég Moyennement pos. (98,27 % – 100 %) Total Faiblement pos. Nég MS-751 (HPV 45) 100 % (216/216) 97,69 % (211/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 98,61 % (213/216) 99,54 % (215/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 99,54 % (215/216) 100 % (214/214) Intra-série 100 % (218/218) Moyennement pos. HeLa (HPV 18) % corrects Intervalle de Moyenne confiance SD %CV Ct à 95 % (98,25 % – NA NA NA 100 %) (94,7 % – 35,28 0,16 0,46 99,01 %) (100 % – 32,31 0,16 0,50 98,25 %) (100 % – 31,07 0,22 0,69 98,25 %) (98,25 % – NA NA NA 100 %) (96 % – 35,89 0,24 0,68 99,53 %) (97,42 % – 32,70 0,16 0,50 99,92 %) (100 % – 30,68 0,13 0,43 98,25 %) (98,25 % – NA NA NA 100 %) (98,25 % – 35,77 0,00 0,00 100 %) (100 % – 32,71 0,20 0,60 98,25 %) (97,42 % – 31,33 0,18 0,57 99,92 %) (98,24 % – NA NA NA 100 %) Contamination croisée : Une étude a été effectuée afin d’évaluer le risque d’obtenir un résultat faussement positif soit dans la même série (contamination croisée intra-série) soit dans une série suivante (contamination entre séries) sur le système BD Viper LT. Une série a été testée tous les jours pendant cinq jours sur chacun des trois instruments soit un total de 675 réplicats de tests. Chaque série se composait d’échantillons BD SurePath Preservative Fluid ou PreservCyt Solution contenant une lignée cellulaire HPV négative (C33A) avec et sans cellules SiHa ensemencées à 1,0 x 105 cellules/mL organisées comme sur un échiquier. Le taux global de contamination avec les milieux BD SurePath Preservative Fluid et PreservCyt Solution était de 0,00 %. Stabilité des échantillons non dilués (en flacon) : Des études analytiques ont été réalisées pour valider les conditions de stockage permettant de garantir la stabilité des échantillons cervicaux non dilués. Les échantillons BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt Solution et BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent contenant une lignée cellulaire HPV négative (C33A), ont été ensemencés avec des cellules SiHa à 3 x LD et stockés entre 2 et 8 °C, 30 °C et -20 °C à différents points expérimentaux. À chaque point expérimental, les échantillons étaient sortis et analysés avec le test BD Onclarity HPV Assay sur le système BD Viper LT. Vingt-quatre répétitions du test ont été faites pour chaque condition (type d’échantillon/température/durée). La stabilité a été atteinte pendant 30 jours à une température comprise entre 2 et 30 °C et à -20 °C. Stabilité des échantillons dilués : Des études analytiques ont été réalisées pour valider les conditions de stockage permettant de garantir la stabilité des échantillons cervicaux dilués. Les échantillons BD SurePath Preservative Fluid et PreservCyt Solution contenant une lignée 30 cellulaire HPV négative (C33A) ont été ensemencés avec des cellules SiHa à 3 X LD, dilués avec le BD HPV LBC Diluent et stockés entre 2 et 8 °C, à 30 °C et à -20 °C à différents points expérimentaux. À chaque point expérimental, les échantillons étaient sortis et analysés avec le test BD Onclarity HPV Assay sur le système BD Viper LT. Vingt-quatre répétitions du test ont été faites pour chaque condition (type d’échantillon/température/durée). La stabilité a été atteinte pendant 15 jours à une température comprise entre 2 et 30 °C et pendant 30 jours à -20 °C. Stabilité des échantillons après préchauffage : Des études analytiques ont été réalisées pour valider les conditions de stockage permettant de garantir la stabilité des échantillons cervicaux après préchauffage. Les échantillons BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt Solution et BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent contenant une lignée cellulaire HPV négative (C33A), ont été ensemencés avec des cellules SiHa à 3 x LD, dilués avec le BD Onclarity HPV LBC Diluent, puis préchauffés avec le BD Viper LT Pre-warm Heater. Les échantillons traités ont été stockés à une température comprise entre 2 et 8 °C, à 30 °C et à -20 °C à différents points expérimentaux. À chaque point expérimental, les échantillons étaient sortis et analysés avec le test BD Onclarity HPV Assay sur le système BD Viper LT. Vingt-quatre répétitions du test ont été faites pour chaque condition (type d’échantillon/température/durée). La stabilité a été atteinte pendant 7 jours à une température comprise entre 2 et 30 °C et pendant 30 jours à -20 °C. INTERPRÉTATION DES TABLEAUX Symboles et abréviations Symboles (+) (-) # % positif négatif nombre pourcentage Abréviations ASCUS Atypical squamous cells of undetermined significance (Cellules squameuses atypiques d’importance indéterminée) UFC Unités formant colonies IC Intervalle de confiance CIN Cervical intraepithelial neoplasia (Néoplasie cervicale intraépithéliale) CV Coefficient de variation HPV Human Papillomavirus (Papillomavirus humain) HR Haut risque LBC Cytologie en milieu liquide (Liquid-Based Cytology) n Nombre NA Non applicable NEGNégatif PCN Pourcentage de concordance négatif PBS Sérum physiologique tamponné au phosphate (Phosphate Buffered Saline) PCR Réaction en chaîne de polymérase (Polymerase Chain Reaction) POSPositif PCP Pourcentage de concordance positif CQ Contrôle de qualité E-T Écart type CONDITIONNEMENT Les produits suivants BD Onclarity et BD Viper compatibles avec le BD Viper LT sont également disponibles : N° réf. Description 442946 BD Onclarity HPV Assay Reagent Pack, 192 tests 441993 Control Set for the BD Onclarity HPV Assay, 24 tubes positifs et 24 tubes négatifs 442841 BD Viper PCR Extraction Reagent Trough with Piercing Tool, 12 cuves de réactifs d’extraction 441992 BD FOX PCR Extraction Tubes, 384 tubes 441354 BD Viper System Neutralization Pouch, 12 sachets 442840 BD Onclarity HPV Liquid Based Cytology Specimen (LBC) Diluent, 400 tubes 441991 BD Onclarity HPV Assay Cervical Brush Collection Kit, 100 442957 BD Viper LT System PCR Tube/Tray Kit 443430 Key Card for the BD Viper LT System (Carte clé pour le système BD Viper LT) 440476 BD ProbeTec Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae (CT/GC) Amplified DNA Assay Endocervical Specimen Collection and DRY TRANSPORT Kit 441996 BD Viper LT Pipette Tips, 3 840 441995 BD Viper LT Solid Waste Liners, 80 442950 BD Pre-warm Heater 442967 BD Viper LT System PCR Accessory kit 442839 Systèm BD Viper LT RÉFÉRENCES: Voir la rubrique “References” du texte anglais 31 Onclarity HPV Assay Deutsch VERWENDUNGSZWECK Der BD Onclarity HPV Assay (HPV-Test) ist ein amplifizierter DNA-Test für den qualitativen Nachweis von Hochrisikotypen der humanen Papillomaviren (HPV). Mit dem Assay können alle Hochrisiko-HPV-Typen (16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 und 68) nachgewiesen werden. Außerdem bietet er die Möglichkeit zur Genotypisierung von sechs Hochrisikotypen (HPV 16, 18, 31, 45, 51 und 52). Zu den mit dem BD Onclarity HPV Assay getesteten zervikalen Proben zählen BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit (zervikales Bürsten-Entnahmeset), BD SurePath Preservative Fluid (Konservierungsflüssigkeit) und PreservCyt-Lösung. (Dazu wird ein Aliquot verwendet, das vor oder nach der Verarbeitung für den BD SurePath- oder ThinPrep-Pap-Test entnommen wird). Der BD Onclarity HPV Assay wird mit dem BD Viper LT System durchgeführt. ZUSAMMENFASSUNG UND ERKLÄRUNG Humane Papillomaviren (HPV) sind die am häufigsten vorkommenden sexuell übertragbaren Viren weltweit. Rund 50 % aller sexuell aktiven Personen leiden einmal in ihrem Leben an einer HPV-Erkrankung im Genitalbereich. Die Betroffenen wissen häufig nicht, dass sie infiziert sind, und ergreifen keine Maßnahmen, um eine Übertragung des Virus auf andere zu verhindern. Es sind mehr als 40 HPV-Typen bekannt, die eine Infektion des Genitalbereich auslösen können.1 In vielen Fällen handelt es sich um transiente HPV-Infektionen, die von alleine ausheilen. In einigen Fällen ist das Virus jedoch persistent und löst eine abnorme Entwicklung normaler Zellen aus, die zu einer Krebserkrankung führt. Diese onkogenen HPV-Typen werden als Hochrisikoviren eingestuft. Zu diesen zählen unter anderem HPV 16 und 18. Andere Typen werden als Niedrigrisikoviren bezeichnet, da von diesen kein Krebsrisiko auszugehen scheint. Laut der World Health Organization (WHO) ist HPV weltweit mit etwa 250.000 Todesfällen pro Jahr die zweithäufigste Ursache für krebsbedingte Todesfälle bei Frauen. Allein in Europa sterben jährlich etwa 15.000 Menschen an der Erkrankung.2 Schätzungen zufolge werden fast 70 % aller Fälle von Gebärmutterhalskrebs durch die HPV-Typen 16 und 18 hervorgerufen.3 Heute können Ärzte Pap-Tests einsetzen, um Veränderungen an den Zellen des Gebärmutterhalses festzustellen. Weisen diese Zellen Anomalitäten auf, kann ein HPV-Test durchgeführt werden, um zu untersuchen, ob die Veränderungen der Gebärmutter durch einen HPV-Typ hervorgerufen werden, der zu Gebärmutterhalskrebs führen kann. Nicht alle molekularen Assays können die verschiedenen HPV-Typen unterscheiden Mit dem BD Viper LT System durchgeführt, ist der BD Onclarity HPV Assay ein amplifizierter DNA-Assay für den qualitativen Nachweis von Hochrisikotypen der humanen Papillomaviren (HPV). Mit dem Assay können die HPV-Typen 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 und 68 nachgewiesen werden. Außerdem bietet er gleichzeitig die Möglichkeit zur Identifizierung der Hochrisikotypen 16, 18, 31, 45, 51 und 52 sowie anderer Hochrisiko-Genotypen, die nach Genotypgruppe berichtet werden (P1: 33/58; P2: 56/59/66; P3: 35/39/68). Zu den zervikalen Proben, die mit dem BD Onclarity HPV Assay getestet werden können, zählen BD SurePath Preservative Fluid (mithilfe eines Aliquots, das vor oder nach der Verarbeitung für den BD SurePath-Pap-Test entnommen wird), PreservCyt-Lösung (mithilfe eines Aliquots, das vor oder nach der Verarbeitung für den PreservCyt-Pap-Test entnommen wird) und BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit. VERFAHRENSGRUNDLAGEN Der BD Onclarity Human Papillomavirus (HPV) Assay wurde für die Verwendung mit der BD SurePath Preservative Fluid (mithilfe eines Aliquots, das vor oder nach der Verarbeitung für den BD SurePath-Pap-Test entnommen wird), der PreservCyt-Lösung (mithilfe eines Aliquots, das vor oder nach der Verarbeitung für den PreservCyt-Pap-Test entnommen wird) und dem BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit, den zugehörigen Reagenzien, dem BD Viper LT System und der BD FOX Extraction (Extraktion) entwickelt. Die Proben durchlaufen einen Vorwärmschritt im BD Pre-warm Heater (Vorwärmblock). Dieser dient der Homogenisierung der Matrix, der Lysierung der Zellen und der Freisetzung der DNA, die extrahiert und amplifiziert werden kann. Nach dem Kühlvorgang werden die Proben in das BD Viper LT System eingesetzt, in dem anschließend die Schritte zur Extraktion und Amplifikation der Ziel-DNA erfolgen, ohne dass ein weiteres Eingreifen durch den Benutzer erforderlich ist. Die Probe wird in ein Extraktionsröhrchen übertragen, das Eisenoxidpartikel in löslicher Folie enthält. Anschließend wird Säure hinzugefügt, um den pH-Wert zu senken und das Eisenoxid positiv zu laden, was wiederum zur Bindung der negativ geladenen DNA führt. Dann werden die Partikel und die gebundene DNA mit Magneten an die Seiten des Extraktionsröhrchens gezogen und die behandelte Probe wird angesaugt und entsorgt. Die Partikel werden gereinigt und es wird ein Elutionspuffer mit hohem pH-Wert hinzugefügt, um die gereinigte DNA zu eluieren. Schließlich wird ein Neutralisierungspuffer verwendet, um den pH-Wert des Eluats für die Amplifikation der DNA zu optimieren. Der BD Onclarity HPV Assay basiert auf dem gleichzeitigen Amplifizieren und Nachweisen der Ziel-DNA mithilfe von Amplifikations-Primern und mit fluoreszierendem Farbstoff markierten Nachweissonden unter Verwendung einer Polymerase-Kettenreaktion (PCR) in Echtzeit. Die Reagenzien liegen getrocknet in drei Röhrchen (G1, G2 und G3) vor, mithilfe derer die 14 HPV-Genotypen nachgewiesen werden können, sowie in einer aus der Probe gewonnenen internen Kontrolle, bestehend aus DNA-Fragmenten des humanen Beta-Globin-Gens. Jedes einzelne Röhrchen enthält die Amplifikations-Primer, mit fluoreszierendem Farbstoff markierte Nachweissonden, DNA-Polymerase, Nukleotide und weitere, für die Amplifikation erforderliche Reagenzien zu dem jeweiligen Assay. Das BD Viper LT System pipettiert einen Teil der gereinigten DNA-Lösung aus jedem Extraktionsröhrchen in eines der drei BD Onclarity HPV-PCR-Röhrchen (G1, G2 und G3), die anschließend versiegelt werden, um eine Kontaminierung zu verhindern. Das Vorhandensein oder Nichtvorhandensein von HPV-DNA wird anhand des PCR-Zyklus bestimmt, bei dem das Signal einen vordefinierten Schwellenwert überschreitet. Zusätzlich wird als interne Kontrolle zur Beurteilung der Verarbeitung, Extraktion und Amplifikation der Probe im Rahmen des Assays ein Fragment des humanen Beta-Globin-Gens extrahiert, amplifiziert und nachgewiesen. 32 MITGELIEFERTE REAGENZIEN UND ARBEITSMATERIALIEN: Jede Reagenzienpackung des BD Onclarity HPV Assay enthält: BD Onclarity HPV G1-PCR-Röhrchen, 2 x 96: jedes G1-PCR-Röhrchen enthält ca. 32,5 pmol Oligonukleotide, 20 pmol mit fluoreszierendem Farbstoff markierte Nachweissonde, 80 nmol dNTPs und 0,52 Einheiten DNAPolymerase mit Stabilisatoren und Pufferkomponenten. BD Onclarity HPV G2-PCR-Röhrchen, 2 x 96: jedes G2-PCR-Röhrchen enthält ca. 42,5 pmol Oligonukleotide, 30 pmol mit fluoreszierendem Farbstoff markierte Nachweissonde, 80 nmol dNTPs und 0,52 Einheiten DNAPolymerase mit Stabilisatoren und Pufferkomponenten. BD Onclarity HPV G3-PCR-Röhrchen, 2 x 96: jedes G3-PCR-Röhrchen enthält ca. 42,5 pmol Oligonukleotide, 25 pmol mit fluoreszierendem Farbstoff markierte Nachweissonde, 80 nmol dNTPs und 0,52 Einheiten DNAPolymerase mit Stabilisatoren und Pufferkomponenten. HINWEIS: Jeder Beutel enthält einen Trockenmittelbeutel. Kontrollset für den BD Onclarity HPV Assay: 24 BD Onclarity HPV Positive Control Tubes (Positiv-Kontrollröhrchen) mit ca. 14.430 Kopien von linearisierten HPV 16-Plasmiden, 8.325 Kopien von linearisierten HPV 18-Plasmiden, 8.418 Kopien von linearisierten HPV 56-Plasmiden sowie 3.885 Kopien eines Plasmids mit einer Gensequenz des humanen Beta-Globins in Trägernukleinsäure und 24 BD Onclarity HPV Negative Control Tubes (Negativ-Kontrollröhrchen), die nur Trägernukleinsäure enthalten. Die Konzentrationen der Trägernukleinsäure und der Plasmide werden mittels Spektralphotometrie bestimmt. BD Onclarity HPV Liquid-Based Cytology Specimen (LBC) Diluent Tubes (Verdünnungsmittelröhrchen): 400 Röhrchen mit jeweils ca. 1,7 mL Puffer mit Salz, Reinigungsmittel und Konservierungsmittel. BD FOX PCR Extraction Tubes (PCR-Extraktionsröhrchen): 48 Streifen mit 8 Röhrchen, die jeweils ca. 10 mg Eisenoxid in löslicher Folie enthalten. BD Viper PCR Extraction Reagent Trough with Piercing Tool (PCR-Extraktionsreagenzbehälter und Punktionswerkzeug): Jeder mit 5 Kammern versehene Extraktionsreagenzbehälter enthält ca. 16,5 mL bindende Säure, 72,5 mL Waschpuffer, 25,4 mL Elutionspuffer und 19,4 mL Neutralisierungspuffer mit Konservierungsmittel sowie 15,5 mL Abfallneutralisierungslösung. GERÄT, LABORUTENSILIEN UND VERBRAUCHSMATERIALIEN Mitgeliefertes Arbeitsmaterial: BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit, BD Viper LT Instrument (Gerät), BD Viper LT Instrument Plates (Geräteplatten), BD Viper LT Pipette Tips (Pipettenspitzen), BD Viper LT Solid Waste Liners (Beutel für Feststoffabfall), BD Viper LT System PCR Tube/Tray Kit (PCR-Röhrchen-/-Schalen-Kit), BD Viper LT System PCR Accessory Kit (PCR-Zubehörkit), BD Viper Pre-warm Heater (Vorwärmblock), BD Viper LT Specimen Rack (Probenständer), BD Viper Neutralization Pouches, Specimen Tubes and Caps (Neutralisierungsbeutel, Probenröhrchen und Kappen) zur Verwendung mit dem BD Viper-System (Extraktionsmodus), BD ProbeTec™ Chlamydia trachomatis/ Neisseria gonorrhoeae (CT/GC) Amplified DNA Assay Endocervical Specimen Collection and DRY TRANSPORT Kit (Kit für die endozervikale Entnahme und den TROCKENTRANSPORT von Proben für den amplifizierten DNA-Test). Benötigtes, jedoch nicht mitgeliefertes Arbeitsmaterial: Nitrilhandschuhe, Verdrängungspipetten, aerosolbeständige Pipettenspitzen aus Polypropylen für 0,5 ± 0,05 mL, Vortex-Mischer, 0,5%iges (v/v) Natriumhypochlorit, 1%iges (v/v) Natriumhypochlorit, 3%iges (w/v) Wasserstoffperoxid, Isopropyl-Alkohol, nukleasefreies Wasser für molekularbiologische Zwecke. Aufbewahrung und Handhabung: Das BD Onclarity HPV LBC Diluent (Verdünnungsmittel) und das BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent (Verdünnungsmittel für die zervikale Bürste) müssen bei 2 – 25 °C aufbewahrt werden. Alle anderen Reagenzien können bei 2 – 33 °C aufbewahrt werden. Ungeöffnet sind die Reagenzienpackungen bis zum Verfallsdatum stabil. Nach dem Öffnen eines Beutels sind die ordnungsgemäß verschlossenen PCR-Röhrchen 4 Wochen lang bzw. bis zum Verfallsdatum stabil (es gilt der jeweils frühere Zeitpunkt). Nicht einfrieren. WARNUNGEN UND VORSICHTSMASSNAHMEN 1. In-vitro-Diagnostikum. 2. Klinische Proben können pathogene Mikroorganismen, wie z. B. Hepatitis-Viren und HIV, enthalten. Beim Umgang mit allen mit Blut oder anderen Körperflüssigkeiten kontaminierten Artikeln sind die „Allgemeinen Vorsichtsmaßnahmen“4-7 sowie die einschlägigen Institutionsrichtlinien zu beachten. Weitere spezielle Vorsichtsund Warnhinweise sowie Anmerkungen zum BD Viper LT-Gerät enthält das Benutzerhandbuch zum BD Viper LT T- System. Proben: 3. Für flüssigkeitsbasierte Zytologieproben nur die BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen verwenden. 4. Für zervikale Bürstenabstriche nur das BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit verwenden. 5. Für ein optimales Ergebnis des BD Onclarity HPV Assay ist Voraussetzung, dass die Proben ordnungsgemäß entnommen, gehandhabt und transportiert werden. 6. Zervikale Bürste bei der Abstrichentnahme nicht zu stark drehen, um unnötiges Bluten zu reduzieren. 7. Die zum Labor gesandten Proben müssen ordnungsgemäß beschriftet sein. 8. Beim Abbrechen des Stiels der zervikalen Bürste darauf achten, dass der Inhalt nicht verspritzt oder verschüttet wird oder Aerosole entstehen. Kopf der zervikalen Bürste vor Kontaminierung schützen. 9. Kreuzkontaminierung während der Handhabung der Proben vermeiden. Sicherstellen, dass die Probenbehälter nicht mit anderen in Berührung kommen. Verwendetes Arbeitsmaterial entsorgen, ohne dieses über offene Probenbehälter hinweg zu transportieren. Sollten die Handschuhe mit den Proben in Berührung kommen, sind sie zu wechseln, um eine Kreuzkontaminierung zu vermeiden. 10. Eine übermäßige oder zu geringe Befüllung der BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen mit LBC-Proben kann die Testleistung beeinträchtigen. Eine übermäßige Befüllung der Röhrchen kann auch zu einem Überlaufen von Flüssigkeit auf das BD Viper LT-Deck führen und Kontaminierungen verursachen. 33 11. Zervikale Proben müssen vor Ablauf des Verfallsdatums des BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchens oder des BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent-Röhrchens entnommen und getestet werden. 12. Zum Transferieren von Proben in die BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen dürfen nur aerosolbeständige Pipettenspitzen aus Polypropylen verwendet werden. Test/Reagenz: 13.Die BD Onclarity HPV Positive und Negative Controls müssen innerhalb von 24 Stunden nach der Hydrierung vorgewärmt werden. 14. Nur Proben- und Kontrollröhrchen mit durchbohrbaren Kappen im BD Viper LT System verwenden. Die durchbohrbaren Kappen vor dem Starten des Geräts nicht entfernen. Punktierte durchbohrbare Kappen vor dem Starten des Geräts unbedingt durch neue durchbohrbare Kappen ersetzen. 15. Reagenzien aus Kits mit verschiedenen Chargennummern nicht gegeneinander austauschen oder miteinander kombinieren. 16. BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent-Röhrchen nicht testen, wenn die Bürste beim Eintreffen im Labor fehlt. Andernfalls kann es zu falsch negativen Testergebnissen kommen. 17. Nur die BD Viper LT-Pipettenspitzen verwenden, die im Lieferumfang des BD Viper LT Systems enthalten sind. 18. BD Viper PCR Extraction Reagent Trough with Piercing Tool (PCR-Extraktionsreagenzbehälter und Punktionswerkzeug) VORSICHT H314 Verursacht schwere Verätzungen und schwere Augenschäden. H302 Gesundheitsschädlich bei Verschlucken. P260 Staub/Rauch/Gas/Nebel/Dampf/Aerosol nicht einatmen. P280 Schutzhandschuhe/Schutzkleidung/Augenschutz/ Gesichtsschutz tragen. P303/361/353 BEI BERÜHRUNG MIT DER HAUT (oder dem Haar): Alle kontaminierten Kleidungsstücke sofort ausziehen. Haut mit Wasser abwaschen/duschen. P304/340 BEI EINATMEN: Die betroffene Person an die frische Luft bringen und in einer Position ruhigstellen, die das Atmen erleichtert. P405 Unter Verschluss aufbewahren. P501 Inhalt/Behälter gemäß den örtlichen/regionalen/nationalen/internationalen Bestimmungen entsorgen. 19. Nur die BD Viper LT Clear Plate Sealers (durchsichtigen Plattensiegel) auf den PCR-Röhrchen mit dem BD Viper LT System verwenden. 20. Reagenzienbeutel mit nicht verwendeten PCR-Röhrchen MÜSSEN nach dem Öffnen wieder sorgfältig verschlossen werden. Vor dem Verschließen der Reagenzienbeutel sicherstellen, dass Trockenmittel vorhanden ist. 21. Die PCR-Röhrchen MÜSSEN vor dem Entfernen der Platte aus dem BD Viper LT System ordnungsgemäß mit den BD Viper LT Clear Plate Sealers verschlossen werden. Das Verschließen gewährleistet eine geschlossene Reaktion bei Amplifikation und Nachweis und ist notwendig, um eine Kontaminierung des Geräts und des Arbeitsbereichs mit Amplifikationsprodukten zu vermeiden. Keinesfalls die Abdeckung von den PCR-Röhrchen entfernen. 22. Zur Entsorgung der getesteten PCR-Röhrchen die im BD Viper LT System PCR Accessory Kit (PCR-Zubehör-Kit) enthaltenen Entsorgungsbeutel verwenden, um eine Kontaminierung des Arbeitsbereichs mit Amplifikationsprodukten zu vermeiden. Vor der Entsorgung sicherstellen, dass die Beutel ordnungsgemäß verschlossen sind. 23. Aufgrund des Designs des BD Viper LT Systems, durch das das Amplikon-Kontaminierungsrisiko im Testbereich reduziert wird, ist zwar kein dedizierter Arbeitsbereich erforderlich, jedoch müssen anderweitige Vorsichtsmaßnahmen, insbesondere zur Vermeidung von Probenkontaminierungen während der Verarbeitung, getroffen werden. 24. Sollten die Handschuhe mit den Proben in Berührung kommen oder feucht erscheinen, HANDSCHUHE unverzüglich WECHSELN, um Kontaminierungen anderer Proben zu vermeiden. Handschuhe vor dem Verlassen des Arbeitsbereichs und beim erneuten Betreten des Arbeitsbereichs wechseln. 25. Im Falle einer Kontaminierung die Reinigungsanweisungen im Benutzerhandbuch zum BD Viper LT System befolgen. 26. Im Fall eines ungewöhnlichen Vorgangs, z. B. bei einer Verschüttung in das BD Viper LT-Gerät oder bei einer DNAKontaminierung, die durch Reinigen nicht beseitigt werden kann, den technischen Kundendienst und Support von BD verständigen. PROBENENTNAHME UND -TRANSPORT Zu den zervikalen Proben, die mit dem BD Onclarity HPV Assay getestet werden können, zählen BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit, BD SurePath Preservative Fluid (mithilfe eines Aliquots, das vor oder nach der Verarbeitung für den BD SurePath-Pap-Test entnommen wird) und PreservCyt-Lösung (mithilfe eines Aliquots, das vor oder nach der Verarbeitung für den ThinPrep-Pap-Test entnommen wird). Für den Versand im In- und Ausland sind die Proben gemäß den jeweils geltenden gesetzlichen Bestimmungen für den Transport von medizinischen Proben und Krankheitserregern bzw. infektiösen Substanzen zu beschriften. Während des Transports sind die maximalen Lagerzeiten und die Temperaturbedingungen für die Lagerung einzuhalten. ENTNAHME VON ZERVIKALEN BÜRSTENABSTRICHEN 1. BD Onclarity HPV Cervical Brush in den Zervikalkanal einführen, bis nur noch die untersten Borsten der Bürste aus dem Muttermund herausragen. ¼- bis ½-Drehung in eine Richtung drehen. Bürste nicht überdrehen, um unnötiges Bluten zu reduzieren. 2. Den Deckel des BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent-Röhrchens entfernen und die Bürste unverzüglich bis zum Röhrchenboden einführen. 3. Den Stiel der Bürste vorsichtig an der perforierten Linie abbrechen. Verspritzen des Inhalts vermeiden. 4. Das Röhrchen wieder fest verschließen. 34 LAGERUNG UND TRANSPORT VON ZERVIKALEN BÜRSTENABSTRICHEN Die zervikalen Bürstenabstriche in BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent-Röhrchen müssen innerhalb von 30 Tagen nach Probenentnahme zum Labor und/oder Testzentrum transportiert werden, wenn sie bei Temperaturen von 2 – 30 ºC gelagert werden, oder innerhalb von 30 Tagen, wenn sie bei -20 ºC gefroren gelagert werden. Proben dürfen nicht über das Verfallsdatum des Verdünnungsmittelröhrchens für die zervikale Bürste hinaus gelagert und transportiert werden. ENTNAHME VON LBC-PROBEN BD SurePath- oder PreservCyt-Proben müssen entweder mit einer endozervikalen Bürste oder einer endozervikalen Bürste-Spatel-Kombination gemäß den Anweisungen in der BD SurePath- bzw. PreservCyt-Packungsbeilage entnommen werden. Nach der Entnahme können BD SurePath- oder PreservCyt-Proben in der Originalflasche bei 2 – 30 °C bis zu 30 Tage gelagert bzw. transportiert werden oder bei -20 ºC gefroren 30 Tage gelagert werden, bevor sie in BD Onclarity HPV LBC Specimen Diluent-Röhrchen (Probenverdünnungsmittelröhrchen) übertragen werden. LAGERUNG UND TRANSPORT VON LBC-PROBEN LBC-Probenübertragung in BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen – vor oder nach dem Entfernen eines Aliquots für die Verarbeitung für den BD SurePath- oder ThinPrep-Test. Ein Aliquot von 0,5 mL der BD SurePath- oder der PreservCyt-Probe wird vor oder nach der Verarbeitung für den BD SurePath- bzw. ThinPrep-Pap-Test aus der Originalflasche in das BD Onclarity HPV LBC Specimen Diluent-Röhrchen von Hand übertragen. Bei der Handhabung des BD Onclarity HPV LBC Specimen Diluent-Röhrchens und der BD SurePath- oder PreservCyt-Probenflasche müssen Handschuhe getragen werden. Sollten die Handschuhe mit den Proben in Berührung kommen, sind sie unverzüglich zu wechseln, um keine anderen Proben zu kontaminieren. BD SurePath-Probenübertragung vor oder nach der Verarbeitung für den BD SurePath-Test HINWEIS: Die Packungsbeilage zum BD PrepStain Slide Processor (Objektträgerverarbeitungssystem) oder BD Totalys SlidePrep (Objektträgerverarbeitungssystem) enthält Anweisungen zur Entnahme eines Aliquots aus der BD SurePath-Probenflasche vor der Durchführung des flüssigkeitsbasierten BD SurePath-Pap-Tests. HINWEIS: Jede Probe einzeln verarbeiten. 1.Das BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen mit den Patientenkenndaten beschriften. 2. Die Kappe des BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchens abnehmen. 3. Zur Herstellung einer homogenen Mischung das BD SurePath-Probenröhrchen 10 – 20 s lang vortexen. 4. Mithilfe einer aerosolbeständigen Spitze schnell innerhalb einer Minute nach dem Vortexen 0,5 mL aus der Probenflasche in das BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen transferieren. 5. Pipettenspitze entsorgen. HINWEIS: Für jede Probe ist die Verwendung einer neuen Pipettenspitze erforderlich. 6.Das BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen mit der Kappe fest verschließen. 7.Das BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen 3 – 4 Mal umdrehen, um eine gründliche Mischung von Probe und Verdünnungsmittel zu gewährleisten. PreservCyt-Probenübertragung vor oder nach der Verarbeitung für den ThinPrep-Pap-Test HINWEIS: Im Nachtrag zum ThinPrep 2000/3000 System-Benutzerhandbuch finden Sie Anweisungen zur Entnahme eines Aliquots aus der PreservCyt-Probenflasche vor der Durchführung des ThinPrep-Tests. HINWEIS: Jede Probe einzeln verarbeiten. 1.Das BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen mit den Patientenkenndaten beschriften. 2. Die Kappe des BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchens abnehmen. 3. Zur Herstellung einer homogenen Mischung die PreservCyt-Probenflasche bei hoher Geschwindigkeit 8 – 12 s lang vortexen. 4. Sofort mithilfe einer aerosolbeständigen Spitze 0,5 mL aus der Probenflasche in das BD Onclarity HPV LBC DiluentRöhrchen transferieren. 5. Pipettenspitze entsorgen. HINWEIS: Für jede Probe ist die Verwendung einer neuen Pipettenspitze erforderlich. 6.Das BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen mit der Kappe fest verschließen. 7.Das BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen 3 – 4 Mal umdrehen, um eine gründliche Mischung von Probe und Verdünnungsmittel zu gewährleisten. Lagerung und Transport von Proben, die in BD HPV LBC Diluent-Röhrchen übertragen wurden Nach der manuellen Übertragung in ein BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen können die verdünnten Proben bis zu 15 Tage lang bei 2 – 30 °C oder bis zu 30 Tage lang bei -20 °C gelagert werden. VERARBEITUNGSVERFAHREN FÜR ALLE PROBEN HINWEIS: Bei gefrorenen Proben sicherstellen, dass sie bei Raumtemperatur vollständig aufgetaut sind und durch Umdrehen gut gemischt wurden, bevor sie weiterverarbeitet werden. 1. Anhand des Röhrchenanordnungsberichts die Proben in der richtigen Reihenfolge in den BD Viper LT Specimen Rack einsetzen und einrasten lassen. 2. Damit sind die Proben für das Vorwärmen bereit. 3. Vor dem weiteren Vorgehen die Handschuhe wechseln, um Kontaminierungen zu vermeiden. VORBEREITUNG DER QUALITÄTSKONTROLLEN 1. Die Kappen einer BD Onclarity HPV Negative Control und eines BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchens abnehmen. 2. Gesamten Inhalt des BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchens in die BD Onclarity HPV Negative Control geben. 35 3. Die rehydrierte BD Onclarity HPV Negative Control wieder verschließen. Das leere BD Onclarity HPV LBC DiluentRöhrchen wieder verschließen und entsorgen. 4. Die Kappen einer BD Onclarity HPV Positive Control und eines BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchens abnehmen. 5. Gesamten Inhalt des BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchens in die BD Onclarity HPV Positive Control geben. 6. Die rehydrierte BD Onclarity HPV Positive Control wieder verschließen. Das leere BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen wieder verschließen und entsorgen. 7. Anhand des Röhrchenanordnungsberichts die rehydrierte BD Onclarity HPV Negative Control an der richtigen Position in das BD Viper LT Specimen Rack einsetzen. 8. Anhand des Röhrchenanordnungsberichts die rehydrierte BD Onclarity HPV Positive Control an der richtigen Position in das BD Viper LT Specimen Rack einsetzen. 9. Damit sind die Kontrollen für das Vorwärmen mit den Proben bereit. HINWEIS: Kontrollen müssen innerhalb von 24 Stunden nach der Hydrierung vorgewärmt werden. VORWÄRMVERFAHREN HINWEIS: Das Vorwärmverfahren muss für alle Proben durchgeführt werden, um sicherzustellen, dass die Probenmatrix homogen ist, bevor sie in das BD Viper LT System eingesetzt wird. Werden Proben nicht vorgewärmt, kann dies die Leistung des BD Onclarity HPV Assay und/oder des BD Viper LT Systems beeinträchtigen. HINWEIS: Gefrorene oder im Kühlschrank aufbewahrte Proben müssen vor dem Vorwärmen bei Raumtemperatur vollständig aufgetaut werden. 1.Das BD Viper LT Specimen Rack in den BD Pre-warm Heater einsetzen und das Vorwärmprotokoll für den BD Onclarity HPV Assay auf dem BD Viper LT-Gerät auswählen. 2. Die Proben werden durch den BD Pre-warm Heater automatisch vorgewärmt und das Vorwärmen wird gemäß dem Vorwärmprotokoll für den BD Onclarity HPV Assay gesteuert. 3. Nach Abschluss des Vorwärmprotokolls für den BD Onclarity HPV Assay den Ständer vom Wärmeblock nehmen und in das BD Viper LT-Gerät einsetzen. 4. Anweisungen zum Testen von Proben und Kontrollen siehe „Testverfahren“. 5. Nach dem Vorwärmen können Proben bis zu 7 Tage lang bei 2 – 30 ºC oder 30 Tage lang bei -20 ºC gelagert werden, ohne dass vor dem Testen im BD Viper LT System ein weiteres Vorwärmen erforderlich ist. 6. Nach dem Vorwärmen können Kontrollen bis zu 24 Stunden bei 2 – 30 ºC gelagert werden, ohne dass vor dem Testen im BD Viper LT System ein weiteres Vorwärmen erforderlich ist. TESTVERFAHREN Bezüglich spezifischer Anweisungen zum Systembetrieb und zur Wartung der Systemkomponenten siehe das Benutzerhandbuch zum BD Viper LT System. Als optimale Umgebungsbedingungen für den HPV Test erwiesen sich 18 - 27 ºC bei 20 - 85% relativer Luftfeuchtigkeit. QUALITÄTSKONTROLLE Die Qualitätskontrolle muss unter Einhaltung der örtlich, landesweit und/oder bundesweit geltenden Bestimmungen oder der Auflagen der Akkreditierungsorganisationen sowie der Standard-Qualitätskontrollverfahren des betreffenden Labors erfolgen. Benutzern wird geraten, die einschlägigen CLSI-Richtlinien und CLIA-Vorschriften bezüglich geeigneter Maßnahmen zur Qualitätskontrolle einzusehen. Das Kontrollenset für den BD Onclarity HPV Assay ist separat erhältlich. Bei jedem Testlauf und für jede neue Reagenzien-Kit-Chargennummer müssen je eine positive Kontrolle und eine negative Kontrolle mitgeführt werden. Die Kontrollen sind gemäß dem Benutzerhandbuch zum BD Viper LT System zu positionieren. Die positive HPV-Kontrolle dient nur zur Überprüfung erheblichen Reagenzienversagens. Die negative HPV-Kontrolle dient zur Überprüfung auf Reagenzien- und/oder Umgebungskontaminierung. Zusätzliche Kontrollen können in Übereinstimmung mit den Richtlinien oder Auflagen der örtlich, landesweit und/oder bundesweit geltenden Bestimmungen oder Akkreditierungsorganisationen getestet werden. Allgemeine QK-Informationen für das BD Viper LT System: Die Position der PCR-Röhrchen wird in einem farbcodierten Plattenanordnungsbildschirm auf dem LCD-Monitor angezeigt. Ein Pluszeichen (+) in einem Röhrchen gibt an, dass es sich um eine positive QK-Probe handelt. Ein Minuszeichen (-) in einem Röhrchen gibt an, dass es sich um eine negative QK-Probe handelt. Für jede Reagenzien-Kit-Chargennummer muss ein QK-Paar eingegeben werden. Wenn die QK-Paare nicht ordnungsgemäß eingegeben wurden, wird ein Meldungsfenster angezeigt, das das Speichern des Ständers und ein Fortsetzen des Durchlaufs verhindert, bis die Qualitätskontrolle vollständig ist. Es können weitere (optionale) QK-Röhrchen eingegeben werden. Diese Röhrchen werden als normale Proben getestet und haben keine Auswirkungen auf den Status „Bestanden“ bzw. „Nicht bestanden“ des Laufs. Informationen dazu siehe das Benutzerhandbuch zum BD Viper LT Systems. HINWEIS: BD Onclarity HPV-Kontrollen müssen vor dem Einsetzen in das BD Viper LT Specimen Rack manuell hydriert werden. Interpretation der Qualitätskontrollergebnisse: Die BD Onclarity HPV Positive Control (Positivkontrolle) und die BD Onclarity HPV Negative Control (Negativkontrolle) müssen positiv bzw. negativ ausfallen, damit Patientenergebnisse berichtet werden können. Wenn die Kontrollen nicht erwartungsgemäß ausfallen, ist der Testlauf ungültig und die Patientenergebnisse werden vom Gerät nicht berichtet. Wenn eine der Kontrollen nicht die zu erwartenden Ergebnisse erbringt, den gesamten Lauf mit einem neuen Kontrollenset, neuen Extraktionsröhrchen, einer neuen Extraktionsreagenzmulde und neuen PCR-Röhrchen wiederholen. Wenn sich das Problem nicht lösen lässt, zusätzliche Informationen vom technischen Kundendienst und Support von BD anfordern. 36 Tabelle 1: Interpretation der Qualitätskontrollergebnisse Kontrolltyp BD Onclarity HPV Positive Control Symbol im Röhrchenergebnisbericht OK QK-Ergebnis QK bestanden BD Onclarity HPV Positive Control QK nicht bestanden BD Onclarity HPV Positive Control QK nicht bestanden BD Onclarity HPV Positive Control QK nicht bestanden BD Onclarity HPV Negative Control OK QK bestanden BD Onclarity HPV Negative Control QK nicht bestanden BD Onclarity HPV Negative Control QK nicht bestanden BD Onclarity HPV Negative Control QK nicht bestanden Die Symbole im Röhrchenergebnisbericht sind unter „Interpretation der Testergebnisse“ beschrieben. INTERPRETATION DER TESTERGEBNISSE Beim BD Onclarity HPV Assay wird eine Polymerase-Kettenreaktion in Echtzeit verwendet, um humane Papillomaviren (HPV) in klinischen Proben nachzuweisen. Alle Berechnungen werden durch die BD Viper LT-Software automatisch durchgeführt. Das Vorhandensein oder Nichtvorhandensein von klinisch relevanter HPV-DNA wird anhand des PCR-Zyklus (Ct) bestimmt, bei dem das Signal einen vordefinierten Schwellenwert überschreitet. Im Rahmen des Assays wird ein Fragment des humanen Beta-Globin-Gens extrahiert, amplifiziert und nachgewiesen. Dies dient als interne Kontrolle zur Bewertung der Verarbeitung, Extraktion und Amplifikation der Probe und bietet Hinweise auf das Vorhandensein von PCR-Inhibitoren. Wenn das HPV-spezifische Signal höher als ein Schwellenwert des Zyklus ist, verwendet der Algorithmus bei der Interpretation der Ergebnisse die interne Kontrolle. Wenn das HPV-spezifische Signal kleiner oder gleich einem Schwellenwert des Zyklus ist, ignoriert der Algorithmus die interne Kontrolle. Bei HPV-Proben wird im Röhrchenergebnisbericht ein „HR“-Ergebnis (die Kombination aller Genotypen) angezeigt. Ein positives Symbol in dieser Spalte zeigt an, dass für einen oder mehrere Genotypen, die mit dem HPV-Assay nachgewiesen werden können, ein positives Ergebnis erzielt wurde. Die Spalte „GT“ wird verwendet, um die Ergebnisse für Genotypen anzuzeigen, die in Ihrer Region nicht verfügbar sind. Diese Ergebnisse können nicht gekauft werden. Die spezifischen Genotypen und kombinierten Genotypen werden in Spalten angezeigt. Wenn das Ergebnis für einen Genotyp gekauft wurde, werden diese Ergebnisse wie im Folgenden erläutert berichtet. Wenn die Ergebnisse für einen Genotyp nicht für den automatischen Erwerb konfiguriert wurden, sind diese Ergebnisse durch ein „Schlüssel“-Symbol verdeckt. Das Gerät kann so konfiguriert werden, dass spezifische Genotypen gekauft/berichtet werden, nachdem der Lauf beendet ist. Für Anweisungen zur Autorisierung des automatischen Berichtens von Genotypen siehe das Benutzerhandbuch zum BD Viper LT System. Falls die Kontrollergebnisse nicht erwartungsgemäß ausfallen, werden die Patientenergebnisse nicht berichtet. Informationen zu den erwarteten Kontrollwerten siehe den Abschnitt zur Qualitätskontrolle. Berichtete Ergebnisse werden wie folgt interpretiert. Tabelle 2: Interpretation der Ergebnisse des Tests auf Hochrisiko-HPV-Genotypen für den BD Onclarity HPV Assay Hochrisiko-HPVErgebnis HR HR Interpretation Ergebnis Positiv auf Hochrisiko-HPV-Typen HPV-HR positiv Negativ auf Hochrisiko-HPV-Typen HPV-HR negativ HPV-DNA, falls vorhanden, ist nicht nachweisbar. Versagen der internen Kontrolle HPV-DNA, falls vorhanden, ist nicht nachweisbar. HPV-DNA, falls vorhanden, ist nicht nachweisbar. HPV-DNA, falls vorhanden, ist nicht nachweisbar. Extraktionstransfer fehlgeschlagen Fehler beim Flüssigkeitsstand Fehler Tabelle 3: Interpretation der Ergebnisse des Tests auf spezifische HPV-Genotypen für den BD Onclarity HPV Assay HPV-Genotypergebnis 16 16 18 18 45 45 Interpretation Ergebnis Positiv auf HPV-Typ 16 HPV-Typ 16 positiv Negativ auf HPV-Typ 16 HPV-Typ 16 negativ Positiv auf HPV-Typ 18 HPV-Typ 18 positiv Negativ auf HPV-Typ 18 HPV-Typ 18 negativ Positiv auf HPV-Typ 45 HPV-Typ 45 positiv Negativ auf HPV-Typ 45 HPV-Typ 45 negativ (Fortsetzung) 37 HPV-Genotypergebnis P1 P1 31 31 P2 P2 51 51 52 52 P3 P3 GT GT -- Interpretation Ergebnis Positiv auf HPV-Typen 33 und/oder 58 HPV-Typen 33 und/oder 58 positiv Negativ auf HPV-Typen 33 und/oder 58 HPV-Typen 33 und/oder 58 negativ Positiv auf HPV-Typ 31 HPV-Typ 31 positiv Negativ auf HPV-Typ 31 HPV-Typ 31 negativ Positiv auf HPV-Typen 56, 59 und/oder 66 HPV-Typen 56, 59 und/oder 66 positiv Negativ auf HPV-Typen 56, 59 und/oder 66 HPV-Typen 56, 59 und/oder 66 negativ Positiv auf HPV-Typ 51 HPV-Typ 51 positiv Negativ auf HPV-Typ 51 HPV-Typ 51 negativ Positiv auf HPV-Typ 52 HPV-Typ 52 positiv Negativ auf HPV-Typ 52 HPV-Typ 52 negativ Positiv auf HPV-Typen 35, 39 und/oder 68 HPV-Typen 35, 39 und/oder 68 positiv Negativ auf HPV-Typen 35, 39 und/oder 68 HPV-Typen 35, 39 und/oder 68 negativ Positive(s) Ergebnis(se) für HPV-Genotyp in Ihrer Region nicht verfügbar Positive(s) Ergebnis(se) für HPV-Genotyp eingeschränkt Negative(s) Ergebnis(se) für HPV-Genotyp in Ihrer Region nicht verfügbar Ergebnis für HPV-Genotyp kann gekauft werden Negative(s) Ergebnis(se) für HPV-Genotyp eingeschränkt Ergebnis für HPV-Genotyp kann nicht gekauft werden Genotypergebnis ist gesperrt Negatives HPV-Ergebnis, Versagen der internen Kontrolle, Fehler beim Flüssigkeitsstand oder Extraktionstransfer fehlgeschlagen Überprüfung auf Vorliegen von DNA-Kontaminierungen Das folgende Testverfahren sollte mindestens einmal im Monat durchgeführt werden, um den Arbeitsbereich und die Geräteoberflächen auf das Vorliegen von DNA-Kontaminierungen zu überprüfen. Die Überprüfung des Umfelds ist äußerst wichtig, um eine Kontaminierung bereits vor der Entstehung von Schwierigkeiten zu erkennen. 1. Für jeden zu testenden Bereich einen sauberen Abstrichtupfer aus dem BD ProbeTec Chlamydia trachomatis/ Neisseria gonorrhoeae (CT/GC) Amplified DNA Assay Endocervical Specimen Collection and DRY TRANSPORT Kit verwenden. 2. Etwas nukleasefreies Wasser für molekularbiologische Zwecke in einen kleinen, sauberen Behälter geben. 3. Den Abstrichtupfer in das nukleasefreie Wasser für molekularbiologische Zwecke eintauchen und anschließend in langen Zügen über den ersten Bereich streichen. 4. Die Kappe von einem BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen abnehmen und den Tupfer in das Verdünnungsmittel geben. Den Abstrichtupfer zum Mischen 5 – 10 s lang im BD Onclarity HPV Diluent-Röhrchen schwenken. 5. Den Abstrichtupfer an der Röhrcheninnenwand ausdrücken, sodass sich die Flüssigkeit am Röhrchenboden sammelt. 6. Den Abstrichtupfer vorsichtig aus dem BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen herausziehen, um Spritzer zu vermeiden. Den Abstrichtupfer entsorgen. 7. Das BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen mit der schwarzen durchbohrbaren Kappe wieder fest verschließen. 8. Für jeden gewünschten Bereich wiederholen. 9. Wenn alle Tupferproben genommen und in Verdünnungsmittel ausgepresst wurden, diese entsprechend des Vorwärmverfahrens aufbereiten und anschließend das Testverfahren befolgen. Weitere Informationen zur Überprüfung des Umfelds und zu den Reinigungsverfahren siehe das Benutzerhandbuch zum BD Viper LT System. Lässt sich ein Kontaminierungsereignis nicht beseitigen, zusätzliche Informationen vom technischen Kundendienst und Support von BD anfordern. VERFAHRENSBESCHRÄNKUNGEN 1. Voraussetzung für eine optimale Testleistung ist die ordnungsgemäße Probenentnahme und -handhabung. Siehe den Abschnitt „Probenentnahme und Transport“ in dieser Packungsbeilage. 2. Ein negatives Testergebnis schließt die Möglichkeit einer Infektion nicht aus, da die Testergebnisse durch unsachgemäße Probenentnahme, technische Fehler, Probenverwechslung oder eine Anzahl von Mikroorganismen in der Probe, die unterhalb der Nachweisgrenze des Tests liegt, beeinträchtigt werden können. 3.Der BD Onclarity HPV Assay liefert qualitative Ergebnisse. 4. Die Verwendung des BD Onclarity HPV Assay ist auf Personal beschränkt, das im Testverfahren geschult und mit dem BD Viper LT System vertraut ist. LEISTUNGSMERKMALE An zwei geographisch unterschiedlichen Klinikstandorten in Europa wurden BD Onclarity HPV Cervical Brush-Proben, BD SurePath-Proben und/oder PreservCyt-Proben von 836 dem Protokoll gemäß geeigneten Frauen entnommen, die aufgrund abnormer Ergebnisse beim Pap-Test oder einer HPV-Infektion zur Folgeuntersuchung erschienen, sowie von Frauen, die im Rahmen einer Routineuntersuchung in einer Klinik vorstellig wurden. Von jeder Studienteilnehmerin wurden zwei Proben in der folgenden Reihenfolge entnommen: eine BD SurePath-Probe (Standort A) oder eine 38 PreservCyt-Probe (Standort B) und eine BD Onclarity HPV Cervical Brush-Probe (transportiert in einem BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent-Röhrchen). Aus jedem entnommenen zytologischen Fläschchen wurden 0,5 mL in ein BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen aliquotiert. Zu den meisten Proben waren Zytologie, HPV-DNA-Ergebnisse (digene Hybrid Capture 2 (hc2) High-Risk HPV DNA Test) und das Ergebnis des Roche LINEAR ARRAY HPV Genotyping Test (RLA) verfügbar. Zu den meisten Probanden, die eine Hochrisiko-Klinik besuchten, waren Histologieergebnisse verfügbar. An jedem Standort wurden außerdem Restproben (BD SurePath oder PreservCyt) mit zugehörigen Zytologieergebnissen, HPV-DNA-Ergebnissen (digene Hybrid Capture 2 High-Risk HPV DNA Test), Ergebnissen des Roche LINEAR ARRAY HPV Genotyping Test und, sofern verfügbar, Histologieergebnissen einbezogen. Von jeder einbezogenen Probe wurden 0,5 mL in ein BD Onclarity HPV LBC Diluent-Röhrchen aliquotiert. Es wurden 510 konforme retrospektive Proben einbezogen, und zu 234 Frauen waren Histologieergebnisse verfügbar. Alle Proben wurden mit dem BD Viper LT System gemäß den Angaben in der Packungsbeilage des Assays und dem Benutzerhandbuch getestet. Für jeden Medientyp wurde die klinische Sensitivität und Spezifität beim Nachweis einer Erkrankung berechnet, die definiert war als (1) Histologieergebnis zervikale intraepitheliale Neoplasie (CIN2) oder höher oder (2) Histologieergebnis zervikale intraepitheliale Neoplasie (CIN3) oder höher. Die finale Datenanalyse umfasst BD Onclarity HPV Assay-Ergebnisse von 472 BD SurePath-Proben, 361 PreservCyt-Proben und insgesamt 515 BD Onclarity HPV Cervical Brush-Proben: 247 BD Onclarity HPV Cervical Brush-Proben (in BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent) für Standort A und 268 BD Onclarity HPV Cervical Brush-Proben (in BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent) für Standort B. Die Leistungseinschätzung für den Nachweis einer hochgradigen zervikalen Erkrankung durch den BD Onclarity HPV-Assay und den hc2-Assay sind in den folgenden Tabellen dargestellt: Tabellen 4 und 5 für BD SurePath-Medien, Tabellen 8 und 9 für PreservCyt-Medien und Tabellen 12 und 13 für die BD Onclarity HPV Cervical Brush-Proben. Die Ergebnisse des BD Onclarity HPV Assay wurden außerdem mit den HPV-DNA-Ergebnissen des digene Hybrid Capture 2 High-Risk HPV DNA Test und des Roche LINEAR ARRAY HPV Genotyping Test (zusammengesetzter Vergleichstest) verglichen. Ein positives Ergebnis der beiden (Hochrisiko-)Assays hc2 und RLA ist als positives Ergebnis des zusammengesetzten Vergleichstests definiert, ein negatives Ergebnis der beiden (Hochrisiko-)Assays hc2 und RLA ist als negatives Ergebnis des zusammengesetzten Vergleichstests definiert. Wenn die Ergebnisse der beiden Assays nicht übereinstimmen (oder nicht für beide Tests ein Ergebnis verfügbar war) ist das Ergebnis des zusammengesetzten Vergleichstests als ungeklärt definiert. Für jeden Medientyp wurden die positive, die negative, und die gesamte Übereinstimmung in Prozent mit dem zusammengesetzten Vergleichstest berechnet. Die finale Datenanalyse umfasst die Ergebnisse des BD Onclarity HPV Assay und des zusammengesetzten Vergleichstests (unabhängig vom histologischen Status) von 670 BD SurePath-Proben und 674 PreservCyt -Proben. (Tabellen 6 und 10) Das absolute Risiko einer Erkrankung (CIN2+ oder CIN3+) bei der Studienpopulation zu jedem Medientyp wurde mithilfe des BD Onclarity HPV Assay für jeden Genotyp oder jede Genotypgruppe berechnet. Es wurden die absoluten Risiken berechnet, wenn der Genotyp (oder die Genotypgruppe) alleine und/oder in Gegenwart anderer Genotypen vorliegt. Zu jedem Medientyp ist eine Tabelle mit dem absoluten Risiko abgebildet. Jedes Medium wurde nur an einem Standort entnommen, daher kann erwartet werden, dass aufgrund der Populationsvariation Unterschiede bei den Positivraten von HPV und Genotypen auftreten. (Tabellen 7 und 11) Klinische Leistung mit BD SurePath-Proben Tabelle 4: Leistung des BD Onclarity HPV Assay mit BD SurePath-Medien im Vergleich zu Histologieergebnissen (CIN2+) BD Onclarity HPV Assay Schätzung hc2 HPV DNA Test 95-%-Konfidenzintervall Schätzung 95-%-Konfidenzintervall Sensitivität 97,9 % (190/194) (94,8 %, 99,2 %) 98,4 % (190/193) (95,5 %, 99,5 %) Spezifität 22,7 % (63/278) (18,1 %, 27,9 %) 17,0 % (47/277) (13,0 %, 21,8 %) Tabelle 5: Leistung des BD Onclarity HPV Assay mit BD SurePath-Medien im Vergleich zu Histologieergebnissen (CIN3+) BD Onclarity HPV Assay hc2 HPV DNA Test Schätzung 95-%-Konfidenzintervall Schätzung 95-%-Konfidenzintervall Sensitivität 97,7 % (126/129) (93,4 %, 99,2 %) 98,4 % (126/128) (94,5 %, 99,6 %) Spezifität 18,7 % (64/343) (14,9 %, 23,1 %) 14,0 % (48/342) (10,8 %, 18,1 %) Tabelle 6: Leistung des BD Onclarity HPV Assay mit BD SurePath-Medien im Vergleich zum zusammengesetzten Vergleichstest Ergebnis des zusammengesetzten Vergleichstests BD Onclarity Positiv Negativ Ungeklärt* Gesamt HPV Assay Positiv 532 6 27 565 Negativ 8 50 47 105 Gesamt 540 56 74 670 PositivÜbereinstimmung in Prozent NegativÜbereinstimmung Übereinstimmung in Prozent insgesamt in Prozent (95-%(95-%(95-%Konfidenzintervall) Konfidenzintervall) Konfidenzintervall) 98,5% (97,1%, 99,2%) 89,3% (78,5%, 95,0%) 97,7% (96,1%, 98,6%) *hc2- und RLA-Ergebnisse stimmen nicht überein oder es war nicht für beide Tests ein Ergebnis verfügbar. 39 Tabelle 7: Absolutes CIN2+- und CIN3+-Risiko bei BD Onclarity HPV Assay-Genotypen auf BD SurePathMedien Infektion durch einen oder mehrere BD Onclarity Genotypen HPV AssayAbsolutes 95-%Genotyp CIN2+KonfidenRisiko zintervall Infektion durch einen Genotyp oder eine Genotyp-Gruppe Infektion durch einen oder mehrere Genotypen Infektion durch einen Genotyp oder eine Genotyp-Gruppe Absolutes CIN2+Risiko 95-%Konfidenzintervall Absolutes CIN3+Risiko 95-%Konfidenzintervall Absolutes CIN2+Risiko 95-%Konfidenzintervall HPV16 63,9 % (99/155) (56,1 %, 71,0 %) 64,9 % (48/74) (53,5 %, 74,8 %) 43,9 % (68/155) (36,3 %, 51,7 %) 47,3 % (35/74) (36,3 %, 58,5 %) HPV18 50,0 % (24/48) (36,4 %, 63,6 %) 50,0 % (7/14) (26,8 %, 73,2 %) 43,8 % (21/48) (30,7 %, 57,7 %) 42,9 % (6/14) (21,4 %, 67,4 %) HPV45 46,7 % (21/45) (32,9 %, 60,9 %) 23,5 % (4/17) (9,6 %, 47,3 %) 31,1 % (14/45) (19,5 %, 45,7 %) 17,6 % (3/17) (6,2 %, 41,0 %) HPV33/58 49,4 % (42/85) (39,0 %, 59,8 %) 47,1 % (16/34) (31,5 %, 63,3 %) 31,8 % (27/85) (22,8 %, 42,3 %) 23,5 % (8/34) (12,4 %, 40,0 %) HPV31 64,2 % (52/81) (53,3 %, 73,8 %) 72,7 % (16/22) (51,8 %, 86,8 %) 40,7 % (33/81) (30,7 %, 51,6 %) 50,0 % (11/22) (30,7 %, 69,3 %) HPV56/59/66 25,5 % (25/98) (17,9 %, 35,0 %) 0,0 % (0/29) (0,0 %, 11,7 %) 13,3 % (13/98) (7,9 %, 21,4 %) 0,0 % (0/29) (0,0 %, 11,7 %) HPV51 41,7 % (15/36) (27,1 %, 57,8 %) 25,0 % (2/8) (7,1 %, 59,1 %) 25,0 % (9/36) (13,8 %, 41,1 %) 12,5 % (1/8) (2,2 %, 47,1 %) HPV52 35,1 % (20/57) (24,0 %, 48,1 %) 33,3 % (4/12) (13,8 %, 60,9 %) 19,3 % (11/57) (11,1 %, 31,3 %) 16,7 % (2/12) (4,7 %, 44,8 %) HPV35/39/68 36,0 % (27/75) (26,1 %, 47,3 %) 33,3 % (7/21) (17,2 %, 54,6 %) 17,3 % (13/75) (10,4 %, 27,4 %) 19,0 % (4/21) (7,7 %, 40,0 %) Klinische Leistung mit PreservCyt-Proben Tabelle 8: Leistung des BD Onclarity HPV Assay mit PreservCyt-Medien im Vergleich zu Histologieergebnissen (CIN2+) BD Onclarity HPV Assay hc2 HPV DNA Test Schätzung 95-%-Konfidenzintervall Schätzung 95-%-Konfidenzintervall Sensitivität 94,7 % (160/169) (90,2 %, 97,2 %) 97,0 % (160/165) (93,1 %, 98,7 %) Spezifität 50,5 % (97/192) (43,5 %, 57,5 %) 40,8 % (75/184) (33,9 %, 48,0 %) Tabelle 9: Leistung des BD Onclarity HPV Assay mit PreservCyt-Medien im Vergleich zu Histologieergebnissen (CIN3+) BD Onclarity HPV Assay hc2 HPV DNA Test Schätzung 95-%-Konfidenzintervall Schätzung 95-%-Konfidenzintervall Sensitivität 94,4 % (85/90) (87,6 %, 97,6 %) 97,7 % (85/87) (92,0 %, 99,4 %) Spezifität 37,3 % (101/271) (31,7 %, 43,2 %) 29,8 % (78/262) (24,6 %, 35,6 %) Tabelle 10: Leistung des BD Onclarity HPV Assay mit PreservCyt-Medien im Vergleich zum zusammengesetzten Vergleichstest Ergebnis des zusammengesetzten Vergleichstests BD Onclarity Positiv Negativ Ungeklärt* Gesamt HPV Assay Positiv 246 5 18 269 Negativ 10 366 29 405 Gesamt 256 371 47 674 PositivÜbereinstimmung in Prozent NegativÜbereinstimmung in Prozent Übereinstimmung in Prozent insgesamt (95-%(95-%(95-%Konfidenzintervall) Konfidenzintervall) Konfidenzintervall) 96,1 % (93,0 %, 97,9 %) 98.7 % (96,9 %, 99,4 %) 97,6 % (96,1 %, 98,5 %) * hc2- und RLA-Ergebnisse stimmen nicht überein oder es war nicht für beide Tests ein Ergebnis verfügbar. 40 Tabelle 11: Absolutes CIN2+- und CIN3+-Risiko bei BD Onclarity HPV Assay-Genotypen auf PreservCytMedien BD Onclarity HPV AssayGenotyp HPV 16 HPV 18 HPV 45 HPV 33/58 HPV 31 HPV 56/59/66 HPV 51 HPV 52 HPV 35/39/68 Infektion durch einen oder mehrere Genotypen Infektion durch einen Genotyp oder eine Genotyp-Gruppe Absolutes CIN2+Risiko 95-%Konfidenzintervall Absolutes CIN2+Risiko 77.1 % (84/109) 50,0 % (12/24) 50,0 % (6/12) 70,0 % (28/40) 67,7 % (42/62) 34,0 % (18/53) 48,0 % (12/25) 73,9 % (17/23) 38,5 % (10/26) (68,3 %, 84,0 %) (31,4 %, 68,6 %) (25,4 %, 74,6 %) (54,6 %, 81,9 %) (55,4 %, 78,0 %) (22,7 %, 47,4 %) (30,0 %, 66,5 %) (53,5 %, 87,5 %) (22,4 %, 57,5 %) 81,4 % (57/70) 45,5 % (5/11) 25,0 % (1/4) 75,0 % (15/20) 71,0 % (22/31) 11,1 % (2/18) 27,3 % (3/11) 85,7 % (6/7) 40,0 % (2/5) Infektion durch einen oder mehrere Genotypen 95-%Absolutes KonfidenCIN3+zintervall Risiko (70,8 %, 88,8 %) (21,3 %, 72,0 %) (4,6 %, 69,9 %) (53,1 %, 88,8 %) (53,4 %, 83,9 %) (3,1 %, 32,8 %) (9,7 %, 56,6 %) (48,7 %, 97,4 %) (11,8 %, 76,9 %) 44,0 % (48/109) 29,2 % (7/24) 16,7 % (2/12) 35,0 % (14/40) 30,6 % (19/62) 9,4 % (5/53) 16,0 % (4/25) 26,1 % (6/23) 15,4 % (4/26) Infektion durch einen Genotyp oder eine Genotyp-Gruppe 95-%Konfidenzintervall Absolutes CIN3+Risiko 95-%Konfidenzintervall (35,1 %, 53,4 %) (14,9 %, 49,2 %) (4,7 %, 44,8 %) (22,1 %, 50,5 %) (20,6 %, 43,0 %) (4,1 %, 20,3 %) (6,4 %, 34,7 %) (12,5 %, 46,5 %) (6,1 %, 33,5 %) 50,0 % (35/70) 18,2 % (2/11) 0,0 (0/4) 50,0 % (10/20) 41,9 % (13/31) 0,0 % (0/18) 18,2 % (2/11) 42,9 % (3/7) 20,0 % (1/5) (38,6 %, 61,4 %) (5,1 %, 47,7 %) (0,0 %, 49,0 %) (29,9 %, 70,1 %) (26,4 %, 59,2 %) (0,0 %, 17,6 %) (5,1 %, 47,7 %) (15,8 %, 75,0 %) (3,6 %, 62,4 %) Klinische Leistung mit BD Onclarity HPV Cervical Brush-Proben Tabelle 12: Leistung des BD Onclarity HPV Assay mit der BD Onclarity HPV Cervical Brush im Vergleich zu Histologieergebnissen (CIN2+) BD Onclarity HPV Assay A B hc2 HPV DNA Test Schätzung 95-%-Konfidenzintervall Schätzung 95-%-Konfidenzintervall Sensitivität 97,2 % (104/107) (92,1 %, 99,0 %) 99,1 % (106/107) (94,9 %, 99,8 %) Spezifität 17,9 % (25/140) (12,4 %, 25,0 %) 21,4 % (30/140) (15,4 %, 28,9 %) Sensitivität 100,0 % (121/121) (96,9 %, 100,0 %) 97,5 % (116/119) (92,8 %, 99,1 %) Spezifität 37,4 % (55/147) (30,0 %, 45,5 %) 43,0 % (61/142) (35,1 %, 51,2 %) Labor Tabelle 13: Leistung des BD Onclarity HPV Assay mit der BD Onclarity HPV Cervical Brush im Vergleich zu Histologieergebnissen (CIN3+) BD Onclarity HPV Assay Schätzung 95-%-Konfidenzintervall Sensitivität 97,3 % (72/74) Spezifität 15,0 % (26/173) Sensitivität Spezifität Labor A B hc2 HPV DNA Test Schätzung 95-%-Konfidenzintervall (90,7 %, 99,3 %) 98,6 % (73/74) (92,7 %, 99,8 %) (10,5 %, 21,1 %) 17,3 % (30/173) (12,4 %, 23,7 %) 100,0 % (60/60) (94,0 %, 100,0 %) 98,3 % (57/58) (90,9 %, 99,7 %) 26,4 % (55/208) (20,9 %, 32,8 %) 31,0 % (63/203) (25,1 %, 37,7 %) Analytische Studien Analytische Sensitivität am klinischen Schwellenwert: Die Nachweisgrenze (Limit of Detection, LOD) am klinischen Schwellenwert für HPV wurde für den BD Onclarity HPV Assay mithilfe der folgenden HPV-positiven Zelllinien bestimmt: SiHa (HPV 16), HeLa (HPV 18) und MS751 (HPV 45) sowie geklonter Plasmid-DNA mit den Sequenzen der folgenden HPV-Genotypen: HPV 31, 33, 35, 39, 51, 52, 56, 58, 59, 66 und 68 in BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt-Lösung und BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent mit einer HPV-negativen Zelllinie (C33A). Die HPV-Zelllinien wurden einzeln getestet, während die HPV-Plasmide in drei Gruppen aufgeteilt getestet wurden 1) HPV 31, 33, 51, 52 und 59, 2) HPV 56, 58, 68 und 3) HPV 35 und 66. Es wurde ein Minimum von 45 Replikaten jeder der sechs Zielkonzentrationen für die HPV-Zelllinien sowie von 20 Replikaten jeder der sechs Zielkonzentrationen für die HPV-Plasmide mit mindestens drei Reagenzienchargen und mindestens drei BD Viper LT Systemen getestet. Die LOD ist die Konzentration von HPV-DNA in unverdünnten Proben, für die in mindestens 95 % der Fälle positive Ergebnisse über dem klinischen Schwellenwert erzielt werden. Der maximale LOD-Wert für jeden HPV-Genotyp und jedes Medium ist in Tabelle 14 dargestellt. 41 Tabelle 14: Analytische Sensitivität Ziel BD SurePath-Medien (95-%-Konfidenzintervall) PreservCyt-Medien (95-%-Konfidenzintervall) BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent (95-%-Konfidenzintervall) SiHa (HPV 16) Zellen/mL 1584 (1276 – 1962) 1835 (1426 – 2358) 137 (131 – 144) HeLa (HPV 18) Zellen/mL 915 (739 – 1131) 1786 (1175 – 2715) 51 (46 – 56) MS751 (HPV 45) Zellen/mL 3793 (2944 – 4888) 5425 (4167 – 7066) 305 (284 – 343) HPV 31 Kopien/mL 3652 (3159 – 3868) 4118 (3898 – 4228) 692 (650 – 817) HPV 33 Kopien/mL 7326 (6578 – 8932) 8272 (7946 – 8743) 1376 (1272 – 1451) HPV 35 Kopien/mL 6820 (6477 – 7282) 7282 (6895 – 7674) 1552 (1317 – 1780) HPV 39 Kopien/mL 7894 (7115 – 8193) 8272 (7810 – 9398) 1531 (1419 – 1685) HPV 51 Kopien/mL 6697 (5786 – 7097) 5909 (5553 – 6824) 1229 (1155 – 1353) HPV 52 Kopien/mL 3582 (3414 – 4184) 4184 (3740 – 4761) 833 (744 – 934) HPV 56 Kopien/mL 4976 (4140 – 5698) 4774 (4479 – 5997) 836 (737 – 911) HPV 58 Kopien/mL 10094 (9403 – 11180) 11488 (8989 – 12360) 2990 (2656 – 7819) HPV 59 Kopien/mL 4400 (4145 – 5069) 4374 (4105 – 5482) 772 (722 – 899) HPV 66 Kopien/mL 3793 (3621 – 4030) 4462 (4008 – 4844) 701 (646 – 767) HPV 68 Kopien/mL 10415 (9799 – 11642) 10481 (9816 – 12082) 2079 (1995 – 2125) Kreuzreaktion: Es wurde ein Testprofil aus Bakterien, Hefe und kultivierten Viren in Kombination mit geklonter Plasmid-DNA mit Hochrisiko- und Niedrigrisiko-HPV-Zielsequenzen verwendet, um die analytische Spezifität des BD Onclarity HPV Assay auf dem BD Viper LT System zu bewerten. Jede potenzielle Kreuzreaktion wurde einzeln in BD SurePath Preservative Fluid und PreservCyt-Lösung mit einer HPV-negativen Zelllinie (C33A) getestet. Die Mikroorganismen sind in den Tabellen 15 und 16 beschrieben. Der BD Onclarity HPV Assay zeigte bei keinem der getesteten Mikroorgansimen eine Kreuzreaktion. 42 Tabelle 15: Bezüglich analytischer Spezifität getestete Mikroorganismen Bakterien* Viren** Actinomyces israelii Adenovirus Typ 5 Atopobium vaginae EBV-1, B95-8-Stamm Bacteroides fragilis HCMV. AD169-Stamm Bacteroides ureolyticus HIV-1 Bifidobacterium adolescentis HSV1 Bifidobacterium brevi HSV2 Bifidobacterium longum ssp. longum Hochrisiko-HPV*** Chlamydia trachomatis HPV 16 Clostridium perfringens HPV 18 Corynebacterium genitalium HPV 31 Enterobacter cloacae ssp. cloacae HPV 33 Enterococcus faecalis HPV 35 Enterococcus faecium HPV 39 Escherichia coli HPV 45 Fusobacterium nucleatum ssp. nucleatum HPV 51 Gardnerella vaginalis HPV 52 Klebsiella pneumonia ssp. ozaenae HPV 56 Lactobacillus acidophilus HPV 58 Mycobacterium smegmatis HPV 59 Mycoplasma genitalium HPV 66 Neisseria gonorrhoeae HPV 68 Peptostreptococcus anaerobius Prevotella bivia Prevotella disiens Proteus mirabilis Proteus vulgaris Providencia stuartii Pseudomonas aeruginosa Staphylococcus aureus Staphylococcus epidermidis Streptococcus agalactiae Streptococcus pyogenes Ureaplasma urealyticum Hefe/Protozoen**** Candida albicans Trichomonas vaginalis *Bakterien wurden bei ca. 1,0 x 107 KBE/mL getestet, mit folgenden Ausnahmen: Chlamydia trachomatis (1,0 x 107 EB/mL), Mycobacterium smegmati (2,5 x 106 KBE/mL)und Ureaplasma urealyticum (8,0 x 106 KBE/mL). **Viren wurden bei 1,0 x 106 VP/mL getestet. ***Hochrisiko-HPV-Plasmid-DNA wurde bei 1,0 x 106 Kopien/mL getestet. **** Hefe (Candida albicans) wurde bei ca. 1,0 x 107 KBE/mL getestet; Protozoen (Trichomonas vaginalis) wurden bei 1,4 x 106 KBE/mL getestet. Tabelle 16: Bezüglich analytischer Spezifität getestete Niedrigrisiko-HPV-Plasmide HPV 6 HPV 69 HPV 11 HPV 70 HPV 26 HPV 73 HPV 30 HPV 82 HPV 34 HPV 97 HPV 53 HPV c85 HPV 67 *Niedrigrisiko -HPV-Plasmid-DNA wurde bei 1,0 x 106 Kopien/mL getestet. 43 Störsubstanzen: Das Potential für Störungen des BD Onclarity HPV Assay auf dem BD Viper LT System wurde mithilfe exogener und endogener Substanzen bestimmt, die in klinischen zervikalen Proben vorkommen können. Dazu wurden erstellte HPVnegative Proben und HPV-positive Proben (beimpft mit SiHa-, HeLa- und MS751-Zellen bei 3 x LOD) in Gegenwart oder Abwesenheit jeder der potenziell störenden Substanzen getestet. Die in dieser Studie verwendeten Substanzen sind in Tabelle 17 beschrieben. Die Konzentrationen geben den höchsten Wert an, bei dem die Substanzen keine Störung des BD Onclarity HPV Assay verursachten. Tabelle 17: Potenzielle Störsubstanzen Potenzielle Störsubstanz BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent Getestete Konzentration BD SurePathMedien PreservCyt-Medien Getestete Konzentration Getestete Konzentration KY-Vaginalgleitgel 10 % (w/v) 6 % (w/v) 10 % (w/v) VCF kontrazeptiver Vaginalfilm 3 % (w/v) 10 % (w/v) 10 % (w/v) VCF kontrazeptiver Vaginalschaum 10 % (w/v) 10 % (w/v) 10 % (w/v) Conceptrol kontrazeptives Gel 1 % (w/v) 10 % (w/v) 10 % (w/v) Monistat 3* 2 % (w/v) 2 % (w/v) 1,8 % (w/v) Clotrimazol 7 10 % (w/v) 10 % (w/v) 10 % (w/v) Vagistat-1 Tioconazol 2 % (w/v) 2 % (w/v) 2 % (w/v) Clindamycin-Vaginalcreme 9 % (w/v) 10 % (w/v) 10 % (w/v) Summer’s Eve-Intimdusche 10 % (v/v) 10 % (v/v) 10 % (v/v) Zovirax-(Acyclovir-)Creme 10 % (w/v) 8 % (w/v) 10 % (w/v) Vandazole Gel (Metronidazol-Vaginalgel, 0,75 %) 10 % (w/v) 10 % (w/v) 10 % (w/v) Summer’s Eve-Deodorant 2% (w/v) 3% (w/v) 2 % (w/v) Rinder-Mucin 10% (v/v) 10% (v/v) 10 % (v/v) Progesteron 20 ng/mL 20 ng/mL 20 ng/mL Estradiol 1,2 ng/mL 1,2 ng/mL 1,2 ng/mL Vollblut 3 % (v/v) 5 % (v/v) 5 % (v/v) Leukozyten 1x106 1x106 Zellen/mL Zellen/mL 1x106 Zellen/mL Sperma 10 % (v/v) 10 % (v/v) 10 % (v/v) Essigsäure-Spülung** 5 % (v/v) Blut + Essigsäure-Spülung 5 % Blut (v/v), 2,5 % Essigsäure-Spülung (v/v) *Höhere Konzentrationen als die angegebenen führten zu Flüssigkeitsstand-Fehlern während der Extraktion auf dem BD Viper LT System. **Essigsäure-Spülung besteht aus 1 Teil Eisessig: 9 Teilen CytoLyt-Lösung. Störung durch konkurrierende Ziele: Für den BD Onclarity HPV Assay wurde eine Bewertung des Potentials einer Inhibierung des HPV-Nachweises aufgrund des Vorliegens eines Ziels in hoher Konzentration und eines anderen in niedriger Konzentration bei einer Mischinfektionen durchgeführt. SiHa-, HeLa- und MS751-Zellen wurden einzeln oder gemeinsam bei 3 x LOD in Gegenwart oder Abwesenheit eines oder mehrerer konkurrierender HPV-Ziele bei 1,0 x 106 Kopien/mL in BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt-Lösung und BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent mit einer HPV-negativen Zelllinie (C33A) getestet (Tabelle 18). 44 Tabelle 18: Störung durch konkurrierende Ziele HPV-Assay-Röhrchentyp Individuelle zelluläre HPV-Ziele bei 3 x LOD HPV-Plasmide bei 1 x 106 Kopien/mL Nachweis der zellulären HPV-Ziele in Gegenwart oder Abwesenheit konkurrierender Genotypen (HPVPlasmide) SiHa (HPV 16) HPV 18 + HPV 45 Ja G1-Genotypen mit koamplifizierten G1-Zielen HeLa (HPV 18) HPV 16 + HPV 45 Ja HPV 45 (MS751) HPV 16 + HPV 18 Ja G1-Genotypen mit koamplifizierten G2-Zielen SiHa + HeLa + MS751 HPV 31 + HPV 33 + HPV 56 + HPV 58 + HPV 59 + HPV 66 Ja G1-Genotypen mit koamplifizierten G3-Zielen SiHa + HeLa + MS751 HPV 35 + HPV 39 + HPV 51+ HPV 52 + HPV 68 Ja Reproduzierbarkeit: Die Reproduzierbarkeit des BD Onclarity HPV Assay wurde im BD Viper LT-Gerät mithilfe eines Testpanels mit 4 Proben bewertet, das sich aus negativen, stark negativen, schwach positiven und mäßig positiven Proben zusammensetzte. Die positiven Proben des Testpanels setzten sich aus SiHa-, HeLa- und MS751-Zellen zusammen, mit denen Pools aus HPV-negativen klinischen BD SurePath-Proben und BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent mit einer HPV-negativen Zelllinie (C33A) beimpft wurden. Das Testpanel wurde über 12 Tage gleichmäßig auf 3 Reagenzienchargen und 3 Geräte verteilt getestet. Die Daten sind in Tabelle 19 zusammengefasst. 45 Tabelle 19: Zusammenfassung der Reproduzierbarkeitsdaten für den BD Onclarity HPV Assay auf dem BD Viper LT System Zwischen Läufen Medien Zelllinie (Genotyp) SurePath SiHa (HPV 16) HeLa (HPV 18) MS-751 (HPV 45) PanelStufe Konzentration Zellen/mL Neg. 0 Stark neg. Schwach pos. Mäßig pos. 1582 Neg. 0 Stark neg. Schwach pos. Mäßig pos. Cervical Brush Diluent 914 2742 0 3793 Stark neg. Schwach pos. 395 11378 0 100 % (216/216) 97,69 % (211/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 98,61 % (213/216) 99,54 % (215/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 99,54 % (215/216) 100 % (214/214) Gesamt 95-%Konfidenzintervall Mittl. CT SD %CV SD %CV SD %CV (98,25 % – 100 %) NZ NZ NZ NZ NZ NZ NZ (94,7 % – 99,01 %) 35,28 0,16 0,46 0,54 1,52 0,57 1,62 (100 % – 98,25 %) 32,31 0,16 0,50 0,22 0,69 0,30 0,92 (100 % – 98,25 %) 31,07 0,22 0,69 0,22 0,71 0,35 1,11 (98,25 % – 100 %) NZ NZ NZ NZ NZ NZ NZ (96 % – 99,53 %) 35,89 0,24 0,68 0,75 2,09 0,85 2,37 (97,42 % – 99,92 %) 32,70 0,16 0,50 0,30 0,92 0,37 1,14 (100 % – 98,25 %) 30,68 0,13 0,43 0,22 0,72 0,30 0,98 (98,25 % – 100 %) NZ NZ NZ NZ NZ NZ NZ (98,25 % – 100 %) 35,77 0,00 0,00 0,52 1,45 0,55 1,53 (100 % – 98,25 %) 32,71 0,20 0,60 0,26 0,80 0,36 1,10 (97,42 % – 99,92 %) 31,33 0,18 0,57 0,35 1,10 0,41 1,31 (98,24 % – 100 %) NZ NZ NZ NZ NZ NZ NZ 32 100 % (218/218) (98,27 % – 100 %) 36,29 0,09 0,25 0,59 1,63 0,62 1,71 205 94,91 % (205/216) (91,11 % – 97,13 %) 33,63 0,26 0,78 0,33 0,97 0,43 1,27 615 100 % (216/216) (98,25 % – 100 %) 31,80 0,16 0,51 0,18 0,56 0,25 0,79 0 100 % (214/214) (98,24 % – 100 %) NZ NZ NZ NZ NZ NZ NZ Stark neg. 13 99,07 % (214/216) (96,69 % – 99,75 %) 35,69 0,10 0,29 0,78 2,18 0,80 2,23 Schwach pos.s 76 99,08 % (216/218) (96,72 % – 99,75 %) 33,34 0,15 0,44 0,25 0,76 0,30 0,91 228 99,54 % (215/216) (97,42 % – 99,92 %) 32,07 0,24 0,73 0,25 0,78 0,37 1,16 Neg. Mäßig pos. 0 100 % (214/214) (98,24 % – 100 %) NZ NZ NZ NZ NZ NZ NZ Stark neg. 59 100 % (216/216) (98,25 % – 100 %) 36,54 0,22 0,61 0,62 1,68 0,66 1,81 Schwach pos. 457 99,54 % (215/216) (97,42 % – 99,92 %) 33,22 0,16 0,48 0,25 0,75 0,32 0,95 1371 100 % (218/218) (98,27 % – 100 %) 31,74 0,14 0,43 0,21 0,67 0,27 0,84 Neg. MS-751 (HPV 45) 102 Neg. Mäßig pos. HeLa (HPV 18) 4746 Stark neg. Schwach pos. Mäßig pos. Neg. SiHa (HPV 16) 342 % korrekt Innerh. Lauf Mäßig pos. Kreuzkontamination: Es wurde eine Studie zur Evaluierung des Risikos eines falsch positiven Ergebnisses im selben Testlauf (Kreuzkontamination innerhalb von Läufen) oder in einem Folgedurchlauf (Verschleppungskontamination zwischen Läufen) des BD Viper LT Systems durchgeführt. Über einen Zeitraum von fünf Tagen wurde auf drei Geräten jeweils ein Lauf pro Tag durchgeführt, sodass insgesamt 675 Testreplikate einbezogen wurden. Jeder Lauf bestand aus Proben in BD SurePath Preservative Fluid oder PreservCyt-Lösung, die eine HPV-negative Zelllinie (C33A) mit und ohne SiHa-Zellen, die bei 1,0 x 105 Zellen/ mL angeimpft wurden, enthielten. Diese Proben wurden abwechselnd in einem Schachbrettmuster angeordnet. Die Kontaminationsrate betrug bei BD SurePath-Konservierungsflüssigkeit und PreservCyt-Lösung insgesamt 0,00 %. Stabilität unverdünnter Proben (in der Flasche): Es wurden analytische Studien durchgeführt, mit denen die Lagerbedingungen bezüglich der Stabilität unverdünnter zervikaler Proben überprüft werden sollten. Dazu wurden Proben in BD SurePath Preservative Fluid-, PreservCyt-Lösungund BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent, die eine HPV-negative Zelllinie (C33A) enthielten, mit SiHa Zellen bei 3 x LOD angeimpft und über mehrere Zeitpunkte hinweg bei 2 – 8 °C, 30 °C und -20 °C gelagert. Zu jedem Zeitpunkt wurden die Proben aus dem Lagerort entnommen und mit dem BD Onclarity HPV Assay auf dem BD Viper LT System getestet. Es wurden für jede Bedingung (Probentyp/Temperatur/Lagerdauer) 24 Assay-Replikate generiert. Bei 2 – 30 °C und bei -20 °C wurde eine Stabilität über 30 Tage erzielt. Stabilität verdünnter Proben: Es wurden analytische Studien durchgeführt, mit denen die Lagerbedingungen bezüglich der Stabilität verdünnter zervikaler Proben überprüft werden sollten. Dazu wurden Proben in BD SurePath Preservative Fluid- und PreservCyt46 Lösung, die eine HPV-negative Zelllinie (C33A) enthielten, mit SiHa Zellen bei 3 x LOD angeimpft, mit BD HPV LBC Diluent verdünnt und anschließend über mehrere Zeitpunkte hinweg bei 2 – 8 °C, 30 °C und -20 °C gelagert. Zu jedem Zeitpunkt wurden die Proben aus dem Lagerort entnommen und mit dem BD Onclarity HPV Assay auf dem BD Viper LT System getestet. Es wurden für jede Bedingung (Probentyp/Temperatur/Lagerdauer) 24 Assay-Replikate generiert. Bei 2 – 30 °C wurde eine Stabilität über 15 Tage erzielt und bei -20 °C eine Stabilität über 30 Tage. Stabilität von Proben nach dem Vorwärmen: Es wurden analytische Studien durchgeführt, mit denen die Lagerbedingungen bezüglich der Stabilität zervikaler Proben nach dem Vorwärmen überprüft werden sollten. Dazu wurden Proben in BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt-Lösung und BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent, die eine HPV-negative Zelllinie (C33A) enthielten, mit SiHa Zellen bei 3 x LOD angeimpft, mit BD Onclarity HPV LBC Diluent verdünnt und anschließend mit dem BD Viper LT Pre-warm Heater vorgewärmt. Die so verarbeiteten Proben wurden über mehrere Zeitpunkte hinweg bei 2 – 8 °C, 30 °C und -20 °C gelagert. Zu jedem Zeitpunkt wurden die Proben aus dem Lagerort entnommen und mit dem BD Onclarity HPV Assay auf dem BD Viper LT System getestet. Es wurden für jede Bedingung (Probentyp/ Temperatur/Lagerdauer) 24 Assay-Replikate generiert. Bei 2 – 30 °C wurde eine Stabilität über 7 Tage erzielt und bei -20 °C eine Stabilität über 30 Tage. INTERPRETATION DER TABELLEN Symbole und Abkürzungen Symbole (+) (-) # % Positiv Negativ Anzahl Prozentsatz Abkürzungen ASCUS Atypische Plattenepithelzellen unbestimmter Signifikanz cfu Koloniebildende Einheiten CI Konfidenzintervall CIN Zervikale intraepitheliale Neoplasie CV Variationskoeffizient HPV Human Papillomavirus HRHochrisiko LBC Flüssigkeitsbasierte Zytologie n Anzahl NZ Nicht zutreffend NEGNegativ NPA Negativ-Übereinstimmung in Prozent PBS Phosphatgepufferte Kochsalzlösung PCRPolymerase-Kettenreaktion POSPositiv PPA Positiv-Übereinstimmung in Prozent QCQualitätskontrolle SD Standardabweichung LIEFERBARE PRODUKTE Die folgenden BD Onclarity- und BD Viper-Produkte zur Verwendung mit dem BD Viper LT System sind ebenfalls erhältlich: Best.- Nr. 442946 441993 442841 441992 441354 442840 441991 442957 443430 440476 441996 441995 442950 442967 442839 Beschreibung BD Onclarity HPV Assay Reagent Pack, 192 Tests Control Set for the BD Onclarity Onclarity HPV Assay, 24 positive und 24 negative Röhrchen BD Viper PCR Extraction Reagent Trough with Piercing Tool, 12 Extraktionsreagenzbehälter BD FOX PCR Extraction Tubes, 384 Röhrchen BD Viper System Neutralization Pouch, 12 Beutel BD Onclarity HPV Liquid Based Cytology Specimen (LBC) Diluent Tubes, 400 BD Onclarity HPV Assay Cervical Brush Collection Kit, 100 BD Viper LT System PCR Tube/Tray Kit Key Card for the BD Viper LT System BD ProbeTec Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae (CT/GC) Amplified DNA Assay Endocervical Specimen Collection and DRY TRANSPORT Kit BD Viper LT Pipette Tips, 3840 BD Viper LT Solid Waste Liners, 80 BD Pre-warm Heater BD Viper LT System PCR Accessory kit BD Viper LT System LITERATUR: S. “References” im englischen Text. 47 Onclarity HPV Assay Italiano USO PREVISTO Il BD Onclarity HPV Assay (test HPV BD Onclarity) è un test per DNA amplificato per il rilevamento qualitativo di tipi di HPV (Human Papillomavirus, papillomavirus umano) ad alto rischio. Il test rileva tutti i tipi di HPV a rischio elevato (16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 e 68) e offre la possibilità di genotipizzazione di sei tipi ad alto rischio (HPV 16, 18, 31, 45, 51 e 52). I campioni cervicali testati con il BD Onclarity HPV Assay includono BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit (kit di raccolta spazzole cervicali per BD Onclarity HPV), BD SurePath Preservative Fluid (liquido conservante BD SurePath) e PreservCyt Solution (soluzione PreservCyt), utilizzando un’aliquota che viene rimossa prima o dopo il trattamento per il BD SurePath Pap test (Pap test BD SurePath) o ThinPrep Pap test (Pap test ThinPrep). Il BD Onclarity HPV Assay viene eseguito con il sistema BD Viper LT. SOMMARIO E SPIEGAZIONE Il papillomavirus umano (HPV) è il virus a trasmissione sessuale più comune al mondo, con il 50% degli individui sessualmente attivi affetti da HPV genitale nell’arco della loro vita. Le persone spesso non sono consapevoli di aver contratto l’infezione e non prendono precauzioni al fine di prevenire la diffusione del virus ad altri soggetti. Esistono oltre 40 tipi di HPV che possono interessare il tratto genitale.1 In molti casi, le infezioni da HPV sono transitorie e il corpo elimina il virus da solo. In alcune situazioni, tuttavia, il virus è persistente e causa un’alterazione delle cellule normali che diventano anomale fino a sviluppare il tumore. Questi tipi oncogeni di HPV sono classificati come ad alto rischio e comprendono HPV 16 e 18. Altre tipologie sono considerate a basso rischio poiché non sembrano causare il tumore. Secondo l’Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS), l’HPV è la seconda causa principale di mortalità correlata a tumore nelle donne in tutto il mondo, con 250.000 decessi all’anno. Soltanto in Europa, la patologia colpisce 15.000 soggetti ogni anno.2 Si stima che quasi il 70% dei carcinomi cervicali sia causato dai tipi di HPV 16 e 18.3 Oggi, i Pap test rivelano al medico la presenza di variazioni delle cellule cervicali. Se tali cellule risultano anomale, è possibile eseguire un test HPV per determinare se queste alterazioni cervicali siano dovute al ceppo di HPV che può portare al carcinoma cervicale. Non tutti i test molecolari sono in grado di distinguere i diversi tipi di HPV. Il BD Onclarity HPV Assay, quando eseguito con il sistema BD Viper LT, è un test per DNA amplificato per il rilevamento qualitativo di tipi di papillomavirus umano (HPV) ad alto rischio. Il test rileva i tipi di HPV 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 e 68 e consente di identificare contemporaneamente i tipi ad alto rischio 16, 18, 31, 45, 51, 52 e altri genotipi ad alto rischio refertati per gruppo di genotipi (P1: 33/58; P2: 56/59/66; P3: 35/39/68). I campioni cervicali che possono essere testati con il BD Onclarity HPV Assay includono BD SurePath Preservative Fluid (utilizzando un’aliquota che viene rimossa prima o dopo il trattamento per il BD SurePath Pap test) e PreservCyt Solution (utilizzando un’aliquota che viene rimossa prima o dopo il trattamento per il PreservCyt Pap test (Pap test PreservCyt)) e il BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit. PRINCIPI DELLA PROCEDURA Il BD Onclarity HPV Assay è concepito per l’uso con BD SurePath Preservative Fluid (utilizzando un’aliquota che viene rimossa prima o dopo il trattamento con il BD SurePath Pap test), PreservCyt Solution (utilizzando un’aliquota che viene rimossa prima o dopo il trattamento con il PreservCyt Pap test) e il BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit, i reagenti applicabili, il sistema BD Viper LT e la tecnologia di estrazione BD FOX. I campioni vengono sottoposti a una fase di pre-riscaldamento nel BD Pre-warm Heater (termoblocco di pre-riscaldamento BD) per omogeneizzare la matrice, eseguire la lisi delle cellule e il rilascio del DNA il quale può essere estratto e amplificato. Dopo il raffreddamento, i campioni vengono caricati sul sistema BD Viper LT che esegue tutte le fasi previste per l’estrazione e l’amplificazione del DNA bersaglio, senza ulteriore intervento dell’utente. Il campione viene trasferito in una provetta di estrazione che contiene particelle di ossido ferrico in una pellicola dissolvibile. Successivamente, viene aggiunto acido per abbassare il pH e indurre una carica positiva sull’ossido ferrico, che a sua volta lega il DNA a carica negativa. Le particelle e il DNA legato vengono quindi attratti verso i lati della provetta di estrazione da magneti e il campione trattato viene aspirato nel materiale di scarto. Le particelle vengono lavate e viene aggiunto un tampone di eluizione a pH elevato per eluire il DNA purificato. Infine, viene utilizzato un tampone di neutralizzazione per regolare il pH dell’eluito alla condizione ottimale per l’amplificazione del DNA. Il BD Onclarity HPV Assay si basa sull’amplificazione e la determinazione simultanee del DNA bersaglio mediante primer di amplificazione e sonde di rilevamento marcate con un agente fluorescente utilizzando PCR (Polymerase Chain Reaction, reazione a catena della polimerasi) in tempo reale. I reagenti vengono essiccati in tre provette (G1, G2 e G3) e sono in grado di rilevare i genotipi HPV 14 e un controllo interno derivato dal campione costituito da un frammento di DNA del gene della beta-globina umana. Ogni singola provetta contiene i primer di amplificazione, sonde di rilevamento marcate con un agente fluorescente, DNA polimerasi, nucleotidi e altri reagenti necessari per l’amplificazione per i rispettivi test. Il sistema BD Viper LT pipetta una parte della soluzione di DNA purificata da ogni provetta di estrazione in tre provette BD Onclarity HPV PCR (G1, G2 e G3) che vengono successivamente sigillate per evitare la contaminazione. La presenza o l’assenza di DNA HPV è determinata dal ciclo PCR in cui il segnale supera una soglia prestabilita. Inoltre, il test estrae, amplifica e rileva un frammento del gene della beta-globina umana come un controllo interno per valutare il trattamento, l’estrazione e l’amplificazione del campione. REAGENTI E MATERIALI FORNITI: Ciascun BD Onclarity HPV Assay Reagent Pack (confezione di reagenti per BD Onclarity HPV Assay) contiene: Provette BD Onclarity HPV G1 PCR, 2 x 96: ogni provetta PCR G1 contiene circa 32,5 pmol di oligonucleotidi, sonde di rilevamento marcate con un agente fluorescente da 20 pmol, 80 nmol di dNTP e 0,52 unità di DNA polimerasi con stabilizzanti e tamponi. 48 Provette BD Onclarity HPV G2 PCR, 2 x 96: ogni provetta PCR G2 contiene circa 42,5 pmol di oligonucleotidi, sonde di rilevamento marcate con un agente fluorescente da 30 pmol, 80 nmol di dNTP e 0,52 unità di DNA polimerasi con stabilizzanti e tamponi. Provette BD Onclarity HPV G3 PCR, 2 x 96: ogni provetta PCR G3 contiene circa 42,5 pmol di oligonucleotidi, sonde di rilevamento marcate con un agente fluorescente da 25 pmol, 80 nmol di dNTP e 0,52 unità di DNA polimerasi con stabilizzanti e tamponi. N.B. Ciascuna busta contiene un sacchetto di essiccante. Control Set for the BD Onclarity HPV Assay (set di controlli per BD Onclarity HPV Assay): 24 provette per il controllo positivo BD Onclarity HPV contenenti circa 14.430 copie di plasmide HPV 16 linearizzato, 8.325 copie di plasmide HPV 18 linearizzato, 8.418 copie di plasmide HPV 56 linearizzato e 3.885 copie di plasmide contenente una sequenza di geni della beta-globina umana nell’acido nucleico carrier e 24 provette per il controllo negativo BD Onclarity HPV contenenti solo acido nucleico carrier. Le concentrazioni dell’acido nucleico carrier e dei plasmidi sono determinate mediante spettrofotometro. BD Onclarity HPV Liquid Based Cytology Specimen (LBC) Diluent Tube (provette di diluente per campioni citologici in fase liquida (LBC) BD Onclarity HPV): 400 provette, ciascuna contenente circa 1,7 mL di tampone con sale, detergente e conservante. BD FOX PCR Extraction Tube (provette di estrazione PCR BD FOX): 48 strisce di 8 provette, ciascuna contenente circa 10 mg di ossido di ferro in una pellicola dissolvibile BD Viper PCR Extraction Reagent Trough with Piercing Tool (contenitore di reagente di estrazione PCR BD Viper con strumento di perforazione): ciascun contenitore di reagente di estrazione a 5 cavità contiene circa 16,5 mL di acido legante, 72,5 mL di tampone di lavaggio, 25,4 mL di tampone di eluizione, 19,4 mL di tampone di neutralizzazione con conservante e 15,5 mL di soluzione di neutralizzazione rifiuti. STRUMENTO, ATTREZZATURA E MATERIALI D’USO E CONSUMO Materiali forniti – BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit, strumento BD Viper LT, BD Viper LT Instrument Plate, BD Viper LT Pipette Tip, BD Viper LT Solid Waste Liner, BD Viper LT System PCR Tube/Tray Kit, BD Viper LT System PCR Accessory Kit, BD Viper Pre-warm Heater, BD Viper LT Specimen Rack, BD Viper Neutralization Pouch, provette di campioni e tappi da utilizzare con il sistema BD Viper (modalità di estrazione), BD ProbeTec Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae (CT/GC) Amplified DNA Assay Endocervical Specimen Collection and DRY TRANSPORT Kit. Materiali necessari ma non forniti – Guanti in nitrile, pipette di spostamento, puntali anti-aerosol in polipropilene in grado di dispensare 0,5 ± 0,05 mL, vortex, ipoclorito di sodio allo 0,5% (v/v), ipoclorito di sodio all’1% (v/v), perossido d’idrogeno al 3% (p/v), alcool isopropilico, acqua priva di nucleasi per biologia molecolare. Requisiti di preparazione e conservazione – Il BD Onclarity HPV LBC Diluent (diluente LBC per BD Onclarity HPV) e il BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent (diluente per spazzole cervicali BD Onclarity HPV) devono essere conservati a 2 – 25 °C. Tutti gli altri reagenti possono essere conservati a 2 – 33 °C. Le confezioni di reagenti ancora sigillate sono stabili fino alla loro data di scadenza. Una volta aperta la busta, le provette PCR sono stabili per 4 settimane, se opportunamente sigillate, o fino alla data di scadenza, a seconda di quale delle due condizioni si verifica prima. Non congelare. AVVERTENZE E PRECAUZIONI 1. Per uso diagnostico in vitro. 2. I campioni clinici possono contenere microrganismi patogeni, inclusi i virus dell’epatite e dell’immunodeficienza umana. Manipolare tutti i materiali e gli articoli contaminati con sangue e altri fluidi biologici in conformità alle norme dell’istituto e alle “Precauzioni standard”4-7. Per ulteriori avvertenze, precauzioni e note specifiche relative al sistema BD Viper LT, consultare il relativo Manuale d’uso del sistema BD Viper LT. Campione: 3. Per i campioni di citologia in fase liquida, utilizzare solo le provette di diluente BD Onclarity HPV LBC. 4. Per i campioni ottenuti con spazzola cervicale, utilizzare solo il BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit. 5. Per ottenere prestazioni ottimali, il BD Onclarity HPV Assay richiede una tecnica corretta di raccolta, manipolazione e trasporto dei campioni. 6. Per ridurre sanguinamenti inutili, non ruotare eccessivamente la spazzola cervicale durante la raccolta del campione. 7. Ciascun campione inviato al laboratorio deve essere correttamente etichettato. 8. Durante la rottura dell’asta della spazzola cervicale, evitare accuratamente di spargere, versare o formare aerosol. Evitare la contaminazione della testina della spazzola cervicale. 9. Evitare accuratamente la contaminazione crociata durante le fasi di trattamento del campione. Assicurarsi che i contenitori dei campioni non entrino a contatto tra loro e gettare i materiali usati senza passare sopra i contenitori aperti. Se i guanti vengono a contatto con i campioni, cambiarli per evitare la contaminazione crociata. 10. Un riempimento insufficiente o eccessivo con il campione LBC della provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC può compromettere i risultati del test. Un riempimento eccessivo delle provette potrebbe determinare anche una fuoriuscita di liquidi nel caricatore BD Viper LT causando la contaminazione. 11. I campioni cervicali devono essere raccolti e testati prima della data di scadenza della provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC o della provetta di BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent. 12. Usare solo puntali per pipette anti-aerosol in polipropilene per trasferire i campioni nelle provette di diluente BD Onclarity HPV LBC. Test/Reagente: 13. I controlli positivi e negativi per BD Onclarity HPV devono essere pre-riscaldati entro 24 ore dall’idratazione. 14. Sul sistema BD Viper LT utilizzare solo provette di campioni e di controlli con tappi perforabili. Non rimuovere i tappi perforabili prima dell’utilizzo dello strumento. Accertarsi di sostituire i tappi forati con nuovi tappi perforabili prima dell’utilizzo dello strumento. 49 15. Non scambiare o mescolare i reagenti provenienti da kit con numeri di lotto diversi. 16. Non analizzare la provetta di BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent, se è pervenuta al laboratorio senza la spazzola, in quanto il test potrebbe dar luogo ad un risultato falso negativo. 17. Con il sistema BD Viper LT utilizzare solo puntali per pipette BD Viper LT forniti da BD. 18. BD Viper PCR Extraction Reagent Trough with Piercing Tool: PERICOLO H314 Provoca gravi ustioni e gravi lesioni oculari. H302 Nocivo se ingerito. P260 Non respirare la polvere/i fumi/i gas/la nebbia/i vapori/gli aerosol. P280 Indossare guanti/indumenti protettivi/Proteggere gli occhi/il viso. P303/361/353 IN CASO DI CONTATTO CON LA PELLE (o con i capelli): togliersi di dosso immediatamente tutti gli indumenti contaminati. Sciacquare la pelle/fare una doccia. P304/340 IN CASO DI INALAZIONE: trasportare l’infortunato all’aria aperta e mantenerlo a riposo in una posizione che favorisca la respirazione. P405 Conservare sotto chiave. P501 Smaltire il prodotto/recipiente in conformità alle normative locali/regionali/nazionali/internazionali. 19. Sulle provette PCR con il sistema BD Viper LT utilizzare solo i BD Viper LT Clear Plate Sealer (sigillanti trasparenti per piastre BD Viper LT). 20. Una volta aperte, le buste di reagenti che contengono provette PCR non usate DEVONO essere richiuse con attenzione. Prima di richiudere le buste dei reagenti, assicurarsi che contengano l’essiccante. 21. Prima di rimuovere la piastra dal sistema BD Viper LT, le provette PCR DEVONO essere opportunamente sigillate con i BD Viper LT Clear Plate Sealer. La chiusura a tenuta garantisce una reazione chiusa per l’amplificazione e la determinazione e si rende necessaria per evitare la contaminazione dello strumento e dell’area di lavoro da parte dei prodotti dell’amplificazione. Non rimuovere mai il materiale sigillante dalle provette PCR. 22. Per evitare di contaminare l’ambiente di lavoro con i prodotti dell’amplificazione, usare le buste per rifiuti incluse nel BD Viper LT PCR Accessory Kit (kit di accessori PCR per sistema BD Viper LT) per smaltire le provette PCR già sottoposte a test. Prima dello smaltimento, assicurarsi che le buste siano ben chiuse. 23. Sebbene non siano richiesti ambienti di lavoro dedicati in quanto la configurazione del BD Viper LT riduce la possibilità di contaminazioni da amplicon nell’area di analisi, è comunque necessario prendere ulteriori precauzioni per evitare qualsiasi contaminazione, in particolare quella dei campioni durante la manipolazione. 24. CAMBIARE I GUANTI se sono venuti a contatto con i campioni o se appaiono bagnati, per evitare la contaminazione di altri campioni. Cambiare i guanti prima di lasciare l’area di lavoro e al momento di entrarvi. 25. In caso di contaminazione, fare riferimento al Manuale d’uso del sistema BD Viper LT per istruzioni relative alla pulizia. 26. Qualora si verifichino situazioni insolite, come un versamento nello strumento BD Viper LT o una contaminazione da DNA impossibile da eliminare con i detergenti, contattare il rappresentante BD di zona. RACCOLTA E TRASPORTO DEI CAMPIONI I campioni cervicali che possono essere testati con il BD Onclarity HPV Assay includono BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit, BD SurePath Preservative Fluid (utilizzando un’aliquota che viene rimossa prima o dopo il trattamento con il BD SurePath Pap test) e PreservCyt Solution (utilizzando un’aliquota che viene rimossa prima o dopo il trattamento con il ThinPrep Pap test). Per le spedizioni nazionali (USA) ed internazionali, i campioni devono essere etichettati in conformità alle norme regionali, nazionali e internazionali relative al trasporto di campioni clinici e agenti eziologici/sostanze infettive. Durante il trasporto occorre rispettare le temperature di conservazione e i tempi stabiliti. RACCOLTA DI CAMPIONI SU SPAZZOLA CERVICALE 1. Inserire la BD Onclarity HPV Cervical Brush (spazzola cervicale per BD Onclarity HPV) nell’endocervice in modo che solo le setole nella parte più bassa siano esposte nel canale. Ruotare lentamente di ¼ – ½ di giro in una sola direzione. Per ridurre sanguinamenti inutili, non ruotare eccessivamente la spazzola. 2. Rimuovere il tappo dalla provetta di BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent e posizionare immediatamente la spazzola sul fondo della provetta. 3. Spezzare con attenzione l’asta in corrispondenza della linea indicata. Evitare di schizzare il contenuto. 4. Richiudere saldamente la provetta. CONSERVAZIONE E TRASPORTO DEI CAMPIONI SU SPAZZOLA CERVICALE I campioni su spazzola cervicale nelle provette di BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent devono essere conservati e trasportati al laboratorio e/o al centro di analisi entro 30 giorni dalla raccolta se conservati a 2 – 30 °C o entro 30 giorni dalla raccolta se conservati congelati a -20 °C. I campioni non devono essere conservati e trasportati oltre la data di scadenza della provetta di diluente per spazzola cervicale. RACCOLTA DEI CAMPIONI LBC I campioni BD SurePath o PreservCyt devono essere raccolti utilizzando spazzolini endocervicali o una combinazione spazzola/spatola (vedere gli inserti allegati ai prodotti BD SurePath o PreservCyt). Una volta raccolti, i campioni BD SurePath o PreservCyt possono essere conservati e trasportati nei flaconi originali fino a 30 giorni a 2 – 30 °C o fino a 30 giorni se conservati congelati a -20 °C prima di trasferirli nelle provette di diluente per campioni BD Onclarity HPV LBC. 50 CONSERVAZIONE E TRASPORTO DEI CAMPIONI LBC Trasferimento dei campioni LBC nelle provette di diluente BD Onclarity HPV LBC – Prima o dopo la rimozione di un’aliquota per il trattamento per il test BD SurePath o ThinPrep. Un’aliquota di 0,5 mL di campione BD SurePath o PreservCyt viene trasferita manualmente dal flacone originale nella provetta di diluente per campioni BD Onclarity HPV LBC prima o dopo il trattamento per il BD SurePath Pap test o ThinPrep Pap test. Indossare guanti per maneggiare la provetta di diluente per campioni BD Onclarity HPV LBC e il flacone del campione BD SurePath o PreservCyt. Se i guanti vengono a contatto con i campioni, cambiarli immediatamente per impedire la contaminazione di altri campioni. Trasferimento dei campioni BD SurePath prima o dopo il trattamento per il test BD SurePath N.B. Fare riferimento al foglietto illustrativo di BD PrepStain Slide Processor o BD Totalys SlidePrep per istruzioni su come rimuovere un’aliquota dal flacone del campione BD SurePath prima di eseguire il Pap test in fase liquida BD SurePath. N.B. Maneggiare un campione alla volta per il trattamento. 1. Etichettare una provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC con i dati identificativi del paziente. 2. Rimuovere il tappo dalla provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC. 3. Per garantire una miscela omogenea, agitare con vortex il flacone del campione BD SurePath per 10 – 20 secondi. 4. Usando un puntale anti-aerosol, trasferire velocemente (entro un minuto dalla miscelazione con vortex) 0,5 mL dal flacone del campione alla provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC. 5. Eliminare il puntale della pipetta. N.B. Usare un puntale della pipetta diverso per ogni campione. 6. Avvitare bene il tappo sulla provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC. 7. Capovolgere la provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC 3 – 4 volte per assicurarsi che il campione e il diluente siano mescolati accuratamente. Trasferimento dei campioni PreservCyt prima o dopo il trattamento per il ThinPrep Pap test N.B. Fare riferimento all’addendum del Manuale d’uso del sistema ThinPrep 2000/3000 per istruzioni su come rimuovere un’aliquota dal flacone del campione PreservCyt prima di eseguire il test ThinPrep. N.B. Maneggiare un campione alla volta per il trattamento. 1. Etichettare una provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC con i dati identificativi del paziente. 2. Rimuovere il tappo dalla provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC. 3. Per garantire una miscela omogenea, agitare con vortex il flacone del campione PreservCyt a velocità elevata per 8 – 12 secondi. 4. Usando un puntale anti-aerosol, trasferire immediatamente 0,5 mL dal flacone del campione alla provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC. 5. Eliminare il puntale della pipetta. N.B. Usare un puntale della pipetta diverso per ogni campione. 6. Avvitare bene il tappo sulla provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC. 7. Capovolgere la provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC 3 – 4 volte per assicurarsi che il campione e il diluente siano mescolati accuratamente. Conservazione e trasporto dei campioni trasferiti nelle provette di diluente BD HPV LBC Dopo il trasferimento manuale in una provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC, il campione diluito può essere conservato fino a 15 giorni a 2 – 30 °C o fino a 30 giorni se conservato a -20 °C. PROCEDURA DI TRATTAMENTO PER TUTTI I CAMPIONI N.B. In caso di campioni congelati, assicurarsi che siano scongelati completamente a temperatura ambiente e mescolarli capovolgendoli prima di procedere. 1. Utilizzando il Tube Layout Report (Report della disposizione delle provette), posizionare i campioni nell’ordine stabilito nel BD Viper LT Specimen Rack (rack per campioni BD Viper LT) e bloccarli in sede. 2. I campioni sono pronti per essere pre-riscaldati. 3. Cambiare i guanti prima di continuare per evitare contaminazioni. PREPARAZIONE DEL CONTROLLO DI QUALITÀ 1. Rimuovere il tappo di un controllo negativo per BD Onclarity HPV e di una provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC. 2. Versare l’intero contenuto della provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC nel controllo negativo per BD Onclarity HPV. 3. Riapplicare il tappo sul controllo negativo per BD Onclarity HPV reidratato. Riapplicare il tappo e smaltire la provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC vuota. 4. Rimuovere il tappo di un controllo positivo per BD Onclarity HPV e di una provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC. 5. Versare l’intero contenuto della provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC nel controllo positivo per BD Onclarity HPV. 6. Riapplicare il tappo sul controllo positivo per BD Onclarity HPV reidratato. Riapplicare il tappo e smaltire la provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC vuota. 7. Utilizzando il Tube Layout Report (Report della disposizione delle provette), disporre il controllo negativo per BD Onclarity HPV reidratato nella posizione appropriata nel BD Viper LT Specimen Rack. 8. Utilizzando il Tube Layout Report (Report della disposizione delle provette), disporre il controllo positivo per BD Onclarity HPV reidratato nella posizione appropriata nel BD Viper LT Specimen Rack. 9. I controlli sono pronti per essere pre-riscaldati con i campioni. N.B. I controlli devono essere pre-riscaldati entro 24 ore dall’idratazione. 51 PROCEDURA DI PRE-RISCALDAMENTO N.B. La procedura di pre-riscaldamento deve essere applicata a tutti i campioni per garantire che la matrice del campione sia omogenea prima del caricamento sul sistema BD Viper LT. Il mancato pre-riscaldamento dei campioni potrebbe avere un effetto negativo sui risultati del BD Onclarity HPV Assay e/o sul sistema BD Viper LT. N.B. I campioni refrigerati o congelati devono essere scongelati completamente a temperatura ambiente prima del pre-riscaldamento. 1. Inserire il BD Viper LT Specimen Rack nel BD Pre-warm Heater e selezionare il protocollo di pre-riscaldamento per il BD Onclarity HPV Assay sullo strumento BD Viper LT. 2.Il BD Pre-warm Heater pre-riscalda automaticamente i campioni e i controlli in base al protocollo di pre-riscaldamento per il BD Onclarity HPV Assay. 3. Al termine del protocollo di pre-riscaldamento per il BD Onclarity HPV Assay, rimuovere il rack dal termoblocco e caricarlo nello strumento BD Viper LT. 4. Per l’analisi di campioni e controlli, fare riferimento alla sezione Procedura del test. 5. Dopo il pre-riscaldamento, i campioni possono essere conservati fino a 7 giorni a 2 – 30 °C o fino a 30 giorni a -20 °C senza ulteriore pre-riscaldamento prima di eseguire il test sul sistema BD Viper LT. 6. Dopo il pre-riscaldamento, i controlli possono essere conservati fino a 24 h a 2 – 30 °C senza ulteriore pre-riscaldamento prima di eseguire il test sul sistema BD Viper LT. PROCEDURA DEL TEST Per le istruzioni specifiche relative al funzionamento e alla manutenzione dei componenti del sistema, fare riferimento al Manuale d’uso del sistema BD Viper LT. È stato riscontrato che temperature di 18 – 27 °C con umidità relativa del 20 – 85% costituiscono condizioni ambientali ottimali per il dosaggio HPV. CONTROLLO DI QUALITÀ Le procedure per il controllo di qualità devono essere effettuate in conformità con le norme vigenti e/o i requisiti di accreditamento e la prassi di controllo di qualità del laboratorio specifico. Fare riferimento alle linee guida CLSI e alle norme CLIA in materia per una corretta esecuzione delle procedure relative al controllo di qualità. Il Control Set for the BD Onclarity HPV Assay viene fornito separatamente. Includere un controllo positivo e un controllo negativo in ogni ciclo di test e in ogni kit di reagenti con un nuovo numero di lotto. Posizionare i controlli secondo il Manuale d’uso del sistema BD Viper LT. Il controllo positivo per HPV monitora esclusivamente l’inefficacia dei reagenti. Il controllo negativo per HPV monitora la contaminazione del reagente e/o dell’ambiente. Ulteriori test di controllo possono essere eseguiti in conformità alle linee guida o ai requisiti delle normative vigenti o degli enti di accreditamento. Informazioni generali su CQ per il sistema BD Viper LT: La posizione delle provette PCR è indicata in una schermata della disposizione delle piastre con codifica a colori sul monitor LCD. Il simbolo più (+) all’interno della provetta indica il campione CQ positivo. Il simbolo meno (-) all’interno della provetta indica il campione CQ negativo. È necessario registrare una coppia CQ per ogni numero di lotto del kit di reagenti. Se le coppie CQ non sono state registrate correttamente, viene visualizzata una finestra di messaggio che impedisce di salvare il rack e di procedere con l’esecuzione fino al completamento. È possibile registrare provette CQ aggiuntive (opzionali). Tali provette vengono testate come campioni normali e non influiscono sullo stato valido/non valido dell’esecuzione. Per istruzioni, fare riferimento al Manuale d’uso del sistema BD Viper LT. N.B. I BD Onclarity HPV Control (controlli per BD Onclarity HPV) devono essere idratati manualmente prima di caricarli nel BD Viper LT Specimen Rack. Interpretazione dei risultati del controllo di qualità: Per la validità dei risultati dei campioni prelevati dai pazienti, l’analisi del controllo negativo per BD Onclarity HPV e del controllo positivo per BD Onclarity HPV deve risultare rispettivamente positiva e negativa. In caso contrario, l’esecuzione non viene considerata valida e lo strumento non include i risultati nel referto del paziente. Se uno dei controlli non fornisce i risultati attesi, ripetere l’intera esecuzione usando un nuovo set di controlli, nuove provette per estrazione, un nuovo contenitore per reagenti di estrazione e nuove provette PCR. Se il problema persiste, contattare il rappresentante BD di zona per ulteriori informazioni. 52 Tabella 1: Interpretazione dei risultati del controllo di qualità Tipo di controllo Simbolo in Tube Result Report (Report dei risultati della provetta) Controllo positivo per BD Onclarity HPV OK Disposizione CQ CQ superato Controllo positivo per BD Onclarity HPV CQ non superato Controllo positivo per BD Onclarity HPV CQ non superato Controllo positivo per BD Onclarity HPV CQ non superato Controllo negativo per BD Onclarity HPV OK CQ superato Controllo negativo per BD Onclarity HPV CQ non superato Controllo negativo per BD Onclarity HPV CQ non superato Controllo negativo per BD Onclarity HPV CQ non superato Fare riferimento alla sezione Interpretazioni dei risultati del test per una descrizione dei simboli presenti nel Tube Result Report (Report dei risultati della provetta). INTERPRETAZIONE DEI RISULTATI DEL TEST Il BD Onclarity HPV Assay utilizza la reazione a catena della polimerasi in tempo reale per rilevare la presenza del papillomavirus umano (HPV) nei campioni clinici. Tutti i calcoli vengono eseguiti automaticamente dal software BD Viper LT. La presenza o l’assenza di DNA HPV clinicamente rilevante è determinata dal ciclo PCR (CT) in cui il segnale supera una soglia prestabilita. Il test estrae, amplifica e rileva un frammento del gene della beta-globina umana come un controllo interno per valutare il trattamento, l’estrazione e l’amplificazione del campione e indicare la presenza degli inibitori PCR. Se il segnale specifico per HPV è superiore alla soglia di un ciclo, il controllo interno viene utilizzato dall’algoritmo nell’interpretazione del risultato. Se il segnale specifico per HPV è inferiore o uguale alla soglia di un ciclo, il controllo interno viene ignorato dall’algoritmo. Per i campioni HPV, un risultato “HR” (High Risk, alto rischio) (la combinazione di tutti i genotipi) viene visualizzato nel Tube Results Report (Report dei risultati della provetta). Un simbolo positivo in questa colonna indica che uno o più genotipi rilevabili dal test HPV presentano un risultato positivo. La colonna “GT” viene utilizzata per refertare i risultati per i genotipi non disponibili nel paese. Questi risultati non possono essere acquistati. Genotipi specifici e genotipi combinati vengono mostrati nelle colonne. Se i risultati per un genotipo sono stati acquistati vengono refertati come spiegato di seguito. Se i risultati dei genotipi non sono stati configurati per l’acquisto automatico vengono nascosti dall’icona a forma di “chiave”. Lo strumento può essere configurato in modo da acquistare/refertare genotipi specifici al termine dell’esecuzione. Per istruzioni sull’autorizzazione della refertazione automatica dei genotipi, vedere il Manuale d’uso del sistema BD Viper LT. Se i risultati dei controlli del test sono diversi da quelli attesi, i risultati dei pazienti non vengono refertati. Per i valori di controllo attesi, vedere la sezione Controllo di qualità. I risultati inclusi nel referto vengono determinati nel modo seguente. Tabella 2: Interpretazione dei risultati del test per genotipo HPV ad alto rischio per il BD Onclarity HPV Assay Risultato HPV ad alto rischio HR HR Interpretazione Risultato Positivo per i tipi di HPV ad alto rischio HPV HR positivo Negativo per i tipi di HPV ad alto rischio HPV HR negativo DNA HPV, se presente, non è individuabile Errore del controllo interno DNA HPV, se presente, non è individuabile Errore trasferimento di estrazione DNA HPV, se presente, non è individuabile Errore livello di liquido DNA HPV, se presente, non è individuabile Errore 53 Tabella 3: Interpretazione dei risultati del test per genotipo HPV specifico per il BD Onclarity HPV Assay Risultato genotipo HPV 16 16 18 18 45 Interpretazione Risultato Positivo per HPV tipo 16 HPV tipo 16 positivo Negativo per HPV tipo 16 HPV tipo 16 negativo Positivo per HPV tipo 18 HPV tipo 18 positivo Negativo per HPV tipo 18 HPV tipo 18 negativo Positivo per HPV tipo 45 HPV tipo 45 positivo Negativo per HPV tipo 45 HPV tipo 45 negativo 45 P1 P1 31 31 P2 P2 51 51 52 52 P3 P3 Positivo per HPV tipi 56, 59 e/o 66 HPV tipi 56, 59 e/o 66 positivo Negativo per HPV tipi 56, 59 e/o 66 HPV tipi 56, 59 e/o 66 negativo Positivo per HPV tipi 35, 39 e/o 68 HPV tipi 35, 39 e/o 68 positivo Negativo per HPV tipi 35, 39 e/o 68 HPV tipi 35, 39 e/o 68 negativo GT Risultato(i) genotipo HPV positivo non disponibile(i) nel paese Risultato(i) genotipo HPV positivo limitato(i) Risultato(i) genotipo HPV negativo non disponibile(i) nel paese Risultato genotipo HPV disponibile per l’acquisto Risultato(i) genotipo HPV negativo limitato(i) GT -- Positivo per HPV tipi 33 e/o 58 HPV tipi 33 e/o 58 positivo Negativo per HPV tipi 33 e/o 58 HPV tipi 33 e/o 58 negativo Positivo per HPV tipo 31 HPV tipo 31 positivo Negativo per HPV tipo 31 HPV tipo 31 negativo Positivo per HPV tipo 51 HPV tipo 51 positivo Negativo per HPV tipo 51 HPV tipo 51 negativo Positivo per HPV tipo 52 HPV tipo 52 positivo Negativo per HPV tipo 52 HPV tipo 52 negativo Risultato genotipo HPV non disponibile per l’acquisto Risultato genotipo bloccato Risultato HPV negativo, errore controllo interno, errore livello di liquido o errore trasferimento di estrazione Monitoraggio della presenza di contaminazione da DNA Almeno una volta al mese, effettuare la seguente procedura di test per individuare l’eventuale presenza di contaminazione da DNA sulle superfici dell’area di lavoro e delle attrezzature. Questo monitoraggio dell’ambiente è indispensabile per individuare la contaminazione prima che insorgano problemi. 1. Per ogni area da analizzare, utilizzare un tampone di raccolta pulito contenuto nel BD ProbeTec Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae (CT/GC) Amplified DNA Assay Endocervical Specimen Collection and DRY TRANSPORT Kit. 2. Versare una quantità di acqua priva di nucleasi per biologia molecolare in un piccolo contenitore pulito. 3. Immergere il tampone nell’acqua priva di nucleasi per biologia molecolare e pulire la prima area con un movimento ampio. 4. Rimuovere il tappo di una provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC e inserire il tampone nel diluente. Miscelare ruotando il tampone nel BD Onclarity HPV Diluent per 5 – 10 secondi. 5. Premere il tampone lungo le pareti interne della provetta in modo da far scorrere il liquido sul fondo. 6. Rimuovere con cura il tampone dalla provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC per evitare schizzi. Eliminare il tampone. 7. Richiudere saldamente la provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC con il tappo perforabile nero. 8. Ripetere questo passaggio per ciascuna area da testare. 9. Una volta raccolti e premuti tutti i tamponi, sottoporli al processo di pre-riscaldamento, quindi seguire la procedura del test. Per ulteriori informazioni sul monitoraggio dell’ambiente e sulle procedure di pulizia, consultare il Manuale d’uso del sistema BD Viper LT. Se un evento di contaminazione persiste, contattare il rappresentante BD di zona per ulteriori informazioni. LIMITAZIONI DELLA PROCEDURA 1. Per fornire prestazioni ottimali, il test richiede una tecnica corretta di raccolta e trattamento dei campioni. Fare riferimento alle sezioni relative alla raccolta e al trasporto dei campioni incluse in questo foglietto illustrativo. 2. Un risultato negativo non esclude la possibilità di infezione, in quanto i risultati del test possono essere condizionati da errori di raccolta del campione, errori tecnici, scambio dei campioni o dalla presenza nel campione di un numero di organismi inferiore alla soglia di sensibilità del test. 54 3.Il BD Onclarity HPV Assay fornisce risultati qualitativi. 4.Il BD Onclarity HPV Assay deve essere usato esclusivamente da personale che abbia ricevuto una preparazione adeguata per effettuare la procedura del test e utilizzare il sistema BD Viper LT. CARATTERISTICHE PRESTAZIONALI I campioni su BD Onclarity HPV Cervical Brush, i campioni BD SurePath e/o i campioni PreservCyt sono stati raccolti da 836 donne conformi al protocollo per cui è stato richiesto un follow-up a causa di Pap test anomalo o infezione da HPV o donne che si sono rivolte a una clinica per una visita di routine in due centri clinici situati in luoghi geografici diversi in Europa. Da ogni soggetto arruolato sono stati raccolti due campioni nel seguente ordine: un campione BD SurePath (Sito A) o un campione PreservCyt (Sito B) e un campione su BD Onclarity HPV Cervical Brush (trasferito in una provetta di BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent). Per ogni fiala citologica raccolta, sono stati aliquotati 0,5 mL in una provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC. I risultati citologici per DNA HPV (digene Hybrid Capture 2 (hc2) High-Risk HPV DNA Test) e i risultati del Roche LINEAR ARRAY HPV Genotyping Test (RLA) erano disponibili per la maggior parte dei campioni. I risultati istologici erano disponibili per la gran parte dei soggetti che si sono rivolti a una clinica per patologie ad alto rischio. Ogni sito ha inserito anche campioni residuali (BD SurePath o PreservCyt) con risultati citologici, risultati per DNA HPV (digene Hybrid Capture 2 High-Risk HPV DNA Test), risultati del Roche LINEAR ARRAY HPV Genotyping Test e, dove applicabile, risultati istologici. Per ogni campione incluso, sono stati aliquotati 0,5 mL in una provetta di diluente BD Onclarity HPV LBC. Sono stati inseriti 510 campioni retrospettivi conformi, con risultati istologici disponibili per 234 donne. Tutti i campioni sono stati analizzati con il sistema BD Viper LT secondo il foglietto illustrativo allegato alla confezione del test e al manuale d’uso. Per ogni tipo di terreno, sono state calcolate la sensibilità e la specificità per il rilevamento della patologia, definita come (1) CIN2 (Cervical Intraepithelial Neoplasia, neoplasia intraepiteliale cervicale) o risultato istologico superiore oppure (2) CIN3 o risultato istologico superiore. L’analisi finale dei dati comprende i risultati del BD Onclarity HPV Assay relativi a 472 campioni BD SurePath, 361 campioni PreservCyt e un totale di 515 campioni su BD Onclarity HPV Cervical Brush: 247 campioni su BD Onclarity HPV Cervical Brush (nel BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent) per il Sito A e 268 campioni su BD Onclarity HPV Cervical Brush (nel BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent) per il Sito B. Le stime delle prestazioni per il rilevamento della patologia cervicale di grado elevato con il BD Onclarity HPV Assay e il test hc2 sono riportate nelle tabelle 4 e 5 per i BD SurePath media (terreni BD SurePath), nelle tabelle 8 e 9 per i PreservCyt Media (terreni PreservCyt) e nelle tabelle 12 e 13 per i campioni su BD Onclarity HPV Cervical Brush. I risultati del BD Onclarity HPV Assay sono stati inoltre confrontati con i risultati per DNA HPV derivanti dal digene Hybrid Capture 2 High-Risk HPV DNA Test e dal Roche LINEAR ARRAY HPV Genotyping Test (comparatore composito). Un risultato positivo dai test hc2 e RLA (ad alto rischio) viene definito come positivo per il comparatore composito, mentre un risultato negativo viene definito come negativo per il comparatore composito. Quando i due test generano risultati diversi (o non erano disponibili risultati per entrambi i test), il risultato del comparatore composito viene considerato irrisolto. La percentuale di concordanza positiva, negativa e complessiva è stata calcolata per ogni tipo di terreno rispetto al comparatore composito. L’analisi finale dei dati comprende i risultati del BD Onclarity HPV Assay e del comparatore composito (indipendentemente dallo stato istologico) relativi a 670 campioni BD SurePath e 674 campioni PreservCyt. (Tabelle 6 e 10) Il rischio assoluto della patologia (CIN2+ e CIN3+) nella popolazione in studio per ogni tipo di terreno è stato calcolato per ciascun genotipo e gruppo di genotipi nel BD Onclarity HPV Assay. I rischi assoluti vengono calcolati quando il genotipo (o il gruppo di genotipi) è presente da solo e/o in presenza di altri genotipi. Viene riportata una tabella del rischio assoluto per ogni tipo di terreno. Ciascun terreno è stato raccolto solo in un sito, quindi si possono prevedere differenze nelle percentuali di positività a HPV e al genotipo correlate alla variabilità della popolazione. (Tabelle 7 e 11) Prestazioni cliniche dei campioni BD SurePath Tabella 4: Prestazioni del BD Onclarity HPV Assay con i BD SurePath Media rispetto ai risultati istologici (CIN2+) BD Onclarity HPV Assay Stima Test DNA HPV hc2 Intervallo di confidenza 95% Stima Intervallo di confidenza 95% Sensibilità 97,9% (190/194) (94,8%, 99,2%) 98,4% (190/193) (95,5%, 99,5%) Specificità 22,7% (63/278) (18,1%, 27,9%) 17,0% (47/277) (13,0%, 21,8%) Tabella 5: Prestazioni del BD Onclarity HPV Assay con i BD SurePath Media rispetto ai risultati istologici (CIN3+) BD Onclarity HPV Assay Test DNA HPV hc2 Stima Intervallo di confidenza 95% Stima Intervallo di confidenza 95% Sensibilità 97,7% (126/129) (93,4%, 99,2%) 98,4% (126/128) (94,5%, 99,6%) Specificità 18,7% (64/343) (14,9%, 23,1%) 14,0% (48/342) (10,8%, 18,1%) 55 Tabella 6: Prestazioni del BD Onclarity HPV Assay con i BD SurePath Media rispetto al comparatore composito Risultato comparatore composito BD Onclarity Positivo Negativo HPV Assay Irrisolto* Totale Positivo 532 6 27 565 Negativo 8 50 47 105 Totale 540 56 74 670 Percentuale di concordanza positiva Percentuale di concordanza negativa Percentuale di concordanza complessiva (intervallo di confidenza 95%) (intervallo di confidenza 95%) (intervallo di confidenza 95%) 98,5% (97,1%, 99,2%) 89,3% (78,5%, 95,0%) 97,7% (96,1%, 98,6%) *I risultati di hc2 e RLA forniscono risultati diversi o non erano disponibili risultati per entrambi i test. Tabella 7: Rischio assoluto di CIN2+ e CIN3+ per i genotipi nel BD Onclarity HPV Assay con i BD SurePath Media Genotipo BD Onclarity HPV Assay Infezione dovuta a uno o più genotipi Infezione dovuta a un singolo genotipo o a un gruppo di genotipi Infezione dovuta a uno o più genotipi Infezione dovuta a un singolo genotipo o a un gruppo di genotipi Rischio Intervallo di Rischio Intervallo di Rischio Intervallo di Rischio Intervallo di assoluto confidenza assoluto confidenza assoluto confidenza assoluto confidenza 95% 95% 95% 95% CIN2+ CIN2+ CIN3+ CIN3+ HPV16 63,9% (99/155) (56,1%, 71,0%) 64,9% (48/74) (53,5%, 74,8%) 43,9% (68/155) (36,3%, 51,7%) 47,3% (35/74) (36,3%, 58,5%) HPV18 50,0% (24/48) (36,4%, 63,6%) 50,0% (7/14) (26,8%, 73,2%) 43,8% (21/48) (30,7%, 57,7%) 42,9% (6/14) (21,4%, 67,4%) HPV45 46,7% (21/45) (32,9%, 60,9%) 23,5% (4/17) (9,6%, 47,3%) 31,1% (14/45) (19,5%, 45,7%) 17,6% (3/17) (6,2%, 41,0%) HPV33/58 49,4% (42/85) (39,0%, 59,8%) 47,1% (16/34) (31,5%, 63,3%) 31,8% (27/85) (22,8%, 42,3%) 23,5% (8/34) (12,4%, 40,0%) HPV31 64,2% (52/81) (53,3%, 73,8%) 72,7% (16/22) (51,8%, 86,8%) 40,7% (33/81) (30,7%, 51,6%) 50,0% (11/22) (30,7%, 69,3%) HPV56/59/66 25,5% (25/98) (17,9%, 35,0%) 0,0% (0/29) (0,0%, 11,7%) 13,3% (13/98) (7,9%, 21,4%) 0,0% (0/29) (0,0%, 11,7%) HPV51 41,7% (15/36) (27,1%, 57,8%) 25,0% (2/8) (7,1%, 59,1%) 25,0% (9/36) (13,8%, 41,1%) 12,5% (1/8) (2,2%, 47,1%) HPV52 35,1% (20/57) (24,0%, 48,1%) 33,3% (4/12) (13,8%, 60,9%) 19,3% (11/57) (11,1%, 31,3%) 16,7% (2/12) (4,7%, 44,8%) HPV35/39/68 36,0% (27/75) (26,1%, 47,3%) 33,3% (7/21) (17,2%, 54,6%) 17,3% (13/75) (10,4%, 27,4%) 19,0% (4/21) (7,7%, 40,0%) Prestazioni cliniche dei campioni PreservCyt Tabella 8: Prestazioni del BD Onclarity HPV Assay con i PreservCyt Media rispetto ai risultati istologici (CIN2+) BD Onclarity HPV Assay Test DNA HPV hc2 Stima Intervallo di confidenza 95% Stima Intervallo di confidenza 95% Sensibilità 94,7% (160/169) (90,2%, 97,2%) 97,0% (160/165) (93,1%, 98,7%) Specificità 50,5% (97/192) (43,5%, 57,5%) 40,8% (75/184) (33,9%, 48,0%) Tabella 9: Prestazioni del BD Onclarity HPV Assay con i PreservCyt Media rispetto ai risultati istologici (CIN3+) BD Onclarity HPV Assay Test DNA HPV hc2 Stima Intervallo di confidenza 95% Stima Intervallo di confidenza 95% Sensibilità 94,4% (85/90) (87,6%, 97,6%) 97,7% (85/87) (92,0%, 99,4%) Specificità 37,3% (101/271) (31,7%, 43,2%) 29,8% (78/262) (24,6%, 35,6%) 56 Tabella 10: Prestazioni del BD Onclarity HPV Assay con i PreservCyt Media rispetto al comparatore composito Risultato comparatore composito BD Onclarity Positivo Negativo HPV Assay Irrisolto* Percentuale di concordanza negativa Percentuale di concordanza complessiva (intervallo di confidenza 95%) (intervallo di confidenza 95%) (intervallo di confidenza 95%) 96,1% (93,0%, 97,9%) 98,7% (96,9%, 99,4%) 97,6% (96,1%, 98,5%) Percentuale di concordanza positiva Totale Positivo 246 5 18 269 Negativo 10 366 29 405 Totale 256 371 47 674 * I risultati di hc2 e RLA forniscono risultati diversi o non erano disponibili risultati per entrambi i test. Tabella 11: Rischio assoluto di CIN2+ e CIN3+ per i genotipi nel BD Onclarity HPV Assay con i PreservCyt Media Genotipo BD Onclarity HPV Assa HPV 16 HPV 18 HPV 45 HPV 33/58 HPV 31 HPV 56/59/66 HPV 51 HPV 52 HPV 35/39/68 Infezione dovuta a uno o più genotipi Infezione dovuta a un singolo genotipo o a un gruppo di genotipi Rischio Intervallo di Rischio assoluto confidenza assoluto 95% CIN2+ CIN2+ 77,1% (84/109) 50,0% (12/24) 50,0% (6/12) 70,0% (28/40) 67,7% (42/62) 34,0% (18/53) 48,0% (12/25) 73,9% (17/23) 38,5% (10/26) (68,3%, 84,0%) (31,4%, 68,6%) (25,4%, 74,6%) (54,6%, 81,9%) (55,4%, 78,0%) (22,7%, 47,4%) (30,0%, 66,5%) (53,5%, 87,5%) (22,4%, 57,5%) 81,4% (57/70) 45,5% (5/11) 25,0% (1/4) 75,0% (15/20) 71,0% (22/31) 11,1% (2/18) 27,3% (3/11) 85,7% (6/7) 40,0% (2/5) Intervallo di confidenza 95% (70,8%, 88,8%) (21,3%, 72,0%) (4,6%, 69,9%) (53,1%, 88,8%) (53,4%, 83,9%) (3,1%, 32,8%) (9,7%, 56,6%) (48,7%, 97,4%) (11,8%, 76,9%) 57 Infezione dovuta a uno o più genotipi Rischio Intervallo di assoluto confidenza 95% CIN3+ 44,0% (48/109) 29,2% (7/24) 16,7% (2/12) 35,0% (14/40) 30,6% (19/62) 9,4% (5/53) 16,0% (4/25) 26,1% (6/23) 15,4% (4/26) (35,1%, 53,4%) (14,9%, 49,2%) (4,7%, 44,8%) (22,1%, 50,5%) (20,6%, 43,0%) (4,1%, 20,3%) (6,4%, 34,7%) (12,5%, 46,5%) (6,1%, 33,5%) Infezione dovuta a un singolo genotipo o a un gruppo di genotipi Rischio assoluto CIN3+ Intervallo di confidenza 95% 50,0% (35/70) 18,2% (2/11) 0,0 (0/4) 50,0% (10/20) 41,9% (13/31) 0,0% (0/18) 18,2% (2/11) 42,9% (3/7) 20,0% (1/5) (38,6%, 61,4%) (5,1%, 47,7%) (0,0%, 49,0%) (29,9%, 70,1%) (26,4%, 59,2%) (0,0%, 17,6%) (5,1%, 47,7%) (15,8%, 75,0%) (3,6%, 62,4%) Prestazioni cliniche dei campioni su BD Onclarity HPV Cervical Brush Tabella 12: Prestazioni del BD Onclarity HPV Assay con la BD Onclarity HPV Cervical Brush rispetto ai risultati istologici (CIN2+) BD Onclarity HPV Assay Stima Stima Intervallo di confidenza 95% Sensibilità 97,2% (104/107) (92,1%, 99,0%) 99,1% (106/107) (94,9%, 99,8%) Sensibilità 17,9% (25/140) (12,4%, 25,0%) 21,4% (30/140) (15,4%, 28,9%) Sensibilità 100,0% (121/121) (96,9%, 100,0%) 97,5% (116/119) (92,8%, 99,1%) Sensibilità 37,4% (55/147) (30,0%, 45,5%) 43,0% (61/142) (35,1%, 51,2%) Sito A B Test DNA HPV hc2 Intervallo di confidenza 95% Tabella 13: Prestazioni del BD Onclarity HPV Assay con la BD Onclarity HPV Cervical Brush rispetto ai risultati istologici (CIN3+) BD Onclarity HPV Assay Intervallo di confidenza 95% Stima Intervallo di confidenza 95% Sensibilità 97,3% (72/74) Sensibilità 15,0% (26/173) (90,7%, 99,3%) 98,6% (73/74) (92,7%, 99,8%) (10,5%, 21,1%) 17,3% (30/173) Sensibilità (12,4%, 23,7%) 100,0% (60/60) (94,0%, 100,0%) 98,3% (57/58) Sensibilità (90,9%, 99,7%) 26,4% (55/208) (20,9%, 32,8%) 31,0% (63/203) (25,1%, 37,7%) Sito A B Test DNA HPV hc2 Stima Studi analitici Sensibilità analitica al cut-off clinico: Il LOD (Limits of Detection, limite di rilevamento) al cut-off clinico HPV è stato determinato per il BD Onclarity HPV Assay utilizzando le linee cellulari HPV positive, ovvero SiHa (HPV 16), HeLa (HPV 18) e MS751 (HPV 45) e DNA plasmidico clonato contenente le sequenze per i seguenti genotipi HPV: HPV 31, 33, 35, 39, 51, 52, 56, 58, 59, 66 e 68 in BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt Solution e BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent contenenti la linea cellulare HPV negativa (C33A). Le linee cellulari HPV sono state testate singolarmente, mentre i plasmidi HPV sono stati verificati insieme in tre gruppi: 1) HPV 31, 33, 51, 52 e 59; 2) HPV 56, 58, 68 e 3) HPV 35 e 66. Un minimo di quarantacinque repliche di ciascuno dei sei livelli bersaglio per le linee cellulari HPV e venti repliche di ciascuno dei sei livelli bersaglio di plasmidi HPV sono stati testati in almeno tre lotti di reagenti e minimo tre sistemi BD Viper LT. Il LOD è il livello di DNA HPV nel campione non diluito che presenta risultati positivi superiori al cut-off clinico almeno il 95% delle volte. Il valore LOD massimo per ciascuno dei genotipi HPV e dei terreni viene descritto nella tabella 14. Tabella 14: Sensibilità analitica Bersaglio BD SurePath Media (intervallo di confidenza 95%) PreservCyt Media (intervallo di confidenza 95%) BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent (intervallo di confidenza 5%) Cellule SiHa (HPV 16)/mL 1.584 (1.276 – 1.962) 1.835 (1.426 – 2.358) 137 (131 – 144) Cellule HeLa (HPV 18)/mL 915 (739 – 1.131) 1.786 (1.175 – 2.715) 51 (46 – 56) Cellule MS751 (HPV 45)/mL 3.793 (2.944 – 4.888) 5.425 (4.167 – 7.066) 305 (284 – 343) Copie HPV 31/mL 3.652 (3.159 – 3.868) 4.118 (3.898 – 4.228) 692 (650 – 817) Copie HPV 33/mL 7.326 (6.578 – 8.932) 8.272 (7.946 – 8.743) 1.376 (1.272 – 1.451) Copie HPV 35/mL 6.820 (6.477 – 7.282) 7.282 (6.895 – 7.674) 1.552 (1.317 – 1.780) Copie HPV 39/mL 7.894 (7.115 – 8.193) 8.272 (7.810 – 9.398) 1.531 (1.419 – 1.685) Copie HPV 51/mL 6.697 (5.786 – 7.097) 5.909 (5.553 – 6.824) 1.229 (1.155 – 1.353) Copie HPV 52/mL 3.582 (3.414 – 4.184) 4.184 (3.740 – 4.761) 833 (744 – 934) Copie HPV 56/mL 4.976 (4.140 – 5.698) 4.774 (4.479 – 5.997) 836 (737 – 911) Copie HPV 58/mL 10.094 (9.403 – 11.180) 11.488 (8.989 – 12.360) 2.990 (2.656 – 7.819) Copie HPV 59/mL 4.400 (4.145 – 5.069) 4.374 (4.105 – 5482) 772 (722 – 899) Copie HPV 66/mL 3.793 (3.621 – 4.030) 4.462 (4.008 – 4844) 701 (646 – 767) Copie HPV 68/mL 10.415 (9.799 – 11.642) 10.481 (9.816 – 12.082) 2.079 (1.995 – 2.125) 58 Reattività crociata: Un pannello di batteri, lieviti e virus coltivati, insieme a DNA plasmidico clonato contenente sequenze bersaglio di HPV ad alto e a basso rischio, è stato utilizzato per valutare la specificità analitica del BD Onclarity HPV Assay sul sistema BD Viper LT. Ogni componente caratterizzato da potenziale reattività crociata è stato testato singolarmente in BD SurePath Preservative Fluid e PreservCyt Solution contenenti una linea cellulare HPV negativa (C33A). I microrganismi vengono descritti nelle tabelle 15 e 16. Il BD Onclarity HPV Assay non ha prodotto reazioni crociate con i microrganismi analizzati. Tabella 15: Microrganismi testati per la specificità analitica Batteri* Virus** Actinomyces israelii Adenovirus, tipo 5 Atopobium vaginae EBV-1, ceppo B95-8 Bacteroides fragilis HCMV. Ceppo AD169 Bacteroides ureolyticus HIV-1 Bifidobacterium adolescentis HSV1 Bifidobacterium brevi HSV2 Bifidobacterium longum ssp. longum HPV ad alto rischio*** Chlamydia trachomatis HPV 16 Clostridium perfringens HPV 18 Corynebacterium genitalium HPV 31 Enterobacter cloacae ssp. cloacae HPV 33 Enterococcus faecalis HPV 35 Enterococcus faecium HPV 39 Escherichia coli HPV 45 Fusobacterium nucleatum ssp. nucleatum HPV 51 Gardnerella vaginalis HPV 52 Klebsiella pneumonia ssp. ozaenae HPV 56 Lactobacillus acidophilus HPV 58 Mycobacterium smegmatis HPV 59 Mycoplasma genitalium HPV 66 Neisseria gonorrhoeae HPV 68 Peptostreptococcus anaerobius Prevotella bivia Prevotella disiens Proteus mirabilis Proteus vulgaris Providencia stuartii Pseudomonas aeruginosa Staphylococcus aureus Staphylococcus epidermidis Streptococcus agalactiae Streptococcus pyogenes Ureaplasma urealyticum Lieviti/Protozoi**** Candida albicans Trichomonas vaginalis * Batteri testati a circa 1,0 x 107 CFU/mL eccetto i seguenti: Chlamydia trachomatis (1,0 x 107 EB/mL), Mycobacterium smegmatis (2,5 x 106 CFU/mL) e Ureaplasma urealyticum (8,0 x 106 CFU/mL). ** Virus testati a 1,0 x 106 VP/mL. *** DNA plasmidico HPV ad alto rischio testato a 1,0 x 106 copie/mL. **** Lieviti (Candida albicans) testati a circa 1,0 x 107 CFU/mL; protozoi (Trichomonas vaginalis) testati a circa 1,4 x 106 CFU/mL. 59 Tabella 16: Plasmidi HPV a basso rischio testati per la specificità analitica HPV 6 HPV 69 HPV 11 HPV 70 HPV 26 HPV 73 HPV 30 HPV 82 HPV 34 HPV 97 HPV 53 HPV c85 HPV 67 *DNA plasmidico HPV a basso rischio testato a 1,0 x 106 copie/mL. Sostanze interferenti: Il potenziale di interferenza nel BD Onclarity HPV Assay sul sistema BD Viper LT è stato determinato con sostanze esogene ed endogene che possono essere presenti nei campioni cervicali clinici. I campioni HPV negativi e HPV positivi pianificati (addizionati con le cellule SiHa, HeLa e MS751 a 3 x LOD) sono stati testati in presenza e in assenza di ciascuna potenziale sostanza interferente. Le sostanze utilizzate in questi studi vengono descritte nella tabella 17. Le concentrazioni rappresentano il livello massimo di sostanza che non causa interferenze nel BD Onclarity HPV Assay. Tabella 17: Potenziali sostanze interferenti Potenziale sostanza interferente BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent Concentrazione testata Lubrificante vaginale KY 10% (p/v) 6% (p/v) 10% (w/v) Pellicola contraccettiva vaginale VCF 3% (w/v) 10% (w/v) 10% (w/v) Schiuma contraccettiva vaginale VCF 10% (w/v) 10% (w/v) 10% (w/v) Gel contraccettivo Conceptrol 1% (w/v) 10% (w/v) 10% (w/v) BD SurePath Media PreservCyt Media Concentrazione testata Concentrazione testata Monistat 3* 2% (w/v) 2% (w/v) 1,8% (w/v) Clotrimazolo 7 10% (w/v) 10% (w/v) 10% (w/v) Tioconazolo Vagistat-1 2% (w/v) 2% (w/v) 2% (w/v) Crema vaginale a base di clindamicina 9% (w/v) 10% (w/v) 10% (w/v) Lavanda vaginale Summer’s Eve 10% (v/v) 10% (v/v) 10% (v/v) Crema Zovirax (aciclovir) 10% (w/v) 8% (w/v) 10% (w/v) Gel Vandazole (gel vaginale a base di metronidazolo, 0,75%) 10% (w/v) 10% (w/v) 10% (w/v) Deodorante Summer’s Eve 2% (w/v) 3% (w/v) 2% (w/v) Mucina bovina 10% (v/v) 10% (v/v) 10% (v/v) Progesterone 20 ng/mL 20 ng/mL 20 ng/mL Estradiolo 1,2 ng/mL 1,2 ng/mL 1,2 ng/mL Sangue intero 3% (v/v) 5% (v/v) 5% (v/v) Leucociti 1x106 1x106 cellule/mL cellule/mL 1x106 cellule/mL Sperma 10% (v/v) 10% (v/v) 10% (v/v) Lavaggio a base di acido acetico** 5% (v/v) Sangue + Lavaggio a base di acido acetico 5% sangue (v/v) 2,5% lavaggio a base di acido acetico (v/v) *Concentrazioni superiori ai valori elencati hanno causato errori nel livello di liquido durante l’estrazione sul sistema BD Viper LT. **Il lavaggio a base di acido acetico è costituito da 1 parte di acido acetico glaciale e 9 parti di soluzione CytoLyt. 60 Interferenza dei bersagli competitivi: Il potenziale di inibizione del rilevamento HPV dovuto a un bersaglio presente a un livello elevato e un altro bersaglio presente a bassi livelli durante un’infezione mista è stato valutato nel BD Onclarity HPV Assay. Le cellule SiHa, HeLa e MS751 sono state testate singolarmente o insieme a 3 x LOD in presenza o in assenza di bersagli HPV competitivi a 1,0 x 106 copie/mL in BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt Solution e BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent contenenti una linea cellulare HPV negativa (C33A) (tabella 18). Tabella 18: Interferenza dei bersagli competitivi Tipo di provetta del test HPV Bersagli cellulari HPV singoli a 3 x LOD Plasmidi HPV a 1 x 106 copie/mL Rilevamento bersaglio cellulare HPV in presenza o assenza di genotipi concorrenti (plasmidi HPV) SiHa (HPV 16) HPV 18 + HPV 45 Sì Genotipi G1 con bersagli co-amplificati G1 HeLa (HPV 18) HPV 16 + HPV 45 Sì HPV 45 (MS751) HPV 16 + HPV 18 Sì Genotipi G1 con bersagli co-amplificati G2 SiHa + HeLa + MS751 HPV 31 + HPV 33 + HPV 56 + HPV 58 + HPV 59 + HPV 66 Sì Genotipi G1 con bersagli co-amplificati G3 SiHa + HeLa + MS751 HPV 35 + HPV 39 + HPV 51+ HPV 52 + HPV 68 Sì Riproducibilità: La riproducibilità del BD Onclarity HPV Assay è stata valutata con lo strumento BD Viper LT utilizzando un pannello di quattro membri costituito da campioni negativi, con alta negatività, bassa positività e moderata positività. I membri positivi del pannello erano formati da cellule SiHa, HeLa and MS751 addizionate insieme nei pool di campioni clinici BD SurePath HPV negativi e BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent contenente una linea cellulare HPV negativa (C33A). Il pannello è stato testato all’interno di una distribuzione uniforme di tre lotti di reagenti e tre strumenti nell’arco di 12 giorni. I dati sono riassunti nella tabella 19. 61 Tabella 19: Riepilogo dei dati di riproducibilità per il BD Onclarity HPV Assay sul sistema BD Viper LT Inter-série Linea Terreno cellulare (genotipo) SurePath SiHa (HPV 16) HeLa (HPV 18) MS-751 (HPV 45) Diluente per spazzola cervicale SiHa (HPV 16) NA NA NA NA NA NA NA 32 100 % (218/218) (98,27 % – 100 %) 36,29 0,09 0,25 0,59 1,63 0,62 1,71 Bassa pos 205 94,91 % (205/216) (91,11 % – 97,13 %) 33,63 0,26 0,78 0,33 0,97 0,43 1,27 Mod pos 615 100 % (216/216) (98,25 % – 100 %) 31,80 0,16 0,51 0,18 0,56 0,25 0,79 0 100 % (214/214) (98,24 % – 100 %) NA NA NA NA NA NA NA 13 99,07 % (214/216) (96,69 % – 99,75 %) 35,69 0,10 0,29 0,78 2,18 0,80 2,23 Bassa pos 76 99,08 % (216/218) (96,72 % – 99,75 %) 33,34 0,15 0,44 0,25 0,76 0,30 0,91 Mod pos 228 99,54 % (215/216) (97,42 % – 99,92 %) 32,07 0,24 0,73 0,25 0,78 0,37 1,16 0 100 % (214/214) (98,24 % – 100 %) NA NA NA NA NA NA NA 59 100 % (216/216) (98,25 % – 100 %) 36,54 0,22 0,61 0,62 1,68 0,66 1,81 Bassa pos 457 99,54 % (215/216) (97,42 % – 99,92 %) 33,22 0,16 0,48 0,25 0,75 0,32 0,95 Mod pos 1.371 100 % (218/218) (98,27 % – 100 %) 31,74 0,14 0,43 0,21 0,67 0,27 0,84 Concentrazione % corretta cellule/mL Nég 0 Alta neg 342 Bassa pos 1.582 Mod pos 4.746 Nég 0 Alta neg 102 Bassa pos 914 Mod pos 2.742 Nég 0 Alta neg 395 Bassa pos 3.793 Mod pos 11.378 Nég 0 Alta neg Alta neg Nég MS-751 (HPV 45) Total 100 % (216/216) 97,69 % (211/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 98,61 % (213/216) 99,54 % (215/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 99,54 % (215/216) 100 % (214/214) Livello pannello Nég HeLa (HPV 18) Intra-série Intervallo di confidenza 95% (98,25 % – 100 %) (94,7 % – 99,01 %) (100 % – 98,25 %) (100 % – 98,25 %) (98,25 % – 100 %) (96 % – 99,53 %) (97,42 % – 99,92 %) (100 % – 98,25 %) (98,25 % – 100 %) (98,25 % – 100 %) (100 % – 98,25 %) (97,42 % – 99,92 %) (98,24 % – 100 %) Alta neg CT media SD %CV SD %CV SD %CV NA NA NA NA NA NA NA 35,28 0,16 0,46 0,54 1,52 0,57 1,62 32,31 0,16 0,50 0,22 0,69 0,30 0,92 31,07 0,22 0,69 0,22 0,71 0,35 1,11 NA NA NA NA NA NA NA 35,89 0,24 0,68 0,75 2,09 0,85 2,37 32,70 0,16 0,50 0,30 0,92 0,37 1,14 30,68 0,13 0,43 0,22 0,72 0,30 0,98 NA NA NA NA NA NA NA 35,77 0,00 0,00 0,52 1,45 0,55 1,53 32,71 0,20 0,60 0,26 0,80 0,36 1,10 31,33 0,18 0,57 0,35 1,10 0,41 1,31 Contaminazione crociata: È stato condotto uno studio per valutare il rischio della produzione di un risultato falso positivo nella stessa esecuzione (contaminazione crociata all’interno dell’esecuzione) o in un’esecuzione successiva (contaminazione residua tra le esecuzioni) sul sistema BD Viper LT. È stata eseguita un’esecuzione al giorno per cinque giorni su ciascuno dei tre strumenti, con un totale di 675 repliche del test. Ogni esecuzione era costituita da campioni in BD SurePath Preservative Fluid o PreservCyt Solution contenenti una linea cellulare HPV negativa (C33A) con e senza cellule SiHa addizionati a 1,0 x 105 cellule/mL e disposti in un pattern a scacchiera. Il tasso complessivo di contaminazione con BD SurePath Preservative Fluid e PreservCyt Solution era pari a 0,00%. Stabilità dei campioni non diluiti (in fiala): Sono stati condotti studi analitici per supportare i dati di stabilità di conservazione per campioni cervicali puri. I campioni in BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt Solution e BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent contenenti una linea cellulare HPV negativa (C33A) sono stati addizionati con le cellule SiHa a 3 x LOD e conservati a 2 – 8 °C, 30 °C e -20 °C in diversi punti temporali. A ogni punto temporale, i campioni sono stati rimossi dalla conservazione e testati con il BD Onclarity HPV Assay nel sistema BD Viper LT. Sono state generate ventiquattro repliche del test per ogni condizione (tipo di campione/temperatura/durata). La stabilità è stata raggiunta per 30 giorni nell’intervallo 2 – 30 °C e a -20 °C. Stabilità dei campioni diluiti: Sono stati condotti studi analitici per supportare i dati di stabilità di conservazione per campioni cervicali diluiti. I campioni in BD SurePath Preservative Fluid e PreservCyt Solution contenenti una linea cellulare HPV negativa (C33A) 62 sono stati addizionati con le cellule SiHa a 3 X LOD, diluiti con il BD HPV LBC Diluent, quindi conservati a 2 – 8 °C, 30 °C e -20 °C in diversi punti temporali. A ogni punto temporale, i campioni sono stati rimossi dalla conservazione e testati con il BD Onclarity HPV Assay nel sistema BD Viper LT. Sono state generate ventiquattro repliche del test per ogni condizione (tipo di campione/temperatura/durata). La stabilità è stata raggiunta per 15 giorni nell’intervallo 2 – 30 °C e per 30 giorni a -20 °C. Stabilità dei campioni successiva al pre-riscaldamento: Sono stati condotti studi analitici per supportare i dati di stabilità di conservazione per campioni cervicali diluiti dopo il pre-riscaldamento. I campioni in BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt Solution e BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent contenenti una linea cellulare HPV negativa (C33A) sono stati addizionati con le cellule SiHa a 3 x LOD, diluiti con il BD Onclarity HPV LBC Diluent, quindi pre-riscaldati con il BD Viper LT Pre-warm Heater. I campioni trattati sono stati conservati nell’intervallo 2 – 8 °C, a 30 °C e -20 °C in diversi punti temporali. A ogni punto temporale, i campioni sono stati rimossi dalla conservazione e testati con il BD Onclarity HPV Assay nel sistema BD Viper LT. Sono state generate ventiquattro repliche del test per ogni condizione (tipo di campione/temperatura/durata). La stabilità è stata raggiunta per 7 giorni nell’intervallo 2 – 30 °C e per 30 giorni a -20 °C. INTERPRETAZIONE DELLE TABELLE Simboli e abbreviazioni Simboli (+) (-) # % positivo negativo numero percentuale Abbreviazioni ASCUS Atypical squamous cells of undetermined significance (cellule squamose atipiche di significato non determinato) cfu Colony Forming Units (unità formanti colonie) IC Intervallo di confidenza CIN Cervical Intraepithelial Neoplasia (neoplasia intraepiteliale cervicale) CV Coefficiente di variazione HPV Human Papillomavirus (papillomavirus umano) HR High Risk (alto rischio) LBC Liquid-Based Cytology (citologia in fase liquida) n numero NA Non applicabile NEGNegativo NPA Negative Percent Agreement (percentuale di concordanza negativa) PBS Phosphate Buffered Saline (soluzione fisiologica tamponata con fosfato) PCR Polymerase Chain Reaction (reazione a catena della polimerasi) POSPositivo PPA Positive Percent Agreement (percentuale di concordanza positiva) CQ Controllo di qualità DS Deviazione standard DISPONIBILITÀ Sono inoltre disponibili i seguenti prodotti BD Onclarity e BD Viper su BD Viper LT: N. di cat. Descrizione 442946 BD Onclarity HPV Assay Reagent Pack, 192 test 441993 Control Set for the BD Onclarity HPV Assay, 24 provette positive e 24 provette negative 442841 BD Viper PCR Extraction Reagent Trough with Piercing Tool, 12 contenitori per reagente di estrazione 441992 BD FOX PCR Extraction Tubes, 384 provette 441354 BD Viper System Neutralization Pouch, 12 sacchetti 442840 BD Onclarity HPV Liquid Based Cytology Specimen (LBC) Diluent Tubes, 400 441991 BD Onclarity HPV Assay Cervical Brush Collection Kit, 100 442957 BD Viper LT System PCR Tube/Tray Kit 443430 Key Card for the BD Viper LT System 440476 BD ProbeTec Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae (CT/GC) Amplified DNA Assay Endocervical Specimen Collection and DRY TRANSPORT Kit 441996 BD Viper LT Pipette Tips, 3840 441995 BD Viper LT Solid Waste Liners, 80 442950 BD Pre-warm Heater 442967 BD Viper LT System PCR Accessory kit 442839 BD Viper LT System BIBLIOGRAFIA : Vedere “References” nel testo inglese. 63 Onclarity HPV Assay Español USO PREVISTO BD Onclarity HPV Assay (Análisis HPV BD Onclarity) es una prueba de ADN amplificado para la detección cualitativo de tipos de papilomavirus humano (HPV) de alto riesgo. El análisis detecta todos los tipos de HPV de alto riesgo (16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, y 68) y proporciona la capacidad de genotipar seis tipos de alto riesgo (HPV 16, 18, 31, 45, 51 y 52). Las muestras de cuello uterino que se analizan con BD Onclarity HPV Assay incluyen BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit (Kit de recogida mediante cepillo cervical HPV BD Onclarity), BD SurePath Preservative Fluid (Líquido conservante BD SurePath) y PreservCyt Solution (Solución PreservCyt) (utilizando una alícuota que se retira antes o después del procesamiento para las pruebas de Papanicolau BD SurePath o ThinPrep). BD Onclarity HPV Assay se realiza con el BD Viper LT System. RESUMEN Y EXPLICACIÓN El papilomavirus humano (HPV) es el virus de transmisión sexual más común en el mundo. El 50 % de las personas sexualmente activas del mundo tienen HPV genital en algún momento de sus vidas. A menudo, las personas no saben que están infectadas y no toman precauciones para evitar la transmisión del virus a otras personas. Existen más de 40 tipos de HPV que pueden infectar el tracto gh enital1. En muchos casos, las infecciones por HPV son transitorias, ya que el cuerpo es capaz de eliminar el virus por sí solo. No obstante, en algunos casos el virus es persistente y provoca que las células normales se vuelvan anómalas, lo cual da lugar a un cáncer. Estos tipos de HPV oncogénicos están clasificados como de alto riesgo e incluyen HPV 16 y 18. Otros tipos se consideran de bajo riesgo, puesto que no parecen causar cáncer. Según los datos de la Organización Mundial de la Salud (OMS), el HPV es la segunda causa principal de mortalidad femenina por cáncer, con unas 250.000 muertes aproximadamente al año. Solo en Europa, la enfermedad provoca unas 15.000 muertes al año2. Se estima que cerca del 70 % de los cánceres de cuello uterino se deben a los tipos de HPV 16 y 183. Actualmente, las pruebas de Papanicolau pueden informar a los médicos si existen cambios en las células del cuello uterino. Si las células son anómalas, se puede realizar una prueba para determinar si los cambios en las células del cuello uterino se deben a una cepa de HPV que pueda dar lugar a un cáncer de cuello uterino. No todos los análisis moleculares pueden distinguir entre los distintos tipos de HPV. Cuando se utiliza con BD Viper LT System, BD Onclarity HPV Assay es un análisis de ADN amplificado para la detección cualitativa de los tipos de alto riesgo de papilomavirus humano (HPV). El análisis detecta los tipos de HPV 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 y 68, y permite identificar simultáneamente los tipos de alto riesgo 16, 18, 31, 45, 51, 52 y otros genotipos de alto riesgo informados por grupo de genotipos (P1: 33/58; P2: 56/59/66; P3: 35/39/68). Las muestras del cuello uterino que se pueden analizar con BD Onclarity HPV Assay incluyen BD SurePath Preservative Fluid (utilizando una alícuota que se retira antes o después de procesar la prueba de Papanicolau BD SurePath), PreservCyt Solution (utilizando una alícuota que se retira antes o después de procesar la prueba de Papanicolau PreservCyt) y BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit. PRINCIPIOS DEL PROCEDIMIENTO BD Onclarity Human Papillomavirus (HPV) Assay está diseñado para usarlo con BD SurePath Preservative Fluid (utilizando una alícuota que se retira antes o después de procesar la prueba de Papanicolau BD SurePath), PreservCyt Solution (utilizando una alícuota que se retira antes o después de procesar la prueba de Papanicolau PreservCyt) y BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit, los reactivos aplicables, BD Viper LT System y BD FOX Extraction. Las muestras se someten a una fase de precalentamiento en el BD Pre-warm Heater (Bloque térmico de calentamiento BD) con el fin de homogeneizar la matriz, lisar las células y liberar el ADN adecuado para extraerlo y amplificarlo. Después de que se enfrían, las muestras se cargan en BD Viper LT System, que ejecuta a continuación todos los pasos del proceso de extracción y amplificación del AND diana, sin que sea necesaria ninguna otra intervención del usuario. La muestra se transfiere a un tubo de extracción que contiene partículas de óxido férrico en una película soluble. Después, se añade un ácido para reducir el pH e inducir la carga positiva del óxido férrico que, como consecuencia, se une al ADN con carga negativa. Seguidamente, las partículas y el ADN ligado son atraídos hacia los laterales del tubo de extracción mediante imanes y la muestra tratada se aspira y se desecha. A continuación, se lavan las partículas y se añade un tampón de elución de pH elevado para eluir el ADN purificado. Finalmente, se utiliza un tampón de neutralización para ajustar el pH del eluato hasta el valor óptimo para amplificación del ADN. BD Onclarity HPV Assay se basa en la amplificación y detección simultáneas de ADN diana utilizando cebadores de amplificación y sondas detectoras marcadas con fluorescencia utilizando la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) en tiempo real. Los reactivos están deshidratados en tres tubos (G1, G2 y G3) aptos para detectar los 14 genotipos del HPV y un control interno derivado de la muestra que consiste en un fragmento de ADN del gen de la beta globina humana. Cada uno de los tubos contiene los cebadores de amplificación, sondas de detección marcadas con fluorescencia, ADN polimerasa, nucleótidos y otros reactivos necesarios para la amplificación de los análisis respectivos. BD Viper LT System pipetea una parte de la solución de ADN purificado de cada tubo de extracción en los tres tubos BD Onclarity HPV PCR (G1, G2 y G3) que, a continuación, se sellan para evitar contaminaciones. La presencia o ausencia del ADN del HPV se determina mediante el ciclo de PCR, en el cual la señal supera un umbral establecido previamente. Además, el análisis extrae, amplifica y detecta un fragmento del gen de la beta globina humana como control interno para evaluar el procesamiento, la extracción y la amplificación de la muestra. REACTIVOS Y MATERIALES SUMINISTRADOS: Cada BD Onclarity HPV Assay Reagent Pack (Paquete de reactivos para BD Onclarity HPV Assay) contiene: Tubos BD Onclarity HPV G1 PCR, 2 x 96: cada tubo de PCR G1 contiene aproximadamente 32,5 pmol de oligonucleótidos, 20 pmol de sondas de detección marcadas con fluorescencia, 80 nmol de dNTP y 0,52 unidades de ADN polimerasa con estabilizantes y otros componentes de tampón. 64 Tubos BD Onclarity HPV G2 PCR, 2 x 96: cada tubo PCR G2 contiene aproximadamente 42,5 pmol de oligonucleótidos, 30 pmol de sondas de detección marcadas con fluorescencia, 80 nmol de dNTP y 0,52 unidades de ADN polimerasa con estabilizantes y otros componentes de tampón. Tubos BD Onclarity HPV G3 PCR, 2 x 96: cada tubo de PCR G3 contiene aproximadamente 42,5 pmol de oligonucleótidos, 25 pmol de sondas de detección marcadas con fluorescencia, 80 nmol de dNTP y 0,52 unidades de ADN polimerasa con estabilizantes y otros componentes de tampón. NOTA: CADA BOLSA CONTIENE UNA BOLSA CON SECANTE. Control Set for the BD Onclarity HPV Assay (Juego de controles para BD Onclarity HPV Assay): 24 BD Onclarity HPV Positive Control Tubes (tubos de control positivo de HPV BD Onclarity) que contienen aproximadamente 14.430 copias de plásmidos linealizados HPV 16, 8.325 copias de plásmidos linealizados HPV 18, 8.418 copias de plásmidos linealizados HPV 56 y 3.885 copias de un plásmido que contiene una secuencia de gen de la beta globina humana en un ácido nucleico portador, y 24 BD Onclarity HPV Negative Control Tubes (tubos de control negativo de HPV BD Onclarity) que contienen ácido nucleico portador únicamente. Las concentraciones del ácido nucleico portador y los plásmidos se determina mediante espectrofotometría. BD Onclarity HPV Liquid Based Cytology Specimen (LBC) Diluent Tubes (Tubos de diluyente para BD Onclarity HPV LBC): 400 tubos. Cada uno de ellos contiene aproximadamente 1,7 mL de tampón con sal, detergente y conservante. BD FOX PCR Extraction Tubes (Tubos de extracción): 48 tiras de 8 tubos, cada uno de ellos con 10 mg aproximadamente de óxido de hierro en una película soluble. BD Viper PCR Extraction Reagent Trough with Piercing Tool (Cubeta de reactivo de extracción con herramienta de perforación): cada cubeta de reactivo de extracción de 5 cavidades contiene aproximadamente 16,5 mL de ácido de fijación, 72,5 mL de tampón de lavado, 25,4 mL de tampón de elución, 19,4 mL de tampón de neutralización con conservante y 15,5 mL de solución de neutralización de residuos. INSTRUMENTO, EQUIPO Y MATERIALES Materiales suministrados: BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit, BD Viper LT Instrument, BD Viper LT Instrument Plates, BD Viper LT Pipette Tips, BD Viper LT Solid Waste Liners, BD Viper LT System PCR Tube/Tray Kit, BD Viper LT System PCR Accessory Kit (Kit de accesorios), BD Viper Pre-warm Heater, BD Viper LT Specimen Rack (Gradilla de muestras), BD Viper Neutralization Pouches (Bolsas de neutralización), tubos de muestras y tapones para usar en BD Viper System (modo de extracción), BD ProbeTec Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae (CT/GC) Amplified DNA Assay Endocervical Specimen Collection and DRY TRANSPORT Kit. Materiales necesarios pero no suministrados: Guantes de nitrilo, pipetas de desplazamiento, puntas resistentes a los aerosoles de polipropileno para 0,5 ± 0,05 mL, agitador vórtex, hipoclorito sódico 0,5 % (v/v), hipoclorito sódico 1 % (v/v), peróxido de hidrógeno 3 % (p/v), alcohol isopropílico, agua libre de nucleasas de grado para biología molecular. Requisitos de conservación y manipulación: Los diluyentes BD Onclarity HPV LBC Diluent y BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent se deben almacenar a 2 – 25 °C. Todos los demás reactivos pueden almacenarse a una temperatura de 2 – 33 °C. Los juegos de reactivos sin abrir son estables hasta la fecha de caducidad. Una vez abierta una bolsa, los tubos de PCR son estables durante 4 semanas si se cierran de manera apropiada o hasta la fecha de caducidad, lo que suceda antes. No congelar. ADVERTENCIAS Y PRECAUCIONES 1. Para uso diagnóstico in vitro. 2. En las muestras clínicas puede haber microorganismos patógenos, como los virus de la hepatitis y el virus de la inmunodeficiencia humana. Para la manipulación de todos los elementos contaminados con sangre u otros líquidos corporales deben seguirse las “Precauciones estándar”4-7 y las directrices del centro. Para conocer las advertencias, precauciones y notas adicionales específicas de BD Viper LT, consultar el Manual del usuario del sistema BD Viper LT. Muestras: 3. Para las muestras de citología en líquido, utilice únicamente tubos de diluyente BD Onclarity HPV LBC. 4. Para muestras de cepillo cervical, utilice solo el BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit. 5. Para lograr un rendimiento óptimo del BD Onclarity HPV Assay es necesario realizar una recogida, una manipulación y un transporte correctos de las muestras. 6. Para reducir hemorragias innecesarias, no gire el cepillo cervical más de lo necesario durante la recogida de muestras. 7. Cada muestra debe entregarse al laboratorio correctamente identificada mediante una etiqueta. 8. Al romper el vástago del cepillo cervical, tenga cuidado de evitar salpicaduras o derrames y de generar aerosoles. Evite la contaminación del cabezal del cepillo cervical. 9. Durante la manipulación de las muestras, es preciso extremar las precauciones para evitar la contaminación cruzada. Es preciso asegurarse de que los recipientes de muestras no entran en contacto unos con otros y de que los materiales utilizados se desechan sin pasarlos por encima de otros recipientes abiertos. Si los guantes entran en contacto con muestras, deben reemplazarse para evitar la contaminación cruzada. 10. Si se dispensa una cantidad excesiva o insuficiente de muestra de LBC en el tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC, esto puede afectar al funcionamiento del análisis. Además, dispensar un volumen excesivo puede provocar que el líquido se derrame sobre la superficie del sistema BD Viper LT, lo que a su vez puede causar contaminación. 11. Las muestras cervicales se deben recoger y analizar antes de la fecha de caducidad del tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC o del tubo de diluyente BD Onclarity HPV Cervical Brush. 12. Utilizar únicamente puntas de pipeta de polipropileno resistentes a aerosoles para transferir muestras a los tubos de diluyente BD Onclarity HPV LBC. Análisis/reactivo: 13. Los controles positivos y negativos de BD Onclarity HPV se deben templar con 24 horas de antelación antes de hidratarlos. 65 14. En el sistema BD Viper LT, utilizar exclusivamente tubos de muestra y de control con tapón perforable. No quitar los tapones perforables antes de poner en marcha el instrumento. Asegurarse de sustituir los tapones ya perforados por nuevos tapones perforables antes de utilizar el instrumento. 15. No intercambiar ni mezclar reactivos de equipos que tengan números de lote diferentes. 16. No analizar el tubo de diluyente BD Onclarity HPV Cervical Brush si se recibe en el laboratorio sin el cepillo correspondiente. De hacerlo, podría producirse un resultado falso negativo del análisis. 17. Utilizar exclusivamente las puntas de pipeta BD Viper LT tal como las suministra BD con el sistema BD Viper LT. 18. BD Viper PCR Extraction Reagent Trough with Piercing Tool PELIGRO H314 Provoca quemaduras graves y lesiones oculares graves. H302 Nocivo en caso de ingestión. P260 No respirar el polvo/el humo/el gas/la niebla/los vapores/el aerosol. P280 Llevar guantes/prendas/gafas/ máscara de protección. P303/361/353 EN CASO DE CONTACTO CON LA PIEL (o el pelo): Quitarse inmediatamente las prendas contaminadas. Aclararse la piel con agua/ducharse. P304/340 EN CASO DE INHALACIÓN: Transportar a la víctima al exterior y mantenerla en reposo en una posición confortable para respirar. P405 Guardar bajo llave. P501 Eliminar el contenido/el recipiente de conformidad con las normativas locales, regionales, nacionales e internacionales. 19. Utilizar exclusivamente BD Viper Clear Plate Sealers (cierres herméticos transparentes de placas BD Viper LT) en los tubos de PCR con BD Viper LT System. 20. Las bolsas de reactivos que contengan tubos de PCR sin utilizar, SE DEBEN volver a cerrar herméticamente después de abrirlas. Es preciso verificar la presencia de un agente deshidratante antes de volver a cerrar herméticamente las bolsas de reactivos. 21. Los tubos de PCR SE DEBEN sellar correctamente con BD Viper LT Clear Plate Sealers antes de sacar la placa de BD Viper LT System. El cierre hermético garantiza una reacción cerrada para amplificación y detección y es necesario para evitar la contaminación del instrumento y del área de trabajo con productos de amplificación. No retirar el material de cierre hermético de los tubos de PCR en ningún momento. 22. Para evitar la contaminación del entorno de trabajo con productos de amplificación, deben utilizarse las bolsas de desechos suministradas con el BD Viper LT System PCR Accessory Kit (Kit de accesorios para PCR de BD Viper LT System) para desechar los tubos de PCR analizados. Antes de desechar las bolsas es preciso asegurarse de que están correctamente cerradas. 23. Aunque no se requieren áreas de trabajo específicas, ya que el diseño del BD Viper LT reduce la posibilidad de contaminación con productos de amplificación en el entorno de análisis, es preciso observar otras precauciones para controlar la contaminación, especialmente para evitar la contaminación de las muestras durante su procesamiento. 24. Si los guantes entran en contacto con muestras o parecen estar húmedos, ES PRECISO SUSTITUIRLOS para evitar la contaminación de otras muestras. Los guantes deben cambiarse antes de salir del área de trabajo y al entrar en ella. 25. En caso de contaminación, consulte las instrucciones de limpieza en el Manual del usuario de BD Viper LT System. 26. Póngase en contacto con el representante local de BD en caso de que se produzca una situación inusual, como un derrame en el instrumento BD Viper LT o contaminación por ADN que no pueda eliminarse mediante los procedimientos de limpieza. RECOGIDA Y TRANSPORTE DE LAS MUESTRAS Las muestras del cuello uterino que se pueden analizar con BD Onclarity HPV Assay incluyen BD Onclarity HPV Cervical Brush Collection Kit, BD SurePath Preservative Fluid (utilizando una alícuota que se retira antes o después de procesar la prueba de Papanicolau BD SurePath) y PreservCyt Solution (utilizando una alícuota que se retira antes o después de procesar la prueba de Papanicolau ThinPrep). Para los envíos dentro de Estados Unidos e internacionales, las muestras deben etiquetarse en cumplimiento de la normativa estatal, federal e internacional aplicable al transporte de muestras clínicas y agentes etiológicos/sustancias infecciosas. Durante el transporte, deberán mantenerse las condiciones de tiempo y temperatura aplicables al almacenamiento. RECOGIDA DE MUESTRAS DE CEPILLO CERVICAL 1. Insertar el BD Onclarity HPV Cervical Brush en el endocérvix hasta que solo las cerdas del extremo inferior queden visibles en el orificio cervical externo. Girar lentamente de ¼ a ½ vuelta en un sentido. Para reducir hemorragias innecesarias, no gire el cepillo más de lo necesario. 2. Quitar el tapón del tubo de diluyente BD Onclarity HPV Cervical Brush e introducir inmediatamente el cepillo en la parte inferior del tubo. 3. Romper con cuidado el vástago por la línea indicada. Evitar salpicaduras del contenido. 4. Volver a cerrar con fuerza el tubo. ALMACENAMIENTO Y TRANSPORTE DE MUESTRAS DE CEPILLO CERVICAL Las muestras de cepillo cervical en tubos de diluyente BD Onclarity HPV Cervical Brush deben almacenarse y transportarse al laboratorio o centro de análisis en el plazo de 30 días tras la recogida en caso de que se hayan mantenido a 2 – 30 °C, o en el plazo de 30 días tras la recogida si se han mantenido congeladas a -20 °C. Nunca se deberá realizar el almacenamiento y el transporte de las muestras después de la fecha de caducidad del tubo de diluyente para cepillo cervical. 66 RECOGIDA DE MUESTRAS LBC Las muestras de BD SurePath o PreservCyt deben recogerse con una escoba endocervical o una combinación de cepillo y espátula, tal y como se describe en el correspondiente prospecto BD SurePath o PreservCyt. Una vez recogidas, las muestras de BD SurePath o PreservCyt se pueden conservar y transportar en los frascos originales a 2 – 30 °C durante 30 días O 30 días si se congelan a -20 °C antes de la transferencia a los tubos de BD Onclarity HPV LBC Specimen Diluent (tubos de dilución de muestras de BD Onclarity HPV LBC). ALMACENAMIENTO Y TRANSPORTE DE LAS MUESTRAS LBC Transferencia de la muestra a los tubos de diluyente BD Onclarity HPV LBC: antes o después de eliminar una alícuota para procesar mediante las pruebas BD SurePath o ThinPrep. Antes de procesar cualquier prueba de Papanicolau BD SurePath o ThinPrep, se debe transferir manualmente una parte alícuota de 0,5 mL de la muestra BD SurePath o PreservCyt del vial original al tubo de dilución de muestras BD Onclarity HPV LBC. Usar guantes para manipular el tubo de dilución de muestras BD Onclarity HPV LBC y el vial de muestras BD SurePath o PreservCyt. Si los guantes entran en contacto con la muestra, cámbielos inmediatamente para evitar que se contaminen otras muestras. Transferencia de muestras BD SurePath antes o después de procesarlas para realizar la prueba BD SurePath NOTA: Refer to the BD PrepStain™ Slide Processor or BD Totalys™ SlidePrep Product Insert for instructions on removing an aliquot from the BD SurePath specimen vial prior to performing the BD SurePath liquid-based Pap test. NOTA: procese una muestra cada vez. 1. Etiquete un tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC con los datos de identificación de la paciente. 2. Retire el tapón del tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC. 3. Para garantizar una mezcla homogénea, agite en vórtex el frasco de la muestra BD SurePath durante 10 – 20 segundos. 4. Utilizando una punta resistente a aerosoles, transfiera rápidamente 0,5 mL del frasco de la muestra al tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC antes de que transcurra un minuto después de agitarla. 5. Deseche la punta de la pipeta. NOTA: hay que utilizar una punta de pipeta distinta para cada muestra. 6. Ajuste bien el tapón en el tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC. 7. Invierta el tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC 3 – 4 veces para asegurarse de que la muestra y el diluyente se mezclan bien. Transferencia de muestras PreservCyt antes o después de procesarlas para realizar la prueba de Papanicolaou ThinPrep NOTA: en el Apéndice del Manual del operador del sistema ThinPrep 2000/3000 encontrará instrucciones para retirar una parte alícuota del frasco de muestras PreservCyt antes de realizar la prueba ThinPrep. NOTA: procese una muestra cada vez. 1. Etiquete un tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC con los datos de identificación de la paciente. 2. Retire el tapón del tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC. 3. Para garantizar una mezcla homogénea, agite en vórtex el frasco de la muestra PreservCyt a alta velocidad durante 8 – 12 segundos. 4. Utilizando una punta resistente a aerosoles, transfiera inmediatamente 0,5 mL del frasco de la muestra al tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC. 5. Deseche la punta de la pipeta. NOTA: hay que utilizar una punta de pipeta distinta para cada muestra. 6. Ajuste bien el tapón en el tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC. 7. Invierta el tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC 3 – 4 veces para asegurarse de que la muestra y el diluyente se mezclan bien. Almacenamiento y transporte de muestras transferidas a los tubos de dilución de muestras BD HPV LBC Después de la transferencia manual al tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC, la muestra diluida se puede almacenar a 2 – 30 °C durante hasta 15 días, o hasta 30 días si se almacena a -20 °C. PROCEDIMIENTO DE PROCESAMIENTO PARA TODAS LAS MUESTRAS NOTA: si las muestras estaban congeladas, es preciso verificar que están completamente descongeladas y mezcladas por inversión antes de iniciar el procedimiento. 1. Con la ayuda del Tube Layout Report (Informe de disposición de los tubos), coloque las muestras en orden en la gradilla de muestras BD Viper LT Specimen Rack y fije su posición. 2. Las muestras ya están listas para ser precalentadas. 3. Deben cambiarse los guantes antes de continuar para evitar la contaminación. PREPARACIÓN DE LOS CONTROLES DE CALIDAD 1. Quite el tapón de un BD Onclarity HPV Negative Control y de un tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC. 2. Vierta la totalidad del contenido del tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC en el BD Onclarity HPV Negative Control. 3. Vuelva a tapar el BD Onclarity HPV Negative Control rehidratado. Vuelva a tapar el tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC vacío y deséchelo. 4. Quite el tapón de un BD Onclarity HPV Positive Control y de un tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC. 5. Vierta la totalidad del contenido del tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC en el BD Onclarity HPV Positive Control. 67 6. Vuelva a tapar el BD Onclarity HPV Positive Control rehidratado. Vuelva a tapar el tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC vacío y deséchelo. 7. Con la ayuda del Tube Layout Report (Informe de disposición de los tubos), coloque el BD Onclarity HPV Negative Control rehidratado en la posición correspondiente de la gradilla de muestras BD Viper LT Specimen Rack. 8. Con la ayuda del informe de disposición de los tubos, coloque el BD Onclarity HPV Positive Control rehidratado en la posición correspondiente de la gradilla de muestras BD Viper LT Specimen Rack. 9. Ahora, los controles están listos para ser precalentados junto a las muestras. NOTA: Los controles se deben precalentar durante las 24 horas de la hidratación. PROCEDIMIENTO DE PRECALENTAMIENTO NOTA: el procedimiento de precalentamiento debe aplicarse una sola vez a todas las muestras para garantizar la homogeneidad de la matriz de las muestras antes de cargarlas en el sistema BD Viper LT. El hecho de no precalentar las muestras puede afectar negativamente al rendimiento de BD Onclarity HPV Assay o de BD Viper LT System. NOTA: las muestras refrigeradas o congeladas deben templarse totalmente a temperatura ambiente antes de proceder a precalentarlas. 1. Inserte la gradilla de muestras BD Viper LT Specimen Rack en el bloque térmico de precalentamiento BD Pre-warm Heater y seleccione el protocolo de precalentamiento de BD Onclarity HPV Assay en el instrumento BD Viper LT. 2.El BD Pre-warm Heater precalentará automáticamente las muestras y los controles conforme al protocolo de precalentamiento de BD Onclarity HPV Assay. 3. Una vez que se haya completado el protocolo de precalentamiento de BD Onclarity HPV Assay, quite la gradilla del bloque térmico y cárguela en el instrumento BD Viper LT. 4. Consulte la sección Procedimiento de análisis para analizar las muestras y los controles. 5. Una vez precalentadas, las muestras pueden conservarse durante hasta 7 días a 2 – 30 °C o durante hasta 30 días a –20 °C sin necesidad de precalentarlas de nuevo antes del análisis en BD Viper LT System. 6. Después del precalentamiento, los controles se pueden conservar durante hasta 24 h a 2 – 30 °C sin necesidad de ningún precalentamiento adicional en el BD Viper LT System. PROCEDIMIENTO DE ANÁLISIS Consulte el manual del usuario de BD Viper LT System para obtener instrucciones específicas sobre la utilización y el mantenimiento de los componentes del sistema. Se comprobó que las condiciones ambientales óptimas para el análisis de HPV 18 - 27 °C con una humedad relativa del 20 - 85 %. CONTROL DE CALIDAD El control de calidad debe llevarse a cabo de conformidad con la normativa local y/o nacional aplicable, los requisitos de los organismos de acreditación y los procedimientos estándar de control de calidad del laboratorio. Se recomienda consultar las instrucciones pertinentes del CLSI y la normativa de la CLIA para obtener información acerca de las prácticas adecuadas de control de calidad. El Control Set for the BD Onclarity HPV Assay se suministra por separado. En cada serie de análisis y para cada nuevo número de lote de kit de reactivos debe incluirse un control positivo y un control negativo. Los controles deben colocarse según se indica en el manual del usuario del BD Viper LT System. El control positivo HPV únicamente un posible fallo sustancial del reactivo. El control negativo de HPV controla la contaminación por reactivos y la contaminación ambiental. Además, es posible analizar controles adicionales según las directrices o los requisitos establecidos por la normativa local y/o nacional aplicable o por los organismos de acreditación competentes. Información general de control de calidad de BD Viper LT System: La ubicación de los tubos de PCR se muestra en el monitor LCD, en una pantalla que refleja la disposición de las placas mediante un código de colores. El símbolo más (+) en un tubo indica que se trata de una muestra de control de calidad positiva. A su vez, el símbolo menos (-) en un tubo indica que se trata de una muestra de control de calidad negativa. Debe registrarse un par para control de calidad por cada número de lote de kit de reactivos. Si el par de controles de calidad no se ha registrado correctamente, aparece una cuadro de mensaje que impide al usuario guardar la gradilla y proseguir con el procesamiento mientras no se haya completado este paso. Es posible registrar tubos adicionales (opcionales) para control de calidad. Estos tubos se analizan como muestras normales y no afectan al estado Pasó/Fallido de la serie. Consulte las instrucciones en el Manual del usuario de BD Viper LT System. NOTA: Los controles de HPV BD Onclarity deben hidratarse manualmente antes de cargarlos en la gradilla para muestras BD Viper LT Specimen Rack. Interpretación de los resultados de los controles de calidad: Los controles BD Onclarity HPV Positive Control y BD Onclarity HPV Negative Control deben dar un resultado de análisis positivo y negativo respectivamente para poder obtener resultados del paciente. Si los controles no presentan el comportamiento previsto, la serie de análisis se considera no válida y el instrumento no genera un informe de los resultados del paciente. Si uno de los dos controles no ofrece los resultados previstos, repita la serie completa utilizando un juego de controles, tubos de extracción, una cubeta de reactivo de extracción y tubos de PCR nuevos. Si el problema no se resuelve, póngase en contacto con su representante local de BD para obtener más información. 68 Tabla 1: Interpretación de los resultados de los controles de calidad Tipo de control BD Onclarity HPV Positive Control Símbolo del Tube Result Report (Informe de resultados de los tubos) OK esultado del control de calidad (QC) QC correcto BD Onclarity HPV Positive Control QC incorrecto BD Onclarity HPV Positive Control QC incorrecto BD Onclarity HPV Positive Control QC incorrecto BD Onclarity HPV Negative Control OK QC correcto BD Onclarity HPV Negative Control QC incorrecto BD Onclarity HPV Negative Control QC incorrecto BD Onclarity HPV Negative Control QC incorrecto Consulte la sección Interpretación de los resultados para obtener una descripción de los diversos símbolos del Tube Result Report (Informe de resultados de los tubos). INTERPRETACIÓN DE LOS RESULTADOS DEL ANÁLISIS BD Onclarity HPV Assay utiliza la reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real para detectar la presencia del papilomavirus humano (HPV) en muestras clínicas. El software de BD Viper LT realiza todos los cálculos automáticamente. La presencia o ausencia del ADN del HPV clínicamente relevante se determina mediante el ciclo de PCR (Ct), en el cual la señal supera un umbral establecido previamente. El análisis extrae, amplifica y detecta un fragmento del gen de la beta globina humana como control interno para evaluar el procesamiento, la extracción y la amplificación de la muestra, así como para indicar la presencia de inhibidores de la PCR. A su vez, si la señal específica de HPV es mayor que un umbral de ciclo, el algoritmo utiliza el control interno para interpretar el resultado. Si la señal específica de HPV es menor o igual que un umbral de ciclo, el algoritmo ignora el control interno. Para muestras con HPV, aparece un resultado “HR” (combinación de todos los genotipos) en el Tube Results Report (Informe de resultados de los tubos). Un símbolo positivo en esta columna indica que uno o más de los genotipos de HPV que el análisis es capaz de detectar da un resultado positivo. La columna “GT” se utiliza para informar de resultados de genotipos que no están disponibles en su región. Estos resultados no se pueden adquirir. Los genotipos específicos y los genotipos combinados aparecen en columnas. Si se han comprado los resultados de un genotipo, los resultados se indican en el informe tal como se describe a continuación. Si hay algún resultado de algún genotipo que no se haya configurado para compra automática, estos resultados aparecen enmascarados con un icono de “llave”. El instrumento se puede configurar para comprar/informar de genotipos específicos después de completar la serie. Consulte las instrucciones para autorizar el informe de genotipado automático en el Manual del usuario de BD Viper LT System. Si los controles del análisis no ofrecen los resultados previstos, no se obtienen resultados del paciente. Consulte la sección Control de calidad para conocer los valores de control previstos. Los resultados comunicados se determinan de la siguiente manera. Tabla 2: Interpretación de los resultados de las pruebas de genotipo de HPV para HPV de alto riesgo con BD Onclarity HPV Assay Resultado de HPV de alto riesgo HR HR Interpretación Resultado Positivo para tipos de HPV de alto riesgo Positivo HPV AR Negativo para tipos de HPV de alto riesgo Negativo HPV AR No es posible detectar ADN de HPV, si lo hay Fallo en el control interno No es posible detectar ADN de HPV, si lo hay Fallo de transferencia de extracción No es posible detectar ADN de HPV, si lo hay Fallo de nivel de líquido No es posible detectar ADN de HPV, si lo hay Error 69 Tabla 3: Interpretación de los resultados de las pruebas de genotipo de HPV específico con BD Onclarity HPV Assay Resultado del genotipo de HPV 16 16 18 18 45 45 P1 P1 31 31 P2 P2 51 51 52 52 P3 P3 GT GT -- Interpretación Resultado Negativo para HPV tipo 16 Positivo para HPV tipo 16 Negativo para HPV tipo 16 Negativo para HPV tipo 16 Negativo para HPV tipo 18 Positivo para HPV tipo 18 Negativo para HPV tipo 18 Negativo para HPV tipo 18 Negativo para HPV tipo 45 Positivo para HPV tipo 45 Negativo para HPV tipo 45 Negativo para HPV tipo 45 Positivo para HPV tipos 33 y/o 58 Positivo para HPV tipo 33 y/o 58 Negativo para HPV tipos 33 y/o 58 Negativo para HPV tipo 33 y/o 58 Negativo para HPV tipo 31 Positivo para HPV tipo 31 Negativo para HPV tipo 31 Negativo para HPV tipo 31 Positivo para HPV tipos 56, 59 y/o 66 Positivo para HPV tipo 56, 59 y/o 66 Negativo para HPV tipos 56, 59 y/o 66 Negativo para HPV tipo 56, 59 y/o 66 Negativo para HPV tipo 51 Positivo para HPV tipo 51 Negativo para HPV tipo 51 Negativo para HPV tipo 51 Negativo para HPV tipo 52 Positivo para HPV tipo 52 Negativo para HPV tipo 52 Negativo para HPV tipo 52 Positivo para HPV tipos 35, 39 y/o 68 Positivo para HPV tipo 35, 39 y/o 68 Negativo para HPV tipos 35, 39 y/o 68 Negativo para HPV tipo 35, 39 y/o 68 Resultados positivos de genotipo de HPV no disponibles en su región Resultados negativos de genotipo de HPV no disponibles en su región El resultado del genotipo de HPV está disponible para la compra Resultados positivos de genotipo de HPV restringido Resultados negativos de genotipo de HPV restringido El resultado del genotipo de HPV no está disponible para la compra El resultado del genotipo está bloqueado Resultado negativo para, fallo del control interno, fallo del nivel de líquido o fallo en la transferencia de extracción Control de la presencia de contaminación por ADN Al menos una vez al mes, debe realizarse el siguiente procedimiento de análisis para verificar que tanto el área de trabajo como las superficies de los equipos no están contaminadas por ADN. El control ambiental es esencial para detectar la posible contaminación antes de que se produzca un problema. 1. En cada zona que se vaya a analizar, utilice una torunda de recogida limpia de BD ProbeTec Chlamydia trachomatis/ Neisseria gonorrhoeae (CT/GC) Amplified DNA Assay Endocervical Specimen Collection and DRY TRANSPORT kit. 2. Vierta un poco de agua libre de nucleasas de grado para biología molecular en un recipiente limpio pequeño. 3. Sumerja la torunda en el agua libre de nucleasa de grado para biología molecular y frote primero la zona con un movimiento amplio de barrido. 4. Quite el tapón de un tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC e inserte la torunda en el diluyente. Mezcle girando la torunda en el tubo de diluyente BD Onclarity HPV durante 5 – 10 s. 5. Exprima la torunda en la pared interior del tubo de forma que el líquido discurra hacia la parte inferior del tubo. 6. Extraiga con cuidado la torunda del tubo de diluyente BD Onclarity HPV para evitar salpicaduras. Desechar la torunda. 7. Vuelva a tapar firmemente el tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC con el tapón perforable negro. 8. Repita el proceso para cada área que desee analizar. 9. Una vez que haya recogido y escurrido todas las torundas, procéselas siguiendo sucesivamente los procedimientos de precalentamiento y de análisis. Consulte el Manual del usuario de BD Viper LT System para obtener más información sobre el control ambiental y los procedimientos de limpieza. Si un acontecimiento de contaminación no desaparece, póngase en contacto con el representante local de BD para obtener información adicional. LIMITACIONES DEL PROCEDIMIENTO 1. El rendimiento óptimo del análisis requiere una recogida y una preparación apropiadas de las muestras. Consulte la sección “Recogida y transporte de las muestras” de este prospecto. 2. Un resultado negativo del análisis no excluye la posibilidad de infección, ya que los resultados del análisis pueden verse afectados por una recogida inadecuada de la muestra, errores técnicos, la mezcla de muestras o el número de microorganismos presentes en la muestra, que puede ser inferior al límite de sensibilidad del análisis. 3. BD Onclarity HPV Assay proporciona resultados cualitativos. 70 4. El uso de los análisis BD Onclarity HPV Assay está limitado a personal debidamente formado en el procedimiento de análisis y el uso de BD Viper LT System. CARACTERÍSTICAS DE RENDIMIENTO Se recogieron muestras de BD Onclarity HPV Cervical Brush, BD SurePath o PreservCyt de 836 mujeres que cumplían con el protocolo y que se remitieron para seguimiento debido a pruebas de Papanicolau anómalas o infección por HPV, o bien mujeres que acudieron a una clínica para realizar controles rutinarios en dos centros clínicos geográficamente distintos situados en Europa. De cada sujeto participante se recogieron dos muestras en el orden siguiente: una muestra BD SurePath (centro A) o una muestra PreservCyt (centro B) y una muestra BD Onclarity HPV Cervical Brush (transportada en un tubo de diluyente BD Onclarity HPV Cervical Brush). De cada vial de citología recogido, se introdujo una alícuota de 0,5 mL en un tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC. Para la mayoría de las muestras se dispuso de resultados de citología, ADN de HPV DNA (digene Hybrid Capture 2 (hc2) High-Risk HPV DNA Test) y Roche LINEAR ARRAY HPV Genotyping Test (RLA). De la mayoría de sujetos que acudieron a una clínica de alto riesgo, se dispuso de resultados de histología. Cada centro también aportó muestras residuales (BD SurePath o PreservCyt) con resultados asociados de citología, resultados de ADN de HPV (digene Hybrid Capture 2 High-Risk HPV DNA Test), resultados de Roche LINEAR ARRAY HPV Genotyping Test y, en caso que fuesen pertinentes, resultados de histología. De cada muestra participante, se introdujo una alícuota de 0,5 mL en un tubo de diluyente BD Onclarity HPV LBC. Se incorporaron 510 muestras que cumplían con los requisitos, con resultados de histología disponibles para 234 mujeres. Todas las muestras se analizaron en BD Viper LT System conforme a las instrucciones del prospecto del envase del análisis y del manual del usuario. Para cada tipo de medio, se calcularon la sensibilidad clínica y la especificidad de la detección de la enfermedad, que se definió como (1) neoplasia intraepitelial cervical (CIN2) o resultado histológico mayor o (2) neoplasia intraepitelial cervical (CIN3) o resultado histológico mayor. El análisis de los datos finales incluye resultados de BD Onclarity HPV Assay de 472 muestras BD SurePath, 361 muestras PreservCyt y 515 muestras en total de BD Onclarity HPV Cervical Brush: 247 muestras de BD Onclarity HPV Cervical Brush (en BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent) del centro A y 268 muestras de BD Onclarity HPV Cervical Brush (en BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent) del centro B. Las estimaciones de rendimiento para la detección de enfermedad cervical de alto grado mediante los análisis BD Onclarity HPV Assay y hc2 Assay se presentan en las Tablas 4 y 5 para medios BD SurePath, en las Tablas 8 y 9 para medios PreservCyt y en las Tablas 12 y 13 para las muestras de BD Onclarity HPV Cervical Brush. Los resultados de BD Onclarity HPV Assay también se compararon con resultados de ADN de HPV obtenidos mediante los análisis Hybrid Capture 2 High-Risk HPV DNA Test y Roche LINEAR ARRAY HPV Genotyping Test (comparador compuesto). Un resultado positivo mediante los análisis hc2 y RLA (alto riesgo) se define como resultado positivo del comparador compuesto, un resultado negativo de ambos análisis hc2 y RLA (alto riesgo) se define como negativo del comparador compuesto, y si los dos análisis divergen (o no se disponen de resultados para ambos análisis), el resultado del comparador compuesto se considera no resuelto. Para cada tipo de medio se calculó el porcentaje de acuerdo positivo, negativo y global frente al comparador compuesto. El análisis de los datos finales incluye resultados de BD Onclarity HPV Assay y del comparador compuesto (independientemente del estado de la histología) procedentes de 670 muestras BD SurePath y 674 muestras PreservCyt. (Tablas 6 y 10) El riesgo absoluto de enfermedad (CIN2+ y CIN3+) en la población de estudio para cada tipo de medio se calculó para cada genotipo o grupo de genotipos en el BD Onclarity HPV Assay. Los riesgos absolutos se calculan cuando el genotipo (o grupo de genotipos) está presente, solo o en presencia de otros genotipos. Para cada tipo de medio se muestra una tabla de riesgo absoluto. Cada medio solo se recogió en un centro. Por consiguiente, se pueden esperar variaciones en las tasas de positividad por HPV y por genotipo debido a variaciones en la población. (Tablas 7 y 11) Rendimiento clínico en muestras de BD SurePath Tabla 4: Rendimiento de BD Onclarity HPV Assay con medio BD SurePath comparado con los resultados histológicos (CIN2+) BD Onclarity HPV Assay Estimación hc2 HPV DNA Test Intervalo de confianza 95% Estimación Intervalo de confianza 95% Sensibilidad 97,9 % (190/194) (94,8 %, 99,2 %) 98,4 % (190/193) (95,5 %, 99,5 %) Especificidad 22,7 % (63/278) (18,1 %, 27,9 %) 17,0 % (47/277) (13,0 %, 21,8 %) Tabla 5: Rendimiento de BD Onclarity HPV Assay con medio BD SurePath comparado con los resultados histológicos (CIN3+) BD Onclarity HPV Assay hc2 HPV DNA Test Estimación Intervalo de confianza 95% Estimación Intervalo de confianza 95% Sensibilidad 97,7% (126/129) (93,4 %, 99,2 %) 98,4 % (126/128) (94,5 %, 99,6 %) Especificidad 18,7% (64/343) (14,9 %, 23,1 %) 14,0 % (48/342) (10,8 %, 18,1 %) 71 Tabla 6: Rendimiento de BD Onclarity HPV Assay con medio BD SurePath comparado con el comparador compuesto Resultado del comparador compuesto BD Onclarity HPV Assay Positivo Negativo No resuelto* Total Positivo 532 6 27 565 Negativo 8 50 47 105 Total 540 56 74 670 Concordancia porcentual positiva (Intervalo de confianza del 95 %) Concordancia porcentual negativa (Intervalo de confianza del 95 %) Concordancia porcentual global (Intervalo de confianza del 95 %) 98,5 % (97,1 %, 99,2 %) 89,3 % (78,5 %, 95,0 %) 97,7 % (96,1 %, 98,6 %) *Los resultados de hc2 y RLA no coinciden o bien no están disponibles ambos análisis. Tabla 7: Riesgo absoluto de CIN2+ y CIN3+ para los genotipos de BD Onclarity HPV Assay en medio BD SurePath Genotipo de BD Onclarity HPV Assay Infección debida a uno o más genotipos Infección debida a un solo genotipo o grupo de genotipos Infección debida a uno o más genotipos Infección debida a un solo genotipo o grupo de genotipos Riesgo absoluto CIN2+ Intervalo de confianza 95 % Riesgo Intervalo de Riesgo Intervalo de Riesgo Intervalo de absoluto confianza absoluto confianza absoluto confianza 95 % 95 % 95 % CIN2+ CIN3+ CIN3+ HPV16 63,9 % (99/155) (56,1 %, 71,0 %) 64,9 % (48/74) (53,5 %, 74,8 %) 43,9 % (68/155) (36,3 %, 51,7 %) 47,3 % (35/74) (36,3 %, 58,5 %) HPV18 50,0 % (24/48) (36,4 %, 63,6 %) 50,0 % (7/14) (26,8 %, 73,2 %) 43,8 % (21/48) (30,7 %, 57,7 %) 42,9 % (6/14) (21,4 %, 67,4 %) HPV45 46,7 % (21/45) (32,9 %, 60,9 %) 23,5 % (4/17) (9,6 %, 47,3 %) 31,1 % (14/45) (19,5 %, 45,7 %) 17,6 % (3/17) (6,2 %, 41,0 %) HPV33/58 49,4 % (42/85) (39,0 %, 59,8 %) 47,1 % (16/34) (31,5 %, 63,3 %) 31,8 % (27/85) (22,8 %, 42,3 %) 23,5 % (8/34) (12,4 %, 40,0 %) HPV31 64,2 % (52/81) (53,3 %, 73,8 %) 72,7 % (16/22) (51,8 %, 86,8 %) 40,7 % (33/81) (30,7 %, 51,6 %) 50,0 % (11/22) (30,7 %, 69,3 %) HPV56/59/66 25,5 % (25/98) (17,9 %, 35,0 %) 0,0 % (0/29) (0,0 %, 11,7 %) 13,3 % (13/98) (7,9 %, 21,4 %) 0,0 % (0/29) (0,0 %, 11,7 %) HPV51 41,7 % (15/36) (27,1 %, 57,8 %) 25,0 % (2/8) (7,1 %, 59,1 %) 25,0 % (9/36) (13,8 %, 41,1 %) 12,5 % (1/8) (2,2 %, 47,1 %) HPV52 35,1 % (20/57) (24,0 %, 48,1 %) 33,3 % (4/12) (13,8 %, 60,9 %) 19,3 % (11/57) (11,1 %, 31,3 %) 16,7 % (2/12) (4,7 %, 44,8 %) HPV35/39/68 36,0 % (27/75) (26,1 %, 47,3 %) 33,3 % (7/21) (17,2 %, 54,6 %) 17,3 % (13/75) (10,4 %, 27,4 %) 19,0 % (4/21) (7,7 %, 40,0 %) Rendimiento clínico en muestras PreservCyt Tabla 8: Rendimiento de BD Onclarity HPV Assay con medio PreservCyt comparado con los resultados histológicos (CIN2+) BD Onclarity HPV Assay hc2 HPV DNA Test Estimación Intervalo de confianza 95 % Estimación Intervalo de confianza 95 % Sensibilidad 94,7 % (160/169) (90,2 %, 97,2 %) 97,0 % (160/165) (93,1 %, 98,7 %) Especificidad 50,5 % (97/192) (43,5 %, 57,5 %) 40,8 % (75/184) (33,9 %, 48,0 %) Tabla 9: Rendimiento de BD Onclarity HPV Assay con medio PreservCyt comparado con los resultados histológicos (CIN3+) BD Onclarity HPV Assay hc2 HPV DNA Test Estimación Intervalo de confianza 95 % Estimación Intervalo de confianza 95 % Sensibilidad 94,4 % (85/90) (87,6 %, 97,6 %) 97,7 % (85/87) (92,0 %, 99,4 %) Especificidad 37,3 % (101/271) (31,7 %, 43,2 %) 29,8 % (78/262) (24,6 %, 35,6 %) 72 Tabla 10: Rendimiento de BD Onclarity HPV Assay con medio PreservCyt comparado con el comparador compuesto Resultado del comparador compuesto BD Onclarity HPV Assay Positivo Negativo No resuelto* Total Positivo 246 5 18 269 Negativo 10 366 29 405 Total 256 371 47 674 Concordancia porcentual positiva (Intervalo de confianza del 95 %) Concordancia porcentual negativa (Intervalo de confianza del 95 %) Concordancia porcentual global (Intervalo de confianza del 95 %) 96,1 % (93,0 %, 97,9 %) 98,7 % (96,9 %, 99,4 %) 97,6 % (96,1 %, 98,5 %) * Los resultados de hc2 y RLA no coinciden o bien no están disponibles ambos análisis. Tabla 11: Riesgo absoluto de CIN2+ y CIN3+ para los genotipos de BD Onclarity HPV Assay en medio PreservCyt Genotipo de BD Onclarity HPV Assay HPV 16 HPV 18 HPV 45 HPV 33/58 HPV 31 HPV 56/59/66 HPV 51 HPV 52 HPV 35/39/68 Infección debida a uno o más genotipos Infección debida a un solo genotipo o grupo de genotipos Infección debida a uno o más genotipos Infección debida a un solo genotipo o grupo de genotipos Riesgo Intervalo de Riesgo Intervalo de Riesgo Intervalo de Riesgo Intervalo de absoluto confianza absoluto absoluto confianza confianza absoluto confianza 95 % 95 % 95 % 95 % CIN2+ CIN2+ CIN3+ CIN3+ 77,1 % (84/109) 50,0 % (12/24) 50,0 % (6/12) 70,0 % (28/40) 67,7 % (42/62) 34,0 % (18/53) 48,0 % (12/25) 73,9 % (17/23) 38,5 % (10/26) (68,3 %, 84,0 %) (31,4 %, 68,6 %) (25,4 %, 74,6 %) (54,6 %, 81,9 %) (55,4 %, 78,0 %) (22,7 %, 47,4 %) (30,0 %, 66,5 %) (53,5 %, 87,5 %) (22,4 %, 57,5 %) 81,4 % (57/70) 45,5 % (5/11) 25,0 % (1/4) 75,0 % (15/20) 71,0 % (22/31) 11,1 % (2/18) 27,3 % (3/11) 85,7 % (6/7) 40,0 % (2/5) (70,8 %, 88,8 %) (21,3 %, 72,0 %) (4,6 %, 69,9 %) (53,1 %, 88,8 %) (53,4 %, 83,9 %) (3,1 %, 32,8 %) (9,7 %, 56,6 %) (48,7 %, 97,4 %) (11,8 %, 76,9 %) 44,0 % (48/109) 29,2 % (7/24) 16,7 % (2/12) 35,0 % (14/40) 30,6 % (19/62) 9,4 % (5/53) 16,0 % (4/25) 26,1 % (6/23) 15,4 % (4/26) (35,1 %, 53,4 %) (14,9 %, 49,2 %) (4,7 %, 44,8 %) (22,1 %, 50,5 %) (20,6 %, 43,0 %) (4,1 %, 20,3 %) (6,4 %, 34,7 %) (12,5 %, 46,5 %) (6,1 %, 33,5 %) 50,0 % (35/70) 18,2 % (2/11) 0,0 (0/4) 50,0 % (10/20) 41,9 % (13/31) 0,0 % (0/18) 18,2 % (2/11) 42,9 % (3/7) 20,0 % (1/5) (38,6 %, 61,4 %) (5,1 %, 47,7 %) (0,0 %, 49,0 %) (29,9 %, 70,1 %) (26,4 %, 59,2 %) (0,0 %, 17,6 %) (5,1 %, 47,7 %) (15,8 %, 75,0 %) (3,6 %, 62,4 %) Rendimiento en muestras de BD Onclarity HPV Cervical Brush Tabla 12: Rendimiento de BD Onclarity HPV Assay con BD Onclarity HPV Cervical Brush comparado con resultados de histología (CIN2+) BD Onclarity HPV Assay Centro A B hc2 HPV DNA Test Estimación Intervalo de confianza 95 % Estimación Intervalo de confianza 95 % Sensibilidad 97,2 % (104/107) (92,1 %, 99,0 %) 99,1 % (106/107) (94,9 %, 99,8 %) Especificidad 17,9 % (25/140) (12,4 %, 25,0 %) 21,4 % (30/140) (15,4 %, 28,9 %) Sensibilidad 100,0 % (121/121) (96,9 %, 100,0 %) 97,5 % (116/119) (92,8 %, 99,1 %) Especificidad 37,4 % (55/147) (30,0 %, 45,5 %) 43,0 % (61/142) (35,1 %, 51,2 %) 73 Tabla 13: Rendimiento de BD Onclarity HPV Assay con BD Onclarity HPV Cervical Brush comparado con resultados de histología (CIN3+) BD Onclarity HPV Assay Estimación Intervalo de confianza 95 % Sensibilidad 97,3 % (72/74) Especificidad 15,0 % (26/173) Sensibilidad Especificidad Centro A B hc2 HPV DNA Test Estimación Intervalo de confianza 95 % (90,7 %, 99,3 %) 98,6 % (73/74) (92,7 %, 99,8 %) (10,5 %, 21,1 %) 17,3 % (30/173) (12,4 %, 23,7 %) 100,0 % (60/60) (94,0 %, 100,0 %) 98,3 % (57/58) (90,9 %, 99,7 %) 26,4 % (55/208) (20,9 %, 32,8 %) 31,0 % (63/203) (25,1 %, 37,7 %) Estudios analíticos Sensibilidad analítica en el valor límite clínico: El límite de detección (LdD) en el valor límite clínico de HPV se determinó para BD Onclarity HPV Assay utilizando estirpes celulares positivas por HPV: SiHa (HPV 16), HeLa (HPV 18) y MS751 (HPV 45) y ADN de plásmidos clonados con las secuencias de los genotipos de HPV siguientes: HPV 31, 33, 35, 39, 51, 52, 56, 58, 59, 66 y 68 en BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt Solution y BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent con una estirpe celular negativa por HPV (C33A). Las estirpes celulares con HPV se analizaron individualmente, mientras que los plásmidos de HPV se analizaron colectivamente en tres grupos: 1) HPV 31, 33, 51, 52 y 59; 2) HPV 56, 58, 68 y 3) HPV 35 y 66. Se analizaron como mínimo cuarenta y cinco réplicas de cada uno de los seis niveles diana para los plásmidos de HPV con un mínimo de tres lotes de reactivos y un mínimo de tres equipos BD Viper LT System. El LdD es el nivel de ADN de HPV en la muestra sin diluir que da resultados positivos por encima del valor límite clínico por lo menos un 95 % de las veces. El valor máximo de LdD para cada uno de los genotipos de HPV y medios se describe en la Tabla 14. Tabla 14: Sensibilidad analítica Diana Medio BD SurePath (Intervalo de confianza 95 %) Medio PreservCyt (Intervalo de confianza 95 %) BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent (Intervalo de confianza 95 %) SiHa (HPV 16) células/mL 1584 (1276 – 1962) 1835 (1426 – 2358) 137 (131 – 144) HeLa (HPV 18) células/mL 915 (739 – 1131) 1786 (1175 – 2715) 51 (46 – 56) MS751 (HPV 45) células/mL 3793 (2944 – 4888) 5425 (4167 – 7066) 305 (284 – 343) HPV 31 copias/mL 3652 (3159 – 3868) 4118 (3898 – 4228) 692 (650 – 817) HPV 33 copias/mL 7326 (6578 – 8932) 8272 (7946 – 8743) 1376 (1272 – 1451) HPV 35 copias/mL 6820 (6477 – 7282) 7282 (6895 – 7674) 1552 (1317 – 1780) HPV 39 copias/mL 7894 (7115 – 8193) 8272 (7810 – 9398) 1531 (1419 – 1685) HPV 51 copias/mL 6697 (5786 – 7097) 5909 (5553 – 6824) 1229 (1155 – 1353) HPV 52 copias/mL 3582 (3414 – 4184) 4184 (3740 – 4761) 833 (744 – 934) HPV 56 copias/mL 4976 (4140 – 5698) 4774 (4479 – 5997) 836 (737 – 911) HPV 58 copias/mL 10094 (9403 – 11180) 11488 (8989 – 12360) 2990 (2656 – 7819) HPV 59 copias/mL 4400 (4145 – 5069) 4374 (4105 – 5482) 772 (722 – 899) HPV 66 copias/mL 3793 (3621 – 4030) 4462 (4008 – 4844) 701 (646 – 767) HPV 68 copias/mL 10415 (9799 – 11642) 10481 (9816 – 12082) 2079 (1995 – 2125) Reactividad cruzada: Se utilizó un panel de bacterias, levaduras y virus cultivados junto con ADN de plásmido con secuencias de diana de HPV de alto riesgo y bajo riesgo con el fin de evaluar la especificidad analítica de BD Onclarity HPV Assay en BD Viper LT System. Cada candidato a reacciones cruzadas se analizó individualmente en BD SurePath Preservative Fluid y PreservCyt Solution con una estirpe celular negativa por HPV (C33A). Los microorganismos se describen en las Tablas 15 y 16. BD Onclarity HPV Assay no sufrió reacciones cruzadas con ninguno de los microorganismos probados. 74 Tabla 15: Microorganismos analizados para especificidad analítica Bacterias* Virus** Actinomyces israelii Adenovirus, tipo 5 Atopobium vaginae EBV-1, cepa B95-8 Bacteroides fragilis HCMV. Cepa AD169 Bacteroides ureolyticus VIH-1 Bifidobacterium adolescentis VHS1 Bifidobacterium brevi VHS2 Bifidobacterium longum ssp. longum HPV de alto riesgo*** Chlamydia trachomatis HPV 16 Clostridium perfringens HPV 18 Corynebacterium genitalium HPV 31 Enterobacter cloacae ssp. cloacae HPV 33 Enterococcus faecalis HPV 35 Enterococcus faecium HPV 39 Escherichia coli HPV 45 Fusobacterium nucleatum ssp. nucleatum HPV 51 Gardnerella vaginalis HPV 52 Klebsiella pneumonia ssp. ozaenae HPV 56 Lactobacillus acidophilus HPV 58 Mycobacterium smegmatis HPV 59 Mycoplasma genitalium HPV 66 Neisseria gonorrhoeae HPV 68 Peptostreptococcus anaerobius Prevotella bivia Prevotella disiens Proteus mirabilis Proteus vulgaris Providencia stuartii Pseudomonas aeruginosa Staphylococcus aureus Staphylococcus epidermidis Streptococcus agalactiae Streptococcus pyogenes Ureaplasma urealyticum Levaduras/Protozoos**** Candida albicans Trichomonas vaginalis * Bacterias probadas aproximadamente a 1,0 x 107 UFC/mL excepto para las siguientes: Chlamydia trachomatis (1,0 x 107 CE/mL), Mycobacterium smegmatis (2,5 x 106 UFC/mL) y Ureaplasma urealyticum (8,0 x 106 UFC/mL). ** Virus probados a 1,0 x 106 VP/mL. *** ADN de plásmido de HPV de alto riesgo probado a 1,0 x 106 copias/mL. **** Levadura (Candida albicans) probada a aproximadamente 1,0 x 107 UFC/mL; Protozoos (Trichomonas vaginalis) probados a aproximadamente 1,4 x 106 UFC/mL. Tabla 16: Plásmidos de HPV de bajo riesgo probados para determinar la especificidad analítica HPV 6 HPV 69 HPV 11 HPV 70 HPV 26 HPV 73 HPV 30 HPV 82 HPV 34 HPV 97 HPV 53 HPV c85 HPV 67 *ADN de plásmido de HPV de bajo riesgo probado a 1,0 x 106 copias/mL. 75 Sustancias causantes de interferencias: Las posibilidades de interferencia en el BD Onclarity HPV Assay en BD Viper LT System se determinaron frente a sustancias exógenas y endógenas que pueden estar presentes en muestras clínicas de cuello uterino. Muestras elaboradas negativas por HPV y positivas por HPV (inoculadas al mismo tiempo con células SiHa, HeLa y MS751 a 3 x LdD) se analizaron en presencia o ausencia de cada una de las sustancias con posibilidades de interferencias. Las sustancias empleadas en estos estudios se describen en la Tabla 17. Las concentraciones representan el nivel máximo de la sustancia que no dio lugar a ninguna interferencia en BD Onclarity HPV Assay. Tabla 17: Sustancias con posibilidades de interferencia Sustancia con posibilidades de interferencia BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent Concentración probada Lubricante vaginal KY Medio BD SurePath Medio PreservCyt Concentración probada Concentración probada 10 % (p/v) 6 % (p/v) 10 % (p/v) 3 % (p/v) 10 % (p/v) 10 % (p/v) 10 % (p/v) 10 % (p/v) 10 % (p/v) Gel anticonceptivo Conceptrol 1 % (p/v) 10 % (p/v) 10 % (p/v) Monistat 3* 2 % (p/v) 2 % (p/v) 1,8 % (p/v) Clotrimazol 7 10 % (p/v) 10 % (p/v) 10 % (p/v) Vagistat-1 Tioconazol Película anticonceptiva vaginal VCF Espuma anticonceptiva vaginal VCF 2 % (p/v) 2 % (p/v) 2 % (p/v) Crema vaginal con clindamicina 9 % (p/v) 10 % (p/v) 10 % (p/v) Ducha Summer’s Eve 10 % (v/v) 10 % (v/v) 10 % (v/v) Crema Zovirax (aciclovir) 10 % (p/v) 8 % (p/v) 10 % (p/v) Vandazole Gel (gel vaginal con metronidazol 0,75 %) 10 % (p/v) 10 % (p/v) 10 % (p/v) Desodorante Summer’s Eve 2 % (p/v) 3 % (p/v) 2 % (p/v) Mucina bovina 10 % (v/v) 10 % (v/v) 10 % (v/v) Progesterona 20 ng/mL 20 ng/mL 20 ng/mL Estradiol 1,2 ng/mL 1,2 ng/mL 1,2 ng/mL Sangre completa 3 % (v/v) 5 % (v/v) 5 % (v/v) Leucocitos 1x106 1x106 células/mL células/mL 1x106 células/mL Semen 10 % (v/v) 10 % (v/v) 10 % (v/v) Preparación de lavado con ácido acético** 5 % (v/v) Sangre + preparación de lavado con ácido acético 5 % sangre (v/v), 2,5 % preparación de lavado con ácido acético (v/v) ** Las concentraciones mayores que las indicadas dieron lugar a fallos de nivel de líquido durante la extracción en BD Viper LT System. ** La preparación de lavado con ácido acético consiste en 1 parte de ácido acético glacial: 9 partes de solución de CytoLyt. Interferencia entre dianas en competencia: Las posibilidades de inhibición de la detección de HPV debido a la presencia de una diana con un nivel mayor y otra con niveles bajos durante una infección mixta se evaluaron en el BD Onclarity HPV Assay. Se analizaron células SiHa, HeLa y MS751 individual o colectivamente a 3 x LdD en presencia o ausencia de dianas HPV en competencia a razón de 1,0 x 106 copias/mL en BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt Solution y BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent con una estirpe celular negativa por HPV (C33A) (Tabla 18). 76 Tabla 18: Interferencia entre dianas en competencia Dianas celulares HPV individuales a 3 x LdD Plásmidos HPV a 1 x 106 copias/mL Detección de diana celular HPV en presencia o ausencia de genotipos en competencia (plásmidos HPV) SiHa (HPV 16) HPV 18 + HPV 45 Sí HeLa (HPV 18) HPV 16 + HPV 45 Sí HPV 45 (MS751) HPV 16 + HPV 18 Sí Genotipos G1 con dianas G2 co-amplificadas SiHa + HeLa + MS751 HPV 31 + HPV 33 + HPV 56 + HPV 58 + HPV 59 + HPV 66 Sí Genotipos G1 con dianas G3 co-amplificadas SiHa + HeLa + MS751 HPV 35 + HPV 39 + HPV 51+ HPV 52 + HPV 68 Sí Tipo de tubo de ensayo HPV Genotipos G1 con dianas G1 co-amplificadas Reproducibilidad: La reproducibilidad de BD Onclarity HPV Assay se evaluó en el equipo BD Viper LT utilizando un panel de cuatro miembros que contenía muestras negativas, positivas altas, positivas bajas y positivas moderadas. Los miembros positivos del panel consistían en células SiHa, HeLa y MS751 inoculadas conjuntamente en conjuntos de muestras clínicas BD SurePath y BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent negativas por HPV que contenían una estirpe de células negativas por HPV (C33A). El panel se analizó con una distribución de tres lotes de reactivos y tres instrumentos a lo largo de 12 días. Los datos se resumen en la Tabla 19. 77 Tabla 19: Resumen de los datos de reproducibilidad de BD Onclarity HPV Assay en BD Viper LT System Medio Estirpe celular (genotipo) SurePath SiHa (HPV 16) HeLa (HPV 18) MS-751 (HPV 45) Nivel del panel Concentración células/ mL Neg 0 Neg alto Pos bajo Pos mod 1582 Neg 0 Neg alto Pos bajo Pos mod Cervical Brush Diluent HeLa (HPV 18) 102 914 2742 0 Neg alto Pos bajo Pos mod 3793 395 11378 0 Neg alto Pos bajo Pos mod 205 Neg 0 Neg alto Pos bajo Pos mod Neg MS-751 (HPV 45) 4746 Neg Neg SiHa (HPV 16) 342 Neg alto Pos bajo Pos mod 32 615 13 76 228 0 59 457 1371 % correcto Intervalo de confianza 95 % 100 % (216/216) 97,69 % (211/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 98,61 % (213/216) 99,54 % (215/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 100 % (216/216) 99,54 % (215/216) 100 % (214/214) 100 % (218/218) 94,91 % (205/216) 100 % (216/216) 100 % (214/214) 99,07 % (214/216) 99,08 % (216/218) 99,54 % (215/216) 100 % (214/214) 100 % (216/216) 99,54 % (215/216) 100 % (218/218) (98,25 % – 100 %) (94,7 % – 99,01 %) (100 % – 98,25 %) (100 % – 98,25 %) (98,25 % – 100 %) (96 % – 99,53 %) (97,42 % – 99,92 %) (100 % – 98,25 %) (98,25 % – 100 %) (98,25 % – 100 %) (100 % – 98,25 %) (97,42 % – 99,92 %) (98,24 % – 100 %) (98,27 % – 100 %) (91,11 % – 97,13 %) (98,25 % – 100 %) (98,24 % – 100 %) (96,69 % – 99,75 %) (96,72 % – 99,75 %) (97,42 % – 99,92 %) (98,24 % – 100 %) (98,25 % – 100 %) (97,42 % – 99,92 %) (98,27 % – 100 %) Entre series Dentro de la serie Ct medio DE % CV DE % CV DE % CV NA NA NA NA NA NA NA 35,28 0,16 0,46 0,54 1,52 0,57 1,62 32,31 0,16 0,50 0,22 0,69 0,30 0,92 31,07 0,22 0,69 0,22 0,71 0,35 1,11 NA NA NA NA NA NA NA 35,89 0,24 0,68 0,75 2,09 0,85 2,37 32,70 0,16 0,50 0,30 0,92 0,37 1,14 30,68 0,13 0,43 0,22 0,72 0,30 0,98 NA NA NA NA NA NA NA 35,77 0,00 0,00 0,52 1,45 0,55 1,53 32,71 0,20 0,60 0,26 0,80 0,36 1,10 31,33 0,18 0,57 0,35 1,10 0,41 1,31 NA NA NA NA NA NA NA 36,29 0,09 0,25 0,59 1,63 0,62 1,71 33,63 0,26 0,78 0,33 0,97 0,43 1,27 31,80 0,16 0,51 0,18 0,56 0,25 0,79 NA NA NA NA NA NA NA 35,69 0,10 0,29 0,78 2,18 0,80 2,23 33,34 0,15 0,44 0,25 0,76 0,30 0,91 32,07 0,24 0,73 0,25 0,78 0,37 1,16 NA NA NA NA NA NA NA 36,54 0,22 0,61 0,62 1,68 0,66 1,81 33,22 0,16 0,48 0,25 0,75 0,32 0,95 31,74 0,14 0,43 0,21 0,67 0,27 0,84 Total Contaminación cruzada: Se llevó a cabo un estudio con el objetivo de evaluar el riesgo de que se produjera un resultado falso positivo en una misma serie (contaminación cruzada intraserie) o en una serie posterior (contaminación por arrastre entre series) en BD Viper LT System. Se realizó una serie al día durante cinco días en cada uno de los tres instrumentos, con un total de 675 réplicas de análisis. Cada serie consistió en muestras de BD SurePath Preservative Fluid o PreservCyt Solution con una estirpe celular negativa por HPV (C33A) con y sin células SiHa inoculadas a razón de 1,0 x 105 células/mL organizadas en un patrón de tablero de ajedrez alternado. La tasa de contaminación global con BD SurePath Preservative Fluid y PreservCyt Solution fue del 0,00 %. Estabilidad de muestras puras (en vial): Se realizaron estudios analíticos para respaldar las exigencias de almacenamiento de muestras de cuello uterino puras. Se inocularon muestras de BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt Solution y BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent que contenían una estirpe celular negativa por HPV (C33A), con células SiHa a una concentración 3 x LdD y se almacenaron a 2 – 8 °C, 30 °C y -20 °C para determinar varios puntos en el tiempo. En cada uno de los momentos definidos, las muestras se quitaron del lugar de almacenamiento y se analizaron con BD Onclarity HPV Assay en BD Viper LT System. Se generaron 24 réplicas de cada conjunto de condiciones (tipo de muestra, temperatura y duración de almacenamiento). Se consiguió la estabilidad durante 30 días a 2 – 30 °C y -20 °C. Estabilidad de muestras diluidas: Se realizaron estudios analíticos para respaldar las exigencias de almacenamiento de muestras de cuello uterino diluidas. Se inocularon muestras de BD SurePath Preservative Fluid y PreservCyt Solution que contenían una estirpe celular negativa por HPV (C33A), con células SiHa a una concentración 3 x LdD y, a continuación, se almacenaron a 2 – 8 °C, 30 °C y -20 °C para determinar varios puntos en 78 el tiempo. En cada uno de los momentos definidos, las muestras se quitaron del lugar de almacenamiento y se analizaron con BD Onclarity HPV Assay en BD Viper LT System. Se generaron 24 réplicas de cada conjunto de condiciones (tipo de muestra, temperatura y duración de almacenamiento). Se consiguió la estabilidad durante 15 días a 2 – 30 °C y durante 30 días a -20 °C. Estabilidad de las muestras tras la fase de precalentamiento: Se realizaron estudios analíticos para respaldar las exigencias de almacenamiento de muestras de cuello uterino después del precalentamiento. Se inocularon muestras de BD SurePath Preservative Fluid, PreservCyt Solution y BD Onclarity HPV Cervical Brush Diluent que contenían una estirpe celular negativa por HPV (C33A), con células a razón de 3 x LdD, se diluyeron con BD Onclarity HPV LBC Diluent y, a continuación, se precalentaron con el bloque térmico de precalentamiento BD Viper LT Pre-warm Heater. Las muestras procesadas se almacenaron a 2 – 8 °C, 30 °C y -20 °C para determinar varios puntos en el tiempo. En cada uno de los momentos definidos, las muestras se quitaron del lugar de almacenamiento y se analizaron con BD Onclarity HPV Assay en BD Viper LT System. Se generaron 24 réplicas de cada conjunto de condiciones (tipo de muestra, temperatura y duración de almacenamiento). Se consiguió la estabilidad durante 7 días a 2 – 30 °C y durante 30 días a -20 °C. INTERPRETACIÓN DE LAS TABLAS Símbolos y abreviaturas Símbolos (+) (-) # % positivo negativo número porcentaje Abreviaturas ASCUS Células escamosas atípicas de relevancia indeterminada UFC Unidades formadoras de colonias IC Intervalo de confianza CIN Neoplasia intraepitelial de cuello uterino CV Coeficiente de variación HPV Papilomavirus humano AR Alto riesgo LBC Citología en líquido n Número NA No aplicable NEGNegativo NPA Concordancia porcentual negativa PBS Solución salina tamponada con fosfato PCR Reacción en cadena de la polimerasa POSPositivo PPA Concordancia porcentual positiva QC Control de calidad DE Desviación estándar DISPONIBILIDAD También están disponibles los productos BD Onclarity y BD Viper siguientes para usar con BD Viper: Nº de cat. 442946 441993 442841 441992 441354 442840 441991 442957 443430 440476 441996 441995 442950 442967 442839 Descripción BD Onclarity HPV Assay Reagent Pack, 192 análisis Control Set for the BD Onclarity HPV Assay, 24 tubos positivos y 24 tubos negativos BD Viper PCR Extraction Reagent Trough with Piercing Tool, 12 cubetas de reactivo de extracción BD FOX PCR Extraction Tubes, 384 tubos BD Viper System Neutralization Pouch, 12 bolsas BD Onclarity HPV Liquid Based Cytology Specimen (LBC) Diluent Tubes, 400 BD Onclarity HPV Assay Cervical Brush Collection Kit, 100 BD Viper LT System PCR Tube/Tray Kit Tarjeta de claves para BD Viper LT System BD ProbeTec Chlamydia trachomatis/Neisseria gonorrhoeae (CT/GC) Amplified DNA Assay Endocervical Specimen Collection and DRY TRANSPORT Kit BD Viper LT Pipette Tips, 3840 BD Viper LT Solid Waste Liners, 80 BD Pre-warm Heater BD Viper LT System PCR Accessory kit BD Viper LT System REFERENCIAS: Ver “References” en el texto en inglés. 79 Manufacturer / Производител / Výrobce / Fabrikant / Hersteller / Κατασκευαστής / Fabricante / Tootja / Fabricant / Proizvođać / Gyártó / Fabbricante / Атқарушы / Gamintojas / Tilvirker / Producent / Producător / Производитель / Výrobca / Proizvođač / Tillverkare / Üretici / Виробник Use by / Използвайте до / Spotřebujte do / Brug før / Verwendbar bis / Χρήση έως / Usar antes de / Kasutada enne / Date de péremption / Upotrijebiti do / Felhasználhatóság dátuma / Usare entro / Дейін пайдалануға / Naudokite iki / Houdbaar tot / Brukes for / Stosować do / Prazo de validade / A se utiliza până la / Использовать до / Použite do / Upotrebiti do / Använd före / Son kullanma tarihi / Використати до\line YYYY-MM-DD / YYYY-MM (MM = end of month) ГГГГ-ММ-ДД / ГГГГ-ММ (ММ = края на месеца) RRRR-MM-DD / RRRR-MM (MM = konec měsíce) ÅÅÅÅ-MM-DD / ÅÅÅÅ-MM (MM = slutning af måned) JJJJ-MM-TT / JJJJ-MM (MM = Monatsende) ΕΕΕΕ-MM-HH / ΕΕΕΕ-MM (MM = τέλος του μήνα) AAAA-MM-DD / AAAA-MM (MM = fin del mes) AAAA-KK-PP / AAAA-KK (KK = kuu lõpp) AAAA-MM-JJ / AAAA-MM (MM = fin du mois) GGGG-MM-DD / GGGG-MM (MM = kraj mjeseca) ÉÉÉÉ-HH-NN / ÉÉÉÉ-HH (HH = hónap utolsó napja) AAAA-MM-GG / AAAA-MM (MM = fine mese) ЖЖЖЖ-АА-КК / ЖЖЖЖ-АА / (АА = айдың соңы) MMMM-MM-DD / MMMM-MM (MM = mėnesio pabaiga) JJJJ-MM-DD / JJJJ-MM (MM = einde maand) ÅÅÅÅ-MM-DD / ÅÅÅÅ-MM (MM = slutten av måneden) RRRR-MM-DD / RRRR-MM (MM = koniec miesiąca) AAAA-MM-DD / AAAA-MM (MM = fim do mês) AAAA-LL-ZZ / AAAA-LL (LL = sfârşitul lunii) ГГГГ-ММ-ДД / ГГГГ-ММ (ММ = конец месяца) RRRR-MM-DD / RRRR-MM (MM = koniec mesiaca) GGGG-MM-DD / GGGG-MM (MM = kraj meseca) ÅÅÅÅ-MM-DD / ÅÅÅÅ-MM (MM = slutet av månaden) YYYY-AA-GG / YYYY-AA (AA = ayın sonu) РРРР-MM-ДД / РРРР-MM (MM = кінець місяця) Catalog number / Каталожен номер / Katalogové číslo / Katalognummer / Αριθμός καταλόγου / Número de catálogo / Katalooginumber / Numéro catalogue / Kataloški broj / Katalógusszám / Numero di catalogo / Каталог нөмірі / Katalogo numeris / Catalogus nummer / Numer katalogowy / Număr de catalog / Номер по каталогу / Katalógové číslo / Kataloški broj / Katalog numarası / Номер за каталогом Authorized Representative in the European Community / Оторизиран представител в Европейската общност / Autorizovaný zástupce pro Evropském společenství / Autoriseret repræsentant i De Europæiske Fællesskaber / Autorisierter Vertreter in der Europäischen Gemeinschaft / Εξουσιοδοτημένος αντιπρόσωπος στην Ευρωπαϊκή Κοινότητα / Representante autorizado en la Comunidad Europea / Volitatud esindaja Euroopa Nõukogus / Représentant autorisé pour la Communauté européenne / Autorizuirani predstavnik u Europskoj uniji / Meghatalmazott képviselő az Európai Közösségben / Rappresentante autorizzato nella Comunità Europea / Европа қауымдастығындағы уәкілетті өкіл / Įgaliotasis atstovas Europos Bendrijoje / Bevoegde vertegenwoordiger in de Europese Gemeenschap / Autorisert representant i EU / Autoryzowane przedstawicielstwo we Wspólnocie Europejskiej / Representante autorizado na Comunidade Europeia / Reprezentantul autorizat pentru Comunitatea Europeană / Уполномоченный представитель в Европейском сообществе / Autorizovaný zástupca v Európskom spoločenstve / Autorizovano predstavništvo u Evropskoj uniji / Auktoriserad representant i Europeiska gemenskapen / Avrupa Topluluğu Yetkili Temsilcisi / Уповноважений представник у країнах ЄС In Vitro Diagnostic Medical Device / Медицински уред за диагностика ин витро / Lékařské zařízení určené pro diagnostiku in vitro / In vitro diagnostisk medicinsk anordning / Medizinisches In-vitro-Diagnostikum / In vitro διαγνωστική ιατρική συσκευή / Dispositivo médico para diagnóstico in vitro / In vitro diagnostika meditsiiniaparatuur / Dispositif médical de diagnostic in vitro / Medicinska pomagala za In Vitro Dijagnostiku / In vitro diagnosztikai orvosi eszköz / Dispositivo medicale per diagnostica in vitro / Жасанды жағдайда жүргізетін медициналық диагностика аспабы / In vitro diagnostikos prietaisas / Medisch hulpmiddel voor in-vitro diagnostiek / In vitro diagnostisk medisinsk utstyr / Urządzenie medyczne do diagnostyki in vitro / Dispositivo médico para diagnóstico in vitro / Dispozitiv medical pentru diagnostic in vitro / Медицинский прибор для диагностики in vitro / Medicínska pomôcka na diagnostiku in vitro / Medicinski uređaj za in vitro dijagnostiku / Medicinteknisk produkt för in vitro-diagnostik / İn Vitro Diyagnostik Tıbbi Cihaz / Медичний пристрій для діагностики in vitro Temperature limitation / Температурни ограничения / Teplotní omezení / Temperaturbegrænsning / Temperaturbegrenzung / Περιορισμοί θερμοκρασίας / Limitación de temperatura / Temperatuuri piirang / Limites de température / Dozvoljena temperatura / Hőmérsékleti határ / Limiti di temperatura / Температураны шектеу / Laikymo temperatūra / Temperatuurlimiet / Temperaturbegrensning / Ograniczenie temperatury / Limites de temperatura / Limite de temperatură / Ограничение температуры / Ohraničenie teploty / Ograničenje temperature / Temperaturgräns / Sıcaklık sınırlaması / Обмеження температури Batch Code (Lot) / Код на партидата / Kód (číslo) šarže / Batch-kode (lot) / Batch-Code (Charge) / Κωδικός παρτίδας (παρτίδα) / Código de lote (lote) / Partii kood / Numéro de lot / Lot (kod) / Tétel száma (Lot) / Codice batch (lotto) / Топтама коды / Partijos numeris (LOT) / Lot nummer / Batch-kode (parti) / Kod partii (seria) / Código do lote / Cod de serie (Lot) / Код партии (лот) / Kód série (šarža) / Kod serije / Partinummer (Lot) / Parti Kodu (Lot) / Код партії Contains sufficient for <n> tests / Съдържанието е достатъчно за <n> теста / Dostatečné množství pro <n> testů / Indeholder tilstrækkeligt til <n> tests / Ausreichend für <n> Tests / Περιέχει επαρκή ποσότητα για <n> εξετάσεις / Contenido suficiente para <n> pruebas / Küllaldane <n> testide jaoks / Contenu suffisant pour <n> tests / Sadržaj za <n> testova / <n> teszthez elegendő / Contenuto sufficiente per <n> test / <п> тесттері үшін жеткілікті / Pakankamas kiekis atlikti <n> testų / Inhoud voldoende voor "n" testen / Innholder tilstrekkelig til <n> tester / Zawiera ilość wystarczającą do <n> testów / Conteúdo suficiente para <n> testes / Conţinut suficient pentru <n> teste / Достаточно для <n> тестов(а) / Obsah vystačí na <n> testov / Sadržaj dovoljan za <n> testova / Innehåller tillräckligt för <n> analyser / <n> test için yeterli malzeme içerir / Вистачить для аналізів: <n> 80 Peel / Обелете / Otevřete zde / Åbn / Abziehen / Αποκολλήστε / Desprender / Koorida / Décoller / Otvoriti skini / Húzza le / Staccare / Ұстіңгі қабатын алып таста / Plėšti čia / Schillen / Trekk av / Oderwać / Destacar / Se dezlipeşte / Отклеить / Odtrhnite / Oljuštiti / Dra isär / Ayırma / Відклеїти Consult Instructions for Use / Направете справка в инструкциите за употреба / Prostudujte pokyny k použití / Se brugsanvisningen / Gebrauchsanweisung beachten / Συμβουλευτείτε τις οδηγίες χρήσης / Consultar las instrucciones de uso / Lugeda kasutusjuhendit / Consulter la notice d'emploi / Koristi upute za upotrebu / Olvassa el a használati utasítást / Consultare le istruzioni per l’uso / Пайдалану нұсқаулығымен танысып алыңыз / Skaitykite naudojimo instrukcijas / Raadpleeg de gebruiksaanwijzing / Se i bruksanvisningen / Zobacz instrukcja użytkowania / Consultar as instruções de utilização / Consultaţi instrucţiunile de utilizare / См. руководство по эксплуатации / Pozri Pokyny na používanie / Pogledajte uputstvo za upotrebu / Se bruksanvisningen / Kullanım Talimatları’na başvurun / Див. інструкції з використання control / Положителен контрол / Pozitivní kontrola / Positiv kontrol / Positive Kontrolle / Θετικός μάρτυρας / Positive Control positivo / Positiivne kontroll / Contrôle positif / Pozitivna kontrola / Pozitív kontroll / Controllo positivo / Оң бақылау / Teigiama kontrolė / Positieve controle / Kontrola dodatnia / Controlo positivo / Control pozitiv / Положительный контроль / Pozitif kontrol / Позитивний контроль Negative control / Отрицателен контрол / Negativní kontrola / Negativ kontrol / Negative Kontrolle / Αρνητικός μάρτυρας / Control negativo / Negatiivne kontroll / Contrôle négatif / Negativna kontrola / Negatív kontroll / Controllo negativo / Негативтік бақылау / Neigiama kontrolė / Negatieve controle / Kontrola ujemna / Controlo negativo / Control negativ / Отрицательный контроль / Negatif kontrol / Негативний контроль Do not use if package damaged / Не използвайте, ако опаковката е повредена / Nepoužívejte, je-li obal poškozený / Må ikke anvendes hvis emballagen er beskadiget / Inhal beschädigter Packungnicht verwenden / Μη χρησιμοποιείτε εάν η συσκευασία έχει υποστεί ζημιά. / No usar si el paquete está dañado / Mitte kasutada, kui pakend on kahjustatud / Ne pas l’utiliser si l’emballage est endommagé / Ne koristiti ako je oštećeno pakiranje / Ne használja, ha a csomagolás sérült / Non usare se la confezione è danneggiata / Егер пакет бұзылған болса, пайдаланба / Jei pakuotė pažeista, nenaudoti / Niet gebruiken indien de verpakking beschadigd is / Må ikke brukes hvis pakke er skadet / Nie używać, jeśli opakowanie jest uszkodzone / Não usar se a embalagem estiver danificada / A nu se folosi dacă pachetul este deteriorat / Не использовать при повреждении упаковки / Nepoužívajte, ak je obal poškodený / Ne koristite ako je pakovanje oštećeno / Använd ej om förpackningen är skadad / Ambalaj hasar görmüşse kullanmayın / Не використовувати за пошкодженої упаковки Collection date / Дата на събиране / Datum odběru / Opsamlingsdato / Entnahmedatum / Ημερομηνία συλλογής / Fecha de recogida / Kogumiskuupäev / Date de prélèvement / Dani prikupljanja / Mintavétel dátuma / Data di raccolta / Жинаған тізбекүні / Paėmimo data / Verzameldatum / Dato prøvetaking / Data pobrania / Data de colheita / Data colectării / Дата сбора / Dátum odberu / Datum prikupljanja / Uppsamlingsdatum / Toplama tarihi / Дата забору Patient ID number / ИД номер на пациента / ID pacienta / Patientens ID-nummer / Patienten-ID / Αριθμός αναγνώρισης ασθενούς / Número de ID del paciente / Patsiendi ID / No d'identification du patient / Identifikacijski broj pacijenta / Beteg azonosító száma / Numero ID paziente / Пациенттің идентификациялық нөмірі / Paciento identifikavimo numeris / Identificatienummer van de patiënt / Pasientens ID-nummer / Numer ID pacjenta / Número da ID do doente / Număr ID pacient / Идентификационный номер пациента / Identifikačné číslo pacienta / ID broj pacijenta / Patientnummer / Hasta kimlik numarası / Ідентифікатор пацієнта 81 82 83 B m Becton, Dickinson and Company 7 Loveton Circle Sparks, MD 21152 USA A Benex Limited Pottery Road, Dun Laoghaire Co. Dublin, Ireland LINEAR ARRAY is a registered trademark of Roche Molecular Systems, Inc. Hybrid Capture and Digene are registered trademarks of Digene Corporation. Brands listed in the table of Potential Interfering Substances are trademarks of their respective owners. PreservCyt, ThinPrep and CytoLyt are registered trademarks of Hologic, Inc. BD, BD Logo, and all other trademarks are property of Becton, Dickinson and Company. ©2014 BD. 84