Corso di formazione “Conoscenza delle risorse elettroniche” – 3° modulo - Siena, maggio 2005
Risorse Elettroniche in Area Biomedica
Bartolomeo Eustachi (San Severino Marche, 1500?-1574)
“Tabulae anatomicae” Roma 1714
A cura di Maria Cristina Costantini, Biblioteca Centrale di Medicina
[email protected]
http://www.unisi.it/bcm
Introduzione
Le Fonti dell’Informazione Biomedica*
Fonti orali
Il Collega esperto: lo
Fonti scritte
Libri
specializzando più anziano, un
Trattati
docente dell’Università, uno
Atti di Congressi
specialista noto a livello nazionale o
Enciclopedie…
internazionale.
Riviste
Riviste scientifiche con revisori (“peer review”)
E-mail
Liste di discussione
Forum
Riviste istituzionali (di enti, associazioni, ministeri)
Riviste a pubblicazione discrezionale
Riviste mediche divulgative (“usa e getta”)
Basi Dati
Bibliografiche
Fattuali
* “Semplice Introduzione alle Fonti di Informazione in Medicina” (AISMe: Approccio Interdisciplinare
alle Scienze Mediche, II anno) a cura di Piersante Sestini e Ombretta Bugiani.
<http://aisme.med.unisi.it/aisme2/fonti.htm>
Introduzione
Tipologia dei documenti
Articoli originali
Rassegne narrative (o “non sistematiche” o “stato dell’arte”)
Rassegne sistematiche di articoli originali
Linee guida
Protocolli clinici
Case report
Editoriali
Lettere
La maggior parte dei documenti è in lingua inglese
Da: “Semplice Introduzione alle Fonti di Informazione in Medicina” (AISMe: Approccio Interdisciplinare
alle Scienze Mediche, II anno) a cura di Piersante Sestini e Ombretta Bugiani.
<http://aisme.med.unisi.it/aisme2/fonti.htm>
Introduzione
La Domanda in Medicina
Domanda “di sfondo”
Richiesta di informazioni generali, struttura semplice (es: “cosa è l’ictus
cerebrale?”)
Pubblicazioni più generali (Libro, rassegna narrativa, linee
guida)
Domanda “di primo piano”
Richiesta di informazioni specifiche, struttura complessa
informazioni
precise derivate da osservazioni originali (RCT, rassegne sistematiche…)
Chi domanda cosa
Medici
Pazienti
Studenti
Studiosi di altre discipline
Da: “Semplice Introduzione alle Fonti di Informazione in Medicina” (AISMe: Approccio Interdisciplinare
alle Scienze Mediche, II anno) a cura di Piersante Sestini e Ombretta Bugiani.
<http://aisme.med.unisi.it/aisme2/fonti.htm>
Introduzione
La valutazione delle Risorse
- Chiunque può accedere all’informazione biomedica in rete
- Chiunque può pubblicare siti web
La Qualità
deve essere
garantita
Servizi di recensione/revisione
dei siti biomedici:
Codici di Autoregolamentazione:
I principi del codice HON
http://www.hon.ch/home.html
OMNI
HEALTHWEB
…ecc.
Santoro, Eugenio. La qualità delle informazioni mediche su internet [Online] aprile 2001.
<http://www.marionegri.it/santoro/qualita.htm>
National Center for Biotechnology Information
National Library of Medicine – National Institutes of Health (USA)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Nato nel 1988 come risorsa nazionale per la
biologia molecolare, NCBI implementa e
gestisce database ad accesso libero,
conduce ricerche di biologia
computazionale, sviluppa strumenti
informatici per analizzare i dati del genoma
e si occupa della disseminazione
dell’informazione biomedica.
ENTREZ è il sistema integrato per la
ricerca e il recupero dell’informazione usato
da NCBI per i principali database, tra cui
PubMed, OMIM, Nucleotide and
Protein Sequences, Protein Structures,
Complete Genomes, PubChem,
Taxonomy, ed altri.
Nel diagramma a fianco è schematizzata la
struttura integrata dei database: nella
versione in rete è possibile visualizzare le
relazioni a partire dai singoli nodi…
http://www.ncbi.nih.gov/Database/datamodel/index.html
Esempio: I collegamenti da PubMed
Entrez Global Query Cross-Database Search System
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gquery/gquery.fcgi
Attraverso questa pagina di ENTREZ è possibile lanciare una ricerca simultanea su un
gruppo di 29 database (oppure accedere alla maschera di interrogazione di ognuno di
essi, usando la pagina come una directory).
La stringa di ricerca può consistere in uno o più termini in liguaggio naturale; è
possibile usare gli operatori booleani.
Accanto all’icona/nome di ogni database compare il numero di record trovati:
selezionandolo, l’utente può visualizzare i record ed eventualmente proseguire la ricerca.
In caso di risposta totalmente negativa (nessun termine trovato) o parziale (uno o più
termini non trovati) lo sfondo della casella di risultato è grigio, e in ogni database sarà
possibile vedere il dettaglio degli esiti della ricerca.
Entrez Global Query Cross-Database Search System: esempio di ricerca simultanea
Tipologia: Base dati bibliografica.
Accesso: Libero e gratuito.
Lingua: Inglese.
http://www.ncbi.nih.gov/entrez/query.fcgi
http://pubmed.org
Produttori: National Center for
Biotechnology Information (NCBI),
National Library of Medicine (NLM),
National Institutes of Health (NIH)
Contenuto: Più di 15 milioni di
citazioni di articoli biomedici, dal 1951
ad oggi in vari settori: medicina,
odontoiatria, infermieristica, medicina
veterinaria, sanità e scienze
precliniche. La maggior parte degli
articoli è in lingua inglese; i periodici
indicizzati sono circa 4.800, pubblicati
negli Stati Uniti e in altri 70 paesi.
L’aggiornamento è quotidiano (ca
33.000 nuove citazioni al mese.
La selezione dei documenti da indicizzare viene fatta da un comitato composto da medici, editori e
bibliotecari
PubMed consente l’accesso agli articoli disponibili in full text sui siti web degli editori e ad altre
risorse web collegate (libri, localizzazione delle riviste, ecc.).
Componenti di PubMed
 MEDLINE: la principale base dati bibliografica per la biomedicina (circa 12 milioni
di record dal 1966 ad oggi);
 OLDMEDLINE: circa 1.760.000 citazioni dal 1950 al 1965
 PREMEDLINE (Record “in progress”): citazioni in attesa di essere passate al
vaglio per la definitiva indicizzazione su MEDLINE
 Out-of scope citations: citazioni da riviste di scienze e chimica che contengono
articoli indicizzati in MEDLINE (es. “Science”);
 PubMed Central: citazioni degli articoli in full-text inviati a PMC da varie riviste
(MEDLINE e non-MEDLINE);
 Citazioni da altri database: HealthSTAR, AIDSLINE, HISTLINE, SPACELINE,
BIOETHICSLINE, POPLINE;
 “Ahead of print” or “epub” citations: citazioni di articoli elettronici, in attesa di
essere pubblicati su riviste cartacee.
Ricerca libera: i termini inseriti vengono cercati in tutti i campi.
Ricerca per Campi: al termine si fa seguire il tag corrispondente ai campi di interesse
([au]=autore, [ti]=titolo, [so]= titolo della rivista.
Ricerca per frase: racchiudendo due o più termini tra virgolette (“ “) o facendoli seguire dal tag
[tw] verranno cercati come frase.
Ricerca per Titolo di Rivista
Il “Journal database”: fornisce informazioni sui periodici indicizzati in PubMed (ISSN,
abbreviazioni standard, link alla scheda catalografica della National Library of Medicine…).
Ricerca per Autore: cognome + iniziali (es.: Caniggia A.)
Troncamento = *
Operatori Booleani = AND, OR, NOT
Parentesi per stabilire un ordine di priorità per ricerche con più termini.
Limiti per campo, tipologia di pubblicazione (editoriale, lettera, metanalisi, linee
guida, ecc.), età del gruppo di studio, data di pubblicazione, lingua, solo citazioni con
abstract, uomo/animale, subset (AIDS, bioetica, tossicologia, ecc.) e sesso.
Single Citation Matcher: una maschera di ricerca con tutti i campi della citazione.
Serve per trovare rapidamente una citazione di cui si conoscano almeno alcuni elementi.
Ricerca per descrittore: i MeSH - Medical Subject Headings (ca 19.000
descrittori principali, ca 800 subheadings, più di 100.000 voci supplementari)
Il Mesh Database
Ogni termine è corredato
da una definizione, dalla
struttura gerarchica
(termini sovraordinati e
sottordinati), dalle
qualificazioni; una volta
scelto il termine è
possibile inserirlo
direttamente in una
maschera di ricerca con
l’operatore adeguato e
ripetere la ricerca e la
selezione di tutti i
termini necessari: a
questo punto è possibile
lanciare la ricerca
attraverso il pulsante
“search PubMed”.
Funzioni avanzate:
Clinical Queries:
sono un particolare
gruppo di filtri di ricerca
sviluppati per il
reperimento di studi
clinici di particolare rilievo
per i medici che praticano
la medicina basata
sull’evidenza (EBM).
Funzioni avanzate: Mappatura Automatica dei Termini
L’opzione Details permette di vedere come il programma ha interpretato la richiesta
Funzioni avanzate:
Index – permette di costruire stringhe di ricerca attraverso la consultazione dei vari
indici.
Preview – visualizza il numero di record risultanti da una ricerca prima di mostrare le
citazioni, permettendo così di aggiustare la strategia.
Funzioni avanzate:
History – memorizza fino a 100 ricerche e consente di incrociare i set.
Funzioni avanzate:
Clipboard – cartella per l’archiviazione dei record provenienti da varie ricerche, fino
ad un massimo di 500.
My NCBI – Per salvare in modo permanente strategie di ricerca; permette l’invio di
alert in posta elettronica qualora vi siano degli aggiornamenti. Richiede un’ iscrizione
gratuita e si accede tramite password.
Funzioni avanzate:
Related articles – gli articoli sono correlati fra loro attraverso la comparazione delle
parole del titolo, dell’abstract, e dei termini MeSH. Vengono visualizzati in ordine di
rilevanza.
LinkOut – Visualizza i link esterni della citazione, dal full text alle biblioteche che
possiedono il periodico.
Guide all’uso di PubMed
In rete
PubMed in Pillole (come imparare ad usare PubMed in un’ora o poco più), a cura di
Carlo Drago e Rita Strazzeri, Università di Roma “La Sapienza”:
http://w3.uniroma1.it/vrd-medicina/Sommario.htm>
La ricerca nelle banche dati bibliografiche: l’esempio di PubMed (una piccola
introduzione per i non addetti ai lavori), di Caterina Barazia:
<http://www.aib.it/aib/contr/barazia1.htm>
PuMed Tutorial: Il tutorial ufficiale della National Library of Medicine, accessibile anche
dal menù di PubMed:
<http://www.nlm.nih.gov/bsd/pubmed_tutorial/m1001.html>
Using PubMed Effectively: a tutorial for using PubMed, By Mick Draper
The University of Adelaide Library , Australia:
http://www.library.adelaide.edu.au/guide/med/pubmed.html
A stampa
Ugolini, Donatella. MEDLINE/PubMed : guida all’uso. – Genova: Istituto Nazionale per
la Ricerca sul Cancro, 2004. – 36 p. : ill.
Published International Literature On Traumatic Stress
PILOTS Database
http://www.ncptsd.va.gov//publications/pilots/
Tipologia: Base dati bibliografica.
Lingua: Inglese
Accesso: Libero e gratuito.
PILOTS è prodotto dal National Center for PostTraumatic Stress Disorder, Department Of
Veterans Affairs (USA).
Contenuto: più di 25.000 citazioni, quasi tutte
con abstract, che costituiscono la quasi totalità
della letteratura internazionale sulla sindrome
da stress post-traumatico ed altri disturbi
mentali dovuti all’esposizione ad eventi
traumatici. I documenti indicizzati sono articoli
di periodici, libri, capitoli di libri, opuscoli,
rapporti tecnici e materiale vario in varie le
lingue. L’aggiornamento è bimestrale.
N.B.: Per accedere alle maschere di ricerca, cliccare su “Search
PILOTS”
Il sito fornisce:
Lista di “incidenti” e di “persone” usati come descrittori nel database
Informazioni su come ottenere i documenti citati.
Ricerca: Ricerca “semplice” e “avanzata”; ricerca per termini controllati (tesauro), autore, fonte, anno di
pubblicazione, ecc. E’ possibile usare troncamenti e operatori booleani. E’ disponibile una guida per gli utenti,
scaricabile in formato pdf.
SIBIL (Sistema Informativo per la Bioetica In Linea)
http://www.bioetica.iss.it/sebina/opac.exe/ase
Tipologia: Base dati bibliografica
Soggetto: Bioetica
Accesso: Libero e gratuito
Lingua: Italiano
Produttore: Servizio Documentazione
dell’Istituto Superiore di Sanità.
Copertura temporale: Materiale documentario
pubblicato in Italia a partire dal 1995.
Copertura materiale: “Monografie, e capitoli di
monografie, articoli di periodici, leggi e
documenti normativi in genere, pareri di comitati
etici, codici etici e linee guida, letteratura grigia,
siti internet e alcuni tra i principali documenti
internazionali”.
Descrizione: SIBIL nasce nel 2001 da un progetto del Servizio di Documentazione dell’Istituto Superiore di Sanità; contiene
circa 4.200 record strutturati in campi: autore, titolo, descrizione della pubblicazione da cui il documento è tratto, tipo di
pubblicazione, descrittori. La ricerca può essere lanciata per ognuno dei campi attraverso modalità di “ricerca semplice” e
“ricerca raffinata”, o per parola (modalità “ricerca libera”). Oltre al soggettario è disponibile il Thesaurus TIB (Thesaurus
Italiano di Bioetica): 1.600 descrittori, relazioni gerarchiche (BT e NT), associative (RT), rinvii (UF).
Accesso al full-text dei documenti: il campo “Localizzazione” e il tasto “Altri cataloghi” indicano la collocazione fisica dei
documenti nelle biblioteche italiane. Se disponibile, compare il link al full-text in rete.
NOTA: Per le ricerche bibliografiche è possibile inoltrare riciesta direttamente al Servizio di Documentazione
Bioethics Information Retrieval Project
http://www.georgetown.edu/research/nrcbl/ir/
BIOETHICSLINE
1973-2000
Database prodotto dal Kennedy Institute of Ethics della Georgetown
University per la National Library of Medicine. A partire dal 2001 è stato
integrato nei due maggiori database bibliografici della NLM
National Library of
Medicine
2001Record di monografie, capitoli
di monografie, atti normativi e
letteratura grigia
MEDLINE/PubMed
2001Record di articoli di periodici e giornali,
sentenze e leggi. Questo materiale fa
parte di un “subset” di
MEDLINE/PubMed, “Bioethics”, grazie a
una complessa strategia di ricerca che
cerca parole libere nel testo o termini
MeSH relativi alla bioetica, messa a
punto dal Bioethics Information
Retrieval Project
NLM Gateway
Il Gateway della National Library of Medicine permette la
ricerca contemporanea su entrambi i database (insieme a
molte altre risorse)
ETHX on the Web
Più di 180.000 citazioni di
articoli, libri, disegni di
legge, sentenze, atti
normativi, audiovisivi,
relativi alla bioetica e
all’etica professionale.
Genetics and Ethics
Più di 22.000 citazioni di
varie tipologie di documenti
relativi all’etica e alle
politiche pubbliche in
genetica
Presso il Kennedy Institute
of Ethics della Georgetown
University
Come si crea un “subset” in PubMed:
jsubsete OR ethical [ti] OR ethically [ti] OR ethico OR ethics [mh] OR ethics [ti] OR ethics [sh] OR ethicist OR ethicists OR bioethic OR
bioethical OR bioethicist OR bioethicists OR bioethics OR abortion, criminal [majr] OR abortion, eugenic [majr] OR ((abortion, induced
[majr:noexp] OR abortion, legal [majr]) NOT animals [mh:exp] AND (attitude [mh] OR public opinion OR coercion OR decision making
[mh] OR prenatal diagnosis [majr] OR pregnancy trimester, third [mh] OR women's health services OR women's rights [mh])) OR
(abortion, therapeutic [majr] AND (attitude [mh] OR public opinion OR coercion OR decision making [mh] OR women's rights [mh]))
OR advance care planning [majr] OR advance directive adherence OR advance directives OR animal care committees OR animal rights
OR animal experimentation [majr:noexp] OR (animal welfare [majr] AND laboratory animals) OR (animal experimentation [mh] AND
animal welfare [mh:noexp]) OR vivisection [majr] OR anonymous testing [mh] OR beginning of human life [mh] OR ((biomedical
enhancement [mh] OR clinical trials/lj [majr] OR embryo disposition [mh] OR embryo research [mh] OR euthanasia, active
[mh:noexp] OR fetal research [mh] OR withholding treatment [majr] OR posthumous conception) AND humans [mh]) OR (euthanasia
[ti] AND humans) OR (euthanasia [mh:noexp] AND (humans [mh] OR history [sh] OR political systems)) OR euthanasia, active,
voluntary OR euthanasia, passive OR civil rights [majr] OR (commitment of mentally ill [majr] AND (attitude OR public opinion OR
coercion OR jurisprudence [mh:noexp] OR lj [sh])) OR commodification OR confidentiality [mh] OR confidentiality [ti] OR
dehumanization [mh] OR directed tissue donation OR (disabled persons [mh:noexp] AND disease transmission, horizontal) OR
disclosure [majr:noexp] OR (drug industry [majr:noexp] AND (health personnel [majr:noexp] OR faculty, medical OR faculty, nursing
OR medical staff [mh] OR nursing staff [mh] OR nurses [mh:noexp] OR nurse administrators [mh] OR physicians [mh] OR physician's
role OR health occupations [mh:noexp])) OR duty to recontact OR eugenics OR fraud [majr] OR freedom [majr] OR genetic privacy OR
(gene therapy [majr] AND government agencies) OR (gift giving AND (industry [majr] OR interprofessional relations [majr] OR
professional-patient relations [majr])) OR health care rationing [majr] OR holocaust [mh] OR human experimentation [mh] OR human
experimentation [ti] OR (human experimentation AND (attitude OR public opinion OR standards [sh])) OR human rights [majr:noexp]
OR (human rights abuses AND (human rights abuses [ot] OR biological warfare OR biomedical research OR bioterrorism OR health
facilities [mh] OR health occupations [mh] OR health personnel OR prisoners OR professional role OR public health [mh:noexp])) OR
informed consent [mh] OR consent forms [ti] OR informed consent [ti] OR involuntary sterilization OR legal guardians [majr] OR (life
support care [majr] AND (brain death OR decision making OR patient participation [mh] OR pregnancy [mh] OR pregnant women OR
palliative care [mh] OR social values [mh] OR terminal care [majr] OR terminally ill [majr])) OR mandatory programs [majr:noexp]
OR (mandatory reporting [majr] AND (AIDS serodiagnosis OR HIV infections OR communicable diseases OR (domestic violence
[majr:noexp] AND professional role [majr]) OR medical errors [majr:noexp])) OR mandatory testing [majr] OR medical futility OR
mental competency [majr] OR (national socialism AND victims) OR oocyte donation/px [majr] OR parental consent [ti] OR parental
notification OR paternalism OR patient self determination act OR patient rights [mh:noexp] OR ((patient [ti] OR patients [ti]) AND
rights [ti]) OR personhood [ti] OR (prejudice AND (diagnosis OR therapy) AND (age factors [majr] OR disabled persons [majr] OR
ethnic groups [majr] OR minority groups [majr] OR sex factors [majr])) OR (prejudice [majr] … [continua]
“La più grande Biblioteca Medica del mondo”:
U.S. National Library of Medicine
http://www.nlm.nih.gov/
La National Library of Medicine posside più di
7 milioni di documenti in ambito biomedico e
sanitario, di ogni tipologia e su ogni tipo di
supporto.
Per 125 anni ha pubblicato l’Index Medicus, il
repertorio bibliografico cartaceo da cui si è
sviluppato MEDLINE.
Ad oggi ospita e gestisce numerosi database, di
cui molti sono pensati anche per un pubblico di
non addetti ai lavori: per un elenco vedi
<http://www.nlm.nih.gov/databases/>
Dal sito è possibile accedere a “mostre online”
(sulle figure della medicina greca, sulle donne
nella storia della medicina ecc.), a progetti di
rilevanza internazionale, come il Visible Human
Project, e a risorse di genetica.
Mette a disposizione materiale didattico
sull’uso delle risorse.
Attraverso il Gateway è possibile interrogare
simultaneamente il catalogo e numerose altre
risorse…
http://gateway.nlm.nih.gov/gw/Cmd
…Pensato per gli utenti inesperti e nuovi
all’uso delle basi dati della NLM, il
Gateway costituisce un punto di
partenza unico per la ricerca.
L’interfaccia è amichevole e la ricerca
molto semplice.
Tra le risorse interrogabili, molte sono
quelle rivolte al “pubblico”
I risultati sono trasparenti e
permettono la navigazione sulla risorsa
nativa.
Un esempio di ricerca con il Gateway della National Library of Medicine:
Le Linee Guida: Stati Uniti
National Guideline Clearinghouse
http://www.guideline.gov/
Tipologia: Base dati di Linee
guida cliniche basate
sull’evidenza.
Accesso: Libero e gratuito.
Lingua: Inglese.
Produttori: Agency for
Healthcare Research and Quality
(AHRQ).
Contenuto: Linee guida destinate
a medici, infermieri ed altri
operatori sanitari, e ai gestori dei
sistemi sanitari.
Per ogni linea-guida è disponibile:
un abstract strutturato
(scaricabile anche da palmare) e,
quando sia possibile, il link al
testo completo; il sito contiene
inoltre: comparazioni e sintesi tra
diverse linee guida; un forum elettronico per lo scambio di informazioni tra i vari operatori; una bibliografia sulle linee
guida, sulle metodologie per la loro compilazione, valutazione e implementazione.
Ricerca: per parola libera, per scorrimento di liste, ricerca avanzata attraverso la combinazione di più elementi derivati
da uno specifico schema di classificazione.
Le Linee Guida: Italia
PNLG – Programma Nazionale Linee Guida
Tipologia: Base dati di Linee guida cliniche
basate sull’evidenza.
http://www.pnlg.it/
Accesso: Libero e gratuito.
Lingua: Italiano.
Produttori: Istituto Superiore di Sanità,
Agenzia per i Servizi Sanitari Regionali… ed
altri enti.
Contenuto: Linee guida cliniche e clinicoorganizzative, predisposte per orientare gli
organizzatori dei servizi sanitari e i medici
nelle scelte relative ai servizi sanitari e alla
diagnosi/trattamento/terapia delle
principali patologie. Tra gli scopi dichiarati
c’è anche quello di informare i cittadini e
permettere loro una scelta consapevole tra
alternative di provata efficacia.
La Banca Dati di Confronto di Linee Guida
Internazionali valuta comparativamente
l’affidabilità di diverse linee guida e la loro
trasferibilità nel contesto nazionale.
Limiti: Per quanto si dichiari rivolto anche ai cittadini, tutto il sito è scritto con un linguaggio tecnico,
complesso e di difficile comprensione per i non addetti ai lavori.
A database of Substance Abuse Information
http://www.projectcork.org/database_search/index.html
Tipologia: Base dati bibliografica.
Accesso: Libero e gratuito.
Contenuto: più di 61.000 citazioni sull’abuso di
sostanze, di cui più di 53.500 articoli di riviste e
7.500 tra libri, capitoli di libri e letteratura grigia,
la cui qualità viene vagliata da professionisti del
settore. La copertura cronologica va dal 1978 ai
nostri giorni, con un pregresso –limitato- che risale
fino al 1800. Ogni citazione è provvista di abstract.
L’aggiornamento è trimestrale (ca 1.500 citazioni
per volta). Il materiale indicizzato è
interdisciplinare, dalle scienze sociali alle
informazioni cliniche: la “mission” del database è
di fornire informazioni ad un ampio spettro di
operatori, dai clinici ai gestori/organizzatori dei
servizi sanitari, a chi si occupa della prevenzione e
degli aspetti sociali del problema.
Ricerca: il database usa un vocabolario controllato di 400 termini utilizzabile nella ricerca per soggetto; si possono
ricercare parole anche negli altri campi.
Il sito produce un’interessante documentazione di settore (es. materiale didattico).
L’Open Access in area biomedica
PubMed Central
http://pubmedcentral.nih.gov/
Tipologia: Archivio di e-print
Accesso: Libero e gratuito.
Lingua: Inglese
Produttore: U.S. National Institutes of Health
(NIH), National Center for Biotechnology
Information (NCBI), presso la National Library
of Medicine (NLM).
Contenuto: Deposito di articoli digitali a testo
pieno, cui gli editori aderiscono su base
volontaria pur dovendo rispettare alcune
norme editoriali (per es. che tutto il materiale
inviato sia peer-reviewed); uno stesso
periodico può inviare tutti gli articoli o solo
alcuni. Comunque, dal momento della
pubblicazione al deposito su PMC non può
trascorrere più di un anno
Sul sito è disponibile la lista delle riviste che
partecipano al progetto, con l’indicazione del primo ed ultimo fascicolo presenti nell’archivio. Gli articoli si aprono
all’interno di PubMed Central, o direttamente sul sito dell’editore, a seconda delle politiche adottate.
PMC è integrato con PubMed e con altri database dell’NCBI: la ricerca per articolo sfrutta l’interfaccia Entrez
L’Open Access in area biomedica:
CogPrints
http://www.cogprints.org/
Tipologia: Archivio di e-print
Accesso: Libero e gratuito.
Contenuto: Articoli a testo pieno in ogni
ramo della Psicologia, delle Neuroscienze e
della Linguistica; copre anche molte aree
delle seguenti discipline: Informatica
(intelligenza artificiale, robotica, visione,
apprendimento, reti neurali…); Filosofia
(mente, linguaggio, conoscenza, scienza,
logica…); Biologia (etologia, sociobiologia,
genetica comportamentale, teoria
dell’evoluzione…); Medicina (psichiatria,
neurologia, geneica umana, diagnostica per
immagini…); Antropologia (primatologia,
etnologia cognitiva, archeologia,
paleontologia…).
Ricerca: scorrimento di liste per soggetto e anno di archiviazione; ricerca semplice e avanzata per parole/campo; lista
dei documenti più recenti.
Questo archivio è compatibile con Open Archive Protocol for Metadata Harvesting OAI 2.0
L’Open Access in area biomedica:
Tipologia: Rivista elettronica.
Accesso: Libero e gratuito.
Lingua: Inglese.
Contenuto: Articoli a testo pieno e commenti in
ogni ramo della Psicologia, delle Neuroscienze e
della Linguistica; copre anche molte aree delle
seguenti discipline: Informatica (intelligenza
artificiale, robotica, visione, apprendimento, reti
neurali…); Filosofia (mente, linguaggio,
conoscenza, scienza, logica…); Biologia (etologia,
sociobiologia, genetica comportamentale, teoria
dell’evoluzione…); Medicina (psichiatria,
neurologia, geneica umana, diagnostica per
immagini…); Antropologia (primatologia, etnologia
cognitiva, archeologia, paleontologia…).
http://psycprints.ecs.soton.ac.uk/
Ricerca: scorrimento di liste per soggetto e anno di archiviazione; ricerca semplice e avanzata per parole/campo; lista
dei documenti più recenti.
Questo archivio è compatibile con Open Archive Protocol for Metadata Harvesting OAI 2.0
Un esempio di Subject Gateway in Medicina:
OMNI
Tipologia: Portale tematico (Subject
Gateway).
Accesso: Libero e gratuito.
Lingua: Inglese.
OMNI (Organising Medical Networked
Information) è un repertorio strutturato di
risorse internet nel campo della medicina
e della sanità.
Le risorse sono valutate con criteri
rigorosi e trasparenti di qualità da un
gruppo di esperti della materia e di
specialisti dell’informazione.
Si rivolge a medici, studenti, ricercatori e
docenti.
Ricerca: semplice, avanzata, per
scorrimento di liste di soggetto
(classificazione della NLM, Termini MeSH)
http://omni.ac.uk/
Siti di informazione orientati al paziente:
ORPHANET
Tipologia: Servizio di
informazioni.
Accesso: Libero e gratuito.
Lingua: Italiano (e altre lingue
europee)
Contenuto: Rete europea di
informazioni sulle malattie
rare e i farmaci orfani.
- Descrizione di ca 1.200
malattie rare
- Progetti di ricerca (Francia)
- Laboratori diagnostici
- Protocolli clinici
http://www.orpha.net/consor/cgi-bin/index.html
- Farmaci
Il servizio è rivolto ai pazienti, ai medici e ricercatori, alle associazioni e all’industria. I testi sono scritti
da esperti; i criteri di selezione delle notizie sono trasparenti. In Italia, i riferimenti per le malattie rare
sono il Ministero della salute <http://www.ministerosalute.it> e l’ Istituto Superiore di Sanità
<http://www.iss.it>.
Siti di informazione orientati al paziente:
MedlinePlus
Ampio sito dedicato alla
diffusione di
un’informazione
sanitaria di qualità al
“pubblico” su più di 600
argomenti. Contiene:
Informazioni
provenienti da fonti
ufficiali e qualificate
Tutorial interattivi di
educazione alla salute
Un’Enciclopedia
medica in linea
http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/
Informazioni sui
farmaci
MedlinePlus è integrato con PubMed attraverso l’opzione “LinkOut”
Organizzazione Mondiale della Sanità
http://www.who.int/en/
Per cercare informazioni
qualificate su:
Emergenze sanitarie
Emergenze sociali
Epidemie
Profilassi e vaccinazioni
Legislazioni sanitarie e statistiche
Patologie
Terapie
Problemi dei paesi in via di sviluppo
Progetti internazionali
...
e
Centers for Disease Control and Prevention
http://www.cdc.gov/
Un altro sito orientato alla
prevenzione e al controllo
delle malattie, utile
Per i viaggiatori
Per i medici che devono
affrontare emergenze
Per gli organizzatori dei servizi
sanitari
...
Due parole su Harold Varmus:
Harold E. Varmus
Premio Nobel per la
medicina nel 1989
per i suoi studi sulle
basi genetiche del
cancro. Nel 1993 il
Presidente Clinton lo
aveva nominato
Direttore del NIH.
Quasi 23.000 ricercatori sparsi in tutto il
mondo hanno sottoscritto la lettera
aperta (qui sopra), comparsa sul sito
Public Library of Science. I primi
firmatari sono Harold Varmus, ora
presidente del Memorial Sloan-Kettering
Cancer Center di New York, Pat Brown
dell'Università di Stanford, e Richard
Roberts dei New England BioLabs.
"Appoggiamo il progetto di stabilire una biblioteca pubblica
online, che fornirà integralmente e in modo gratuito gli articoli
di ricerca nei settori della medicina, della biologia e delle
scienze della vita (...).
La presenza di questa biblioteca accrescerà la disponibilità e
l'utilità della letteratura scientifica, migliorerà la produttività,
e catalizzerà l'integrazione di diversi punti di vista e idee nelle
scienze biomediche.
Riconosciamo che gli editori delle riviste scientifiche hanno il
diritto a un ritorno economico per il loro ruolo nella
comunicazione scientifica. Crediamo però che un archivio
permanente delle pubblicazioni scientifiche e delle idee non
dovrebbe essere posseduto né controllato dagli editori (...).
Per spingere gli editori delle riviste a sostenere l'iniziativa,
dichiariamo che a partire da settembre 2001 pubblicheremo,
revisioneremo, faremo da referee e ci abboneremo soltanto a
quelle riviste che hanno accettato di garantire accesso gratuito
e senza restrizioni a qualsiasi articolo di ricerca originale,
avvalendosi di PubMed Central e di risorse online similari,
entro sei mesi dalla data di pubblicazione".
Harold Varmus et al.
da Tempo Medico n. 709 (9 giugno 2001)
<http://www.tempomedico.it/cale01/cale709.htm>
“Trovare senza ricercare è difficile e raro
ma, se uno cerca, è frequente e facile.
Tuttavia se uno non sa come cercare, la
scoperta è impossibile.”
Archita di Taranto
(matematico e filosofo greco, Taranto ca. 428-ca. 347 a. C.)
<http://aisme.med.unisi.it/index.htm>