Universita’ di Bari Conferenza di Denver 1-3 gruppo A 1966 X-6-12 gruppo C 13-15 gruppo D 19-20 gruppo F by GP&NA 4-5 gruppo B 16-18 gruppo E Y-21-22 gruppo G Universita’ di Bari Cariotipi a confronto 1-3 gruppo A 4-5 gruppo B X-6-12 gruppo C 13-15 gruppo D 19-20 gruppo F by GP&NA 16-18 gruppo E Y-21-22 gruppo G Universita’ di Bari Metodi colorazione differenziale Colorano una regione specifica di alcuni o di tutti i cromosomi C-bande : tutti i centromeri e le regioni eterocromatiche variabili dei cromosomi 1,9,16,Y Creano un’alternanza di bande chiare e scure lungo l’asse del cromosoma specifica per ogni coppia di omologhi. by GP&NA Universita’ di Bari QM-banding pattern utilizzando la mostarda di quinacrina...... by GP&NA Universita’ di Bari DAPI e QM by GP&NA Universita’ di Bari G-bande by GP&NA Universita’ di Bari R-bande by GP&NA Universita’ di Bari Diagramma by GP&NA Universita’ di Bari 46,XX - cariotipo normale Femminile Terminologia 46,XY - cariotipo normale Maschile Questo modo di scrivere ci da’ due informazioni: - numero totale dei cromosomi (46) - sesso dell’organismo 47,XY,+21 Maschio con 47 cromosomi (invece di 46) ed un cromosoma 21 in piu’ (sindrome di Down) 46,XX,del(14)(q23) 46,XY,dup(14)(q22q25) 46,XX,r(7)(p22q36) by GP&NA del=delezione dup= duplicazione r=ring (cromosoma ad anello) Universita’ di Bari cromosoma sul vetrino FISH sintesi di una sonda complementare marcata con un fluorocromo denaturazione doppia elica di DNA AT C GGTATC C TA TAGG C ATAG G AT AT C GGTATC C TA TAGG C ATAG G AT AT C GGTATC C TA TAGG C ATAG G AT A denaturazione AT C GGTATC C TA TAGG C ATAG G AT TAGG C ATAG G AT ibridazione della sonda sui cromosomi denaturati sul vetrino AT C GGTATC C TA TAGG C ATAG G AT osservazione del vetrino by GP&NA Universita’ di Bari FISH : microscopio a fluorescenza Osservazione al microscopio filtro di emissione filtro di eccitazione Lampada a vapori di mercurio CCD camera Elaborazione al computer obiettivo/ condensatore by GP&NA fotografia Universita’ di Bari FISH: metafase in DAPI Cromosomi 1. denaturati 2. colorati con DAPI by GP&NA Universita’ di Bari FISH: segnali by GP&NA Universita’ di Bari FISH: merge by GP&NA Universita’ di Bari Analisi del cariotipo 1) Allestimento della coltura 2) Preparazione dei vetrini 3) Colorazione del preparato con colorazioni differenziali di routine 4) Osservazione al microscopio, selezione delle metafasi e acquisizione delle immagini by GP&NA Universita’ di Bari Allestimento del preparato fitoemoagglutinina (stimola la crescita) colchicina (ultimi 30’) Ipotonica (20’) sangue periferico proliferazione centrifugazione centrifugazione 48-96h terreno di coltura fissativo pellet risospeso by GP&NA pellet risospeso fissativo centrifugazioni (2-3) risospensione in poco fissativo allestimento del preparato Universita’ di Bari Analisi del cariotipo 1) Allestimento della coltura 2) Preparazione dei vetrini 3) Colorazione del preparato con colorazioni differenziali di routine 4) Osservazione al microscopio, selezione delle metafasi e acquisizione delle immagini by GP&NA Universita’ di Bari Colorazione QM 3) Colorazione del preparato con colorazioni differenziali di routine Fluorocromi: QM, DAPI. Necessario un microscopio a flurescenza by GP&NA Universita’ di Bari Colorazione Giemsa 3) Colorazione del preparato con colorazioni differenziali di routine G-banding con Giemsa dopo trattamento con tripsina by GP&NA Universita’ di Bari Analisi del cariotipo 1) Allestimento della coltura 2) Preparazione dei vetrini 3) Colorazione del preparato con colorazioni differenziali di routine 4) Osservazione al microscopio, selezione delle metafasi e acquisizione delle immagini by GP&NA Universita’ di Bari Selezione delle metafasi Ottima ma….. by GP&NA Universita’ di Bari Selezione delle metafasi Puo’ essere anche cosi’.. Cromosomi non ben riconoscibili, difficili anche da contare. Scartare! (potendo) by GP&NA Universita’ di Bari Selezione delle metafasi .. O cosi’ Troppo contratti pero’ si puo’ usare per contarli. Scartare! (potendo) by GP&NA Universita’ di Bari Selezione delle metafasi Sufficiente Si possono contare Puo’ essere utile per analizzare i cromosomi non sovrapposti by GP&NA Universita’ di Bari Selezione delle metafasi Discreta Si possono contare, e anche se ci sono alcune sovrapposizioni, si possono analizzare by GP&NA Universita’ di Bari Selezione delle metafasi Buona Si possono contare, e anche se ci sono alcune sovrapposizioni, la morfologia dei cromosomi e’ buona by GP&NA Universita’ di Bari Come si fa il cariotipo? 1. SI CONTANO I CROMOSOMI : IMPORTANTE PER SOSPETTARE LA PRESENZA DI ALTERAZIONI NEL NUMERO CROMOSOMICO 2. SI APPAIANO GLI OMOLOGHI PER SIMILARITA’ 3. SI METTONO IN ORDINE SECONDO LA CONVENZIONE by GP&NA Universita’ di Bari Fare il cariotipo 46 10 9 11 by GP&NA 16 Universita’ di Bari Cariotipo ordinato CARIOTIPO IN QM (specifico il bandeggio) by GP&NA