Costanti di ionizzazione MODALITA’ DI PREPARAZIONE DI SOLUZIONI TAMPONE Esempio: calcolare il pH di una soluzione tampone che contiene CH3COOH 0,10 M e CH3COONa (acetato di sodio) 0,20 M. Ka dell’acido acetico = 1.7 x 10-5 In soluzione acquosa il sale acetato di sodio si dissocia come segue: CH3COONa(s) CH3COO-(aq) + Na+(aq) per cui la concentrazione CH3COO- (la base) in soluzione risulta pari a 0.20 M Il pKa dell’acido acetico è: pK a log1,7 10-5 4,77 Applicando l’equazione di Henderson-Hasselbalch si ottiene: [CH 3COO ] pH pK a + log [CH3 COOH] 4.77 + log pH= 4.77 + log 2 4.77 + 0.30 5.07 0.20 0.10 Esempio: calcolare il pH di una soluzione tampone che contiene NH3 0.10 M e NH4Cl 0.20 M. Kb di NH3 = 1.8 x 10-5 In soluzione acquosa il sale cloruro di ammonio si dissocia come segue: NH4Cl(s) NH4+(aq) + Cl-(aq) per cui la concentrazione di NH4+ (l’acido) in soluzione risulta pari a 0.20M Sapendo che Kw= Ka x Kb → Ka= Kw/Kb Ka = 1.0 x 10-14/1.8 x 10-5 = 5.6 x 10-10 il pKa è 9,25 Si applica poi l’equazione di Henderson-Hasselbalch: [NH 3 ] 0.1 9.25 + log pH pK a + log + [NH 4 ] 0.2 pH= 9.25 + log 0.5 9.25 0.30 8.95 Esempio: calcolare il rapporto fra la concentrazione di acido acetico e di ione acetato necessari per preparare una soluzione tampone a pH 4,9. pKa dell’acido acetico = 4,77 Applicando l’equazione di Henderson-Hasselbalch si ha: [base] pH pK a + log [acido] [CH 3COO ] 4,9 4,77 + log [CH 3COOH] [CH 3COO ] log 4,9 4,77 0,13 [CH 3COOH] [CH 3COO ] 100,13 1,35 [CH 3COO ] 1,35 [CH 3COOH] [CH 3COOH] Ciò vuol dire che per ogni mole di acido acetico è necessario aggiungere 1,35 moli di acetato di sodio Esempio: calcolare il pH e la M della soluzione tampone preparata miscelando 20ml di NaOH 0,2M e 50ml di CH3COOH 0,1M moli NaOH = 0,02L x 0,2mol/L = 4·10-3 moli moli CH3COOH= 0,05L x 0,1mol/L = 5 ·10-3moli CH3COOH +NaOH CH3COO- + Na+ + H2O (5mmol) (4mmol) (4mmol) (4mmol) (4mmol) (5-4=1mmol) Volume finale = 70ml [CH3COOH] = 1/70 = 0,014 M [CH3COO-] = 4/70 = 0,057 M Applicando l’equazione di Henderson-Hasselbalch si ottiene: [base] pH pK a + log [acido] 0,057 pH 4,77 + log 0,014 - [CH 3COO ] = + pH 4,77 log [CH 3COOH] pH= 4,77+ 0.6 = 5,37 La M del tampone preparato è: M = 5 mmoli (4 mmol CH3COO- +1 mmol CH3COOH)/70 ml = 0,0714M Procedure di preparazione di una soluzione tampone Una soluzione tampone è sempre costituita da un acido debole HA e dalla sua base coniugata A- oppure da una base debole B e dal suo acido coniugato B+. Le soluzioni tampone possono essere preparate in vari modi: I campioni da separare in SDS-PAGE vengono prima fatti bollire per 5 minuti in un tampone (sample buffer) contenente SDS e β-mercaptoetanolo E’ stato dimostrato empiricamente che affinchè tutte le proteine siano rivestite uniformemente con SDS è sufficiente una concentrazione di SDS dello 0,1% (peso/vol) L’SDS è aggiunto nel sample buffer, nello stacking gel e nel resolving gel Il sample buffer contiene anche un colorante tracciante ionizzabile (blu di bromofenolo), il quale consente di seguire l’andamento della corsa elettroforetica Sono presenti inoltre saccarosio e glicerolo, i quali hanno la funzione di rendere più densa la soluzione del campione, consentendo di stratificare senza problemi il campione sul fondo del pozzetto di caricamento del gel dove è presente il tampone di corsa Il blu di bromofenolo, essendo una molecola molto piccola, non subisce alcun effetto frizionale per cui rappresenta il fronte del gel L’elettroforesi termina, e dunque viene tolta la corrente, quando il blu di bromofenolo raggiunge il fondo del gel • Il gel di separazione, generalmente lungo 10 cm, è polimerizzato all’interno di due lastrine di vetro, separate tra loro da due spaziatori di Teflon spessi 1,5 mm • Lo stacking gel è versato sopra il gel di risoluzione e vi si inserisce un pettine per formare i pozzetti per il caricamento dei campioni • Lo stacking gel è generalmente lungo 1 cm