MALDI BioTyper
Arintha Biotech 2010/06
1
MALDI BioTyper
Identificazione batterica
MALDI Biotyper
Il sistema Bruker di nuova generazione
Arintha Biotech 2010/06
2
L’identificazione
Una corretta identificazione poggia le sue basi
sul riconoscimento delle caratteristiche più salienti
e specifiche espresse dal microrganismo da identificare
Arintha Biotech 2010/06
3
L’identificazione
Con adatte osservazioni e prove sperimentali
si determina il maggior numero di caratteristiche del batterio
e i dati ottenuti si confrontano con le descrizioni
delle varie specie esistenti in letteratura.
Arintha Biotech 2010/06
4
Criteri
1.
2.
3.
4.
5.
6.
Caratteri colturali
Aspetti morfologici
Comportamenti metabolici
Composizione chimica
Individualità antigenica
Costituzione genica
Arintha Biotech 2010/06
5
Le tecniche
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
Piastre con terreno cromogenico
Test biochimici in provetta/su colonia
Gallerie di identificazione
Elettroforesi Pulsata su gel (PFGE)
Citofluorimetria
Immunoenzimatica
Immunofluorescenza
FISH, Microarray
FT-IR
FAME GC/MS (esteri metilici degli acidi grassi
Sequenziamento del DNA ribosomale
PCR
Tutte queste tecniche presentano un elevato costo e
richiedono tempi di analisi lunghissimi
Ognuna ha una definita finalità
Arintha Biotech 2010/06
6
L’idea
L’identificazione e la classificazione dei microrganismi possono essere
realizzate utilizzando la spettrometria di massa Maldi TOF, ovvero
misurando il profilo proteico di batteri, lieviti e muffe.
La elevata riproducibilità è assicurata dalla misura delle proteine ad
elevata abbondanza, tra cui molte proteine ribososomiali.
Poiché le proteine ribosomiali sono parte del funzionamento cellulare,
sono presenti in tutte le cellule viventi.
Pertanto l’impronta proteica che il Maldi BioTyper determina non è
influenzata da variabilità nelle condizioni di crescita o ambientale
Vantaggio fondamentale per ottenere e generare robuste biblioteche di
microrganismi.
Arintha Biotech 2010/06
7
MALDI TOF MS
Arintha Biotech 2010/06
8
Procedura analitica
Arintha Biotech 2010/06
9
Campi di applicazione
Arintha Biotech 2010/06
10
Vantaggi
Arintha Biotech 2010/06
11
Vantaggi
Arintha Biotech 2010/06
12
Vantaggi
Arintha Biotech 2010/06
13
Libreria
Arintha Biotech 2010/06
14
Interpretazione
Arintha Biotech 2010/06
15
software
Arintha Biotech 2010/06
16
Correlazioni
Arintha Biotech 2010/06
17
Studi interlaboratori
Arintha Biotech 2010/06
18
Risultati
Arintha Biotech 2010/06
19
Colonie miste
Arintha Biotech 2010/06
20
Riesami
Arintha Biotech 2010/06
21
Risoluzione
Arintha Biotech 2010/06
22
Tempi di analisi
Arintha Biotech 2010/06
23
Valutazioni
Arintha Biotech 2010/06
24
Valutazioni
Arintha Biotech 2010/06
25
Conclusioni
•
•
•
•
•
•
Minima preparazione del campione
Analisi veloci ed accurate, elevata riproducibilità
Basso costo del consumabile
Libreria di 3300 microrganismi
Continuo aggiornamento della libreria e suo ampliamento
La libreria può essere aggiornata dall’utilizzatore con
microrganismi da lui stesso identificati
Arintha Biotech 2010/06
26
Arintha biotech srl
Arintha Biotech 2010/06
27