DISPONIBILITA’ POSTI TESI ANNO 2014-2015
Laboratori di ricerca dei Docenti della Laurea Magistrale in
Biotecnologie Molecolari
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GRUPPO DI RICERCA: Prof. M. Bazzicalupo, Dott. A. Mengoni
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DISPONIBILITÀ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/ TESI DI LAUREA TRIENNALE E/O
MAGISTRALE IN BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referenti : Prof. M. Bazzicalupo, Dott. A. Mengoni
Tema della ricerca: GENOMICA FUNZIONALE NELLA SIMBIOSI TRA PIANTE E BATTERI
Le ricerche svolte riguardano lo studio delle interazioni molecolari tra piante e batteri simbiotici. viene fatto
uso di tecniche di genetica molecolare, bioinformatica e di coltura in vitro di piante. Maggiori informazioni
sono disponibili sul sito del laboratorio (www. dblage.unifi.it).
Parole chiave : SYSTEMS BIOLOGY, GENOMICA, REGOLAZIONE GENICA, SIMBIOSI, BATTERI
ASSOCIATI ALLE PIANTE
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi : Laboratorio di Genetica Microbica, Dipartimento di Biologia
Evoluzionistica e Institut de Recherche Interdisciplinaire - IRI CNRS USR3078, Lille, Francia
In collaborazione con: Dott. E. Biondi, CNRS, Lille (Francia)
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GRUPPO DI RICERCA: Dr Francesca CANTINI
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DISPONIBILITA’ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA MAGISTRALE IN
BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referente: Dr. Francesca Cantini
Tema della ricerca: Studio dei legandi della proteina IDO tramite NMR screening
La tesi/tirocinio condotto al CERM (http://www.cerm.unifi.it/) riguarda l’interazione fra la proteina
Indoleamina 2,3-diossigenasi (IDO) e alcune piccole molecole che agiscono sulla funzione di signaling di
tale proteina modulando la sua emivita. Il progetto di tesi si colloca all’interno di un progetto più ampio in
collaborazione con l’Università di Perugia che verte sulla caratterizzazione della proteina IDO. IDO è un
importante immunoregolatore, sia in gravidanza che in patologie autoimmunitarie, infiammazione cronica,
trapianti e immunità anti-tumorale. E' stato dimostrato che questa proteina, oltre che come enzima, può
funzionare anche come trasduttore del segnale, attraverso due domini immunoreceptor tyrosine-based
inhibitory motifs (ITIMs). Se fosforilati, tali domini fungono da sito di ancoraggio per differenti molecole
che possono prolungare l'emivita di IDO, promuovendo effetti immunoregolatori a lungo termine, o ridurla,
favorendo risposte infiammatorie. Nell’ambito di questo progetto il candidato studierà l’interazione della
proteina IDO con le piccole molecole tramite NMR (ligand-based NMR screening) e ITC.
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: CERM
In collaborazione con: Università di Perugia
DISPONIBILITA’ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA MAGISTRALE IN
BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referente: Dr. Francesca Cantini
Tema della ricerca: Approcci integrati per lo studio delle conformazioni di IDO nei disordini
immunitari
La tesi/tirocinio condotto al CERM (http://www.cerm.unifi.it/) riguarda la caratterizzazione strutturale via
NMR e raggi X della proteina Indoleamina 2,3-diossigenasi (IDO) nella sua conformazione di signaling. Il
progetto di tesi si colloca all’interno di un progetto più ampio in collaborazione con l’Università di Perugia
che verte sulla caratterizzazione della proteina IDO. IDO è un importante immunoregolatore, sia in
gravidanza che in patologie autoimmunitarie, infiammazione cronica, trapianti e immunità anti-tumorale. E'
stato dimostrato che questa proteina, oltre che come enzima, può funzionare anche come trasduttore del
segnale, attraverso due domini immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motifs (ITIMs). Se fosforilati, tali
domini fungono da sito di ancoraggio per differenti molecole che possono prolungare l'emivita di IDO,
promuovendo effetti immunoregolatori a lungo termine, o ridurla, favorendo risposte infiammatorie. La
struttura cristallizzata di IDO è stata ottenuta nella sua conformazione cataliticamente inattiva, svelando la
presenza di due domini, contenenti il sito catalitico con il fattore eme. Nell’ambito di questo progetto il
candidato caratterizzarà via NMR e raggi X la conformazione di IDO importante per il suo ruolo di molecola
segnalatrice.
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: CERM
In collaborazione con: Università di Perugia
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GRUPPO DI RICERCA: Prof. Antonio GUARNA, Dr.ssa Gloria MENCHI,
Dr Andrea TRABOCCHI
DISPONIBILITA’ DI N.1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA MAGISTRALE IN
BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referenti: Prof Antonio Guarna, Dr Andrea Trabocchi, Dr.ssa Chiara Calugi
Tema della ricerca: SINTESI DI INIBITORI PEPTIDOMIMETICI DI HIV PROTEASI.
Il progetto di tesi consiste nella progettazione razionale e sintesi di molecole peptidomimetiche derivanti
dalla combinazione di amminoacidi e zuccheri. Il progetto riguarderà anche i test di inibizione enzimatica
verso la proteasi di HIV usando tecniche di fluorimetria e lo studio delle interazioni inibitore-enzima con
metodi computazionali.
Parole chiave: HIV proteasi, peptidi, peptidomimetici, inibitori enzimatici, sintesi organica.
Luogo e svolgimento del tirocinio/tesi: Dipartimento di Chimica “Ugo Schiff”
In collaborazione con: Istituto superiore Sanità, Roma e Università di Perugia.
DISPONIBILITA’ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA MAGISTRALE IN
BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI Referenti: Prof Antonio Guarna, Prof Gloria Menchi, Dr Andrea
Trabocchi,
Tema della ricerca: STUDIO DI BETA-TURN MIMETICI COME MEDIATORI DI INTERAZIONI
PROTEINA-PROTEINA
La tesi/tirocinio consisterà nella sintesi e studio di nuovi sistemi molecolari che agiscano come mimetici di
beta-turn nell’ambito dello sviluppo di nuovi agenti che interferiscano con interazioni proteina-proteina
importanti in patologie infettive e oncologiche. Lo studio riguarderà inoltre l’analisi conformazionale delle
molecole sviluppate con tecniche NMR e di modellistica molecolare.
Parole chiave: interazioni proteina-proteina, peptidomimetici, analisi conformazionale, NMR, molecular
modeling, sintesi organica.
Luogo e svolgimento del tirocinio/tesi: Dipartimento di Chimica “Ugo Schiff”
In collaborazione con: Università di Milano, progetto nazionale PRIN.
DISPONIBILITA’ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA MAGISTRALE IN
BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referenti: Prof Antonio Guarna, Dr Andrea Trabocchi, Prof.ssa Gloria Menchi Dr Pierangelo Fabbrizzi
Tema della ricerca: SINTESI E ANALISI CONFORMAZIONALE DI FOLDAMERI
La tesi/tirocinio riguarda la sintesi e lo studio conformazionale di oligomeri organizzati in strutture
secondarie, denominati ‘foldameri’, che rivestono ampio interesse nello sviluppo di nuovi agenti
antimicrobici, con particolare riguardo allo sviluppo di unità monometriche di tipo peptidomimetico
derivanti dalla combinazione di derivati di amminoacidi e zuccheri. L’analisi conformazionale delle
molecole sviluppate sarà eseguita attraverso tecniche NMR e di modellistica molecolare.
Parole chiave: strutture secondarie, legame a idrogeno, peptidomimetici, analisi conformazionale, NMR,
molecular modeling, sintesi organica.
Luogo e svolgimento del tirocinio: Dipartimento di Chimica “Ugo Schiff”
In collaborazione con: Programma europeo COST e Laboratori collegati a livello europeo. Possibilità di
progetti ERASMUS.
DISPONIBILITA’ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA MAGISTRALE
/TRIENNLEIN BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referenti: prof Antonio Guarna, Dr Andrea Trabocchi
Tema della ricerca: SINTESI ED APPLICAZIONI BIOLOGICCHE DI NUOVI SISTEMI
PEPTIDOGLICOMIMETICI
La tesi/tirocinio riguarda la progettazione e sintesi e di nuovi sistemi molecolari capaci di mimare la struttura
di porzioni peptidiche e di carboidrati, attraverso una struttura centrale portante come gruppi funzionali sia
catene laterali di amminoacidi, sia motivi poliidrossilati tipici delle strutture degli zuccheri. L’interesse di
queste molecole può collocarsi nell’ambito di composti capaci di interferire con glicoproteine ed enzimi che
riconoscono gli zuccheri come loro substrati.
Parole chiave: carboidrati, peptidomimetici, riconoscimento molecolare, sintesi organica.
Luogo e svolgimento del tirocinio: Dipartimento di Chimica “Ugo Schiff”.
DISPONIBILITA’
DI
N.
1
POSTO
PER
TIROCINIO/TESI
DI
LAUREA
TRIENNALE/MAGISTRALE IN BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referenti: Prof Antonio Guarna, Dr Andrea Trabocchi, Dr Pierangelo Fabbrizzi
Tema della ricerca: SINTESI ORIENTATA ALLA DIVERSITÀ DI PEPTIDOMIMETICI E LORO
APPLICAZIONI BIOLOGICHE
La tesi/tirocinio riguarda la progettazione e sintesi di molecole peptidomimetiche secondo i principi della
DOS (Diversity-Oriented Synthesis). La creazione di collezioni di molecole strutturalmente complesse e
diverse attraverso un approccio sintetico divergente è di grande interesse nell’ambito dell’identificazione di
nuovi composti capaci di interagire in sistemi cellulari in meccanismi complessi, come interazioni proteinaproteina e signaling cellulare.
Parole chiave: chimica combinatoria, peptidomimetici, sintesi organica.
Luogo e svolgimento del tirocinio: Dipartimento di Chimica “Ugo Schiff”
In collaborazione con: Possibilità di tirocini Erasmus ed Erasmus placement, Università di Oxford (UK)
Università di Rennes (FR); Edmund Mach Foundation, Research and Innovation Centre, San Michele
all’Adige (Trento), Italy.
DISPONIBILITA’ DI N. 2 POSTI PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA MAGISTRALE IN
BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referenti: Prof.ssa Gloria Menchi, Prof Antonio Guarna, Dr Andrea Trabocchi, Dr Pierangelo Fabbrizzi
Tema della ricerca: NUOVI LIGANDI DELLE INTEGRINE: SINTESI E LORO APPLICAZIONI
BIOLOGICHE
La tesi/tirocinio riguarda la progettazione e la sintesi di librerie di nuove molecole (peptidiche o
peptidomimetiche) che saranno testate in vitro verso alcune famiglie delle integrine coinvolte nella ‘cascata
metastatica’ che rappresenta l’aspetto più devastante dei tumori. Le molecole che mostreranno attività in
vitro saranno marcate (isotopi radioattivi, molecole fluorescenti, nanoparticelle) per effettuare studi più
approfonditi sia in vitro che in vivo.
Parole chiave: sintesi organica, sintesi peptidica su fase solida, click chemistry, integrine.
Luogo e svolgimento del tirocinio: Dipartimento di Chimica “Ugo Schiff”
In collaborazione con Dipartimento di Scienze Biomediche, Sperimentali e Cliniche Unità di Medicina
Nucleare. Unità di Oncologia Sperimentale.
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GRUPPO DI RICERCA: PROF .sa Elisabetta MEACCI
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DISPONIBILITÀ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA TRIENNALE IN
BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referente: Prof. Meacci E.
Tema della ricerca: RUOLO BIOLOGICO DEGLI SFINGOLIPIDI NELLA BIOLOGIA DEL
MUSCOLO SCHELETRICO E CARDIACO ED IN CELLULE STAMINALI
L'atrofia muscolare generalizzata, intesa come riduzione della massa muscolare con parziale o completa
perdita di funzione da parte del tessuto muscolare scheletrico (astenia), costituisce una possibile complicanza
di diverse patologie, quali tumori maligni (cachessia, condizione di grave deperimento con ipercatabolismo),
AIDS, scompenso cardiaco congestizio e disordini neuromuscolari (come la distrofia muscolare di Duchenne
e la sclerosi laterale amiotrofica), ma anche come conseguenza del disuso (ad esempio immobilizzazione o
denervazione), oltre che della privazione di nutrienti, della somministrazione di farmaci glucocorticoidi e nel
processo di invecchiamento (sarcopenia). Il progetto di ricerca prevede l'analisi di marcatori di atrofia e le
potenzialità degli sfingolipidi e altre molecole bioattive di interferire con il processo atrofico.
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: Dipartimento di Scienze Biomediche Sperimentali e Cliniche
(Viale GB Morgagni 50, Firenze)
DISPONIBILITÀ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA MAGISTRALE IN
BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referente: Prof Meacci E.
Tema della ricerca:
NUOVI PROTOCOLLI SPERIMENTALI PER LA COSTRUZIONE DI NANO-ANTICORPI
Il progetto prevede la messa a punto di nanoanticorpi per biomoniteraggio e prevenzione ambientale.
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: Dipartimento di Scienze Biomediche Sperimentali e Cliniche
(Viale GB Morgagni 50, Firenze)
In collaborazione con: DiVAL (Spin–off UNIFI); CNR (Firenze), CIBM (Livorno)
DISPONIBILITÀ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA MAGISTRALE IN
BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referente: Prof. Meacci E.
Tema della ricerca: NUOVI POTENZIALI CIRCUITI BIOMOLECOLARI COINVOLTI NELLA
RESISTENZA A CHEMIOTERAPICI
Il progetto prevede la caratterizzazione di circuiti biomolecolari che possano essere responsabili della
resistenza a noti chemioterapici e identificazione di marcatori di staminalità
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: Dipartimento di Scienze Biomediche Sperimentali e Cliniche
(Viale GB Morgagni 50, Firenze)
In collaborazione con: Dipartimento di Biomedicina Sperimentale e Clinica
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GRUPPO DI RICERCA: PROF .sa Maria Rosa MONCELLI
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DISPONIBILITÀ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA TRIENNALE E/O
MAGISTRALE IN BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referente: Prof. Maria Rosa Moncelli (e-mail: [email protected])
Tema della ricerca: ESPRESSIONE E PURIFICAZIONE DI MUTANTI DEL FOSFOLAMBANO
La tesi/tirocinio condotto nel laboratorio BioElectroLab del Dipartimento di Chimica
(http://www.bioelelectrolab.unifi.it/) riguarda l’espressione e la purificazione di mutanti del Fosfolambano.
Durante il periodo di tesi ci proponiamo di garantire l’apprendimento delle tecniche base di biologia
molecolare utili all’espressione di una proteina di membrana e alcune tecniche chimiche utili alla
purificazione della proteina stessa (FPLC, liofilizzazione).
La funzione dei mutanti ottenuta verrà poi studiata con tecniche biofisiche.
Parole chiave: fosfolambano, espressione, purificazione, proteine di membrana.
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: Laboratorio BioElectroLab- Dipartimento di Chimica “Ugo
Schiff”- Polo Scientifico e Tecnologico
In collaborazione con: Prof. Gerhard Thiel, Technische Universitat Darmstadt, Germany
DISPONIBILITÀ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA TRIENNALE E/O
MAGISTRALE IN BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referente : Prof. Maria Rosa Moncelli (e-mail: [email protected])
Tema della ricerca: STUDIO DELLA FUNZIONE DI TRASPORTATORI DI MEMBRANA Il
laboratorio BioElectroLab (http://www.bioelectrolab.unifi.it/) studia la funzione di trasportatori di membrana
(pompe ioniche) combinando tecniche elettriche e spettroscopiche. In particolare, è stata recentemente
introdotta una tecnica spettroscopica che si basa su una misura di fluorescenza con sonde stiriliche
elettrocromiche. Con tale metodo spettroscopico siamo in grado di studiare in dettaglio il meccanismo
molecolare di azione del trasportatore di membrana.
Parole chiave: pompe ioniche; trasporto di membrana; fluorescenza.
Luogo di svolgimento del tirocinio: Laboratorio BioElectroLab - Dipartimento di Chimica “Ugo Schiff” –
Polo Scientifico e Tecnologico
In collaborazione con: Prof. H.-J. Apell, Università di Costanza (Germania); Dr. R.J. Clarke, Università di
Sydney (Australia)
DISPONIBILITÀ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA TRIENNALE E/O
MAGISTRALE IN BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referente: Prof. Maria Rosa Moncelli (e-mail: [email protected])
Tema della ricerca: INTERAZIONE DI FARMACI ANTI-TUMORALI CON ATPASI DI
TRASPORTO
Una tematica di ricerca condotta nel laboratorio BioElectroLab del Dipartimento di Chimica
(http://www.bioelectrolab.unifi.it/) riguarda lo studio dell’interazione di farmaci anti-tumorali con ATPasi di
trasporto, in particolare Na+,K+-ATPasi e Ca2+-ATPasi.
Dopo avere caratterizzato l’affinità dei composti per le proteine con test biochimici, ci proponiamo di
analizzare a livello molecolare l’interazione proteina-farmaco con tecniche elettriche e spettroscopiche.
Parole chiave: Na+,K+-ATPasi; Ca2+-ATPasi; meccanismo di inibizione.
Luogo di svolgimento del tirocinio: Laboratorio BioElectroLab - Dipartimento di Chimica “Ugo Schiff” –
Polo Scientifico e Tecnologico
In collaborazione con: Dr. Fabio Arnesano, Università di Bari, Scientific Devices Heidelberg (Germania)
DISPONIBILITÀ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA TRIENNALE E/O
MAGISTRALE IN BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referente: Prof. Maria Rosa Moncelli (e-mail: [email protected])
Tema della ricerca: STUDIO DEI MECCANISMI DI INTERAZIONE DI POTENZIALI FARMACI
CON I CANALI IONICI La tesi/tirocinio condotto nel laboratorio BioElectroLab del Dipartimento di
Chimica (http://www.bioelelectrolab.unifi.it/) riguarda lo studio dei meccanismi di interazione di nuove
molecole, potenziali farmaci, con i canali ionici TRPA1 (responsabile della percezione del dolore), hERG e
BKCa (importanti per la funzione cardiaca). Tali canali verranno espressi in colture cellulari (trasfezioni
transiente e stabili) e in ovociti di Xenopus laevis, e verranno analizzati con la tecnica del patch clamp.
Durante il periodo di tesi verranno utilizzate le principali tecniche di biologia cellulare e molecolare
(necessarie per ottenere cellule che esprimono il canale di interesse in forma nativa e mutata); inoltre verrà
acquisita una notevole padronanza della tecnica del patch clamp, in tutte le sue configurazioni (cell-attached,
whole-cell, inside-out, outside-out).
Parole chiave: canali ionici, patch-clamp, TRPA1, hERG, BKCa.
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: Laboratorio BioElectroLab- Dipartimento di Chimica “Ugo
Schiff”- Polo Scientifico e Tecnologico
DISPONIBILITÀ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA TRIENNALE E/O
MAGISTRALE IN BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referente: Prof. Maria Rosa Moncelli (e-mail: [email protected])
Tema della ricerca: ESPRESSIONE E PURIFICAZIONE DI PROTEINE RICOMBINANTI AD
ATTIVITA’ ANTI-BATTERICA
La tesi/tirocinio condotto nel laboratorio BioElectroLab del Dipartimento di Chimica
(http://www.bioelelectrolab.unifi.it/) nel Laboratorio di Patologia Vegetale Molecolare riguarda l’espressione
e la purificazione di proteine/peptidi ricombinanti attivi contro batteri fitopatogeni. Durante il periodo di tesi
ci proponiamo di garantire l’apprendimento delle tecniche base di biologia molecolare utili all’espressione di
una proteina ricombinante e delle tecniche chimiche essenziali per la purificazione della proteina stessa.
L’attività biologica sarà poi studiata e verificata tramite saggi in vitro ed in planta su sistemi modello, anche
ricorrendo all’uso di geni codificanti per proteine reporter (GFP, Luc. etc)
Parole chiave: proteine ricombinanti, espressione, purificazione, antibatterici, batetri fitopatogeni, GFP,
Luc.
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: Laboratorio BioElectroLab- Dipartimento di Chimica “Ugo
Schiff”; Laboratorio di Patologia Vegetale Molecolare, DISPAA - Polo Scientifico e Tecnologico di Sesto
F.no
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GRUPPO DI RICERCA: Prof. Luigia PAZZAGLI
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DISPONIBILITÀ DI N. 1-2 POSTI PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA TRIENNALE E/O
MAGISTRALE IN BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referente: Prof. Luigia Pazzagli
Tema della ricerca:
a) CARATTERIZZAZIONE DI CERATOPLATANINE, proteine fungine coinvolte nell’induzione di
risposte di difesa dell’ospite. Metodi utilizzati: produzione e purificazione di proteine ricombinanti;
clonaggio di geni e trasformazione di funghi per l’ottenimento di mutanti negativi; elettroforesi
bidimensionale su funghi e piante ospiti, elettroforesi e western blot per l’individuazione del signaling
attivato durante le risposte di difesa.
B) IDENTIFICAZIONE E CARATTERIZZAZIONE DI PEPTIDI AD ATTIVITÀ
ANTIBATTERICA ISOLATI DA VESPE. Metodi utilizzati: ottenimento campioni, purificazione e
caratterizzazione attività antibatterica, produzione dei peptidi per via eterologa.
Parole chiave: purificazione, HPLC, elettroforesi, interazione pianta/patogeno, peptidi antibatterici.
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: Dipartimento Scienze biochimiche
In collaborazione con: Dipartimento biotecnologie agrarie, Università Firenze.
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GRUPPO DI RICERCA: PROF .sa Paola TURANO
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DISPONIBILITÀ DI 2 POSTI PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA TRIENNALE E/O
MAGISTRALE
Referente: Prof. Paola Turano
Tema della ricerca: ESPRESSIONE E PURIFICAZIONE DI PROTEINE COINVOLTE NEI
PROCESSI DI UPTAKE DEL FERRO, con particolare riferimento a ferritina ed emofori. I campioni di
ferritina preparati saranno prevalentemente destinati allo studio dei meccanismi di aquisizione, rilascio e
biomineralizzazione del ferro attraverso caratterizzazione strutturale (cristallografia e NMR) e
spettrosocopica (spettroscopia di assorbimento elettronico, dicroismo circolare, NMR) della proteina nativa e
di suoi mutanti, a diversi livelli di metallazione. Un altro filone di ricerca riguarderà i processi di
acquisizione del ferro sotto forma di eme mediati da proteine emofore batteriche e il rilascio dell’eme ai
corrispondenti recettori di membrana.
Parole chiave: ferritina, biomineralizzazione, omeostasi del ferro, emofori.
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: CERM, Via Sacconi 6 - 50019 Sesto Fiorentino
In collaborazione con: Prof. Stefano Mangani (Univ. Di Siena), Prof. Elizabeth Theil (Children’s Hospital
Oakland Research Institute)
DISPONIBILITÀ DI 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA TRIENNALE E/O
MAGISTRALE
Referente: Prof. Paola Turano
Tema della ricerca: PREPARAZIONE E CARATTERIZZAZIONE SPETTROSCOPICA DI
MUTANTI DEL CITOCROMO C per lo studio del ruolo di questa proteina nei processi di apoptosi. Nel
processo di apoptosi intrinseca, il citocromo c viene rilasciato nel citosol e interagisce con Apaf-1. Questa
interazione promuove la formazione dell’apoptosoma, innescando la morte cellulare. Il processo è
controllato da una serie di interazioni intermolecolari fra citocromo c e proteine pro- e anti-apoptotiche,
alcune delle quali sono oggetto di questo progetto.
Parole chiave: apoptosi, citocromo c, interazioni proteina-proteina, proprietà di superficie.
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: CERM, Via Sacconi 6 - 50019 Sesto Fiorentino
In collaborazione con: Prof. Mario Piccioli (CERM)
DISPONIBILITÀ DI 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA TRIENNALE E/O
MAGISTRALE
Referente: Prof. Paola Turano
Tema della ricerca: ANALISI METABOLOMICA DI BIOFLUIDI, TESSUTI E CELLULE per la
definizione del profilo metabolico individuale e delle sue alterazioni in presenza di alcune patologie. Lo
spettro NMR di un campione biologico dà luogo ad un profilo definito dalla natura e concentrazione relativa
dei metaboliti in esso presenti e può essere usato a fini diagnostici, prognostici e per valutare l’efficacia di
interventi terapeutici.
Parole chiave: NMR, metaboliti, analisi statistica.
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: CERM, Via Sacconi 6 - 50019 Sesto Fiorentino
In collaborazione con: Prof. Claudio Luchinat (CERM), Dott. Leonardo Tenori (Fondazione Fiorgen)
DISPONIBILITÀ DI 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA TRIENNALE E/O
MAGISTRALE
Referente: Prof. Paola Turano
Tema della ricerca: SVILUPPO DI PROCEDURE OPERATIVE STANDARD PER LA
CONSERVAZIONE DI CAMPIONI BIOLOGICI IN BIOBANCHE. La conservazione di campioni
biologici destinati alla ricerca e dei dati clinici e biologici ad essi associati in biobanche è essenziale per studi
in campo biomedico. Per l’accuratezza dei dati analitici ottenibili da questi campioni è fondamentale che
siano sviluppate procedure validate per la loro raccolta, trattamento e conservazione. Scopo dell’attività è
identificare gli aspetti critici delle procedure esistenti, lo sviluppo di nuovi protocolli e la valutazione della
loro efficacia.
Parole chiave: crioconservazione, trattamenti preanalitici.
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: CERM, Via Sacconi 6 - 50019 Sesto Fiorentino
In collaborazione con: Dott.ssa Giordana Marcon (da Vinci European Biobank)
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GRUPPO DI RICERCA: Prof. Vincenzo LOMBARDI, Dr. Massimo RECONDITI
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DISPONIBILITÀ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA TRIENNALE E/O
MAGISTRALE IN BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referenti: Prof. Vincenzo Lombardi, Dr Massimo Reconditi
Tema della ricerca: STUDIO DEI SISTEMI MOTORI DAL MUSCOLO ALLA SINGOLA
MOLECOLA
Parole chiave: motori molecolari, meccanica di singola cellula, meccanica di singola molecola,
accoppiamento chemomeccanico, relazione struttura-funzione nel sarcomero
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: Laboratorio di Fisiologia, DBE, c/o Dipartimento di Fisica Via g.
Sansone 1 - 50019 Sesto Fiorentino
In collaborazione con: Università di Pavia, King's College London
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GRUPPO DI RICERCA: Dott.sa Alessandra ADESSI Prof. Roberto DE PHILIPPIS, Dr
Federico ROSSI
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DISPONIBILITÀ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA TRIENNALE E/O
MAGISTRALE IN BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referenti: Prof. Alessandra Adessi, Prof. Roberto De Philippis, Dott. Federico Rossi
Tema della ricerca: PRODUZIONE BIOLOGICA DI IDROGENO con batteri rossi non sulfurei.
Utilizzo di substrati derivanti da fermentazioni di residui vegetali per processi integrati di produzione di
energia. Utilizzo di fotobioreattori con diverse geometrie e studio dell’effetto dell’intensità luminosa sulla
produzione di idrogeno.
Parole chiave: idrogeno, foto-fermentazione, fotobioreattori
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: Dipartimento di Scienze delle Produzioni Agroalimentari e
dell’Ambiente; Piazzale delle Cascine 24/via Maragliano 77.
In collaborazione con: ICB-CNR Pozzuoli, ICCOM-CNR e ISE-CNR Sesto Fiorentino.
DISPONIBILITÀ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA TRIENNALE E/O
MAGISTRALE IN BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referenti: Prof. Alessandra Adessi, Prof. Roberto De Philippis, Dott. Federico Rossi
Tema della ricerca: RUOLO DEI MICRORGANISMI PRODUTTORI DI POLISACCARIDI IN
SUOLI DESERTICI o ARTICI. Caratterizzazione della matrice polimerica creata dai microrganismi che
risiedono nelle Croste Biologiche di Suolo. Studio del ruolo della matrice polimerica.
Parole chiave: suoli desertici, suoli artici, polisaccaridi
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: Dipartimento di Scienze delle Produzioni Agroalimentari e
dell’Ambiente; Piazzale delle Cascine 24/via Maragliano 77.
In collaborazione con: ISE-CNR Sesto Fiorentino, Institute of Hydrobiology-Chinese Academy of
Sciences, Hebrew University of Jerusalem.
DISPONIBILITÀ DI N. 1 POSTO PER TIROCINIO/TESI DI LAUREA TRIENNALE E/O
MAGISTRALE IN BIOTECNOLOGIE MOLECOLARI
Referenti: Prof. Alessandra Adessi, Prof. Roberto De Philippis, Dott. Federico Rossi
Tema della ricerca: BIOPOLIMERI MICROBICI DI INTERESSE INDUSTRIALE. Biorimozione dei
metalli pesanti dalle acque con cianobatteri produttori di polisaccaride.
Parole chiave: suoli desertici, suoli artici, polisaccaridi
Luogo di svolgimento del tirocinio/tesi: Dipartimento di Scienze delle Produzioni Agroalimentari e
dell’Ambiente; Piazzale delle Cascine 24/via Maragliano 77.
In collaborazione con: Università di Milano, IBMC, Università di Porto.