Cattedra di Microbiologia ENTEROBACTERIACEAE, VIBRIO, CAMPYLOBACTER, HELICOBACTER Enterobacteriaceae • Gruppo eterogeneo di •Bacilli Gram-negativi •Aerobi e Anaerobi facoltativi •Non sporigeni •Mobili (flagelli peritrichi) o immobili •Fermentano il glucosio •Riducono i nitrati a nitriti •Catalasi positivi •Ossidasi negativi • 32 generi principali e più di 130 specie: • 20 specie responsabili di più del 95% delle infezioni • Generi classificati sulla base di: • caratteristiche biochimiche • struttura antigenica • sulla base di tecniche di ibridazione e di sequenziamento Enterobacteriaceae – Escherichia: E. coli – Klebsiella: K. pneumoniae, K. oxytoca – Proteus: P. mirabilis, P. vulgaris – Salmonella: S. typhi, S. paratyphi, S. enteritidis – Shigella: S. sonnei, S. flexneri, S. dysenteriae – Yersinia:Y. pestis, Y. enterocolitica,Y. pseudotuberculosis – Morganella: M. morganii – Enterobacter: E. aerogenes, E. cloacae – Citrobacter: C. freundii, C. koseri – Serratia: S. marcescens, S. liquefaciens – Hafnia: H. alvei – Providencia: P. stuartii, P. rettgeri – Edwardsiella: E. tarda – Erwinia Habitat • Ampiamente distribuiti in natura – nel suolo – nelle acque – nell’intestino dell’uomo e di numerosi animali • Alcune specie decisamente patogene • Altre specie patogene opportuniste Sierotipi • Laboratorio di riferimento – antigeni • O (lipopolisaccaride) • H (flagellari) • K (capsulari) • F (fimbriali) Es. E. coli O111: K58: H2 Fattori di virulenza comuni associati alle Enterobacteriaceae • • • • • • • Endotossina Capsula Produzione di esotossine Variazione di fase antigenica Sequestro di fattori di crescita Resistenza all’uccisione mediata dal siero Resistenza antimicrobica Endotossina • • • • • • • • • Attivazione del complemento Rilascio di citochine Leucocitosi Trombocitopenia Coagulazione intravascolare disseminata Febbre Diminuita circolazione periferica Shock Morte Capsula • Protezione dalla fagocitosi • Antigeni capsulari interferiscono con il legame degli anticorpi al batterio Tuttavia, specifici anticorpi diminuiscono il ruolo protettivo anticapsulari Variazione di fase antigenica • L’espressione degli antigeni capsulare K e flagellare H è sotto il controllo genico del microrganismo • Questi antigeni possono essere espressi o non espressi - VARIAZIONE DI FASE • Variazione di fase protegge il microrganismo dalla morte cellulare anticorpo-mediata Sistemi di secrezione di tipo III • Sistema effettore che rilascia geni di virulenza in cellule bersaglio • Costituito da circa 20 proteine • Senza di esso diminuisce la virulenza Enterobacteriaceae Coltivazione: • Crescono con facilità su terreni comuni • Terreni selettivi sono spesso utilizzati per l’isolamento da materiali polimicrobici •Agar MacConkey (cristalvioletto-lattosio) •Agar EMB (eosina-blu di metilene) •Agar DCA (deossicolato-citrato) • Il terreno di MacConkey permette la distinzione: •Lattosio fermentanti •Lattosio non fermentanti (Salmonella, Shigella e Proteus) Enterobacteriaceae • Nell’uomo possono causare infezioni: •Localizzate •Sistemiche •Opportunistiche Enterobacteriaceae Rappresentano : • oltre l’80% dei bacilli Gram-negativi • 50% di tutti i batteri isolati da campioni clinici • 30-35% di tutte le setticemie • oltre 70% delle infezioni delle vie urinarie Enterobacteriaceae • infezioni acquisite in comunità • in soggetti “sani” –Infezioni delle vie urinarie –Contaminazione fecale *E. coli *Proteus – ureasi (degrada l’urea) – urine alcaline – Klebsiella pneumoniae * infezioni respiratorie * capsulati Enterobacteriaceae • infezioni gastrointestinali – Escherichia coli – Salmonella spp – Shigella spp – Yersinia enterocolitica Sindrome di Reiter • Antigene di Istocompatibilità (HLA-B27) – Enterobacteriaceae *Salmonella *Shigella *Yersinia – Non Enterobacteriaceae *Campylobacter *Chlamydia Infezioni Opportunistiche -Enterobacteriaceae – – – – setticemia polmonite meningite infezioni delle vie urinarie Citrobacter Enterobacter Escherichia Hafnia Morganella Providencia Serratia Feces • E. coli – lactose positive – not usually identified – lactose positive sp. common, healthy intestine • Shigella, Salmonella, Yersinia – lactose negative – identified Enterobacteriaceae • other sites – identified biochemically Therapy • severe diarrhea – fluid replacement essential • antibiotic therapy sometimes used in local infection but always in systemic disease Enterobacteriaceae • SENSIBILITA’ AGLI ANTIBIOTICI Sensibilità agli antibiotici è estremamente variabile. In generale gli antibiotici più attivi sono: Nuove beta-lattamine (ureidopenicilline, cefalosporine di 3a generazione,monobattamici e carbapenemici) Aminoglicosidi Fluorchinoloni Escherichia coli Escherichia coli • Epidemiologia • Malattie • Diagnosi • Terapia, profilassi e controllo – geneticamente indistinguibili – molte similitudini nelle malattie Escherichia coli • Epidemiologia • Normali commensali del tratto gastrointestinale • Maggior parte delle infezioni sono endogene • Ceppi che causano la gastroenterite acquisiti per via esogena Escherichia coli • Malattie • Infezioni delle vie urinarie (cistite, pielonefrite, prostatite) • Batteremie (bacillo Gram-neg più comunemente isolato) • Gastroenterite (6 diversi gruppi patogeni) • Infezioni intra-addominali (peritoniti - associate a perforazioni intestinali; infezioni delle vie biliari) • Meningite neonatale (ceppi K1) Fimbrie in Escherichia coli Escherichia coli Klebsiella pneumoniae Aspetto mucoso di colonie di Klebsiella pneumoniae Capsula di Klebsiella pneumoniae Klebsiella pneumoniae Batterio peritrico (Proteus mirabilis) Movimento di batteri flagellati Proteus mirabilis Enteropathogenic E. coli (EPEC) destruction of microvilli surface (histopathology A/E) Mostly serotypes O55, O111 Enteritis in paediatric age • fever • diarrhea • vomiting • nausea • non-bloody stools Enterotoxigenic E. coli (ETEC) • diarrhea like cholera • milder • travellers diarrhea Enterotoxigenic E. coli • Heat labile toxin (LT-1, LT-II) – like choleragen – Adenyl cyclase activated – cyclic AMP – secretion water/ions • Heat stable toxin (STa, STb) – Guanylate cyclase activated – cyclic GMP – uptake water/ions LT-1 di ETEC (1 subunità A) GM1 Inactivation of Gsa → GTP-Gsa CFTR Enteroinvasive E. coli (EIEC) • Dysentery -resembles shigellosis -pInv genes, plasmidic, colon invasion -Dissemination: Actin filaments formation (Listeria-like) Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) • 50 serotypes (usually O157:H7) Transmission electron micrograph Meat • Hemorrhagic – Non bloody → bloody, copious diarrhea – few leukocytes – afebrile • hemolytic-uremic syndrome (HUS) – hemolytic anemia – thrombocytopenia (low platelets) – kidney failure Enterohemorrhagic E. coli • Vero toxin (Stx-1, Stx-2) → Histopathology A/E – “shiga-like” (Shigella dysenteriae) – 1 subunit A, 5 subunit B → glycolipid Gb3 • Hemolysins Treatment -gastrointestinal disease • fluid replacement • antibiotics – not used usually unless systemic –e.g. hemolytic-uremia syndrome Shigella • Batteri fermentanti, immobili, anaerobi facoltativi • In base alla loro struttura antigenica vengono divise in 4 specie o sottogruppi: • S. dysenteriae (12 sierotipi) (gruppo sierologico A) • S. flexneri (14 sierotipi) (gruppo sierologico B) • S. boydii (18 sierotipi) (gruppo sierologico C) • S. sonnei (1 sierotipo) – Trasmissione oro-fecale per contaggio diretto o indiretto – Fonte di contaggio: malati, convalescenti e portatori sani (rari) – Provocano processi morbosi di varia gravità • Forme dissenteriche acute (diarrea mucosa e sanguinolenta, dolori addominali) • Gastoenteriti meno gravi Infezioni da Shigella • Danno epiteliale della mucosa del colon nell’arco di 2-3 giorni Shigella sonnei responsabile della maggior parte delle infezioni nei paesi industrializzati Virulenza • Endotossina • Geni per adesività, invasione e replicazione intracellulare (IpaA-B-C-D) • Esotossina (tossina Shiga in S. dysenteriae) – Citotossina - danno endoteliale – Blocca sintesi proteica (lisi 28S rRNA) Infezioni da Shigella • L’uomo è l’unico serbatoio • Microrganismi altamente infettanti (basse cariche in grado di produrre malattia) • Bambini: pazienti ad alto rischio – Trasmissione oro-fecale – Trasmissione bambino-adulto • transmitted by adult food handlers – unwashed hands Terapia di infezioni da Shigella • Recupero di fluidi ed elettroliti • Terapia antibiotica accelera il decorso della malattia sintomatica e la solidificazione delle feci – Fluorochinoloni, Trimethoprim/Sulfametossazolo Salmonella Salmonella • • • • Bacilli Gram-negativi Generalmente mobili Lattosio-negativi (non fermentanti) 2463 "tipi” antigenici in base – Antigene “O” – Antigene “H” – Antigene “K” (es. S. typhi) Salmonella • genetically single species (classification 1997) – S. enterica (6 subspecies) – S. bongori • disease category (Edwin 1966) – S. enteritidis – many serotypes – S. cholerae-suis – S. typhi Salmonellosi • S. enteritidis – Specie di salmonella più frequentemente associata ad infezione nell’uomo – pollame, uova – Non esiste serbatoio nell’uomo – Gastroenterite • • • • nausea vomito diarrea non sanguinolenta auto-limitante (2 - 7 giorni) Salmonellosi I casi non-complicati (la maggior parte) Non necessitano terapia antibiotica S. cholerae-suis • Patogeno meno comune • setticemia • Terapia antibiotica essenziale Febbre tifoidea • • • • Salmonella typhi “salmonelle maggiori” Infezione sistemica Malattia contagiosa caratterizata da: – – – – – Febbre Cefalea Disturbi del sensorio Splenomegalia Leucopenia • Malattia epidemica – Prevalentemente nei Paesi del terzo mondo Salmonella typhi • Serbatoio umano – frequente lo stato di portatore (1-5%) – cistifellea • Cibi contaminati • Contaminazione delle acque • Scarse condizioni sanitarie S. typhi • Vi antigene capsulare – protettivo Febbre Tifoide Fase settica - dopo 10-14 giorni - dura circa 7 giorni Fegato, milza, midollo osseo Colecisti –Elimina il germe per settimane Fase acuta – gastroenterite Passaggio attraverso le cellule che rivestono l’intestino e fagocitosi da parte dei macrofagi gastroenterite Febbre Tifoide -Terapia • Antibiotici – il loro utilizzo è fondamentale • Vaccini – Spesso inefficaci Yersiniosi (Zoonosi) • Yersinia enterocolitica – Gastroenteriti – Adeniti mesenteriche (con sintomi di appendicite acuta) – Setticemie in pazienti defedati Yersiniosi • transmissione – Contaminazione fecale di alimenti • Acqua • Latte – Contatto con animali (maiali, pecore, bovini, cavalli, conigli, cani e gatti) Yersinia Diarrea Febbre Dolori addominali Batteremia (raramente) Terapia antibiotica consigliata Y. pseudotuberculosis • simile • patologia meno grave • serbatoi naturali: roditori e uccelli Vibrio cholerae Vibrios • • • • • • Bacilli ricurvi Gram-negativi Aerobi obbligati o facoltativi Mobili - unico flagello polare Fermentanti Ossidasi-positivi Richieste nutrizionali semplici Specie patogene di Vibrio SPECIE FONTE DI INFEZIONE MALATTIA CLINICA V. cholerae Acqua, alimenti Gastroenterite V. parahaemolyticus Crostacei, acqua di mare Batteremia, infezioni di ferite, cellulite V. vulnificus Crostacei, acqua di mare Gastroenterite, infezioni di ferite, batteremia V. alginolyticus Acqua di mare Infezioni di ferite, otite esterna V. hollisae Crostacei Gastroenterite, infezioni di ferite, batteremia V. fluvialis Pesci Gastroenterite, infezioni di ferite, batteremia V. damsela Acqua di mare Infezioni di ferite V. metschnikovii Sconosciuta Batteriemia V. mimicus Acqua dolce Gastroenterite, infezioni di ferite, batteremia Habitat • Presenti in ambienti acquatici (acque marine e di estuari) • Superficie e nel contenuto intestinale di animali marini • Acqua marina ha reso alofile molte specie Struttura antigenica • I vibrioni possiedono antigeni somatici O e antigeni flagellari H • Al sierotipo O1 appartengono i Vibrioni colerici • Sottotipi dell’antigene O – Ogawa: A, B – Inaba: A, C – Hikojima: A, B, C. • Ulteriore suddivisione del sierotipo O1 in 2 biotipi – Classico – Eltor sulla base di caratteristiche “bio-fisiologiche” (emolisi degli eritrociti di montone, emoagglutinazione per eritrociti di pollo, Reazione di VogesProskauer, sensibilità alla polimixina B e al batteriofago IV) • Vibrioni appartenenti agli altri sierotipi sono definiti “non colerici” Coltivazione • Crescono nei comuni terreni • Terreni selettivi a pH alcalino (pH 8,6) – TCBS (tiosolfato, citrato, bile, saccarosio) Fattori di virulenza di Vibrio cholerae O1 e O139 • Tossina colerica ipersecrezione di elettroliti ed acqua • Pilo coregolato adesione alle cellule mucose • Fattore di colonizzazione accessorio adesine • Proteasi dell’emoagglutinazione (mucinasi) induce infiammazione intestinale e la degradazione delle giunzioni strette • Siderofori cattura il ferro • Neuraminidasi incremento dei recettori per la tossina Infezione colerica • • • • Agente eziologico - Vibrio cholerae O1 Malattia limitata all’uomo Prevalente nei Paesi del Terzo Mondo Nei Paesi Industrializati – poco frequente * “viaggiatore” * ingestione di “frutti di mare” Transmission - V. cholerae feces water – fresh – salt food Terapia • Grave perdita di liquidi • anche 10 litri al giorno • più di 10 scariche l’ora • Disidratazione, acidosi, ipotensione/collasso circolatorio, morte • Terapia – somministrazione di soluzioni acquose di elettroliti per via intravenosa – antibiotico: tetracicline • Vaccinazione – parzialmente efficace – utile nel viaggiatore Vibrio parahemolyticus • Infezioni spesso associate al consumo di pesce crudo • Alofilo - cresce meglio ad alte conc. saline • Frequente causa di diarrea in Giappone • Infezioni di ferite •contatto con acqua di mare CAMPYLOBACTER & HELICOBACTER • Bacilli Gram-negativi • Incurvati o spiraliformi • Asporigeni • Microaerofili • Mobili per flagello polare • Non-fermentanti, non-ossidanti (inerti) • Geneticamente correlati Campylobacter Habitat Sono presenti nelle feci di vari uccelli e di mammiferi cavo orale dell’uomo C. jejuni • infetta il tratto intestinale degli animali • bovini e ovini • maggiore causa di aborto Transmissione • latte • carni Isolamento - Campylobacter • microaerofili • Crescono meglio a 42oC Campylobacter - symptoms • diarrhea • malaise • fever • abdominal pain • usually self-limiting • antibiotics occassionally • bacteremia –small minority Helicobacter pylori • Mucosa gastrica - gastrite cronica attiva di tipo B • Ulcera gastrica/duodenale Urease • Important in neutralizing stomach acid Helicobacter pylori • Capacità di aderire all’epitelio gastrico (fattori di adesività) • Attività ureasica • Attività di una mucinasi • Attività di una lipasi e fosfolipasi • Citotossina vacuolizzante Diagnosis -Helicobacter • Culture - urease NH4+ CO2 • mucosal endoscopy • radioactive CO2 breath after feeding radioactive urea Terapia -Helicobacter • Antibiotici – Amoxicillina e Claritromicina • Bismuto colloidale • Inibitore della pompa protonica