UNIONE EUROPEA
G. Marrucci
Il progetto SCoPE: Sistema
cooperativo distribuito ad alte
prestazioni per elaborazioni
scientifiche multidisciplinari
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Schema della presentazione
a)
b)
c)
d)
e)
f)
g)
h)
Obiettivi
Passi pianificati
I siti coinvolti
Le comunità attive
L’organizzazione
Le attrezzature
Il Middleware
Gli applicativi
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a) Obiettivi del Progetto S.Co.P.E.
RICERCA FONDAMENTALE nei seguenti
settori strategici, che necessitano di
infrastrutture di calcolo avanzate :
•Scienze del Microcosmo e del Macrocosmo
•Scienze dei Materiali e dell’ambiente
•Scienze della Vita
•Scienze Sociali
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b) Passi pianificati
 Realizzazione di codici innovativi nei
settori strategici della ricerca
fondamentale
 Realizzazione di un’infrastruttura di
calcolo ad alte prestazioni basata sul
GRID, Aperta e Multidisciplinare
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c) I siti coinvolti
ASTRONOMICAL
OBSERVATORY
MEDICINE
CAMPUS-GRID
CSI
ENGINEERING
ENGINEERING
Optic Fiber
Already Connected
Work in Progress
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d) Le comunità attive nell’e-science (1)
Gruppo di Astrofisica: impiegato nella ricerca per la rivelazione
delle onde gravitazionali e nello studio di tecniche avanzate di datamining e visualizzazione di immagini su massivi data-set
Astronomici.
http://virgo.infn.it e http://www.eurovotech.org/
Gruppo di Bioinformatica: impegnato in applicazioni che richiedono
un accesso massivo a grandi database, studio di clustering
methods con differenti approcci computazionali per genome
sequence analysis e image analyses per lo studio di cell motility ed
altri fenomeni dinamici.
http://bioinfo.ceinge.unina.it/ e http://www.ceinge.unina.it
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d) Le comunità attive nell’e-science (2)
Gruppo di Ingegneria Elettromagnetica: impegnato nella
modellizzazione, simulazione e studio di procedure di misura del
campo elettromagnetico a livello urbano.
http://www.diet.unina.it/gruppoCE/GruppoEl.html
Gruppo di Scienze dei Materiali, impegnato nello studio di
dinamiche molecolare e meccanica molecolare, codici tight binding
per lo studio di proprietà ottiche di materiali nano strutturati,
metodi ab initio e metodi DFT.
http://lsdm.campusgrid.unina.it/ and http://www1.na.infn.it/cmg/
Gruppo di Matematica Numerica e Calcolo scientifico: design ed
analisi di algoritmi per la risoluzione di problemi di matematica di
base per applicazioni scientifiche distribuite ed implementazione
di tali algoritmi su infrastrutture di HPC.
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d) Le comunità attive nell’e-science (3)
Gruppo di Fisica delle Particelle, impegnato in attività fortemente
connesse con il TIER 2 di ATLAS che prevede l’utilizzo di
infrastrutture di calcolo per applicazioni large-scale e data-intesive,
simulationi
Montecarlo
ed
attività
di
data
anslysis.
(http://lxatlas.na.infn.it )
Gruppo di Fisica Teorica, fortemente attivo in applicazioni di
meccanica statistica con uso massivo di tecniche di calcolo
parallelo e di strumenti avanzati di HPC. ( http://smcs.na.infn.it/ )
Gruppo di Ingegneria della Soft Matter, impegnato nella
modellazione e simulazione di proprietà di flusso complesso di
materiali micro-strutturati. (http://wpage.unina.it/p.maffettone)
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e) L’organizzazione
 WP1 - PROGETTAZIONE, REALIZZAZIONE E TEST
DELL'INFRASTRUTTURA DI CALCOLO E GRID
 WP2 - IMPLEMENTAZIONE DEL MIDDLEWARE DI BASE DELLA
PIATTAFORMA GRID
 WP3 - REALIZZAZIONE E GESTIONE DELLA VO E DELLE
RISORSE E SUPPORTO AGLI UTENTI
 WP4 - PROGETTAZIONE E SVILUPPO DI MIDDLEWARE
APPLICATIVO E SVILUPPO DELLE APPLICAZIONI
SCIENTIFICHE
 WP5 - INTEGRAZIONE DELLA GRID SCOPE
NELL'INFRASTRUTTURA NAZIONALE ED INTERNAZIONALE
 WP6 - DIFFUSIONE DEI RISULTATI E TRAINING AGLI UTENTI
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f) Le attrezzature (1): opere edili (fondi UniNA)
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f) Le attrezzature (2): impianti
Nuova cabina elettrica da 1 Mwatt (con UPS e GE)
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f) Le attrezzature (3): il testbed
Tier-2 ATLAS
Sala
Tier-2 ATLAS
Prototipo SCoPE
Servizi Core - GSC
Servizi Core
GSC
Sala infrastruttura
Principale Campus Grid
Prototipo SCoPE
Servizi Collective
Servizi
Collective
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Campus Grid
f) Le attrezzature (4): sistemi MultiCPU (Chimica)
f) Le attrezzature (4): storage remoto (Medicina)
f) Le attrezzature (5): Control Room
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f) Le attrezzature (6): il DataCenter
•
•
•
•
•
•
320 blade, 8 core = 2560 core
180 Terabyte di storage
33 rack raffreddati ad acqua (16 rack liberi)
Rete Infiniband
Rete Gigabit
Rete TenGigabit
g) Il middleware
• INFNGRID gLite 3.0
– Il middleware INFNGRID garantisce piena
compatibilità con il middleware EGEE
(gLite/LCG)
• release e aggiornamenti/bugfix frequenti
– Update 37 - 05/12/2007
• semplicità di integrazione con l'infrastruttura
Grid italiana (Grid.it) ed europea (EGEE)
• S.O. Scientific Linux 3 (SL3)
• Prevista migrazione a INFNGRID gLite 3.1 (SL4)
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h) Gli applicativi
• Codice nuovo sviluppato in tutte le aree
tematiche
–
–
–
–
–
Astrofisica
Bioinformatica
Fisica Alte Energie
Scienza e Ingegneria dei Materiali
Ingegneria Elettromagnetica
• Adattamento delle applicazioni esistenti per Grid
computing: in completamento
• Presentazione a numerosi convegni worldwide
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Nuovi Risultati Scientifici
Scienze del Microcosmo e del Macrocosmo
Nuovi Risultati Scientifici
Scienze Delle Vita
Protein
mRNA
DNA
Structured
RNA
Nuovi Risultati Scientifici
Scienze dei Materiali e dell’Ambiente
Nuovi risultati scientifici
Ingegneria della Soft Matter
Poster di D’Avino, Maffettone et al. per dettagli
Due particelle in fluido Newtoniano
Stesse in fluido non Newtoniano
Multiparticelle
Integrazione con altre infrastrutture
TRISAIA
Conclusioni
Il progetto SCoPE propone una soluzione unificata al
problema del calcolo avanzato nella Federico II per una vasta
serie di tematiche applicative.
Nasce un nuovo datacenter svecchiando l’hardware
preesistente, consentendo di affrontare in maniera
competitiva le nuove sfide della ricerca scientifica.
E’ nata una nuova comunità di utenti utilizzatrice di
infrastrutture GRID, fortemente eterogenea.
SCoPE interopera nelle e-infrastrutture del meridione e si
proietta come protagonista nelle future esperienze IGI ed EGI.
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