DIPARTIMENTO DI SCIENZE E BIOTECNOLOGIE MEDICO-CHIRURGICHE
CURRICULUM DIDATTICO-SCIENTIFICO DEL PROF. DANIELA DE BIASE
DATI PERSONALI
Nome e Cognome Daniela De Biase
Luogo e data di nascita: 14 giugno 1964
Stato Civile: coniugata
Dipartimento Scienze e Biotecnologie Medico-Chirurgiche
Indirizzo: Corso della Repubblica, 79
Telefono uff./lab./mobile 0773 1757212/230
Fax: 0773 1757254
E-mail: [email protected]
Settore Scientifico-Disciplinare: BIO10 BIOCHIMICA
Orario di Ricevimento: giovedì ore 10-12 (Latina); venerdì 14-15 (Roma)
ATTUALE POSIZIONE
Professore Associato di Biochimica
CARRIERA E TITOLI
1987
1991
1991
1994
2000
2001
2004
Laurea cum laude in Scienze Biologiche presso l’Università di Roma “La Sapienza”
Ph.D. in Biochemistry presso University of Wales, College of Cardiff (UK). Titolo
riconosciuto come equipollente al dottorato italiano in Biochimica.
Ricercatore per il gruppo concorsuale E05A, Biochimica presso la Facoltà di Medicina e
Chirurgia dell’Università di Roma “La Sapienza” con afferenza presso il Dipartimento di
Scienze Biochimiche “A. Rossi Fanelli”.
Ricercatore confermato in ruolo.
Idoneo al Concorso di Professore Associato per il SSD BIO10, Biochimica presso la Facoltà
di Scienze Ambientali della II Università degli Studi di Napoli
Professore Associato SSD BIO10 con afferenza presso il Dipartimento di Scienze
Biochimiche “A. Rossi Fanelli”.
Professore Associato confermato in ruolo.
ATTIVITA’ DIDATTICA
1991 -2001 Attività didattica in qualità di ricercatore
presso il Dipartimento di Scienze Biochimiche dell'Università degli Studi di Roma 'La Sapienza'
secondo le modalità previste in qualità di ricercatore: esercitazioni pratiche di laboratorio, lezioni
ed esami di profitto per il corso di Biochimica (Corso di laurea in Medicina e Chirurgia); assistenza
a studenti interni di Scienze Biologiche nell'istruzione al lavoro di laboratorio e preparazione della
tesi di laurea; assistenza a studenti tirocinanti di Medicina.
Curriculum Vitae
Pagina 1
1995-2000 Affidamento in qualità di Ricercatore Confermato dei seguenti corsi:
1) Corso integrato di Biochimica - Corso di Laurea in Medicina e Chirurgia;
2) Chimica, Biochimica e Biochimica Clinica - Scuola diretta a fini speciali per Tecnici Ortodermisti
(a.a. 1995-1996);
3) Chimica Medica e Biochimica (CI) – Diploma Universitario in Logopedia (sede di Ariccia), I
Facoltà di Medicina e Chirurgia (dall'a.a. 1996-1997).
4) Biochimica – Diploma Universitario in Fisioterapia (sede di Ariccia), Ia Facoltà di Medicina e
Chirurgia (a.a. 1996-1997).
5) Biochimica - Scuola di Specializzazione in Oncologia I, I Facoltà di Medicina e Chirurgia
(dall'A.A.1997-1998- all’a.a. 2007-2008)
6) Biochimica - Ia e IIa Scuola di Specializzazione in Pediatria, I Facoltà di Medicina e Chirurgia
(dall'A.A. 1997-1998 all’a.a. 2001-2002).
2000-2011 Affidamento in qualità di Professore Associato dei seguenti corsi:
1) Biochimica I (dall’a.a. 2000/2001) nel CLM in Medicina e Chirurgia “E” (Latina)
2) Biochimica (CI di Biologia e Biochimica; dall’a.a. 2000/2001) nel CL in Logopedia”B” (Ariccia)
3) Biochimica (CI di Biologia e Biochimica; dall’a.a. 2010/2011) nel CL in Fisioterapia ”E” (Ariccia)
4) Biochimica (CI di Biologia e Biochimica; dall’a.a. 2004/2005) nel CL in Infermieristica “Z”(Pomezia)
5) Biochimica (CI di Biologia e Biochimica; dall’a.a. 2008/2009) nel CL in Ostetricia”A” (RomaPoliclinico)
ATTIVITA’ SCIENTIFICA
Le linee di ricerca della Prof.ssa Daniela De Biase vengono svolte tra l’attuale sede di lavoro
(Dipartimento di Scienze e Biotecnologie Medico-Chirurgiche) e il Dipartimento di Scienze
Biochimiche, in cui ha lavorato per 20 anni, dove mantiene delle collaborazioni (Prof. F
Bossa, Dr.ssa Angela Tramonti).
Tematiche:
1) Regolazione trascrizionale e meccanismo biochimico d’azione del sistema gad di Escherichia coli. Si
tratta del principale sistema coinvolto nel conferire a diverse specie di batteri enterici
resistenza allo stress acido dello stomaco per poi colonizzare l’intestino. Il gruppo della
Prof.ssa De Biase è stato tra i primi a dimostrare che è la glutammato decarbossilasi è
responsabile della resistenza allo stress acido in E. coli. Questa linea di ricerca spazia su più
fronti che vanno dall’analisi molecolare della regolazione trascrizionale del sistema gad alla
caratterizzazione biochimica dei componenti strutturali e regolari, per arrivare ad aspetti che
toccano la fisiologia batterica e l’interazione con l’ospite.
2) Caratterizzazione strutturale e funzionale della GABA-aminotrasferasi di mammifero. E’ stato
studiato il meccanismo di inattivazione della GABA-AT da parte della Vigabatrina, un
inibitore suicida di questo enzima, usato come bersaglio di farmaci ad attività antiepilettica.
La struttura cristallografica ha mostrato che questo enzima contiene un centro [2Fe-2S]
all’interfaccia del dimero: primo e a tutt’oggi unico esempio di un enzima PLP-dipendente in
cui sia stata evidenziata la presenza di un centro metallico non localizzato nel sito attivo.
Sono in corso studi sull’enzima umano.
Collaborazioni scientifiche internazionali in corso:
Dr. Guido Capitani (Paul Scherrer Institut, Villigen, Svizzera)
Curriculum Vitae
Pagina 2
Dr. Sylvie Rimsky (LBPA, CNRS-ENS, Cachan, Francia).
Daniela De Biase è iscritta alla Società Italiana di Biochimica e Biologia Molecolare (SIB) e
alla American Society for Microbiology (ASM).
PUBBLICAZIONI SCIENTIFICHE
A. Peer reviewed publications of DE BIASE DANIELA: selezionate (ultimi 15 anni)
#
Riferimento
1
De Biase D, Agostinelli E, De Matteis G, Mondovì B, Morpurgo L.
2
3
4
5
6
7
8
9
Half-of-the-sites reactivity of bovine serum amine oxidase. Reactivity and chemical
identity of the second site.
Eur J Biochem. 1996; 237(1):93-9.
De Biase D, Tramonti A, John RA, Bossa F.
Isolation, overexpression, and biochemical characterization of the two isoforms of
glutamic acid decarboxylase from Escherichia coli.
Protein Expr Purif. 1996; 8(4):430-8.
Tramonti A, De Biase D, Giartosio A, Bossa F, John RA.
The roles of His-167 and His-275 in the reaction catalyzed by glutamate
decarboxylase from Escherichia coli.
J Biol Chem. 1998; 273(4):1939-45.
di Salvo ML, Delle Fratte S, De Biase D, Bossa F, Schirch V.
Purification and characterization of recombinant rabbit cytosolic serine
hydroxymethyltransferase.
Protein Expr Purif. 1998; 13(2):177-83.
Malashkevich VN, De Biase D, Markovic-Housley Z, Schlunegger MP, Bossa F,
Jansonius JN.
Crystallization and preliminary X-ray analysis of the beta-isoform of glutamate
decarboxylase from Escherichia coli.
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 1998; 54(Pt 5):1020-2.
De Biase D, Tramonti A, Bossa F, Visca P.
The response to stationary-phase stress conditions in Escherichia coli: role and
regulation of the glutamic acid decarboxylase system.
Mol Microbiol. 1999; 32(6):1198-211.
Storici P, Capitani G, De Biase D, Moser M, John RA, Jansonius JN, Schirmer T.
Crystal structure of GABA-aminotransferase, a target for antiepileptic drug therapy.
Biochemistry. 1999; 38(27):8628-34.
Ponti D, Mignogna G, Mangoni ML, De Biase D, Simmaco M, Barra D.
Expression and activity of cyclic and linear analogues of esculentin-1, an antimicrobial peptide from amphibian skin.
Eur J Biochem. 1999; 263(3):921-7.
Marabotti A, De Biase D, Tramonti A, Bettati S, Mozzarelli A.
Curriculum Vitae
Impact
Factor
3.2
1.925
5.498
1.925
4.098
5.207
3.150
3.200
5.498
Pagina 3
10
11
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Allosteric communication of tryptophan synthase. Functional and regulatory
properties of the beta S178P mutant.
J Biol Chem. 2001; 276(21):17747-53.
Tramonti A, John RA, Bossa F, De Biase D.
Contribution of Lys276 to the conformational flexibility of the active site of
glutamate decarboxylase from Escherichia coli.
Eur J Biochem. 2002; 269(20):4913-20.
Polidoro M, De Biase D, Montagnini B, Guarrera L, Cavallo S, Valenti P, Stefanini S,
Chiancone E.
The expression of the dodecameric ferritin in Listeria spp. is induced by iron
limitation and stationary growth phase.
Gene. 2002; 296(1-2):121-8.
Tramonti A, Visca P, De Canio M, Falconi M, De Biase D.
Functional characterization and regulation of gadX, a gene encoding an AraC/XylSlike transcriptional activator of the Escherichia coli glutamic acid decarboxylase
system.
J Bacteriol. 2002; 184(10):2603-13.
Tramonti A, De Canio M, Bossa F, De Biase D.
Stability and oligomerization of recombinant GadX, a transcriptional activator of the
Escherichia coli glutamate decarboxylase system.
Biochim Biophys Acta. 2003; 1647(1-2):376-80.
Capitani G, De Biase D, Aurizi C, Gut H, Bossa F, Grütter MG.
Crystal structure and functional analysis of Escherichia coli glutamate
decarboxylase.
EMBO J. 2003; 22(16):4027-37.
Capitani G, Tramonti A, Bossa F, Grütter MG, De Biase D.
The critical structural role of a highly conserved histidine residue in group II amino
acid decarboxylases.
FEBS Lett. 2003; 554(1-2):41-4.
Storici P, De Biase D, Bossa F, Bruno S, Mozzarelli A, Peneff C, Silverman RB,
Schirmer T.
Structures of gamma-aminobutyric acid (GABA) aminotransferase, a pyridoxal 5'phosphate, and [2Fe-2S] cluster-containing enzyme, complexed with gammaethynyl-GABA and with the antiepilepsy drug vigabatrin.
J Biol Chem. 2004; 279(1):363-73.
Capitani G, De Biase D, Gut H, Ahmed S, Grütter MG.
Structural model of human GAD65: prediction and interpretation of biochemical
and immunogenic features.
Proteins. 2005; 59(1):7-14.
Giangrossi M, Zattoni S, Tramonti A, De Biase D, Falconi M.
Antagonistic role of H-NS and GadX in the regulation of the glutamate
decarboxylase-dependent acid resistance system in Escherichia coli.
J Biol Chem. 2005; 280(22):21498-505.
Gut H, Pennacchietti E, John RA, Bossa F, Capitani G, De Biase D, Grütter MG.
Escherichia coli acid resistance: pH-sensing, activation by chloride and
Curriculum Vitae
3.200
2.610
3.818
2.751
9.369
3.399
5.498
3.181
5.498
9.369
Pagina 4
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21
22
23
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25
autoinhibition in GadB.
EMBO J. 2006;25(11): 2643-51.
Tramonti A, De Canio M, Delany I, Scarlato V, De Biase D.
Mechanisms of transcription activation exerted by GadX and GadW at the gadA
and gadBC gene promoters of the glutamate-based acid resistance system in
Escherichia coli.
J Bacteriol. 2006; 188(23):8118-27.
Fiorini F, Stefanini S, Valenti P, Chiancone E, De Biase D..
Transcription of the Listeria monocytogenes fri gene is growth-phase dependent
and is repressed directly by Fur, the ferric uptake regulator.
Gene. 2008; 410(1):113-21.
Tramonti A, De Canio M, De Biase D.
GadX/GadW-dependent regulation of the Escherichia coli acid fitness island:
transcriptional control at the gadY-gadW divergent promoters and identification of
four novel 42 bp GadX/GadW-specific binding sites.
Mol Microbiol. 2008; 70(4):965-82.
Lammens TM, De Biase D, Franssen MCR, Scott EL, Sanders JPM.
The application of glutamic acid -decarboxylase for the valorization of glutamic
acid.
Green Chemistry.2009; 11:1562-67.
Pennacchietti E, Lammens TM, Capitani G, Franssen MC, John RA, Bossa F, De
Biase D.
Mutation of His465 alters the pH-dependent spectroscopic properties of Escherichia
coli glutamate decarboxylase and broadens the range of its activity toward more
alkaline pH.
J Biol Chem. 2009; 284(46):31587-96.
Yu Z, Bekker M, Tramonti A, Cook GM, van Ulsen P, Scheffers DJ, de Mattos JT, De
Biase D, Luirink J.
Activators of the glutamate-dependent acid resistance system alleviate deleterious
effects of YidC depletion in Escherichia coli.
J Bacteriol. 2011; 193(6):1308-16.
3.818
2.610
5.207
6.056
5.498
3.818
LIBRI
1) Tramonti, P.Visca, F. Bossa and D. De Biase (2000) Environmental stimuli and
regulatory factors affecting the expression of the glutamic acid decarboxylase system
in Escherichia coli. In: Biochemistry and Molecular Biology of Vitamin B6 and PQQ
Dependent Proteins. (A. Iriarte, H.M. Kagan and M. Martinez-Carrion eds.) Birkhaüser,
Verlag, Basel, pp. 41-46.
2) P. Storici, G. Capitani, D. De Biase, R.A. John, J.N. Jansonius and T. Schirmer (2000)
GABA-aminotransferase, a target for antiepileptic drug therapy. In: Biochemistry and
Molecular Biology of Vitamin B6 and PQQ Dependent Proteins. (A. Iriarte, H.M. Kagan and
M. Martinez-Carrion eds.) Birkhaüser, Verlag, Basel, pp. 315-318.
Curriculum Vitae
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