Il contributo delle nanoscienze alla comprensione dei fenomeni biologici
Mariano Venanzi
Bio-NAST Laboratory
Università di Roma Tor Vergata
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Scanning Tunneling Microscopy
effetto tunnel elettronico
Atomic Force Microscopy
interazioni elettroniche deboli
Single Molecule Detection
Rivelazione ottica e manipolazione di singole molecole
L’STM ha permesso non solo di vedere singole
molecole , ma anche di toccare e spostare singoli atomi
o di sentire le loro vibrazioni.
Da questo punto di vista, l’STM può essere considerato
come gli occhi, le mani e le orecchie dei ricercatori.
Uno strumento unico capace di connettere il mondo
macroscopico dei nostri sensi al mondo nanometrico
degli atomi e delle molecole.
Saw-Wai Hla, Ohio University
Immagine STM ad alta risoluzione di un DNA plasmide su mica
Nella posizione della freccia il DNA ha una larghezza di 3nm e
una altezza di 0.65 nm.
Parametri di tunneling: -1.9V, 0.3 pA.
Citocromo c su Au(111)
Electron Transfer Proteins
26nmx26nm
10nmx10nm
Corral quantistici: atomi di Ferro su Cu(111) (r=7.3 nm)
Xe su Ni(110)
CO su Cu(110)
Imaging di biomolecole in condizioni fisiologiche
DNA
Complessi DNA-proteina
Bacteriorodopsina nella membrana cellulare citoplasmatica
100 pN
200 pN
Strato cellulare protettivo di Deinococcus radiodurans
5 nm Cr + 50 nm Au
+ tioalcano funzionalizzato (X)
2x2
“Impara ad usare la forza”
Quanta forza serve per svolgere un tratto di DNA?
Spettroscopia di singola molecola
Studio di singole biomolecole in condizioni fisiologiche
 caratterizzazione di popolazioni eterogenee di molecole
- distribuzioni locali, traiettorie nel tempo
 fluttuazioni in condizioni di equilibrio
 cinetiche di reazione di singoli componenti in condizioni di
non-equilibrio
- intermedi e cammini di reazione
Funzionalizzazione di biomolecole mediante sonde
fluorescenti legate covalentemente e in maniera specifica
Le dimensioni di un probe
(≈0.1 nm) sono molto minori
della luce emessa (≈500 nm).
Lo spot di luce può essere
localizzato
con
grande
precisione
(decimi
di
nanometro).
Lampadine molecolari:
molecole che si accendono quando si legano
Fluorescenza
di
singole molecole di
flavoenzima.
Ogni
picco
rappresenta
una
molecola
del
cofattore
flavina
legata all’enzima.
La reazione enzimatica di ogni singolo
enzima/cofattore puo’ essere seguita in tempo reale
addotto
Biomolecole legate a sferette di polistirene o di silice (≈1m)
Boyer and Walker , Nobel 1997
Un motore a scatti di 120°
Il motore F0
Il motore F1
Membrana mitocondriale
Nel mitocondrio
Kinesina in moto : un trasportatore al lavoro
Una molecola di ATP  8 nm
Un esperimento a due trappole!
410 s
3s
tight trap
weak trap
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